| เอ็นซีแอล |
|---|
 |
| โครงสร้างที่มีอยู่ |
|---|
| พีดีบี | การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB |
|---|
| รายชื่อรหัส PDB |
|---|
2FC8 , 2FC9 , 2KRR |
|
|
| ตัวระบุ |
|---|
| ชื่อเรียกอื่น | NCL , C23, นิวคลีโอลิน, Nsr1 |
|---|
| รหัสภายนอก | โอมิม : 164035 ; เอ็มจีไอ : 97286 ; โฮโมโลยีน : 136488 ; GeneCards : NCL ; OMA : NCL - ออร์โธโลจี |
|---|
|
|
| รูปแบบการแสดงออกของ RNA |
|---|
| บีจี | | มนุษย์ | เมาส์ (ออร์โธล็อก) |
|---|
| สูงสุดที่แสดงใน | - โซนโพรงสมอง
- ส่วนนูนของปมประสาท
- ภาคผนวก
- ส่วนกลางของตับอ่อน
- เนื้อเยื่อกล้ามเนื้อเรียบ
- เอ็นร้อยหวาย
- รังไข่ซ้าย
- รังไข่ข้างขวา
- เนื้อเยื่อบุผิวของลำไส้ใหญ่
- เส้นประสาทน่อง
|
| | สูงสุดที่แสดงใน | - หางของตัวอ่อน
- ถุงไข่แดง
- เอพิบลาสต์
- ปุ่มอวัยวะเพศ
- ชั้นประสาทของเรตินา
- โอโอไซต์ปฐมภูมิ
- โอโอไซต์รอง
- ไซโกต
- โซนโพรงสมอง
- รก
|
| | ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
| ไบโอจีพีเอส |  | | ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
|
| ออนโทโลยีของยีน |
|---|
| หน้าที่ระดับโมเลกุล | - การจับกับ DNA
- การจับตัวของดีเอ็นเอเทโลเมียร์
- การจับกับปลาย C ของโปรตีน
- การจับโปรตีน
- การจับกับ RNA
- การจับโปรตีนที่เหมือนกัน
- การจับกรดนิวคลีอิก
- การจับกับดีเอ็นเอโทโปไอโซเมอเรส
- การจับกับ mRNA 5'-UTR
| | ส่วนประกอบของเซลล์ | - ไซโตพลาซึม
- เมมเบรน
- นิวคลีโอพลาสม์
- คอร์เทกซ์ของเซลล์
- นิวคลีโอลัส
- เม็ดไรโบโปรตีนในไซโตพลาสซึม
- เอ็กโซโซมนอกเซลล์
- นิวเคลียส
- สารประกอบไรโบโปรตีน
| | กระบวนการทางชีวภาพ | - การควบคุมเชิงบวกของการถอดรหัสของ rRNA ขนาดใหญ่ในนิวเคลียสโดย RNA polymerase I
- การสร้างหลอดเลือดใหม่
- การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II
- การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นจากปัจจัยการเจริญเติบโตของผิวหนัง
- การควบคุมการแปลเชิงลบ
- การตอบสนองของเซลล์ต่อปัจจัยยับยั้งมะเร็งเม็ดเลือดขาว
| | แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO |
|
|
| วิกิดาต้า |
|
นิวคลีโอลินเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนNCL [ 5 ] [ 6 ]
ยีน
ยีน NCLของมนุษย์ตั้งอยู่บนโครโมโซม 2ประกอบด้วยเอ็กซอน 14 ส่วนและอิน ตรอน 13 ส่วน โดยมีความยาวประมาณ 11 กิโลเบส อินตรอน 11 ของ ยีน NCLเข้ารหัสRNA นิวคลีโอลาร์ขนาดเล็กที่เรียกว่า U20 [ 7 ]
การทำงาน
นิวคลีโอลินเป็นโปรตีนนิวคลีโอลัสหลักของเซลล์ยูคาริโอติกที่กำลังเจริญเติบโต พบว่ามันเกี่ยวข้องกับโครมาตินภายในนิวคลีโอลัสและอนุภาคพรีไรโบโซม มันกระตุ้นการคลายตัวของโครมาตินโดยการจับกับฮิสโตน H1 เชื่อกันว่ามันมีบทบาทในการถอดรหัสพรีอาร์เอ็นเอและการประกอบไรโบโซม นอกจากนี้มันอาจมีบทบาทในกระบวนการยืดตัวของการถอดรหัสมันจับกับโอลิโกนิวคลีโอไทด์อาร์เอ็นเอที่มีลำดับซ้ำ 5'-UUAGGG-3' ได้แน่นกว่าลำดับซ้ำ 5'-TTAGGG-3' ของดีเอ็นเอสายเดี่ยวที่ปลายโครโมโซม
นิวคลีโอลินยังสามารถทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสร่วมกับ Chicken Ovalbumin Upstream Promoter Transcription Factor II ( COUP-TFII ) ได้อีกด้วย [ 8 ]
ความสำคัญทางคลินิก
มิดไคน์และเพลโอโทรฟินจับกับนิวคลีโอลินบนพื้นผิวเซลล์ในฐานะตัวรับที่มีความสัมพันธ์ต่ำ การจับนี้สามารถยับยั้งการติดเชื้อเอชไอวีได้[ 9 ] [ 10 ]
นิวคลีโอลินที่ผิวเซลล์เป็นตัวรับสำหรับโปรตีนฟิวชั่นของ ไวรัส RSV ( Respiratory Syncytial Virus ) [ 11 ]การรบกวนปฏิสัมพันธ์ระหว่างนิวคลีโอลินและโปรตีนฟิวชั่นของ RSV ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถรักษาการติดเชื้อ RSV ในเซลล์เพาะเลี้ยงและแบบจำลองสัตว์ได้[ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]
ปฏิสัมพันธ์
มีการค้นพบว่านิวคลีโอลินมีปฏิกิริยากับ:
อ่านเพิ่มเติม
- Tuteja R, Tuteja N (1999). "นิวคลีโอลิน: ฟอสโฟโปรตีนนิวคลีโอลาร์หลักที่มีหน้าที่หลากหลาย". บทวิจารณ์เชิงวิเคราะห์ในชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล 33 ( 6): 407– 36. doi : 10.1080/10409239891204260 . PMID 9918513 .
- Pasternack MS, Bleier KJ, McInerney TN (สิงหาคม 1991). "การจับกันของ Granzyme A กับโปรตีนเป้าหมายของเซลล์ Granzyme A จับกับและตัดนิวคลีโอลินในหลอดทดลอง"วารสารเคมีชีวภาพ 266 ( 22): 14703– 8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98743-0 . PMID 1860869 .
- Belenguer P, Caizergues-Ferrer M, Labbé JC, Dorée M, Amalric F (กรกฎาคม 1990). "การฟอสโฟรีเลชันของนิวคลีโอลินเฉพาะในระยะไมโทซิสโดยโปรตีนไคเนส p34cdc2" . Molecular and Cellular Biology . 10 (7): 3607– 18. doi : 10.1128/MCB.10.7.3607 . PMC 360797 . PMID 2192260 .
- Srivastava M, Fleming PJ, Pollard HB, Burns AL (มิถุนายน 1989). "การโคลนและการจัดลำดับ cDNA ของนิวคลีโอลินของมนุษย์" FEBS Letters 250 ( 1): 99– 105. doi : 10.1016/0014-5793(89)80692-1 . PMID 2737305 . S2CID 8690886 .
- Tuteja N, Huang NW, Skopac D, Tuteja R, Hrvatic S, Zhang J, Pongor S, Joseph G, Faucher C, Amalric F (ก.ค. 1995) "DNA helicase IV ของมนุษย์คือนิวคลีโอลิน ซึ่งเป็น RNA helicase ที่ถูกมอดูเลตโดยฟอสโฟรีเลชั่น" ยีน . 160 (2): 143– 8. ดอย : 10.1016/0378-1119(95)00207-M . PMID 7642087 .
- Jordan P, Heid H, Kinzel V, Kübler D (ธันวาคม 1994). "โปรตีนหลักที่อยู่บนพื้นผิวเซลล์ซึ่งเป็นสารตั้งต้นของเอนไซม์ไคเนสนอกเซลล์เป็นโฮโมล็อกของโปรตีนนิวเคลียร์ที่รู้จัก" Biochemistry . 33 (49): 14696– 706. doi : 10.1021/bi00253a007 . PMID 7993898 .
- Nicoloso M, Caizergues-Ferrer M, Michot B, Azum MC, Bachellerie JP (ก.ย. 1994). "U20 ซึ่งเป็น RNA นิวคลีโอลาร์ขนาดเล็กชนิดใหม่ ถูกเข้ารหัสในอินทรอนของยีนนิวคลีโอลินในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม" . Molecular and Cellular Biology . 14 (9): 5766– 76. doi : 10.1128/mcb.14.9.5766 . PMC 359102 . PMID 8065311 .
