พีพีไอบี
โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 1CYN , 3ICH , 3ICI
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	PPIB , CYP-S1, CYPB, HEL-S-39, OI9, SCYLP, peptidylprolyl isomerase B, B
รหัสภายนอก	โอมิม : 123841 ; เอ็มจีไอ : 97750 ; โฮโมโลยีน : 726 ; GeneCards : PPIB ; OMA : PPIB - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 15 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 15q22.31 เริ่ม 64,155,740 bp [ 1 ] จบ 64,163,134 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 9 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 9|9 C เริ่ม 65,967,504 bp [ 2 ] จบ 65,973,905 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน เซลล์สโตรมัลของเยื่อบุโพรงมดลูก คอร์ปัส เอพิไดดิมิส ส่วนหัวของท่ออสุจิ ต่อมไทรอยด์กลีบขวา ต่อมใต้สมองส่วนหน้า ถุงน้ำอสุจิ ต่อมไทรอยด์กลีบซ้าย ต่อมน้ำลายพาโรติด ส่วนหางของท่ออสุจิ เยื่อหุ้มหัวใจ สูงสุดที่แสดงใน หลอดเลือดแดงแคโรติดภายนอก หลอดเลือดแดงแคโรติดภายใน เยื่อบุผิวรับความรู้สึกเวสติบูลาร์ ฟอสซ่า ท่ออสุจิ คอนไดล์ เซลล์บุผนังหลอดน้ำเหลือง เซลล์พาเนธ ยูทริเคิล ท่อส่งน้ำอสุจิ ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอ GPS ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับตัวของคอลลาเจน การจับโปรตีนที่คลายตัว การจับเชิงซ้อนที่มีโปรตีน กิจกรรมไอโซเมอเรส การจับโปรตีน การจับของ RNA โพลีเมอเรส การจับกับ RNA กิจกรรมของเอนไซม์เปปทิดิล-โพรลิล ซิส-ทรานส์ ไอโซเมอเรส การจับกับไซโคลสปอริน เอ ส่วนประกอบของเซลล์ สารประกอบที่มีโปรตีน ช่องว่างภายในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม เมมเบรน การยึดเกาะเฉพาะจุด เมลาโนโซม เอนโดพลาสมิกเรติคูลัมเรียบ คอมเพล็กซ์ชาเปอโรนของเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม เอนโดพลาสมิกเรติคูลัม บริเวณไซโตพลาซึมรอบนิวเคลียส เอ็กโซโซมนอกเซลล์ นิวเคลียส กระบวนการทางชีวภาพ การทำให้โปรตีนคงตัว การควบคุมการดัดแปลงโปรตีนหลังการสังเคราะห์ ไอโซเมอไรเซชันของโปรตีนเปปทิดิล-โพรลิล การควบคุมเชิงบวกโดยโฮสต์ต่อการจำลองแบบจีโนมของไวรัส การควบคุมเชิงบวกโดยโฮสต์ของกระบวนการไวรัส การพับตัวของโปรตีน การควบคุมเชิงบวกของการเจริญเติบโตของสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ การพัฒนาของกระดูก การพับโปรตีนโดยอาศัยชาเปอโรน การพับโปรตีนใหม่ แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 5479 19035 วงดนตรี ENSG00000166794 เอนมัสจี00000032383 ยูนิโปรท พี23284 พี24369 RefSeq (mRNA) NM_000942 NM_011149 RefSeq (โปรตีน) NP_000933 NP_035279 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 15: 64.16 – 64.16 Mb Chr 9: 65.97 – 65.97 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

เปปทิดิล-โพรลิล ซิส-ทรานส์ ไอโซเมอเรส บีเป็นเอนไซม์ที่ถูกเข้ารหัสโดยยีนPPIB ^{[ 5 ]} ในฐานะสมาชิกของตระกูลเปปทิดิล-โพรลิล ซิส-ทรานส์ ไอโซเมอเรส (PPIase) โปรตีนนี้จะเร่งปฏิกิริยา ไอโซเมอไร เซชันแบบซิส-ท รานส์ ของพันธะเปปไทด์ โพรลีนอิมิดิก ซึ่งทำให้สามารถควบคุมการพับตัวของโปรตีนคอลลาเจนชนิดที่ 1ได้^{[ 6 ] [ 7 ]}โดยทั่วไป PPIase พบได้ในยูแบคทีเรียและยูคาริโอต ทั้งหมด รวมถึงอาร์เคแบคทีเรีย บางชนิด ดังนั้นจึงมีการอนุรักษ์ไว้อย่างสูง

