นี่คือรายชื่อ โปรแกรม ซอฟต์แวร์วิกิโดยแบ่งกลุ่มตามกรณีการใช้งาน ได้แก่ โปรแกรมวิกิมาตรฐาน โปรแกรมวิกิส่วนบุคคล วิกิที่ให้บริการเฉพาะบนเซิร์ฟเวอร์ โปรแกรมจัดการเนื้อหาแบบวิกิ และโปรแกรมจัดการโครงการแบบวิกิ นอกจากนี้ยังแบ่งย่อยตามภาษาที่ใช้ในการพัฒนา ได้แก่ JavaScript, Java, PHP , Python, Perl , Rubyและอื่นๆ

• TiddlyWikiเป็น วิกิแบบไร้เซิร์ฟเวอร์ที่ใช้ HTMLและJavaScriptซึ่งเว็บไซต์/วิกิทั้งหมดบรรจุอยู่ในไฟล์เดียว หรือเป็น แอปพลิเคชันวิกิที่ใช้ Node.jsออกแบบมาเพื่อความเป็นไปได้ในการปรับแต่งสูงสุด^{[ 1 ]}
• Wiki.jsเป็นแอปพลิเคชันวิกิแบบโอเพนซอร์สที่พัฒนาด้วย Node.js โดยใช้Gitเป็น กลไกจัดเก็บข้อมูล เบื้องหลังและซิงค์ข้อมูล กับ ที่เก็บ Git ใดๆ ได้โดยอัตโนมัติ นอกจากนี้ยังมี โปรแกรมแก้ไข Markdown แบบภาพ พร้อม ระบบ จัดการเนื้อหาระบบตรวจสอบสิทธิ์ และ เครื่องมือค้นหาในตัว

• XWikiเป็นแพลตฟอร์มซอฟต์แวร์วิกิฟรีที่เขียนด้วยภาษา Java โดยเน้นการออกแบบที่ขยายได้^{[ 2 ]} XWiki เป็นเอ็นจิ้นวิกิระดับองค์กรที่มีชุดคุณสมบัติวิกิที่สมบูรณ์ (การควบคุมเวอร์ชัน ไฟล์แนบ ฯลฯ) และเอ็นจิ้นฐานข้อมูลและภาษาการเขียนโปรแกรมที่ช่วยให้สามารถ สร้างแอปพลิเคชัน ที่ขับเคลื่อนด้วยฐานข้อมูลโดยใช้อินเทอร์เฟซวิกิได้

• Foswikiเป็นวิกิที่มีโครงสร้าง โดยทั่วไปใช้ในการสร้างแพลตฟอร์มการทำงานร่วมกัน ระบบจัดการ ความรู้หรือเอกสาร ระบบฐานความรู้หรือพอร์ทัล สำหรับทีม ซึ่งช่วยให้ผู้ใช้สามารถสร้าง "แอปพลิเคชันวิกิ" ได้
• ikiwikiคือ "ตัวคอมไพล์วิกิ" ที่สามารถใช้Subversionหรือ Git เป็นกลไกจัดเก็บข้อมูลเบื้องหลังได้ ikiwiki จะแปลงหน้าวิกิให้เป็นหน้า HTML ที่เหมาะสมสำหรับการเผยแพร่บนเว็บไซต์
• TWiki เป็นแพลตฟอร์ม วิกิและแอปพลิเคชันระดับองค์กรที่มีความยืดหยุ่น ทรงพลัง ปลอดภัย และใช้งานง่ายเป็นวิกิที่มีโครงสร้าง โดยทั่วไปใช้ในการสร้างพื้นที่พัฒนาโครงการ ระบบจัดการเอกสารฐานความรู้หรือ เครื่องมือ กลุ่มงาน อื่นๆ นอกจากนี้ ยังมีให้ใช้งานในรูปแบบVMware appliance ด้วย
• UseModWikiเป็นซอฟต์แวร์วิกิที่เขียนด้วยภาษา Perl และได้รับอนุญาตภายใต้General Public Licenseสร้างโดย Clifford Adams ในปี 2000 โดยเป็นซอฟต์แวร์ที่ลอกเลียนแบบAtisWiki
• WikiWikiWebซึ่งเป็นวิกิแรกและซอฟต์แวร์ที่เกี่ยวข้อง

