วิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึกคือ การนำบันทึกหลักทั้งหมดของโครงการวิจัยไปเผยแพร่ทางออนไลน์อย่างเปิดเผยทันทีที่บันทึกเสร็จสมบูรณ์ ซึ่งเกี่ยวข้องกับการนำสมุดบันทึกส่วนตัวหรือสมุดบันทึก ห้อง ปฏิบัติการของนักวิจัยไปไว้บนออนไลน์พร้อมกับข้อมูลดิบและข้อมูลที่ผ่านการประมวลผลทั้งหมด รวมถึงเอกสารที่เกี่ยวข้องทั้งหมด เมื่อมีการสร้างเอกสารเหล่านั้นขึ้นมา แนวทางนี้สามารถสรุปได้ด้วยสโลแกนที่ว่า 'ไม่มีข้อมูลภายใน' ถือเป็น แนวทาง ที่โปร่งใสอย่างถึงที่สุดสำหรับการวิจัย และรวมถึงการเปิดเผยข้อมูลการทดลองที่ล้มเหลว มีความสำคัญน้อยกว่า และไม่ได้ตีพิมพ์ ซึ่งเรียกว่า 'ข้อมูลมืด' ^{[ 1 ]}แม้ว่าการปฏิบัติวิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึกจะไม่ใช่เรื่องปกติในแวดวงวิชาการแต่ก็ได้รับความสนใจอย่างมากในช่วงไม่นานมานี้ในสื่อการวิจัย^{[ 2 ] [ 3 ]}และสื่อทั่วไป^{[ 1 ] [ 4 ]}ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของแนวโน้มทั่วไปที่มุ่งไปสู่แนวทางที่เปิดกว้างมากขึ้นในการปฏิบัติและการตีพิมพ์งานวิจัย ดังนั้น วิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึกจึงสามารถอธิบายได้ว่าเป็นส่วนหนึ่งของ การเคลื่อนไหว วิทยาศาสตร์แบบเปิด ที่กว้างขึ้น ซึ่งรวมถึงการสนับสนุนและการนำการเผยแพร่แบบเปิด การเปิดเผยข้อมูลการระดมข้อมูลจาก ฝูงชน และวิทยาศาสตร์ของพลเมือง มา ใช้ ได้รับแรงบันดาลใจส่วนหนึ่งจากความสำเร็จของซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ส^{[ 5 ]}และนำแนวคิดหลายอย่างมาใช้

คำว่า "วิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึก" ^{[ 6 ]}ถูกใช้ครั้งแรกในปี 2549 ในโพสต์บล็อกโดยJean-Claude Bradleyซึ่งเป็นรองศาสตราจารย์ด้านเคมีที่มหาวิทยาลัย Drexelในขณะนั้น Bradley อธิบายวิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึกดังนี้: ^{[ 7 ]}

...มี URL ที่เชื่อมไปยังสมุดบันทึกการทดลองซึ่งสามารถเข้าถึงได้ฟรีและถูกจัดทำดัชนีในเครื่องมือค้นหาทั่วไป ไม่จำเป็นต้องมีลักษณะเหมือนสมุดบันทึกกระดาษ แต่สิ่งสำคัญคือข้อมูลทั้งหมดที่มีให้แก่ผู้วิจัยเพื่อสรุปผลนั้นจะต้องสามารถเข้าถึงได้โดยคนทั่วโลกเช่นกัน

• Aled Edwards และเพื่อนร่วมงาน มหาวิทยาลัยโทรอนโต^{[ 8 ]}
• เรเชล ฮาร์ดิง^{[ 9 ] [ 10 ]}นักวิจัยหลังปริญญาเอกของStructural Genomics Consortium (SGC) มหาวิทยาลัยโทรอน โต
  • บล็อกที่http://labscribbles.com/
  • ทวิตเตอร์@labscribbles
  • Zenodo https://zenodo.org/search?f=author&p=Rachel%20Harding&ln=en

"ทีมนักวิทยาศาสตร์ผู้บุกเบิกที่ SGC กำลังแบ่งปันสมุดบันทึกห้องปฏิบัติการของพวกเขาทางออนไลน์ " ^{[ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]}

