หลังจากการโจมตีสหรัฐอเมริกาเมื่อวันที่ 11 กันยายน 2544 ชัมไซให้สัมภาษณ์กับเดอะนิวยอร์กไทมส์ว่า "การฆ่าผู้บริสุทธิ์เป็นเรื่องผิด และการยกย่องผู้ที่ฆ่าผู้บริสุทธิ์ก็เป็นเรื่องผิดเช่นกัน" ^{[ 10 ]}

อย่างไรก็ตาม ในเดือนตุลาคม ปากีสถานภายใต้ประธานาธิบดีมูชาร์ราฟ ได้ร่วมมือกับ " สงครามต่อต้านการก่อการร้าย " ของอเมริกา รัฐบาลของเขาสั่งห้ามกลุ่มติดอาวุธLashkar-e-JhangviและSipah-e-Muhammad ของปากีสถาน [ ^{11 ] ซึ่งเชื่อกันอย่างกว้างขวาง ว่า}มีส่วนเกี่ยวข้องกับการสังหารหมู่ทางศาสนา หลังจากนั้นไม่นาน ชัมไซได้ออกฟัตวาเรียกร้องให้มีการญิฮาดต่อต้านสหรัฐอเมริกาและปากีสถาน^{[ 9 ]}

รัฐบาลของประเทศมุสลิมทั้งหมดที่เข้าข้างอเมริกาในสงครามครูเสดครั้งนี้ และมอบที่ดินและทรัพยากรให้แก่อเมริกา หรือแบ่งปันข้อมูลข่าวกรองกับอเมริกา ล้วนไม่มีความชอบธรรมอีกต่อไป เป็นหน้าที่ของชาวมุสลิมทุกคนที่จะต้องโค่นล้มรัฐบาลเหล่านี้ด้วยวิธีการใดๆ ก็ตาม^{[ 12 ]}

ตามที่นักวิชาการ Farhan Zahid กล่าว ฟัตวาดังกล่าวหมายความว่า "ญิฮาดที่รุนแรง" เป็น "ข้อบังคับสำหรับชาวมุสลิมทุกคน" และ "ชายหนุ่มมุสลิมที่มีร่างกายแข็งแรง" จำเป็นต้อง "ทำญิฮาดที่รุนแรงต่อสหรัฐอเมริกาในนามของอัฟกานิสถาน และนี่ต้องรวมถึงการสังหารชาวอเมริกัน ชาวยิว ตลอดจนการโจมตีธุรกิจและสถานที่ทางทหาร" (แน่นอนว่าปากีสถานเป็นหนึ่งใน "รัฐบาลของประเทศมุสลิมที่เข้าข้างอเมริกา") Zahid กล่าวว่า Shamzai และฟัตวาของเขา "มีบทบาทสำคัญในการกระตุ้นการเคลื่อนไหวประท้วงต่อต้านอเมริกาในปากีสถานหลังเหตุการณ์ 9/11" ต่อต้านการแทรกแซงของสหรัฐฯ ในอัฟกานิสถานในปี 2001 และในชาวปากีสถานหลายพันคนที่ "เข้าร่วมกับกลุ่มตาลีบันอัฟกานิสถาน" ในเวลาต่อมา^{[ 9 ]} ในการบรรยายครั้งหนึ่ง เขาเทศนาว่า "ญิฮาดที่รุนแรงเป็นทางออกเดียวสำหรับปัญหามากมายที่โลกมุสลิมกำลังเผชิญอยู่" ^{[ 9 ]}

ในการเทศนา แนวคิด Kul-eBandigi (การปฏิบัติตามศาสนาอิสลามอย่างเคร่งครัด) Shamzai เน้นย้ำถึงKasurนั่นคือความผิดพลาดที่ชาวมุสลิมจำนวนมาก (อุมมะห์) ได้กระทำ คือการไม่เข้าร่วมญิฮาดที่รุนแรงในอัฟกานิสถาน แคชเมียร์ เชชเนีย พม่า และที่อื่นๆ การปฏิบัติตามหลัก 5 ประการของศาสนาอิสลาม โดยการละหมาด การถือศีลอดในเดือนรอม ฎอน การจ่ายซะกาตและการไป แสวงบุญ ฮัจญ์นั้นไม่เพียงพอ เมื่อ "ล้มเหลวในการปฏิบัติตามความรับผิดชอบ" อุมมะห์จึง "อ่อนแอ พ่ายแพ้ ถูกดูหมิ่น และตกเป็นทาส" ^{[ 9 ]}