• BookStackเผยแพร่ภายใต้ ใบอนุญาต MITโดยใช้แนวคิดของหนังสือในการจัดระเบียบหน้าและจัดเก็บข้อมูล
• DokuWikiเป็นแอปพลิเคชันวิกิที่ได้รับอนุญาตภายใต้GPLv2และเขียนด้วยภาษา PHP มีจุดมุ่งหมายเพื่อตอบสนองความต้องการด้านเอกสารของบริษัทขนาดเล็ก DokuWiki สร้างขึ้นสำหรับบริษัทและองค์กร ขนาดเล็ก ที่ต้องการวิธีการจัดการข้อมูล สร้างฐานความรู้ และทำงานร่วมกันอย่างง่าย ๆ โดยใช้ไฟล์ข้อความธรรมดาและมีไวยากรณ์ที่เรียบง่ายแต่ทรงพลัง ซึ่งทำให้มั่นใจได้ว่าไฟล์ข้อมูลยังคงอ่านได้นอกวิกิ
• MediaWikiเป็นซอฟต์แวร์วิกิแบบโอเพนซอร์สและใช้งานได้ฟรี เขียนด้วยภาษา PHP ทำหน้าที่เป็นแพลตฟอร์มสำหรับวิกิพีเดียและโครงการวิกิมีเดียอื่นๆ ที่ดำเนินการโดยมูลนิธิวิกิมีเดียนอกจากนี้ยังเปิดให้ใช้งานได้ทั่วไปในวิกิอื่นๆ และได้รับความนิยมอย่างแพร่หลายในวิกิขนาดเล็กที่ไม่ใช่ของวิกิมีเดีย MediaWiki เป็นซอฟต์แวร์วิกิแบบโอเพนซอร์สและใช้งานได้ฟรี พัฒนาขึ้นเพื่อใช้ในวิกิพีเดียในปี 2002 และได้รับชื่อว่า "MediaWiki" ในปี 2003
  • Semantic MediaWikiช่วยให้คุณจัดเก็บและสืบค้นข้อมูลภายในหน้าวิกิได้เหมือนกับฐานข้อมูล นอกจากนี้ยังได้รับการออกแบบมาเพื่ออำนวยความสะดวกและผสานรวมการเขียนร่วมกันภายในวิกิด้วยเทคโนโลยีเชิงความหมาย
  • BlueSpiceขยายขีดความสามารถของ MediaWiki ในด้านการใช้งาน การจัดการคุณภาพ การสนับสนุนกระบวนการ การบริหาร การแก้ไข และความปลอดภัย
• MindTouchเป็นแอปพลิเคชันที่เริ่มต้นจากการแยกสายมาจาก MediaWiki โดยมีส่วนหลังบ้านเขียนด้วยภาษาC# และส่วนหน้าบ้านเขียนด้วยภาษา PHP
• PhpWikiเป็นโคลนWikiWikiWebในPHP
• PmWikiเป็นวิกิที่เขียนด้วยภาษา PHP คุณสมบัติเด่น ได้แก่: ได้รับอนุญาตภายใต้ GPL, ติดตั้ง/ปรับแต่งได้ง่าย, ออกแบบมาเพื่อการสร้างและบำรุงรักษาเว็บไซต์ร่วมกัน และรองรับหลายภาษาไม่จำเป็นต้องใช้ฐานข้อมูล

• LocalWikiคือระบบวิกิที่ใช้Django เป็นพื้นฐาน พร้อมฟีเจอร์การสร้างแผนที่และโปรแกรมแก้ไขแบบ WYSIWYG โครงการ LocalWiki ก่อตั้งโดย Mike Ivanov และ Philip Neustrom ผู้สร้าง DavisWikiและเป็นองค์กรไม่แสวงผลกำไร 501ที่ตั้งอยู่ในซานฟรานซิสโก
• MoinMoinคือเครื่องมือสร้างวิกิที่เขียนด้วยภาษา Python
• Tracคือระบบวิกิและระบบติดตามปัญหาขั้นสูงสำหรับโครงการพัฒนาซอฟต์แวร์

• Gollumใช้ Git เป็นกลไกจัดเก็บข้อมูลเบื้องหลัง เขียนด้วยภาษา Ruby เป็นส่วนใหญ่ และเดิมทีถูกใช้เป็นระบบวิกิของGitHub

