เดิมทีภูมิภาคทะเลสาบมัสแครตเป็นที่อยู่อาศัยของ ชาว อัลกอนควินนักสำรวจชาวยุโรปคนแรกที่ค้นพบทะเลสาบมัสแครตและพื้นที่โดยรอบคือซามูเอล เดอ แชมเพลนเมื่อวันที่ 7 มิถุนายน ค.ศ. 1613 ในขณะนั้น แชมเพลนกำลังสำรวจความเป็นไปได้ของเส้นทางทางเลือกไปยังทะเลเหนือ ( อ่าวฮัดสัน ) ที่จะหลีกเลี่ยงแก่งอันตรายตามแม่น้ำออตตาวา ในระหว่างการสำรวจของเขาในปี ค.ศ. 1613 แชมเพลนได้พบกับกลุ่มชาวอัลกอนควินที่นำโดยนิบาคิส ใกล้กับชายฝั่งของทะเลสาบที่แชมเพลนตั้งชื่อว่า Lac De Nibachis (ปัจจุบันคือทะเลสาบมัสแครต) หลังจากจัดหาผู้นำทางให้แชมเพลนแล้ว นิบาคิสได้ส่งแชมเพลนและคนของเขาไปตามทะเลสาบเจ็ดลีกโดยเรือแคนู ตามบันทึกของแชมเพลน นักผจญภัยได้แบกเรือข้ามฝั่งอีกหนึ่งลีกไปยังทะเลสาบโลเวอร์อัลลูเมตต์ในปัจจุบัน เพื่อพบกับหัวหน้าเผ่าเทสโซอัตบนเกาะที่นักประวัติศาสตร์สรุปว่าเป็นเกาะมอร์ริสัน^{[ 3 ]}

ระหว่างการเดินทางสำรวจจากแม่น้ำออตตาวาไปยังทะเลเหนือในปี 1613 แชมเพลนทำแอสโทรลาบหาย กว่า 200 ปีต่อมาในปี 1867 แอสโทรลาบถูกค้นพบโดยเด็กชายอายุ 15 ปีชื่อเอ็ดเวิร์ด จี. ลี ซึ่งกำลังช่วยพ่อของเขาถางที่ดินในแปลงที่ 13 เขตสัมปทานที่ 2 ตำบลรอสส์ ปัจจุบันรีสอร์ทท้องถิ่นชื่อโลโกสแลนด์ ซึ่งอยู่ทางตะวันออกของคอบเดน ตั้งอยู่บนส่วนหนึ่งของที่ดินนี้ ในปี 1943 แอสโทรลาบถูกซื้อโดยสมาคมนักประวัติศาสตร์นิวยอร์ก และต่อมาได้ส่งคืนให้กับแคนาดาเมื่อรัฐบาลแคนาดาซื้อในปี 1989 ในราคา 250,000 ดอลลาร์ ปัจจุบันแอสโทรลาบจัดแสดงอยู่ที่พิพิธภัณฑ์อารยธรรมในออตตาวา อนุสาวรีย์หินเพื่อรำลึกถึงการค้นพบถูกสร้างขึ้นใกล้กับโลโกสแลนด์ในปี 1952 ^{[ 4 ]}

ในปี พ.ศ. 2380 นักสำรวจเดวิด ทอมป์สันได้ออกเดินทางเพื่อทำเครื่องหมายเส้นทางสำหรับคลองที่เสนอจากแม่น้ำออตตาวาไปยังอ่าวจอร์เจียน คลองนี้จะเดินทางขึ้นไปตามแม่น้ำมัสแครตและผ่านทะเลสาบมัสแครต แต่ก็ไม่เคยเกิดขึ้นจริง เนื่องจากขาดเสบียง ทอมป์สันจึงไม่สามารถทำการสำรวจให้เสร็จสิ้นได้^{[ 4 ]}