• Nickolas J. LaSorte, ^{[ 14 ]}นักวิจัยหลังปริญญาเอกที่ FDA ในสาขาการอยู่ร่วมกันแบบไร้สาย
• ทามารา ไมอูริ^{[ 15 ]}
  • บล็อกที่https://raytruantlab.wordpress.com/
  • ทวิตเตอร์@tam_maiuri
  • Zenodo https://zenodo.org/search?page=1&size=20&q=maiuri
• Peter Murray-Rust , ^{[ 16 ]} Cambridge, สหราชอาณาจักร
• Anthony Salvagno, ^{[ 17 ]}ปริญญาเอก ผู้อำนวยการฝ่ายการศึกษาของ #SciFund Challenge
• Matthew H. Todd, มาลาเรียโอเพนซอร์ส^{[ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]}มหาวิทยาลัยคอลเลจลอนดอน (กลุ่ม Todd)
• ความท้าทายทางวิทยาศาสตร์สมุดบันทึกเปิด^{[ 21 ]}
• สามารถเยี่ยมชมโครงการสวนพฤกษศาสตร์ดิจิทัล (Digital Botanical Gardens Initiative หรือ DBGI) ได้ที่http://www.dbgi.org/dendron-dbgi/

• โทเบียส เจ. ออสบอร์น^{[ 22 ]}
• Carl Boettiger ทฤษฎีและการสร้างแบบจำลองเชิงคำนวณในนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการ^{[ 23 ] [ 24 ]}
• ดรอร์ บาร์-นาตัน^{[ 25 ]}
• Andrés G. Saravia ^{[ 26 ]}ปริญญาเอกฟิสิกส์ เป็นนักศึกษาที่Cinvestav- Mérida
• Daniel Himmelstein ซึ่งเป็นผู้นำโครงการ Rephetio ซึ่ง เป็นการศึกษา การนำยามาใช้ใหม่โดยใช้ GitHub และ Thinklab สำหรับวิทยาศาสตร์และการทำงานร่วมกันแบบเปิดสมุดบันทึกแบบเรียลไทม์^{[ 27 ]}

• Brigette Black ^{[ 28 ]} ), นักศึกษาปริญญาเอกสาขาฟิสิกส์ในห้องปฏิบัติการ Koch ที่มหาวิทยาลัยนิวเม็กซิโก
• ฌอง-คล็อด แบรดลีย์^{[ 29 ]}
• ศรัทธาเยเรมีย์^{[ 30 ]}
• Nadiezda Fernandez-Oropeza, ^{[ 31 ]}นักศึกษาปริญญาเอกสาขาวิศวกรรมชีวการแพทย์ในห้องปฏิบัติการ Koch ที่มหาวิทยาลัยนิวเม็กซิโก
• ไมค์ ลอว์เรนซ์
• Linh Le, ^{[ 32 ]}นักศึกษาปริญญาตรีสาขาฟิสิกส์และศิษย์เก่าของห้องปฏิบัติการ Koch ที่มหาวิทยาลัยนิวเม็กซิโก
• แอนดี้ มาโลนีย์^{[ 33 ]}นักวิจัยหลังปริญญาเอกในห้องปฏิบัติการสมิธที่มหาวิทยาลัยเท็กซัส ปริญญาเอกในห้องปฏิบัติการโคชที่มหาวิทยาลัยนิวเม็กซิโก (2011) ^{[ 34 ] [ 35 ]}
• คาเมรอน เนย์ลอน^{[ 36 ]}
• อเลฮานโดร ทามาโย^{[ 37 ]}
• ต้นกำเนิดและวิวัฒนาการของไข้หวัดใหญ่^{[ 38 ]}

• ห้องปฏิบัติการฟิสิกส์ระดับจูเนียร์ (307L) ที่มหาวิทยาลัยนิวเม็กซิโก^{[ 39 ]}

สิ่งเหล่านี้เป็นความคิดริเริ่มที่เปิดกว้างกว่าสมุดบันทึกห้องปฏิบัติการแบบดั้งเดิม แต่ขาดองค์ประกอบสำคัญสำหรับวิทยาศาสตร์สมุดบันทึกแบบเปิดอย่างสมบูรณ์ โดยปกติแล้วสมุดบันทึกจะถูกแบ่งปันเพียงบางส่วนหรือแบ่งปันโดยมีความล่าช้าอย่างมาก^{[ 40 ]}