• Clikiเขียนด้วยภาษาCommon Lisp
• FlexWikiเขียนด้วยภาษาC#ใช้ เฟรมเวิร์ก . NETและจัดเก็บข้อมูลในไฟล์หรือMicrosoft SQL Serverการพัฒนาได้หยุดลงในปี 2009
• Swikiเขียนด้วยภาษา Squeakสามารถใช้งานได้บนแพลตฟอร์มทั่วไป เช่น Macintosh, Windows, Linux และอื่นๆ
• Wiki Serverเป็นซอฟต์แวร์กรรมสิทธิ์ที่แจกจ่ายมาพร้อมกับMac OS X Server

นอกจากนี้ยังมีแอปพลิเคชันวิกิที่ออกแบบมาสำหรับการใช้งานส่วนบุคคล^{[ 3 ]}แอปสำหรับใช้งานบนมือถือ^{[ 4 ]}และแอปสำหรับใช้งานจากแฟลชไดรฟ์ USB [ ^{5 ] ซึ่ง}มักจะมีคุณสมบัติมากกว่าวิกิแบบดั้งเดิม รวมถึง:

• มุมมองแผนผังต้นไม้แบบไดนามิกของวิกิ
• รองรับ การลากและวางสำหรับรูปภาพ ข้อความ วิดีโอ และสูตรคณิตศาสตร์
• การใช้OLEหรือ Linkback เพื่อให้วิกิสามารถทำหน้าที่เป็นโครงสร้างพื้นฐานเชิงสัมพันธ์สำหรับเอกสารประเภทเดสก์ท็อปหลายประเภท
• การฝังมัลติมีเดีย พร้อมลิงก์ไปยังส่วนต่างๆ ภายในของภาพยนตร์ เพลงประกอบ บันทึก และความคิดเห็น
• มาโครและการเขียนสคริปต์มาโคร

รายชื่อซอฟต์แวร์ดังกล่าว:

• ConnectedTextเป็น ระบบวิกิส่วนบุคคลเชิง พาณิชย์บนระบบปฏิบัติการ Windows ที่มีคุณสมบัติมากมาย เช่นการค้นหาข้อความเต็มรูปแบบโครงสร้างลิงก์แบบภาพ อินเทอร์เฟซที่ปรับแต่งได้ การควบคุมรูปภาพและไฟล์ การแสดงผลหน้าเว็บด้วย CSS การส่งออกไปยัง HTML และ HTML Help และปลั๊กอิน
• Joplinเป็นแอปพลิเคชันจดบันทึกแบบโอเพนซอร์สที่ใช้ Markdown
• Microsoft OneNoteคือซอฟต์แวร์จดบันทึกที่มีโครงสร้างเป็นสมุดบันทึก ส่วน และหน้าต่างๆ ซึ่งสามารถใส่แบบอักษร สื่อต่างๆ ลิงก์ไปยังบันทึกอื่นๆ และไฮเปอร์ลิงก์ได้
• Obsidianเป็นโปรแกรมฐานข้อมูลและจดบันทึกที่ทำงานกับไฟล์ Markdown
• Journallerเป็นโปรแกรมจัดการข้อมูลส่วนบุคคลแบบโอเพนซอร์สและใช้งานได้ฟรี พร้อมฟีเจอร์วิกิส่วนตัวสำหรับระบบปฏิบัติการ OS X
• MyInfoเป็นโปรแกรมจัดการข้อมูลส่วนบุคคลเชิงพาณิชย์สำหรับระบบปฏิบัติการ Windows ที่มีคุณสมบัติแบบวิกิ
• แอป smasiเป็นวิกิแบบง่ายสำหรับใช้งานบนระบบ Android, iOS, MacOS หรือ Windows ฐานความรู้ส่วนบุคคลจะถูกจัดเก็บไว้โดยตรงบนอุปกรณ์
• TiddlyWikiเป็นวิกิแบบโอเพนซอร์สฟรีสำหรับใช้งานส่วนบุคคล (บนเครื่องเดียว) สร้างขึ้นด้วย HTML/JavaScript สามารถใช้งานได้กับทุกเบราว์เซอร์และระบบปฏิบัติการ รองรับการปรับแต่งและส่วนเสริมมากมาย
• Vimwiki คือวิกิส่วนตัวสำหรับโปรแกรมแก้ไขข้อความVimมันทำงานกับไฟล์ข้อความธรรมดาที่เชื่อมโยงกัน ซึ่งเขียนด้วยภาษามาร์กอัปหลายภาษา และมีคุณสมบัติต่างๆ เช่น การส่งออกเป็น HTML การค้นหา บันทึกและงานแบบมีโครงร่าง การติดแท็ก และตารางที่จัดรูปแบบอัตโนมัติ
• WhizFoldersเป็นซอฟต์แวร์วิกิส่วนบุคคลเชิงพาณิชย์สำหรับระบบปฏิบัติการ Windows ที่มีรายการวิกิแบบข้อความที่สมบูรณ์ ซึ่งรองรับการแทรกลิงก์ไปยังรายการวิกิอื่น ๆ หรือไฟล์ภายนอก
• Zimเป็นวิกิแบบสแตนด์อโลนโอเพนซอร์สฟรีที่พัฒนาขึ้นโดยใช้ Python และ GTK พร้อมด้วยตัวแก้ไขแบบ WYSIWYG (What You See Is What You Get)