ในปี ค.ศ. 1848 เจสัน กูลด์ (ค.ศ. 1802-1864) ตัดสินใจสร้างเส้นทางขนส่งสินค้าจากพอร์เทจ ดู ฟอร์ตบนแม่น้ำออตตาวาไปยังเพมโบรก รัฐออนแทรีโอ เส้นทางนี้รวมถึงบริการเรือข้ามฟากข้ามทะเลสาบมัสแครตและขึ้นไปตามแม่น้ำมัสแครตบางส่วนไปยังแจ็กสันส์โกรฟ ซึ่งอยู่นอกเมืองเพมโบรก เส้นทางนี้ถือว่าสั้นกว่าและมีภูมิประเทศที่เหมาะสมกว่าเส้นทางที่ใช้ในปัจจุบันตามแม่น้ำออตตาวา^{[ 4 ]}

เรือข้ามฟากดั้งเดิมเป็นเรือพายท้องแบนที่ผู้โดยสารต้องพายเอง เรือกลไฟลำแรกของทะเลสาบมัสแครต ชื่อเดอะมัสแครตถูกสร้างขึ้นเพื่อตอบสนองความต้องการที่เพิ่มขึ้นสำหรับการขนส่งที่ง่ายขึ้นข้ามทะเลสาบ และในไม่ช้าก็มีเรือนอร์ทสตาร์ ตามมา ในฤดูใบไม้ผลิปี 1853 มีรายงานว่า เรือนอร์ทสตาร์มีความยาวมากกว่า 90 ฟุตและสามารถ “…ลอยอยู่บนน้ำค้างหนักได้” ^{[ 4 ]}

เมื่อวันที่ 16 พฤษภาคม พ.ศ. 2396 เกิดไฟป่าครั้งใหญ่ลุกลามจากเพมโบรคไปยังฮอร์ตัน รัฐออนแทรี โอ มี รายงานว่าควันจากไฟทำให้ผู้อยู่อาศัยได้รับความเดือดร้อนไปไกลถึงไบทาวน์และเพิร์ธ [ ^{5 ] ไฟ}ได้เผาผลาญเกือบทุกอย่างที่ขวางทาง รวมถึงท่าเรือของเจสัน กูลด์บนทะเลสาบมัสแครต โกดังเก็บของ และเรือมัสแครต เรือนอร์ ทสตาร์ รอดพ้นจากไฟไหม้โดยบังเอิญเนื่องจากแล่นเรือกลับจากเพมโบรคในเช้าวันนั้น ในปี พ.ศ. 2303 เจสัน กูลด์ขายธุรกิจของเขาให้กับบริษัท ยูเนียน ฟอร์เวิร์ดดิ้ง ซึ่งเป็นเจ้าของหลักโดยแดเนียล โครว์ลีย์ (อดีตกัปตันเรือนอร์ทสตาร์ ) ในปี พ.ศ. 2306 โครว์ลีย์สร้างเรือข้ามฟากลำใหม่และตั้งชื่อว่าเจสัน กูลด์บริการเรือข้ามฟากบนทะเลสาบมัสแครตสิ้นสุดลงเมื่อรถไฟมาถึงคอบเดนในปี พ.ศ. 2319 ^{[ 4 ]}

ในปี พ.ศ. 2508 นักดำน้ำสองคน คือ คิม ชาร์เลบัวส์ อายุ 28 ปี และแจ็ค เทรมเบลย์ อายุ 26 ปี จากสมาคมใต้น้ำแห่งออตตาวา ได้พบซากเรือเฟอร์รี่ชื่อเดอะ มัสแครตที่ถูกไฟไหม้ ห่างจากชายฝั่งทะเลสาบมัสแครตเพียงไม่กี่ฟุต มีรายงานว่านักดำน้ำทั้งสองนำชิ้นส่วนไม้ อุปกรณ์เหล็ก และขวดจำนวนหนึ่งขึ้นมา โดยสองขวดยังคงมีจุกปิดอยู่^{[ 5 ]}

