โปรตีนเคลื่อนที่ (MP) เป็น โปรตีนเฉพาะที่เข้ารหัสโดยไวรัสซึ่งเชื่อกันว่าเป็นลักษณะทั่วไปของ จีโนม พืชไวรัสจะต้องสามารถเคลื่อนที่ระหว่างเซลล์ เพื่อ แพร่กระจายไปทั่วทั้งต้นพืชได้จึงจะสามารถติดเชื้อในพืชได้ผนังเซลล์ ของพืช ทำให้การเคลื่อนที่/การแพร่กระจายนี้ค่อนข้างยาก ดังนั้น เพื่อให้สิ่งนี้เกิดขึ้นได้ จึงจำเป็นต้องมีโปรตีนเคลื่อนที่ โปรตีนเคลื่อนที่ช่วยให้ไวรัสแพร่กระจายไปทั่วทั้งต้นพืชได้ทั้งในระดับท้องถิ่นและระดับระบบ^{[ 1 ]}มีการศึกษา MP ครั้งแรกในไวรัสโมเสกยาสูบ (TMV) ซึ่งพบว่าไวรัสไม่สามารถแพร่กระจายได้หากไม่มีโปรตีนเฉพาะ^{[ 1 ]}โดยทั่วไป ไวรัสพืชจะเคลื่อนที่ภายในเซลล์จากบริเวณการจำลองแบบไปยังพลาสโมเดสมาตา (PD) ก่อน จากนั้นไวรัสสามารถผ่าน PD และแพร่กระจายไปยังเซลล์อื่นได้ กระบวนการนี้ถูกควบคุมโดย MP MP ที่แตกต่างกันใช้กลไกและเส้นทางที่แตกต่างกันในการควบคุมการแพร่กระจายของไวรัสบางชนิด^{[ 2 ]}พืชเกือบทั้งหมดแสดงออกอย่างน้อยหนึ่ง MP ในขณะที่บางชนิดสามารถเข้ารหัส MP ที่แตกต่างกันได้หลายชนิด ซึ่งช่วยในการส่งผ่านไวรัสจากเซลล์หนึ่งไปยังอีกเซลล์หนึ่ง^{[ 3 ]}ทำหน้าที่เพิ่มขีดจำกัดการกีดกันขนาด (SEL) ของพลาสโมเดสมาตาเพื่อให้ไวรัสแพร่กระจายได้มากขึ้น^{[ 4 ]}

MP ของไวรัสสามารถได้รับการควบคุมบางอย่าง พวกมันสามารถถูกฟอสโฟรีเลตโดยโปรตีนไคเนสของพืช ซึ่งสามารถทำให้ MP ของไวรัสไม่ทำงานและเป็นช่องทางสำหรับการดัดแปลงหลังการแปลและการควบคุมการเคลื่อนที่ของไวรัส^{[ 3 ]}การฟอสโฟรีเลตยังสามารถช่วยในการควบคุมความสามารถในการติดเชื้อของไวรัส การทำงานของพลาสโมเดสมาสามารถควบคุมความเสถียรของคอมเพล็กซ์ MP-vNA ซึ่งก่อตัวขึ้นเพื่อให้ไวรัสถูกขนส่งผ่านโปรตีนเคลื่อนที่ การฟอสโฟรีเลตในระหว่างการขนส่งไวรัสโมเสกยาสูบ-MP-vRNA อาจมีบทบาทในการควบคุมระดับความสามารถในการติดเชื้อของไวรัส^{[ 5 ]}