• Elium (เดิมชื่อ Knowledge Plaza ^{[ 6 ]} ) เป็นเครื่องมือการจัดการความรู้ของยุโรปที่ให้บริการสภาพแวดล้อมวิกิสำหรับงานความรู้หรือทีมงานทั่วทั้งบริษัท

• ConcourseConnectเป็น แอปพลิเคชัน J2EE ที่ใช้งานได้ฟรี พัฒนาโดยConcursiveซึ่งรวบรวม ความสามารถ ด้านเครือข่ายสังคมองค์กรชุมชนออนไลน์สมุดรายชื่อธุรกิจและการจัดการความสัมพันธ์กับลูกค้า เข้าไว้ด้วยกัน คุณสมบัติเด่น ได้แก่ วิกิ บล็อกการจัดการเอกสารการให้คะแนน รีวิว โฆษณาออนไลน์ และโมดูลการจัดการโครงการ วิกิรองรับทั้งการแก้ไขด้วย Wiki Markup และ WYSIWYG
• Confluenceเป็นแอปพลิเคชัน J2EE เชิงพาณิชย์ที่รวมฟังก์ชันวิกิและบล็อก เข้าด้วย กัน คุณสมบัติเด่น ได้แก่ การส่งออกหน้าเป็นไฟล์ PDF และการปรับโครงสร้างหน้า และสามารถใช้งานบนเซิร์ฟเวอร์แอปพลิเคชันใดก็ได้โดยใช้ระบบจัดการฐานข้อมูลเชิงสัมพันธ์ (RDBMS) ใดก็ได้เป็นแบ็กเอนด์
• IBM Connectionsคือซอฟต์แวร์โซเชียลสำหรับองค์กรที่พัฒนาโดยIBMซึ่งรวมเอาวิกิ บล็อก ไฟล์ ฟอรัม ไมโครบล็อก การวิเคราะห์โซเชียล และการจัดการเอกสารเข้าไว้ด้วยกัน
• Jive (เดิมชื่อ Clearspace, Jive SBS และ Jive Engage) เป็นแอปพลิเคชัน J2EE เชิงพาณิชย์ที่พัฒนาโดยJive Softwareซึ่งรวมฟังก์ชันการทำงานของวิกิ บล็อก และการจัดการเอกสารเข้าไว้ด้วยกัน Jive ใช้การแก้ไขแบบ WYSIWYG และรวมถึงการจัดการเวิร์กโฟลว์ด้วย
• Liferayเป็นโครงการพอร์ทัลระดับองค์กรแบบโอเพนซอร์สที่มีระบบจัดการเนื้อหาเว็บและเฟรมเวิร์กแอปพลิเคชันเว็บในตัว พอร์ตเล็ตหลักมีฟังก์ชันการทำงานมากมาย รวมถึงวิกิ (ทั้งไวยากรณ์ Creole และ MediaWiki)
• Mindquarryสร้างวิกิแบบ WYSIWYG สำหรับแต่ละทีม โดยสร้างขึ้นโดยใช้Apache Cocoonซึ่งเขียนด้วยภาษา Java (ภายใต้สัญญาอนุญาต Mozilla Public License)
• Traction TeamPageเป็นวิกิสำหรับองค์กรเชิงพาณิชย์ที่รวมเอาความสามารถในการเขียนบล็อก การจัดการโครงการ การจัดการเอกสาร การสนทนา และการติดแท็กไว้ด้วย วิกินี้มีระบบตรวจสอบฉบับร่างที่ช่วยให้ผู้ดูแลระบบสามารถระบุได้ว่าใครสามารถอ่านเวอร์ชันที่เผยแพร่แล้วและฉบับร่างได้ และใครสามารถเผยแพร่และแก้ไขได้ โครงสร้างการแสดงผลแบบไดนามิกช่วยให้จัดระเบียบหน้าต่างๆ ได้ง่าย และสามารถรวบรวมชุดหน้าใดๆ ก็ได้เพื่อดู ส่งอีเมล หรือส่งออก โดยอิงตามหลักการของระบบออนไลน์ (NLS) ของDouglas Engelbartซึ่งรวบรวมพื้นที่บล็อก/วิกิหลายแห่งเข้าด้วยกันโดยใช้โมเดลการอนุญาตและการแสดงความคิดเห็นแบบอินไลน์ที่ซับซ้อน
• XWikiประกอบด้วยฟังก์ชันวิกิมาตรฐาน รวมถึงการแก้ไขแบบ WYSIWYG การนำเข้า/ส่งออกเอกสารโดยใช้ OpenDocumentคำอธิบายประกอบและการติดแท็กเชิงความหมาย และการจัดการสิทธิ์ขั้นสูง

