สโมสรฟุตบอลมอนโคลอาก่อตั้งขึ้นในฤดูใบไม้ผลิปี 1902 ซึ่งเป็นช่วงเวลาที่ฟุตบอลเริ่มได้รับความนิยมในเมืองและก่อให้เกิดสโมสรฟุตบอลจำนวนมาก^{[ 1 ]}สโมสรนี้เกิดขึ้นในเขตมอนโคลอา ซึ่งเป็นหนึ่งในพื้นที่ฟุตบอลทางประวัติศาสตร์ของมาดริด โดยเป็นสโมสรที่สามที่มีอยู่จริงในเมืองหลวง ต่อจากมาดริดเอฟซีและคลับเอสปาญอลเดมาดริด (1901)

ไม่กี่เดือนหลังจากการก่อตั้ง ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2445 มอนโคลอาได้รับเชิญให้เข้าร่วมงานเฉลิมฉลองที่เอล เอสกอเรียลและส่วนหนึ่งของโปรแกรมมีการแข่งขันระหว่างพวกเขากับมาดริด เอฟซี ซึ่งจัดขึ้นในวันที่ 11 สิงหาคม และการแข่งขันจบลงด้วยสกอร์ 6–5 อย่างดราม่าให้กับมาดริด ซึ่งทำให้พวกเขาได้รับถ้วยรางวัล (จานเซรามิกสองใบ) เป็นครั้งที่สองในประวัติศาสตร์ หลังจากที่ได้รับ ถ้วยรางวัลปลอบใจ จากโคปา เด ลา กราน เปญา ซึ่ง เป็น ถ้วยรางวัลจากการแข่งขันโคปา เด ลา โคโรนาซิออน ปี พ.ศ. 2445ไป แล้ว ^{[ 2 ]}

ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2445 สโมสรฟุตบอลมอนโคลอาได้เข้าร่วมการแข่งขัน Concurso de Bandasร่วมกับสโมสรอื่นๆ ในมาดริดในขณะนั้นซึ่งเป็นการแข่งขันที่เป็นต้นแบบของการแข่งขัน Centro Championship ที่กล่าวถึงข้างต้น ซึ่งเริ่มต้นในปีถัดไปคือ พ.ศ. 2446 ในการแข่งขันนี้ มอนโคลอาต้องการแก้แค้นมาดริดหลังจากเสียถ้วยรางวัลแรกที่เอล เอสกอเรียล แต่พวกเขาล้มเหลวเนื่องจากการแข่งขันจบลงด้วยชัยชนะอย่างถล่มทลาย 0–8 ของมาดริด ซึ่งคว้าแชมป์ไปครองหลังจากเอาชนะคู่แข่งที่เหลือได้อย่างสบายๆ^{[ 3 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2446 การประชุมที่จัดขึ้นในเมืองมันโคลอาได้จัดตั้งคณะกรรมการบริหารของสโมสรดังนี้: ประธาน ฟรานซิสโก บอร์บอน ; รองประธาน โฮอากิน การ์เซีย โบเรส; เหรัญญิก อลอนโซ โคลเมนาเรส; เลขานุการ เฆซุส กอนซาเลซ; สมาชิก: ซัลวาดอร์ นาวาร์โร, ฟรานซิสโก อเรชาวาลา, ฮวน ดานิส, จูเลียน วาลส์ และ เอเซเกียล โรเมโร; หัวหน้าฝ่ายวัสดุ ลอเรนโซ การ์ราสโก^{[ 4 ]}ดูเหมือนว่าเหตุผลในการจัดการประชุมครั้งนั้นก็เพื่อสะท้อนถึงการเปลี่ยนแปลงล่าสุดในสังคม ซึ่งสันนิษฐานว่าเป็นการควบรวมกับสโมสรที่ชื่อว่า ฮิสปาเนีย ฟุตบอล คลับ (สโมสรที่ก่อตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 2445) เนื่องจากในการแข่งขันในอนาคต สโมสรจะถูกบันทึกในพงศาวดารว่า ฮิสปาเนีย แอธเลติก^{[ 5 ]}แต่การควบรวมนี้มีอายุสั้น จึงกระตุ้นให้มีการประชุมใหญ่อีกครั้งในเดือนมิถุนายน ซึ่งอันโตนิโอ อัลบาได้รับการแต่งตั้งเป็นประธานสโมสร และเอมิลิโอ บูเอโน เป็นรองประธาน Jesús González ยังคงดำรงตำแหน่งเลขานุการของสโมสร และมีสมาชิกใหม่ เช่น Carlos Prast, Antonio Gamero และ Francisco Bueno ^{[ 6 ]}ข่าวสารในภายหลังเกี่ยวกับทีม Hispania นี้ก็ไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด เช่นกัน ^{[ a ]} ​​อย่างไรก็ตาม ความก้าวหน้าของสโมสรไม่ได้มั่นคงอย่างที่คาดไว้ แต่ทีมได้รับการเสริมกำลังในช่วงฤดูร้อนปี 1903 ด้วยการมาถึงของผู้เล่นที่ไม่เห็นด้วยหลายคนจาก Madrid FC