โปรตีนเคลื่อนที่ (Movement proteins: MPs) สามารถช่วยไขกลไกสำคัญที่ช่วยควบคุมและกำกับ การขนส่ง โมเลกุลขนาดใหญ่ภายในและระหว่างเซลล์พืชได้ MPs สามารถใช้พลาสโมเดสมา (plasmodesmata) ในการเคลื่อนที่ได้ อย่างไรก็ตาม พวกมันยังสามารถเปลี่ยนแปลงและขัดขวางช่องทางระหว่างเซลล์ได้ ขึ้นอยู่กับว่าเซลล์นั้นเจริญเติบโตเต็มที่แล้วหรือไม่ เมื่อ MPs ถูกแสดงออกอย่างแข็งขัน กำแพงเซลล์ที่ขัดขวางการเคลื่อนที่ของไวรัสพืชจะถูกกำจัดออกไป ซึ่งอาจหมายความว่าโปรตีนเคลื่อนที่สามารถมีบทบาทในการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของเซลล์ได้ MPs และส่วนประกอบอื่นๆ ของไวรัสสามารถโต้ตอบกับระบบเอนโดเมมเบรน (endombrane system)พร้อมกับเครือข่ายไซโทสเกเลตัน (cytoskeletal network) ก่อนที่ไวรัสจะผ่านกำแพงเซลล์ การโต้ตอบเหล่านี้เกิดขึ้นเพื่อระบุจีโนมของไวรัสและนำทางไปยังกำแพงเซลล์เพื่อการขนส่ง MPs ที่เข้ารหัสโดยไวรัสชนิดต่างๆ มีหน้าที่ในการรบกวนการเปิดปิดของพลาสโมเดสมา งานวิจัยชี้ให้เห็นว่าอาจมีลำดับการกำหนดเป้าหมายพลาสโมเดสมา (plasmodesmata targeting sequences) อยู่ภายในโปรตีนเคลื่อนที่ และโปรตีนเหล่านี้อาจทำหน้าที่เป็นเครื่องมือในการระบุส่วนประกอบบางอย่างของพลาสโมเดสมาได้^{[ 4 ]}ไม่พบความคล้ายคลึงกันอย่างกว้างขวางในลำดับของ MP ที่อยู่ใน กลุ่มอนุกรมวิธาน ของไวรัสพืช ที่แตกต่าง กัน นอกจากนี้ ระบบขนส่งของไวรัสบางระบบต้องการเพียง MP เดียว ในขณะที่บางระบบอาจต้องการโปรตีนที่เข้ารหัสโดยไวรัสเพิ่มเติมเพื่ออำนวยความสะดวกในการขนส่งจีโนมของไวรัส^{[ 2 ]}

MP สามารถใช้ได้หลายกลไกที่แตกต่างกัน MP ขนาด 30 kDa ที่พบใน TMV ซึ่งเป็นต้นแบบของตระกูล MP ขนาด 30K ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถเปลี่ยนแปลงขีดจำกัดการแยกขนาดของ PD ได้ นอกจากนี้ยังสามารถจับกับ ssRNA และอาจผ่านพลาสโมเดสมาตาในรูปของสารประกอบ RNP ที่มี RNA จีโนมของไวรัส MP บางชนิดมีโมทีฟโปรตีนที่จำเป็นสำหรับการเคลื่อนที่จากเซลล์หนึ่งไปยังอีกเซลล์หนึ่งโดยไม่ต้องอาศัยโปรตีนเฉพาะของไวรัสชนิดอื่น MP เหล่านี้สามารถจัดลำดับการจับ RNA ที่ไม่จำเพาะและช่วยในการเคลื่อนที่ของไวรัสชนิดอื่นที่ไม่สามารถขนส่งตัวเองได้ กลไก MP อีกประเภทหนึ่งเกี่ยวข้องกับการเคลื่อนที่ของโครงสร้างภายในของพลาสโมเดสมาตา เช่น เดสโมทูบูล และการส่งผ่านไวริออนทั้งหมดจากเซลล์ที่ติดเชื้อไปยังเซลล์ข้างเคียง^{[ 6 ]}

โปรตีนเคลื่อนที่ของซูเปอร์แฟมิลี 30K ซึ่งเป็นหนึ่งในกลุ่ม MP ที่แพร่หลายที่สุดที่พบในไวรัสจาก 16 วงศ์ที่แตกต่างกัน มี โดเมน เจลลี่โรลพับ ที่อนุรักษ์ไว้ร่วม กับ โปรตีน แคปซิด (CP) ของไวรัส RNA และ DNA ขนาดเล็กแบบไอโคซาเฮดรัล โดยเฉพาะอย่างยิ่งไวรัสที่ติดเชื้อพืช^{[ 7 ]}มีการเสนอแนะว่า MP 30K วิวัฒนาการผ่านการจำลองหรือการได้รับยีน CP ในแนวนอนในไวรัสที่ติดเชื้อบรรพบุรุษของพืชมีท่อลำเลียง ตามด้วยการปรับตัวของ CP ที่เป็นพาราโลกัสตัวใดตัวหนึ่ง ในระหว่างการวิวัฒนาการ ร่วมกัน ของไวรัสกับพืชมีท่อลำเลียงที่หลากหลายขึ้น ยีน MP 30K ได้แพร่กระจายในแนวนอนอย่างรวดเร็วในหมู่ไวรัสพืชที่เกิดขึ้นใหม่ ผลักดันความหลากหลายของซูเปอร์แฟมิลี MP 30K และหล่อหลอมไวรัสพืชในปัจจุบัน^{[ 7 ]}