• Socialtextเป็นบริษัทที่ตั้งอยู่ในเมืองพาโลอัลโต รัฐแคลิฟอร์เนีย ผลิตซอฟต์แวร์โซเชียล สำหรับองค์กร วิกิสำหรับองค์กร และ ระบบ สร้างบล็อกบนเว็บ ซึ่งพัฒนาต่อยอดบางส่วนมาจาก Kwiki ซึ่งเป็นซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ส Socialtext มีให้บริการทั้งในรูปแบบบริการแบบโฮสต์ หรืออุปกรณ์ฮาร์ดแวร์เฉพาะ

• สามารถตั้งค่าการติดตั้งDrupal ให้เป็นวิกิโดยใช้ รูปแบบการเขียนโค้ดวิกิ แบบ MediaWiki ได้
• Tiki Wiki CMS Groupware เป็นหนึ่งในโครงการพัฒนาวิกิที่ใหญ่และมีความทะเยอทะยานมากที่สุดโครงการหนึ่ง โดยมีคุณสมบัติ กลุ่มงานเพิ่มเติมมากมาย(เช่น เว็บบอร์ดข้อความ บทความ เป็นต้น)

• Microsoft SharePointเป็นแพลตฟอร์มการทำงานร่วมกันบนเว็บที่ผสานรวมกับMicrosoft Officeเปิดตัวในปี 2544 SharePoint จำหน่ายเป็นหลักในฐานะระบบจัดการและจัดเก็บเอกสาร แต่ผลิตภัณฑ์นี้สามารถปรับแต่งได้อย่างมาก และการใช้งานก็แตกต่างกันอย่างมากในแต่ละองค์กร มีระบบวิกิในตัวสร้างขึ้นบนASP.NET , ภาษา C#และMicrosoft SQL Server
• Telligent ซึ่งเป็นบริษัทในเครือ Verintเป็นธุรกิจซอฟต์แวร์สำหรับการทำงานร่วมกันและการสร้างชุมชนในองค์กร ก่อตั้งขึ้นในปี 2547 โดย Rob Howard บริษัทได้เปลี่ยนชื่อเป็น Zimbra, Inc ในเดือนกันยายน 2556 หลังจากเสร็จสิ้นการเข้าซื้อกิจการ Zimbra จากVMWareในเดือนสิงหาคม 2558 ธุรกิจ Telligent ของ Zimbra ถูกซื้อกิจการโดยVerint Systems

• Altova MetaTeamผสานรวมวิกิและคำศัพท์เฉพาะเข้ากับการจัดการโครงการ การตัดสินใจร่วมกัน และการจัดการประสิทธิภาพของทีม
• Code Co-opเป็น ระบบ ควบคุมเวอร์ชันแบบกระจายศูนย์ที่มีฟังก์ชันการทำงานแบบวิกิ
• Fossilเป็นระบบควบคุมเวอร์ชันแบบกระจายศูนย์ที่ผสานรวมความสามารถของวิกิแบบกระจายศูนย์ ซึ่งเขียนด้วยภาษาซี
• Redmineเป็นแอปพลิเคชันบนเว็บสำหรับการบริหารจัดการโครงการ
• Tracผสานรวมระบบติดตามปัญหาอย่างง่ายและอินเทอร์เฟซไปยัง Subversion เข้าไว้ด้วยกัน

• การเปรียบเทียบซอฟต์แวร์วิกิ
• ประวัติความเป็นมาของวิกิ
• แบบสำรวจวิกิ