อ่าน 5 นาที
การแปรผันของผลกระทบจากตำแหน่ง
การแปรผันตามตำแหน่ง ( PEV ) คือ การแปรผัน ที่เกิดจากการปิดกั้น ยีน ในบางเซลล์ผ่านการวางตำแหน่งที่ผิดปกติกับ เฮเท อโรโครมาติน ผ่านการจัดเรียงใหม่หรือ การเคลื่อนย้าย [ 1 ] นอกจาก...
การแปรผันของผลกระทบจากตำแหน่ง
การแปรผันตามตำแหน่ง ( PEV ) คือการแปรผันที่เกิดจากการปิดกั้นยีนในบางเซลล์ผ่านการวางตำแหน่งที่ผิดปกติกับ เฮเท อโรโครมาตินผ่านการจัดเรียงใหม่หรือการเคลื่อนย้าย [ 1 ] นอกจากนี้ยังเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างโครมาตินด้วย[ 2 ]
ภาพรวม
ตัวอย่างคลาสสิกคือการย้ายตำแหน่ง w m4 (speak white-mottled-4) ของ Drosophilaในการกลายพันธุ์ นี้ การผกผันบนโครโมโซม Xทำให้ ยีน white อยู่ ติดกับเฮเทอโรโครมาตินรอบเซนโทรเมียร์ หรือลำดับของลำดับซ้ำที่กลายเป็นเฮเทอโรโครมาติน[ 3 ]โดยปกติ ยีน whiteจะแสดงออกในทุกเซลล์ของ ดวงตา Drosophila ตัวเต็มวัย ส่งผลให้มี ฟีโนไทป์ตาแดงในตัวกลายพันธุ์ w[m4] สีตาจะเป็นสีผสม (สีแดง-ขาวแบบโมเสก) โดยที่ ยีน whiteแสดงออกในบางเซลล์ในดวงตาและไม่แสดงออกในเซลล์อื่น การกลายพันธุ์นี้ได้รับการอธิบายครั้งแรกโดยHermann Mullerในปี 1930 [ 4 ] PEV คือการปิดใช้งานยีนที่เกิดจากเฮเทอโรโครมาติ น [ 5 ]ปรากฏการณ์การปิดการทำงานของยีนที่คล้ายคลึงกันนี้ยังพบในS. cerevisiaeและ S. pombeด้วย[ 5 ]
โดยทั่วไป ลำดับดีเอ็นเอที่เป็นกำแพงจะป้องกันไม่ให้บริเวณเฮเทอโรโครมาตินแพร่กระจายเข้าไปในยูโครมาตินแต่ลำดับเหล่านี้จะไม่ปรากฏอยู่ในแมลงวันที่มีการจัดเรียงโครโมโซมใหม่บางอย่าง[ 6 ]
นิรุกติศาสตร์
PEV เป็นผลกระทบจากตำแหน่งเนื่องจากการเปลี่ยนแปลงตำแหน่งของยีนจากตำแหน่งเดิมไปยังบริเวณใกล้กับเฮเทอโรโครมาตินมีผลต่อการแสดงออก ของ ยีน[ 7 ]ผลกระทบดังกล่าวคือความแปรปรวนในฟีโนไทป์ที่เฉพาะเจาะจง กล่าวคือ การปรากฏของจุดสีที่ไม่สม่ำเสมอเนื่องจากการแสดงออกของยีนชนิดป่าดั้งเดิมในบางเซลล์ของเนื้อเยื่อแต่ไม่ใช่ในเซลล์อื่น[ 8 ] ดังที่เห็นในดวงตาของแมลงหวี่กลายพันธุ์
อย่างไรก็ตาม เป็นไปได้ว่าผลของยีนที่ถูกปิดการทำงานอาจไม่ปรากฏให้เห็นทางฟีโนไทป์ในบางกรณี PEV ถูกสังเกตพบครั้งแรกในแมลงหวี่เนื่องจากเป็นหนึ่งในสิ่งมีชีวิตกลุ่มแรกๆ ที่ใช้การฉายรังสีเอกซ์เป็นตัวกระตุ้นให้เกิดการกลายพันธุ์[ 1 ]รังสีเอกซ์สามารถทำให้เกิดการจัดเรียงโครโมโซมใหม่ซึ่งอาจส่งผลให้เกิด PEV ได้[ 1 ]
กลไก
ในบรรดาแบบจำลองจำนวนมาก แบบจำลอง เอพิเจเนติกส์ สองแบบ เป็นที่นิยม แบบหนึ่งคือการแพร่กระจายแบบซิสของเฮเทอโรโครมาตินผ่านจุดแตกหักของการจัดเรียงใหม่ปฏิสัมพันธ์แบบทรานส์จะเข้ามามีบทบาทเมื่อ แบบจำลองการแพร่กระจาย แบบซิสไม่สามารถอธิบายปรากฏการณ์บางอย่างได้[ 5 ]
การแพร่กระจายแบบซิส