• เครือข่าย Open Notebook Science Network ^{[ 41 ]}เป็นเครือข่ายบล็อก WordPress ที่ออกแบบมาเพื่อใช้ในการสร้างและดูแลสมุดบันทึกส่วนบุคคล/สมุดบันทึกห้องปฏิบัติการ ณ เดือนมกราคม 2018 ปัจจุบันมีสมาชิกที่ใช้งานอยู่ 126 คนในกลุ่มนี้^{[ 42 ]}
• Protocolpediaช่วยให้สามารถแบ่งปันและจัดเก็บโปรโตคอลของห้องปฏิบัติการได้
• Sci-Mateอนุญาตให้ผู้ใช้กำหนดสิทธิ์การเข้าถึงได้ แต่ก็สามารถใช้งานเป็นเครื่องมือสมุดบันทึกแบบเปิดได้เช่นกัน
• Vinod Scaria ^{[ 43 ]}
• OpenWetWare (เป็นแหล่งรวมห้องปฏิบัติการจำนวนมาก และอนุญาตให้มีการแบ่งปันข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับแต่ละกลุ่มวิจัยได้อย่างเลือกสรร)
• คาเลบ มอร์ส^{[ 44 ]}
• กัส โรซาเนีย^{[ 45 ]}
• แอนโทนี การ์เร็ตต์ ลิซี^{[ 46 ]}
• Rosie Redfield ^{[ 47 ]}นักจุลชีววิทยาที่มหาวิทยาลัยบริติชโคลัมเบีย; ผลลัพธ์ทั้งหมดได้รับการกล่าวถึง แต่สมุดบันทึกการทดลองดิบไม่ได้ถูกเปิดเผย
• มาร์ติน จอห์นสัน^{[ 48 ]}นักเคมีทางทะเลที่มหาวิทยาลัยอีสต์แองเกลีย^{[ 49 ]}
• เกร็ก แลง^{[ 50 ]}นักวิจัยหลังปริญญาเอกในห้องปฏิบัติการของเดวิด บอทสไตน์ที่มหาวิทยาลัยพรินซ์ตัน^{[ 51 ]} - แบ่งปันประมาณสัปดาห์ละครั้ง

สมุดบันทึกห้องปฏิบัติการสาธารณะทำให้สะดวกในการอ้างอิงตัวอย่างการทดลองที่ใช้เพื่อสนับสนุนข้อโต้แย้งในบทความ ตัวอย่างเช่น ในบทความเกี่ยวกับการเพิ่มประสิทธิภาพปฏิกิริยาUgi [ ^{52 ] [ 53 ] มีการใช้ผลิตภัณฑ์สามชุดที่แตกต่างกันใน การ}กำหนดลักษณะ และสเปกตรัมแต่ละรายการจะอ้างอิงถึงการทดลองเฉพาะที่ใช้ผลิตภัณฑ์แต่ละชุด ได้แก่ EXP099 ^{[ 54 ]} EXP203 ^{[ 55 ]}และ EXP206 ^{[ 56 ]}งานนี้ได้รับการตีพิมพ์ในวารสาร Journal of Visualized Experiments ในเวลาต่อมา [ ^{57 ]}ซึ่งแสดงให้เห็นว่าความสมบูรณ์ของแหล่งที่มา ของข้อมูล สามารถรักษาไว้ได้ตั้งแต่สมุดบันทึกห้องปฏิบัติการจนถึงการตีพิมพ์ขั้นสุดท้ายในวารสารที่ได้รับการตรวจสอบโดยผู้ทรง ^{คุณวุฒิ}

หากไม่มีคุณสมบัติเพิ่มเติม Open Notebook Science หมายความว่าการวิจัยกำลังถูกรายงานอย่างต่อเนื่องโดยไม่มีความล่าช้าหรือการกรองที่ไม่สมเหตุสมผล ซึ่งช่วยให้ผู้อื่นเข้าใจได้อย่างแน่ชัดว่าการวิจัยเกิดขึ้นจริงอย่างไรในสาขาหรือกลุ่มวิจัยเฉพาะ ข้อมูลดังกล่าวอาจมีค่าสำหรับผู้ร่วมงาน นักศึกษาในอนาคต หรือนายจ้างในอนาคต การให้สิทธิ์เข้าถึงหน้าสมุดบันทึกที่เลือกไว้หรือการแทรกช่วงเวลาห้ามเผยแพร่จะไม่สอดคล้องกับความหมายของคำว่า "เปิด" ในบริบทนี้ เว้นแต่จะมีการรายงานการแก้ไขข้อผิดพลาด การทดลองที่ล้มเหลว และผลลัพธ์ที่ไม่ชัดเจน ผู้สังเกตการณ์ภายนอกจะไม่สามารถเข้าใจได้อย่างแน่ชัดว่าวิทยาศาสตร์กำลังดำเนินการอย่างไร คำต่างๆ เช่น Pseudo ^{[ 58 ]} หรือ Partial ^{[ 40 ]} ถูกใช้เป็นคุณสมบัติสำหรับการแบ่งปันข้อมูลสมุดบันทึกห้องปฏิบัติการในลักษณะที่เลือกไว้หรือด้วยความล่าช้าอย่างมีนัยสำคัญ