เช่นเดียวกับ ไซโคลฟิลินอื่นๆPPIB สร้างโครงสร้าง β-barrel ที่มี แกน ไฮโดรโฟบิกโครงสร้าง β-barrel นี้ประกอบด้วยβ-strand ขนานกัน 8 เส้น และปิดด้วยα-helix 2 เส้น ที่ด้านบนและด้านล่าง นอกจากนี้ β-turn และลูปใน β-strand ยังช่วยให้โครงสร้าง β-barrel มีความยืดหยุ่น^{[ 8 ]}โดยเฉพาะอย่างยิ่ง PPIB เป็นโปรตีนขนาด 21 kDa ซึ่งมี โมทีฟการกักเก็บ ER ที่ปลาย C-terminalที่นำทางโปรตีนไปยังออร์แกเนลล์ ER ในขณะที่ ส่วนขยายที่ ปลาย N-terminalจะยึดโปรตีนเข้ากับสารตั้งต้น^{[ 7 ] [ 9 ]}

PPIB เป็นสมาชิกของตระกูลเปปทิดิล-โพรลิล ซิส-ทรานส์ ไอโซเมอเรส ( PPIase ) PPIase ทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาไอโซเมอไรเซชันแบบซิส-ทรานส์ของพันธะเปปไทด์โพรลีนอิมิดิกและควบคุมการพับและการเจริญเติบโตของโปรตีน โพรลีนเป็นกรดอะมิโนเพียงชนิดเดียวที่ทราบว่ามีอัตราการไอโซเมอไรเซชัน ทั้งแบบ ซิสและทรานส์ในร่างกายและมักเป็นขั้นตอนที่จำกัดอัตราในการพับโปรตีนใหม่^{[ 10 ]}ตระกูล PPIase ยังแบ่งออกเป็นสามตระกูลย่อยที่มีโครงสร้างแตกต่างกัน ได้แก่ไซโคลฟิลิน (CyP), โปรตีนที่จับกับ FK506 ( FKBP ) และพาร์วูลิน (Pvn) ^{[ 11 ] [ 12 ]}แม้ว่าแต่ละตระกูลจะแสดงกิจกรรม PPIase แต่ตระกูลเหล่านี้ไม่มีลำดับโครงสร้างที่คล้ายคลึงกัน ในฐานะที่เป็นไซโคลฟิลิน PPIB จับกับไซโคลสปอริน A (CsA) และสามารถพบได้ภายในเซลล์หรือถูกหลั่งออกมาจากเซลล์^{[ 9 ] [ 13 ]}

PPIB เป็นไซโคลฟิลินตัวที่สองจากทั้งหมด 18 ตัวที่ถูกระบุในมนุษย์ ต่อจาก CypA ^{[ 11 ] [ 13 ]} PPIB อยู่ในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER) และมีส่วนร่วมในกระบวนการทางชีวภาพหลายอย่าง รวมถึงการเผาผลาญของ ไมโทคอน เดรีย อะพอ พ โทซิส รีดอก ซ์ และการอักเสบตลอดจนโรคและภาวะที่เกี่ยวข้อง เช่นการบาดเจ็บจากการขาดเลือดและ ฟื้นฟูเลือด โรคเอดส์และมะเร็ง^{[ 9 ] [ 14 ]} นอกจากนี้ยังเกี่ยวข้องกับการติดเชื้อ ไวรัส ในยูคาริโอต ไซโคลฟิลินจะกระจายอยู่ทั่วไปในเซลล์และเนื้อเยื่อหลายประเภท^{[ 9 ] [ 8 ]}นอกเหนือจากกิจกรรม PPIase และโปรตีนชา เปอโรนแล้ว ไซโคลฟิลินยังทำหน้าที่ในการเผาผลาญของไมโทคอนเดรีย อะพอพโทซิส การตอบสนองทางภูมิคุ้มกันการอักเสบและ การเจริญ เติบโตและการแพร่กระจายของเซลล์^{[ 6 ] [ 9 ] [ 8 ]}นอกจากPPICแล้ว PPIB ยังไปอยู่ที่เอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER) ซึ่งทำหน้าที่รักษาสมดุลรีดอกซ์ การลดลงของไซโคลฟิลินทั้งสองชนิดนี้จะนำไปสู่การเกิดไฮเปอร์ออกซิเดชันของ ER ^{[ 15 ]}

ใน ER, PPIB จะทำปฏิกิริยากับโปรตีนต่างๆ เช่น P3H1, CRTAP, BiP, GRP94, PDI และ calreticulin เพื่อสร้างคอมเพล็กซ์โฟลเดสและชาเปอโรน และอำนวยความสะดวกในการพับโปรตีน โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับคอลลาเจนชนิดที่ 1 ^{[ 16 ] [ 17 ]}โปรตีนนี้เป็น PPIase หลักสำหรับคอลลาเจนชนิดที่ 1 เนื่องจากคอลลาเจนมีโพรลีนจำนวนมากที่ต้องการไอโซเมอไรเซชันแบบซิส-ทรานส์เพื่อการพับที่เหมาะสม ดังนั้น PPIB จึงมีความสำคัญต่อการสังเคราะห์คอลลาเจนและการดัดแปลงหลังการแปล และส่งผลต่อการประกอบเส้นใย การเชื่อมโยงข้ามเมทริกซ์ และการสร้างแร่ธาตุในกระดูก^{[ 16 ]}