เชื่อกันว่าชัมไซได้โน้มน้าวให้มุลลาห์ อุมาร์ทำสงครามกับสหรัฐอเมริกา[ ^{13 ] [ 14 ] เขา} "ส่งเสริมระบอบตาลีบันอัฟกานิสถาน การปฏิบัติทางศาสนา การบังคับใช้กฎหมายชารีอะห์ การปฏิบัติต่อสตรีและชนกลุ่มน้อย และทำให้การกระทำของพวกเขามีความชอบธรรมผ่านฟัตวาของเขา" ^{[ 9 ]}

ชัมไซเป็น "ผู้อุปถัมภ์หลัก" ของจาอิช-อี-โมฮัมหมัด (JeM) และหัวหน้า JeM อย่างเมาลานา มาซูด อัซฮาร์ เป็น "ลูกศิษย์คนโปรดของชัมไซที่โรงเรียนสอนศาสนาในเมืองบีนอรี" ^{[ 15 ]}ชัมไซยัง "ออกฟัตวาเพื่อสนับสนุนฮาร์กัต-อัล-มูจาฮิดีน (HuM)" ^{[ 16 ]}และผู้นำของฮาร์กัต-อัล-ญิฮาด อัล-อิสลามี (HuJI) "เป็นลูกศิษย์ของเขา" ชัมไซ "ใช้ความสัมพันธ์ของเขากับแกรนด์มุฟตี อับดุล-อาซิซ อิบนุ บาซแห่งซาอุดีอาระเบีย เพื่อขอรับเงินทุนจากกระทรวงกิจการศาสนาของซาอุดีอาระเบีย" ^{[ 17 ]}

มีการกล่าวถึงชัมไซว่ามี "ความสัมพันธ์ใกล้ชิด" กับผู้ก่อตั้งอัลกออิดะห์ อุซามะห์ บิน ลาเดน และผู้ก่อตั้งอันนาบียาห์ ฮัมซา บิน อุมาร์ และเชื่อกันว่าเขาโน้มน้าวให้มุลลาห์ อุมาร์ ปฏิเสธข้อเรียกร้องของชาวอเมริกันให้ส่งตัวอุซามะห์ บิน ลาเดน ฮัมซา บิน อุมาร์ มาให้ ตัวแทนความรู้สึกของเขาคือฟัตวาที่ออกในปี 1998 (ในการประชุมของ Majlis-eTaawun Islami Pakistan หรือองค์การเพื่อความร่วมมืออิสลาม ซึ่งเขาเป็นเอมีร์และผู้ก่อตั้ง) ^{[ 9 ]}

“หากชีคอุซามะห์และชีคฮัมซาถูกจับหรือได้รับอันตราย ญิฮาดจะกลายเป็นข้อบังคับต่อรัฐบาลทุกฝ่ายที่เกี่ยวข้องกับปฏิบัติการ” ^{[ 9 ]}

ชัมไซ "เผยแพร่ลัทธิต่อต้านยิว อย่างเป็นระบบ ... ผสมผสานกับทฤษฎีสมคบคิด" และได้รับการยกย่องว่าเป็นผู้มีส่วนสำคัญในการส่งเสริมลัทธิต่อต้านยิวในปากีสถานโดยซาฮิด^{[ 9 ]}นอกจากการเกลียดชังชาวยิวแล้ว เขายังดูหมิ่นสื่อต่อต้านญิฮาด ดังที่แสดงออกในคำกล่าวหนึ่งว่า: “ หนังสือพิมพ์ Dawnจากการาจีและหนังสือพิมพ์อื่นๆ เช่นThe Frontier Post , The News Internationalและหนังสือพิมพ์อื่นๆ ที่ตีพิมพ์ในประเทศ ล้วนเป็นส่วนหนึ่งของการสมคบคิดของสื่อยิวต่อต้านอิสลาม ญิฮาด และโรงเรียนสอนศาสนาอิสลาม” ^{[ 9 ]}