ข้อโต้แย้งเกี่ยวกับการนำวิทยาศาสตร์แบบเปิดเผยมาใช้ แบ่งออกเป็นสามประเภทหลัก ซึ่งมีความสำคัญแตกต่างกันในสาขาวิทยาศาสตร์ต่างๆ ข้อกังวลหลัก โดยเฉพาะอย่างยิ่งจากนักวิทยาศาสตร์ชีวภาพและนักวิทยาศาสตร์การแพทย์ คือเรื่อง ' การขโมยข้อมูล ' หรือ 'การถูกแย่งผลงาน' แม้ว่าระดับที่กลุ่มวิจัยขโมยหรือดัดแปลงผลงานวิจัยของผู้อื่นยังคงเป็นหัวข้อถกเถียงกันอยู่ แต่ก็เป็นที่แน่นอนว่าความกลัวที่จะไม่ได้ตีพิมพ์ผลงานก่อนใครเป็นแรงผลักดันให้เกิดพฤติกรรมต่างๆ มากมาย โดยเฉพาะในบางสาขา ซึ่งเกี่ยวข้องกับการให้ความสำคัญกับบทความวิจัยที่ได้รับการตีพิมพ์ในวารสารวิชาการที่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิ ซึ่งถือเป็นตัวชี้วัดหลักของความสำเร็จในอาชีพการงาน

ข้อโต้แย้งประการที่สองที่ยกขึ้นมาต่อต้านวิทยาศาสตร์สมุดบันทึกแบบเปิดคือ ถือเป็นการตีพิมพ์ก่อนหน้า ซึ่งทำให้ไม่สามารถจดสิทธิบัตร ได้ และยากที่จะตีพิมพ์ผลลัพธ์ในวารสารวิชาการแบบดั้งเดิมที่มีผู้ทรงคุณวุฒิตรวจสอบ ในส่วนของสิทธิบัตร การตีพิมพ์บนเว็บจัดเป็นการเปิดเผยข้อมูล อย่างชัดเจน ดังนั้น แม้จะมีข้อโต้แย้งเกี่ยวกับคุณค่าของสิทธิบัตร และแนวทางที่หลีกเลี่ยงปัญหานี้ แต่ก็ชัดเจนว่าวิทยาศาสตร์สมุดบันทึกแบบเปิดไม่เหมาะสมสำหรับการวิจัยที่คาดหวังและต้องการการคุ้มครองสิทธิบัตร ในส่วนของการตีพิมพ์ในวารสารวิชาการที่มีผู้ทรงคุณวุฒิตรวจสอบนั้น กรณีนี้ไม่ชัดเจนนัก ผู้จัดพิมพ์วารสารวิทยาศาสตร์ส่วนใหญ่ยอมรับเนื้อหาที่เคยนำเสนอในการประชุมหรือในรูปแบบของเอกสารก่อนตีพิมพ์ ผู้จัดพิมพ์ที่ยอมรับเนื้อหาที่เคยตีพิมพ์ในรูปแบบเหล่านี้โดยทั่วไปได้ระบุอย่างไม่เป็นทางการว่าการตีพิมพ์ข้อมูลบนเว็บ รวมถึงวิทยาศาสตร์สมุดบันทึกแบบเปิด จัดอยู่ในประเภทนี้ โครงการสมุดบันทึกแบบเปิดได้รับการตีพิมพ์ในวารสารวิชาการที่มีผู้ทรงคุณวุฒิตรวจสอบที่มีปัจจัยผลกระทบ สูง ^{[ 59 ] [ 60 ]}แต่ยังไม่ได้ทดสอบกับผู้จัดพิมพ์จำนวนมาก เป็นที่คาดการณ์ได้ว่าสำนักพิมพ์ที่ระบุอย่างชัดเจนว่าไม่รับพิจารณาผลงานก่อนตีพิมพ์ในรูปแบบดังกล่าว จะไม่รับพิจารณาผลงานที่เคยเปิดเผยในสมุดบันทึกแบบเปิดมาก่อน