จากชนพื้นเมืองดั้งเดิมอย่างชาวอัลกอนควิน จนถึงการมาถึงของผู้ตั้งถิ่นฐานชาวยุโรป ทะเลสาบมัสแครตได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นทรัพยากรที่สำคัญสำหรับผู้คนในบริเวณโดยรอบ ในปี 1865 เด็กๆ ที่เรียนที่โรงเรียนประถมคอบเดนจะเล่นสเก็ตหรือพายเรือข้ามทะเลสาบมัสแครตไปโรงเรียนทุกวันสมาคมสตรี คอบเดน จัดงานปิกนิกริมฝั่งทะเลสาบมัสแครตในปี 1912 โดยมีการนั่งเรือข้ามฟากด้วยเรือกลไฟข้ามทะเลสาบ ในปีเดียวกันนั้น ปีเตอร์ แพปปิน ชาวบ้านในพื้นที่ ได้จับปลาสเตอร์เจียนทะเลสาบ หนัก 65 ปอนด์ได้ ที่ทะเลสาบมัสแครต ในเดือนกันยายนปี 1961 นายกรัฐมนตรีฟรอสต์เดินทางมาถึงทะเลสาบมัสแครตด้วยเครื่องบินทะเล เพื่อเปิดหออนุสรณ์คอบเดนที่สร้างขึ้นใหม่อย่างเป็นทางการ จนถึงปัจจุบัน มีบันทึกว่ามีเพียงสองคนเท่านั้นที่ว่ายน้ำข้ามทะเลสาบมัสแครตได้สำเร็จ ได้แก่ ลอว์เรนซ์ แด็ค ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2466 ^{[ 4 ]}และซาราห์ ฮอลล์ ในวันที่ 17 มิถุนายน พ.ศ. 2560 ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2553 ^{[ 2 ]} สโมสร Cobden Civitanได้ใช้ทะเลสาบแห่งนี้ทุกฤดูหนาวเพื่อจัดงานแข่งตกปลาบนน้ำแข็ง Cobden Ice Fishing Derby บนทะเลสาบมัสแครต ในวันที่ 1 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2563 งานแข่งตกปลาครั้งนี้มีผู้เข้าร่วมกว่า 1,500 คน^{[ 6 ]}

ในช่วงหลายทศวรรษที่ผ่านมา ทะเลสาบมัสแครตประสบปัญหาคุณภาพน้ำ ลดลงอย่างมากและสำคัญ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเกี่ยวข้องกับ การป นเปื้อนของสารอาหาร^{[ 2 ]}

คุณภาพน้ำที่ลดลงในทะเลสาบมัสแครตส่งผลกระทบเชิงลบต่อเจ้าของที่ดินริมฝั่ง ผู้ใช้เพื่อการพักผ่อนหย่อนใจ การพัฒนาที่อยู่อาศัย อุตสาหกรรมการท่องเที่ยว พันธุ์ปลา และแหล่งที่อยู่อาศัยในน้ำ และยังก่อให้เกิดความกังวลด้านสุขภาพของประชาชนที่เกี่ยวข้องกับสาหร่ายสีเขียวแกม น้ำเงิน ^{[ 2 ]} มีการคาดการณ์ว่าภาวะยูโทรฟิเคชัน ที่มากเกินไป อาจเกิดจาก การจัดการ ถังบำบัดน้ำเสีย ที่ไม่ดีหรือรั่วซึมจาก แคมป์หลายแห่งที่ตั้งอยู่รอบทะเลสาบมัสแครต^{[ 7 ]}

หนึ่งในผลข้างเคียงที่ร้ายแรงกว่าของการมีสารอาหารมากเกินไปในทะเลสาบมัสแครตคือการแพร่กระจายของสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงิน ( ไซยาโนแบคทีเรีย ) เมื่อสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินเน่าเปื่อย พวกมันจะปล่อยสารพิษลงสู่สภาพแวดล้อมน้ำจืดโดยรอบ ซึ่งอาจเป็นอันตรายต่อมนุษย์ สัตว์เลี้ยง ปศุสัตว์ ปลา และสัตว์ป่าอื่นๆ ทะเลสาบมัสแครตพบว่าความถี่และความรุนแรงของการแพร่กระจายของสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินเพิ่มขึ้นในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา ตั้งแต่ปี 2007 ถึง 2013 กระทรวงสิ่งแวดล้อม การอนุรักษ์ และอุทยานได้ยืนยันการแพร่กระจายของสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินถึงสามครั้ง^{[ 2 ]}