ตามแบบจำลองนี้ เฮเทอโรโครมาตินบังคับให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโครมาตินในบริเวณยูโครมาติน ด้วยเหตุนี้ กลไกการถอดรหัสจึงไม่สามารถเข้าถึงยีนได้ ซึ่งนำไปสู่การยับยั้งการถอดรหัส[ 5 ]กล่าวอีกนัยหนึ่ง เฮเทอโรโครมาตินแพร่กระจายและทำให้เกิดการปิดการทำงานของยีนโดยการปิดกั้นบริเวณยูโครมาตินตามปกติ[ 2 ]แต่แบบจำลองนี้ไม่สามารถอธิบายบางแง่มุมของ PEV ได้ ตัวอย่างเช่น การเกิดลายด่างสามารถเกิดขึ้นได้ในยีนที่อยู่ห่างจากจุดแตกหักของเฮเทอโรโครมาติน-ยูโครมาตินหลายเมกะเบสเนื่องจากการจัดเรียงใหม่ในจุดแตกหักนั้น นอกจากนี้ ความรุนแรงของฟีโนไทป์ลายด่างยังสามารถเปลี่ยนแปลงได้ตามระยะห่างของบริเวณเฮเทอโรโครมาตินจากจุดแตกหัก[ 5 ]
สิ่งนี้บ่งชี้ว่า ปฏิกิริยา แบบทรานส์มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อ PEV
ปฏิสัมพันธ์ ข้ามสาย
สิ่งเหล่านี้คือปฏิสัมพันธ์ระหว่างบริเวณเฮเทอโรโครมาตินที่แตกต่างกันและการจัดระเบียบโครโมโซมโดยรวมในนิวเคลียสระยะอินเตอร์เฟส[ 5 ]การจัดเรียงใหม่เนื่องจาก PEV ทำให้ยีนรายงานอยู่ในช่องใหม่ของนิวเคลียสซึ่งไม่มีกลไกการถอดรหัสที่จำเป็นอยู่ จึงทำให้ยีนถูกปิดการทำงานและโครงสร้างโครมาตินถูกปรับเปลี่ยน[ 2 ]
กลไกทั้งสองนี้ส่งผลกระทบต่อกันและกันด้วย กลไกใดจะมีอิทธิพลเหนือกว่าต่อฟีโนไทป์นั้นขึ้นอยู่กับชนิดของเฮเทอโรโครมาตินและความซับซ้อนของการจัดเรียงใหม่[ 5 ]
การยับยั้งในDrosophila melanogaster
การกลายพันธุ์ใน ยีน musเป็นตัวเลือกที่อาจเป็นตัวปรับเปลี่ยน PEV เนื่องจากยีนเหล่านี้เกี่ยวข้องกับการบำรุงรักษาและการซ่อมแซมโครโมโซม โครงสร้างของโครโมโซมในบริเวณใกล้เคียงจุดแตกหักดูเหมือนจะเป็นปัจจัยสำคัญในการกำหนดกระบวนการปิดใช้งานยีน มีการแยกการกลายพันธุ์ของยีน mus ในโครโมโซมที่สองจำนวน 6 ยีน โดยใช้ w m4โดยวางสำเนาของยีน white ชนิดปกติไว้ติดกับเฮเทอโรโครมาติน mutant ของ musที่นำมาศึกษา ได้แก่mus 201 D1 , mus 205 B1 , mus 208 B1 , mus 209 B1 , mus 210 B1และmus 211 B1มีการสร้างสายพันธุ์โดยการแทนที่โครโมโซม X มาตรฐานด้วย w m4พบว่าการยับยั้ง PEV ไม่ใช่ลักษณะเฉพาะของ การกลายพันธุ์ ของ mus โดยทั่วไป มีเพียง mus 209 B1ที่เป็น homozygous เท่านั้นที่การเกิดลายด่างถูกยับยั้งอย่างมีนัยสำคัญ นอกจากนี้ เมื่อเป็นโฮโมไซกัส 2735 และ D-1368 และการรวมกันเฮเทอโรอัลลีลิกทั้งหมดของการกลายพันธุ์ Pcna จะยับยั้ง PEV อย่างรุนแรง[ 9 ]
ในสิ่งมีชีวิตอื่นๆ
ในหนู
ในหนู มีการสังเกตพบสีขนที่แปรผันได้ เมื่อ บริเวณ ออโตโซมที่มียีนสีขนถูกแทรกเข้าไปในโครโมโซม X จะพบการปิดการทำงานของอัลลีล ที่แปรผันได้ อย่างไรก็ตาม การแปรผันจะสังเกตได้เฉพาะในตัวเมียที่มีการแทรกนี้ร่วมกับ การกลายพันธุ์ แบบโฮโมไซกัสในยีนสีขนดั้งเดิม[ 1 ]อั ลลีล แบบปกติจะถูกปิดใช้งานเนื่องจากเฮเทอโรโครมาตินไนเซชัน[ 1 ]
ในพืช