มอนโคลอาเป็นหนึ่งในสี่ทีมที่เข้าร่วมการแข่งขันชิงแชมป์เซ็นโทรครั้งแรกในปี 1903 ซึ่งพวกเขาต้องเผชิญหน้ากับมาดริด เอฟซี อีกครั้ง รวมถึงสโมสรฟุตบอลอิเบเรียและโมเดอร์โน เอฟซีในครั้งนี้ มอนโคลอาสามารถแก้แค้นมาดริดได้สำเร็จ โดยเอาชนะไปได้ 1–3 ในวันที่ 20 ธันวาคม 1903 แต่พวกเขาก็ยังไม่สามารถคว้าแชมป์ได้ เนื่องจากเสมอ (0–0) และแพ้ (1–3) ให้กับโมเดอร์โน เอฟซี ซึ่งเป็นแชมป์ในอนาคต ทำให้จบอันดับที่สามรองจากมาดริด เอฟซี ที่ได้อันดับสอง^{[ 7 ]}

ตัวแทนจากมาดริดในการแข่งขันโคปาเดลเรย์ได้รับการคัดเลือกผ่านการแข่งขันรอบคัดเลือกหลังจบการแข่งขันชิงแชมป์มาดริด และในที่สุดเกียรตินี้ก็ตกเป็นของสโมสรมาดริดเอฟซี เนื่องจากเป็นสโมสรเดียวที่มีสิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขัน แม้ว่าจะยังไม่ชัดเจนว่าทำไมมีเพียงสโมสรมาดริดเอฟซีเท่านั้นที่เข้าร่วมการแข่งขันรอบคัดเลือกโคปาเดลเรย์

ในฤดูกาล พ.ศ. 2446-2447 มอนโคลอาได้ลงเล่นใน Centro Championship อีกครั้ง และหลังจากเอาชนะ Iberia FC ไป 4-0 ในรอบรองชนะเลิศ พวกเขาก็ได้เล่นรอบชิงชนะเลิศกับ Club Español de Madrid ในการแข่งขันที่จัดขึ้นในวันที่ 27 มีนาคม พ.ศ. 2447 Español กำลังนำอยู่ 1-0 เมื่อกองหลัง ของพวกเขา Hermúa ได้รับบาดเจ็บโดยบังเอิญ เขาได้รับการวินิจฉัยว่ากระดูก หน้าแข้ง และกระดูกน่องหักกรรมการจึงตัดสินใจหยุดการแข่งขัน ซึ่งทำให้ Español ได้รับชัยชนะ^{[ 8 ]}

ปีต่อมา สโมสรได้ตำแหน่งรองชนะเลิศในการแข่งขันชิงแชมป์ระดับภูมิภาคอีกครั้ง หลังจากแพ้ในรอบชิงชนะเลิศ (2–0) อีกครั้งให้กับมาดริด เอฟซี ในการแข่งขันที่กินเวลาเพียง 35 นาที เนื่องจากมอนโคลอาออกจากสนามเพื่อประท้วงการทำหน้าที่ของผู้ตัดสินปราโดแห่ง^แอธเลติก มาดริด [ ^{9 ]}

ใน การแข่งขันระดับภูมิภาค ประจำปี 1906–07มอนโคลอามีกำหนดจะพบกับไอริสในรอบรองชนะเลิศในวันที่ 2 ธันวาคม 1906 แต่การแข่งขันไม่เคยเกิดขึ้น และการแข่งขันก็ถูกระงับเนื่องจากผู้เข้าร่วมทำผิดกฎระเบียบ^{[ 10 ] [ 11 ]}นี่เป็นการปรากฏตัวครั้งสุดท้ายของสโมสรก่อนที่จะหายไปในปี 1907

เจ้าของสโมสรมอนโคลอาเริ่มหมดความสนใจในทีมของตน ซึ่งในช่วงปลายปี 1906 ทีมกำลังเผชิญกับวิกฤตการณ์ภายใน และในวันที่ 30 มกราคม 1907 สโมสรฟุตบอลมอนโคลอาและผู้เกี่ยวข้องจึงถูกควบรวมเข้ากับสโมสรมาดริดเอฟซีอย่างเป็นทางการและเด็ดขาด เพื่อเสริมความแข็งแกร่งให้กับสโมสรหลังจากสูญเสียผู้เล่นที่ย้ายไปก่อตั้งสโมสรแอธเลติกคลับ ซึ่งเป็นสโมสรในมาดริดของแอธเลติกคลับแห่งบิลบาโออย่างไรก็ตาม ผู้เล่นบางส่วนของมอนโคลอาปฏิเสธที่จะเข้าร่วมมาดริดเอฟซี และไปเข้าร่วมสโมสรอื่นในมาดริด เช่น อิเบเรีย รวมถึงก่อตั้งสโมสรฟุตบอลของสมาคมยิมนาสติกแห่งสเปนมาดริดเอฟซีจึงยุบสโมสรฟุตบอลแห่งแรกๆ ในเมืองหลวง ซึ่งในช่วงเวลาหนึ่งเคยถูกมองว่าเป็นสโมสรที่ดีที่สุดอันดับสองของเมือง