นอกจากนี้ โปรตีนนี้ยังเกี่ยวข้องกับเส้นทางการหลั่งและถูกปล่อยออกมาในของเหลวทางชีวภาพ โปรตีนนี้สามารถจับกับเซลล์ที่ได้มาจากทีลิมโฟไซต์และบีลิมโฟไซต์ และอาจควบคุมการกดภูมิคุ้มกันที่เกิดจากไซโคลสปอรินเอ^{[ 18 ]}ในการทดลองหนึ่ง การเติม PPIB ลงในเซลล์เพาะเลี้ยงในหลอดทดลองทำให้เกิดการเคลื่อนที่ของเซลล์และการยึดเกาะของเซลล์ทีกับเมทริกซ์นอกเซลล์ (ECM) ที่ เกิด จากอินทิกริน ซึ่งบ่งชี้ว่าอาจทำหน้าที่ในภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดโดยการดึงดูดเซลล์ทีเข้าสู่เนื้อเยื่อที่ติดเชื้อในร่างกาย^{[ 9 ]}

ในฐานะที่เป็นไซโคลฟิลิน PPIB จะจับกับยาต้านภูมิคุ้มกัน CsA เพื่อสร้างสารเชิงซ้อน CsA-ไซโคลฟิลิน จากนั้นจะไปจับกับแคลซิเนอรินเพื่อยับยั้งเส้นทางการส่งสัญญาณสำหรับการกระตุ้นเซลล์ T

ในเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ พบว่าไซโคลฟิลินถูกกระตุ้นด้วยความร้อนช็อกและภาวะขาดออกซิเจน-การได้รับออกซิเจนอีกครั้ง รวมถึงเกิดเป็นสารเชิงซ้อนกับโปรตีนช็อกความร้อนดังนั้น ไซโคลฟิลินอาจทำหน้าที่ปกป้องหัวใจในระหว่างการบาดเจ็บจากภาวะขาดเลือด-การได้รับเลือดกลับคืน^{[ 9 ]}

PPIB มีส่วนช่วยในการจำลองและการติดเชื้อของไวรัสที่ก่อให้เกิดโรคต่างๆ เช่นเอดส์ ไวรัสตับอักเสบซีโรคหัดและไข้หวัดใหญ่สายพันธุ์เอดังนั้น การกำหนดเป้าหมายการรักษาด้วย PPIB โดยใช้สารยับยั้งแบบเลือกเฉพาะอาจพิสูจน์ได้ว่ามีประสิทธิภาพในการต่อสู้กับการติดเชื้อไวรัสและการอักเสบ^{[ 7 ]}ปัจจุบัน PPIB ถูกนำมาใช้เป็นตัวบ่งชี้ทางชีวภาพสำหรับมะเร็งหลายชนิด^{[ 14 ]}นอกจากนี้ ยังมีอีพิโทปแอนติเจน สองชนิด (CypB84-92 และ CypB91-99) ที่ได้รับการจดจำโดย ลิมโฟไซต์ T ที่เป็นพิษต่อเซลล์ ซึ่ง ถูกจำกัดโดย HLA-A24 และจำเพาะต่อเนื้องอกซึ่งสามารถใช้เป็นวัคซีน มะเร็ง ได้ และในความเป็นจริง ได้ถูกนำมาใช้ในการรักษามะเร็งปอดในการทดลองทางคลินิก^{[ 9 ]}

PPIB ได้รับการระบุในทั้งแบคทีเรียแกรมลบและแบคทีเรียแกรมบวกว่าเป็นโปรตีนภายในเซลล์ ในEscherichia coliพบว่า PPIB มีทั้ง กิจกรรม PPIaseและกิจกรรมChaperone (โปรตีน) ^{[ 19 ]}ในStaphylococcus aureusพบว่า PPIB มีกิจกรรม PPIase และช่วยในการพับตัวใหม่ของStaphylococcal nucleaseโดยตรง^{[ 20 ]}นอกเหนือจากแบคทีเรียเหล่านี้แล้ว PPIB ยังได้รับการระบุในBrucella abortus , Mycobacterium tuberculosis , Bacillus subtilisและแบคทีเรียอื่นๆ^{[ 21 ] [ 22 ] [ 23 ]}

จากการศึกษาพบว่า PPIB มีปฏิกิริยากับสารต่างๆ ดังนี้:

• ^{อะโพ ลิ}โปโปรตีน บี [ ^{24 ]}
• P3H1 , ^{[ 17 ]}
• CRTAP , ^{[ 17 ]}
• BiP , ^{[ 16 ]}
• GRP94 , ^{[ 16 ]}
• PDI , ^{[ 16 ]}และ
• แคลเรติคูลิน^{[ 16 ]}

• ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : P23284 (Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B) ที่PDBe- KB