ด้วยความสัมพันธ์ที่ดีของเขา ในปี 1919 ไมส์เนอร์ได้ดำรงตำแหน่งที่ปรึกษาชั่วคราวใน "สำนักประธานาธิบดีแห่งไรช์ " ซึ่งในขณะนั้นคือฟรีดริช เอเบิร์ต จากพรรคสังคมประชาธิปไตย และภายในวันที่ 1 เมษายน 1920 ไมส์เนอร์ก็ได้เลื่อนตำแหน่งขึ้นเป็นผู้อำนวยการฝ่ายรัฐมนตรีและหัวหน้าสำนัก เอเบิร์ตได้เลื่อนตำแหน่งไมส์เนอร์ขึ้นเป็นเลขาธิการแห่งรัฐ ( Staatssekretär ) ในเดือนพฤศจิกายน 1923

ไมส์เนอร์ยังคงดำรงตำแหน่งเลขาธิการแห่งรัฐต่อไปเมื่อพอล ฟอน ฮินเดนเบิร์กได้รับเลือกเป็นผู้สืบทอดตำแหน่งต่อจากเอเบิร์ตในปี 1925 ไมส์เนอร์ซึ่งอาศัยอยู่กับครอบครัวในพระราชวังของประธานาธิบดีเยอรมันระหว่างปี 1929 ถึง 1939 มีอิทธิพลอย่างมากต่อประธานาธิบดี โดยเฉพาะอย่างยิ่งฮินเดนเบิร์ก ร่วมกับเคิร์ต ฟอน ชไลเชอร์และคนอื่นๆ อีกไม่กี่คน ไมส์เนอร์ได้ผลักดันการยุบระบบรัฐสภาโดยผ่านคณะรัฐมนตรีพลเรือนของประธานาธิบดีในปี 1929 และ 1930

บทบาทของเขาในการแต่งตั้งฮิตเลอร์เป็นนายกรัฐมนตรีระหว่างเดือนธันวาคม 1932 ถึงมกราคม 1933 ยังคงเป็นข้อถกเถียงในหมู่นักประวัติศาสตร์ ในฐานะสมาชิกของ " คามาริลลา " เมสเนอร์มีอิทธิพลไม่น้อยในตำแหน่งรัฐมนตรีต่างประเทศเนื่องจากความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับฮินเดนเบิร์ก ร่วมกับออสการ์ ฟอน ฮินเดนเบิร์กและฟรานซ์ ฟอน พาเพนเมสเนอร์ได้จัดการเจรจากับฮิตเลอร์เพื่อปลดฟอน ชไลเชอร์และแต่งตั้งฮิตเลอร์เป็นนายกรัฐมนตรี สำหรับฝ่ายนาซี การเจรจาได้รับการอำนวยความสะดวกโดยวิลเฮล์ม เคปเปลอ ร์ โยอาคิม ฟอน ริบเบนทรอปและนายธนาคารเคิร์ต ไฟรเฮอร์ ฟอน ชโรเดอร์อดีตเจ้าหน้าที่และหัวหน้าของ "เฮอร์เรนคลับ" (สโมสรสุภาพบุรุษ) กลุ่มอนุรักษ์นิยมเก่าแก่ในเบอร์ลิน ซึ่งฟอน พาเพนก็มีบทบาทอยู่ด้วย ณ สิ้นปี 1932 ทั้งฮิตเลอร์และฮินเดนเบิร์กคงไม่ริเริ่มติดต่อกัน เนื่องจากความไม่ชอบหน้ากันอย่างรุนแรงของทั้งสองฝ่าย

ไมส์เนอร์ยื่นใบลาออกในปี 1933 แต่ถูกปฏิเสธ

เมื่อฮิตเลอร์รวมหน้าที่ของประมุขแห่งรัฐ (ประธานาธิบดี) และหัวหน้าฝ่ายบริหาร (นายกรัฐมนตรี) เข้าด้วยกันในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2477 สำนักงานของไมส์เนอร์จึงถูกเปลี่ยนชื่อเป็น "สำนักนายกรัฐมนตรี" และจำกัดความรับผิดชอบเฉพาะเรื่องการเป็นตัวแทนและพิธีการตามแบบแผน ในขณะที่เรื่องทางการเมืองอื่นๆ ทั้งหมดถูกมอบหมายให้สำนักนายกรัฐมนตรีไรช์ภายใต้การกำกับดูแลของฮันส์ แลมเมอร์ส ไมส์เนอร์ยังได้รับแต่งตั้งให้เป็นสมาชิกของสถาบันกฎหมายเยอรมันด้วย [ ^{2 ] เพื่อ}เป็นการฉลองครบรอบ 4 ปีของระบอบนาซีในวันที่ 30 มกราคม พ.ศ. 2480 ฮิตเลอร์ได้มอบตราพรรคทองคำให้แก่สมาชิกที่ไม่ใช่นาซีหลายคนในรัฐบาลไรช์ รวมถึงไมส์เนอร์ด้วย (หมายเลขสมาชิก 3,805,235) ^{[ 3 ]}ในวันที่ 1 ธันวาคม พ.ศ. 2480 ไมส์เนอร์ได้รับการเลื่อนตำแหน่งเป็นรัฐมนตรีแห่งรัฐ(Staatsminister)และหัวหน้าของ "สำนักนายกรัฐมนตรีของฟือเรอร์และนายกรัฐมนตรี" ซึ่งเปลี่ยนชื่ออีกครั้ง เขาได้รับสถานะเทียบเท่ากับรัฐมนตรีแห่งไรช์แต่ไม่มีตำแหน่ง^{[ 4 ]}

หลังสงครามโลกครั้งที่สองเมสเนอร์ถูกฝ่ายสัมพันธมิตรจับกุมและสอบปากคำในฐานะพยานระหว่างการพิจารณาคดีนูเรมเบิร์กในเดือนกรกฎาคม ปี 1947 เขาปรากฏตัวในฐานะพยาน ให้การสนับสนุน อดีตรัฐมนตรีช่วยว่าการฟรานซ์ ชเลเกลเบอร์ เกอร์ ผู้ถูกกล่าวหา เมสเนอร์ถูกดำเนินคดีในที่สุดในคดีวิลเฮล์มสตราสเซแต่ศาลตัดสินให้เขาพ้นผิดในวันที่ 14 เมษายน สองปีต่อมา ในเดือนพฤษภาคม ปี 1949 เขาถูกกล่าวหาอีกครั้ง คราวนี้ในมิวนิก และถูกตัดสินว่าเป็นผู้ร่วมขบวนการการอุทธรณ์ของเขาถูกปฏิเสธ แต่การดำเนินคดีถูกระงับในเดือนมกราคม ปี 1952

ในปี ค.ศ. 1950 ไมส์เนอร์ได้ตีพิมพ์บันทึกความทรงจำเกี่ยวกับอาชีพข้าราชการที่ไม่ธรรมดาของเขาในหนังสือชื่อ " รัฐมนตรีช่วยว่าการภายใต้เอเบิร์ต ฮินเดนเบิร์ก และฮิตเลอร์"ผู้เขียนคือฮันส์-ออตโต ไมส์เนอร์ (ค.ศ. 1909-1992) ซึ่งเป็นบุตรชายของเขา