- Ishikawa F, Matunis MJ, Dreyfuss G, Cech TR (กรกฎาคม 1993). "โปรตีนนิวเคลียร์ที่จับกับลำดับไซต์การตัดต่อ 3' ของ pre-mRNA r(UUAG/G) และลำดับ DNA เทโลเมียร์ของมนุษย์ d(TTAGGG)n" . Molecular and Cellular Biology . 13 (7): 4301– 10. doi : 10.1128/MCB.13.7.4301 . PMC 359985 . PMID 8321232 .
- Eggert M, Möws CC, Tripier D, Arnold R, Michel J, Nickel J, Schmidt S, Beato M, Renkawitz R (ธันวาคม 1995). "เศษส่วนที่อุดมไปด้วยโปรตีนที่ทำปฏิกิริยากับตัวรับกลูโคคอร์ติคอยด์ชนิดใหม่กระตุ้นการถอดรหัสที่ขึ้นอยู่กับตัวรับในหลอดทดลอง"วารสารชีวเคมี 270 ( 51): 30755– 9. doi : 10.1074/jbc.270.51.30755 . PMID 8530516 . S2CID 25642912 .
- Bharti AK, Olson MO, Kufe DW, Rubin EH (ม.ค. 1996). "การระบุตำแหน่งการจับนิวคลีโอลินในโทโปไอโซเมอเรส I ของมนุษย์"วารสารเคมีชีวภาพ 271 ( 4): 1993– 7. doi : 10.1074/jbc.271.4.1993 . PMID 8567649 . S2CID 25059254 .
- Li YP, Busch RK, Valdez BC, Busch H (เมษายน 1996). "C23 มีปฏิสัมพันธ์กับ B23 ซึ่งเป็นโปรตีนที่คาดว่าทำหน้าที่จับสัญญาณกำหนดตำแหน่งนิวคลีโอลัส"วารสารชีวเคมีแห่งยุโรป237 (1): 153– 8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0153n.x . PMID 8620867 .
- Li D, Dobrowolska G, Krebs EG (มิถุนายน 1996). "การเชื่อมโยงทางกายภาพของเคซีนไคเนส 2 กับนิวคลีโอลิน"วารสารเคมีชีวภาพ 271 ( 26): 15662– 8. doi : 10.1074/jbc.271.26.15662 . PMID 8663258 . S2CID 10750338 .
- Zhou G, Seibenhener ML, Wooten MW (ธันวาคม 1997). "นิวคลีโอลินเป็นสารตั้งต้นของโปรตีนไคเนส C-zeta การเชื่อมต่อระหว่างการส่งสัญญาณที่ผิวเซลล์และนิวเคลียสในเซลล์ PC12"วารสารชีวเคมี272 ( 49): 31130– 7. doi : 10.1074/jbc.272.49.31130 . PMID 9388266 .
- Haluska P, Saleem A, Edwards TK, Rubin EH (เมษายน 1998). "ปฏิสัมพันธ์ระหว่างปลาย N ของเอนไซม์โทโปไอโซเมอเรส I ของมนุษย์และแอนติเจน T ขนาดใหญ่ของ SV40" . Nucleic Acids Research . 26 (7): 1841– 7. doi : 10.1093/nar/26.7.1841 . PMC 147454 . PMID 9512561 .
- Borggrefe T, Wabl M, Akhmedov AT, Jessberger R (กรกฎาคม 1998). "คอมเพล็กซ์การรวมตัวใหม่ของ DNA ที่จำเพาะต่อเซลล์ B"วารสารเคมีชีวภาพ 273 ( 27): 17025– 35. doi : 10.1074/jbc.273.27.17025 . PMID 9642267 . S2CID 24347735 .
- ลารูเซีย เอส, กอนซาเลซ-รูบิโอ ซี, กัมโบรเนโร อาร์, บัลลู บี, โบไนย์ พี, โลเปซ-กรานาโดส อี, บูเวต์ พี, ฟอนตัน จี, เฟรสโน เอ็ม, โลเปซ-ตราสคาซ่า เอ็ม (พ.ย. 1998) "การยึดเกาะของเซลล์เป็นสื่อกลางโดยปัจจัย J ซึ่งเป็นตัวยับยั้งส่วนเสริม หลักฐานการมีส่วนร่วมของนิวคลีโอลิน " วารสารเคมีชีวภาพ . 273 (48): 31718– 25. ดอย : 10.1074/jbc.273.48.31718 . PMID9822633 . S2CID 8004314 .
- Parada CA, Roeder RG (กรกฎาคม 1999). "คอมเพล็กซ์ที่มี RNA polymerase II แบบใหม่ช่วยเสริมศักยภาพการถอดรหัส HIV-1 ที่ได้รับการเสริมด้วย Tat"วารสารEMBO 18 ( 13): 3688– 701. doi : 10.1093/emboj/18.13.3688 . PMC 1171446 . PMID 10393184 .