ข้อโต้แย้งประการที่สามที่ยกขึ้นมาคัดค้านวิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึกคือ การที่มันบั่นทอนความเป็นอิสระของการวิจัยที่แข่งขันกัน และอาจส่งผลให้ขาดการตรวจสอบผลลัพธ์อย่างอิสระที่สำคัญทั้งหมด นี่ไม่ใช่การขโมยข้อมูล แต่เป็นความเป็นไปได้ที่ละเอียดอ่อนกว่ามาก คือการปล่อยให้ข้อมูลที่กำลังพัฒนาไปพร้อมกันมีอิทธิพลต่อกันและกัน ในวิทยาศาสตร์แบบดั้งเดิม การทำงานร่วมกันเชิงทดลองขนาดใหญ่มักจะกำหนดกฎไฟร์วอลล์เพื่อป้องกันการสื่อสารระหว่างสมาชิกของการทำงานร่วมกันที่แข่งขันกัน เพื่อป้องกันไม่เพียงแต่การรั่วไหลของข้อมูลเท่านั้น แต่ยังรวมถึงการมีอิทธิพลต่อวิธีการวิเคราะห์ข้อมูลด้วย

ประเด็นสุดท้ายเกี่ยวข้องกับปัญหา "ข้อมูลล้นทะลัก" หากปริมาณงานวิจัยที่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิในปัจจุบันมีมากเกินกว่าที่คนๆ เดียวจะจัดการได้ แล้วจะคาดหวังให้ใครรับมือกับข้อมูลที่ไม่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิจำนวนมหาศาลที่อาจมีอยู่ได้อย่างไร โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อข้อมูลบางส่วน หรืออาจจะส่วนใหญ่ มีคุณภาพต่ำ? ข้อโต้แย้งที่เกี่ยวข้องอีกประการหนึ่งคือ "สมุดบันทึกของฉันเฉพาะเจาะจงเกินไป" จนอาจไม่เป็นที่สนใจของผู้อื่น คำถามเกี่ยวกับวิธีการค้นหาข้อมูลที่มีคุณภาพสูงและเกี่ยวข้องจึงเป็นประเด็นที่เกี่ยวข้อง ปัญหาของการคัดกรองและตรวจสอบความถูกต้องของข้อมูลและคุณภาพของวิธีการวิจัยเป็นปัญหาที่สำคัญและอาจมีความเกี่ยวข้องนอกเหนือจากวิทยาศาสตร์แบบเปิดสมุดบันทึก แต่เป็นความท้าทายอย่างยิ่งในที่นี้

การแข่งขัน Open Notebook Science Challenge [ ^{61 ]}ซึ่งปัจจุบันมุ่งเน้นไปที่การรายงานการวัดค่าการละลายในตัวทำละลายที่ไม่ใช่น้ำ ได้รับการสนับสนุนจากSubmeta [ ^{62 ]} Nature ^{[ 63 ]}และSigma-Aldrich [ ^{64 ] ผู้ชนะ คนแรกจากทั้งหมดสิบ คน} ของการแข่งขันประจำเดือนธันวาคม 2008 คือ Jenny Hale ^{[ 65 ]}

สามารถใช้โลโก้บนสมุดบันทึกเพื่อระบุเงื่อนไขการแบ่งปัน สมุดบันทึกที่เปิดอย่างสมบูรณ์จะถูกทำเครื่องหมายเป็น "เนื้อหาทั้งหมด" และ "เข้าถึงได้ทันที" สมุดบันทึกที่เปิดบางส่วนสามารถทำเครื่องหมายเป็น "เนื้อหาที่เลือก" และ/หรือ "เข้าถึงได้ล่าช้า" ^{[ 66 ]}

• การเข้าถึงแบบเปิด (การเผยแพร่)
• ข้อมูลเปิด
• การวิจัยแบบเปิด
• เนื้อหาเปิด
• วิทยาศาสตร์แบบเปิด
• โอเพนซอร์ส