ซูเปอร์ไฟลัม PVC
| พีวีซี | |
|---|---|
 | |
| คลามิเดีย ทราโคมาติส | |
การจำแนกทางวิทยาศาสตร์ | |
| โดเมน: | แบคทีเรีย |
| อาณาจักร: | ซูโดโมนาดาติ |
| ซูเปอร์ไฟลัม: | "พีวีซี" |
| ไฟลา | |
| คำพ้องความหมาย | |
Planctobacteria Cavalier-Smith, 1987 [ 1 ] | |
PVC เป็นซูเปอร์ไฟลัมของแบคทีเรียที่ตั้งชื่อตามสมาชิกสำคัญสามกลุ่ม ได้แก่Planctomycetota , VerrucomicrobiotaและChlamydiota [ 2 ] [ 3 ] Cavalier - Smith ตั้งสมมติฐานว่าแบคทีเรีย PVC อาจสูญเสียหรือลดผนังเซลล์เพปติโดไกลแคนลงสองครั้ง[ 4 ]มีการตั้งสมมติฐานว่าสมาชิกในกลุ่ม PVC อาจเป็นเซลล์เจ้าบ้านในเหตุการณ์เอนโดซิม ไบโอติก ที่ก่อให้เกิดเซลล์โปรโตยูคาริโอติกเซลล์ แรก [ 5 ] [ 6 ]
Cavalier-Smithเรียกกลุ่มเดียวกันนี้ว่าPlanctobacteriaและถือว่าเป็นไฟลัมอย่างไรก็ตาม ชุมชนวิทยาศาสตร์ส่วนใหญ่ไม่ได้ปฏิบัติตาม[ 7 ]ในการจัดกลุ่มแบคทีเรียขนาดใหญ่ของ Cavalier-Smith นั้น แบคทีเรียกลุ่มนี้อยู่ในอาณาจักรย่อยGracilicutes และประกอบด้วยไฟลัม Chlamydiota , Lentisphaerota , PlanctomycetotaและVerrucomicrobiota [ 4 ] [ 8 ]
| ซูเปอร์ไฟลัม PVC [ 9 ] [ 10 ] [ 2 ] [ 11 ] |
ลายเซ็นโมเลกุล
Planctomycetota, Verrucomicrobiota และ Chlamydiota ในมุมมองวิวัฒนาการโมเลกุลแบบดั้งเดิมถือเป็นไฟลัมและยังรวมกลุ่มกันในซูเปอร์ไฟลัม PVC พร้อมกับไฟลัม Omnitrophica [ 12 ] (เดิมคือ OP3) และ Poribacteria [ 13 ] พบ ว่ามีเครื่องหมายโมเลกุลที่สำคัญในรูปแบบของโปรตีนลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้ซึ่งสมาชิก PVC ร่วมกันอย่างสม่ำเสมอ ยกเว้นPoribacteriaโปรตีนลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้อาจเป็นเครื่องหมายที่แสดงถึง คุณสมบัติ synapomorphicและเป็นวิธีการแยกแยะกลุ่มแบคทีเรียนี้ ในปี 2014 มีการศึกษาลักษณะเฉพาะของโปรตีนนี้และพบว่ามีบทบาทสำคัญในการจับกับ DNA/RNA [ 14 ] การสังเกตนี้ไม่เพียงแต่เป็นวิธีการในการกำหนดขอบเขตของซูเปอร์ไฟลัม PVC เท่านั้น แต่ยังสนับสนุนความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการที่กลุ่มนี้มีร่วมกันซึ่งแตกต่างจากแบคทีเรียอื่นๆ อย่างมาก[ 15 ] [ 16 ]
นอกจากนี้ ยังพบอินเดลลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้ (CSI) ที่เฉพาะเจาะจงสำหรับ Planctomycetota , VerrucomicrobiotaและChlamydiotaซึ่งแยกความแตกต่างระหว่างไฟลัมแต่ละชนิดออกจากกัน และจากแบคทีเรียอื่นๆ[ 15 ] [ 17 ]พบการแทรกกรดอะมิโนสามตัวในโปรตีนRNA polymerase RpoB ซึ่งพบร่วมกันใน Verrucomicrobia, Chlamydiae และ Lentisphaerae ทุก สายพันธุ์ที่ได้รับการจัดลำดับ CSI นี้ไม่มีอยู่ใน Planctomycetes และ Poribacteria ที่อยู่ใกล้เคียง ซึ่งบ่งชี้ถึงบรรพบุรุษร่วมกันในกลุ่มที่ CSI นี้มีความจำเพาะ[ 15 ]
มีการค้นพบหลักฐานเพิ่มเติมสำหรับการมีอยู่ของกลุ่มนี้[ 18 ] [ 19 ]ซึ่งรวมถึงการมีอยู่ของโปรตีนคล้ายเยื่อหุ้มเซลล์ ทูบูลินการ สังเคราะห์ สเตอรอลและการมีอยู่ของดีเอ็นเอที่ควบแน่น ซึ่งทั้งหมดนี้ได้รับการตีความโดยผู้เขียนบางคนว่าเป็นหลักฐานที่เป็นไปได้สำหรับความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการที่ใกล้ชิดกับยูคาริโอตและอาร์เคียซึ่งเรียกว่า "แบบจำลอง 1 โดเมน " [ 20 ]แบบจำลองทางเลือกอธิบายความคล้ายคลึงกันกับยูคาริโอตว่าเป็นผลมาจากการหลอมรวมแบบเอนโดซิมไบโอติกส์ระหว่างแบคทีเรีย PVC และอาร์เคียที่ถูกกลืนกิน ซึ่งก่อให้เกิดเซลล์โปรโตยูคาริโอตเซลล์แรก[ 5 ]