NDUFB5
NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 5, 16kDaเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน NDUFB5 [ 5 ]โปรตีน NDUFB5 เป็นหน่วยย่อยของNADH dehydrogenase (ubiquinone)ซึ่งตั้งอยู่ในเยื่อหุ้มชั้นในของไมโทคอนเดรียและเป็นคอมเพล็กซ์ที่ใหญ่ที่สุดในบรรดาคอมเพล็กซ์ทั้งห้าของห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอน[ 6 ]
โครงสร้าง
ยีน NDUFB5 ซึ่งตั้งอยู่บนแขน q ของโครโมโซม 3ในตำแหน่ง 26.33 มีความยาว 19,713 คู่เบส โปรตีน NDUFB5 มีน้ำหนัก 21.7 kDa และประกอบด้วยกรดอะมิโน 189 ตัว[ 7 ] [ 8 ] NDUFB5 เป็นหน่วยย่อยของเอนไซม์NADH dehydrogenase (ubiquinone)ซึ่งเป็นคอมเพล็กซ์ระบบหายใจที่ใหญ่ที่สุด โครงสร้างมีรูปร่างคล้ายตัว L โดยมี โดเมนทรานส์ เมมเบรน แบบไฮ โดรโฟ บิกที่ยาว และ โดเมน ไฮโดรฟิลิกสำหรับแขนรอบนอกซึ่งรวมถึงศูนย์รีดอกซ์ที่รู้จักทั้งหมดและไซต์การจับ NADH [ 6 ] NDUFB5 เป็นหนึ่งในหน่วยย่อยไฮโดรโฟบิกประมาณ 31 หน่วยที่ประกอบเป็นบริเวณทรานส์เมมเบรนของคอมเพล็กซ์ I และเป็นหน่วยย่อยที่ไม่เร่งปฏิกิริยาของคอมเพล็กซ์ เป็นที่ทราบกันว่า โดเมนไฮโดรโฟบิก ที่ปลาย Nมีศักยภาพที่จะพับเป็นเกลียวอัลฟา ที่ทอดข้าม เยื่อหุ้มไมโทคอน เดรีย ชั้นในโดยมี โดเมนไฮโดรฟิลิก ที่ปลาย Cทำปฏิกิริยากับหน่วยย่อยทรงกลมของคอมเพล็กซ์ I โครงสร้างสองโดเมน ที่มีการอนุรักษ์ สูง แสดงให้เห็นว่าคุณลักษณะนี้มีความสำคัญต่อการทำงานของโปรตีน และโดเมนไฮโดรโฟบิกทำหน้าที่เป็นจุดยึดสำหรับ คอมเพล็กซ์ NADH ดีไฮโดรจีเนส (ยูบิควิโนน)ที่เยื่อหุ้มไมโทคอนเดรียชั้นใน[ 5 ]
การทำงาน
ยีน NDUFB5 ของมนุษย์เข้ารหัสหน่วยย่อยของคอมเพล็กซ์ Iของห่วงโซ่การหายใจซึ่งถ่ายโอนอิเล็กตรอนจากNADHไปยังยูบิควิโนน [ 5 ] อย่างไรก็ตาม NDUFB5 เป็นหน่วยย่อยเสริมของคอมเพล็กซ์ที่เชื่อกันว่าไม่ได้เกี่ยวข้องกับการเร่งปฏิกิริยา[ 9 ]ในขั้นต้นNADHจะจับกับคอมเพล็กซ์ I และถ่ายโอนอิเล็กตรอนสองตัวไปยังวงแหวนไอโซอัลลอกซาซีนของแขนโปรสเตติกของฟลาวินโมโนนิวคลีโอไทด์ (FMN) เพื่อสร้าง FMNH อิเล็กตรอนจะถูกถ่ายโอนผ่านคลัสเตอร์เหล็ก-กำมะถัน (Fe-S) หลายชุดในแขนโปรสเตติกและในที่สุดไปยังโคเอนไซม์ Q10 (CoQ) ซึ่งถูกรีดิวซ์เป็นยูบิควิโนล (CoQH ) การไหลของอิเล็กตรอนจะเปลี่ยนสถานะรีดอกซ์ของโปรตีน ส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างและค่า pK ของโซ่ข้างที่สามารถแตกตัวเป็นไอออนได้ ซึ่งจะสูบไฮโดรเจนไอออนสี่ตัวออกจากเมทริกซ์ของไมโทคอนเดรีย[ 6 ]