ในพืช PEV ได้รับการสังเกตในOenothera blandinaการปิดกั้นยีนยูโครมาติกเกิดขึ้นเมื่อยีนถูกวางลงในบริเวณเฮเทอโรโครมาติกใหม่[ 1 ]
ดูเพิ่มเติม
เอกสารอ้างอิงเพิ่มเติมที่คัดเลือกแล้ว
- Aagaard L., Laible G., Selenko P., Schmid M., Dorn R., Schotta G., Kuhfittig S., Wolf A., Lebersorger A., Singh PB, Reuter G., Jenuwein T. (1999). "โฮโมล็อกเชิงฟังก์ชันของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมของตัวปรับแต่ง PEV ของ Drosophila Su(var)3-9 เข้ารหัสโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับเซนโทรเมียร์ซึ่งสร้างคอมเพล็กซ์กับส่วนประกอบเฮเทอโรโครมาติน M31" . EMBO J . 18 (7): 1923– 38. doi : 10.1093/emboj/18.7.1923 . PMC 1171278 . PMID 10202156 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Buchner K., Roth P., Schotta G., Krauss V., Saumweber H., Reuter G., Dorn R. (2000). "ความซับซ้อนทางพันธุกรรมและโมเลกุลของตัวปรับเปลี่ยนการแปรผันของเอฟเฟกต์ตำแหน่ง mod(mdg4) ใน Drosophila" Genetics . 155 ( 1): 141– 57. doi : 10.1093/genetics/155.1.141 . PMC 1461079 . PMID 10790390 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Dorn R., Krauss V., Reuter G., Saumweber H. (1993). "ตัวเร่งการเกิดการแปรผันของตำแหน่งใน Drosophila, E(var)3-93D, เข้ารหัสโปรตีนโครมาตินที่มีโดเมนอนุรักษ์ที่พบได้ทั่วไปในตัวควบคุมการถอดรหัสหลายตัว" Proc Natl Acad Sci USA . 90 (23): 11376– 80. Bibcode : 1993PNAS...9011376D . doi : 10.1073/pnas.90.23.11376 . PMC 47985 . PMID 8248257 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Ebert A., Schotta G., Lein S., Kubicek S., Krauss V., Jenuwein T., Reuter G. (2004). "ยีน Su(var) ควบคุมความสมดุลระหว่างยูโคร มาตินและเฮเทอโรโครมาตินใน Drosophila" Genes Dev . 18 (23): 2973– 83. doi : 10.1101/gad.323004 . PMC 534657. PMID 15574598 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Eissenberg JC, Morris GD, Reuter G., Hartnett T. (1992). "โปรตีน HP-1 ที่เกี่ยวข้องกับเฮเทอโรโครมาตินเป็นโปรตีนที่จำเป็นใน Drosophila ซึ่งมีผลต่อการแปรผันของตำแหน่งแบบขึ้นอยู่กับปริมาณ" Genetics . 131 ( 2): 345– 352. doi : 10.1093/genetics/131.2.345 . PMC 1205009 . PMID 1644277 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Jenuwein T., Laible G., Dorn R., Reuter G. (1998). "โปรตีนโดเมน SET ปรับเปลี่ยนโดเมนโครมาตินในยูโครมาตินและเฮเทอโรโครมาติน" . Cell Mol Life Sci . 54 (1): 80– 93. doi : 10.1007/s000180050127 . PMC 11147257 . PMID 9487389 . S2CID 7769686 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Schotta G., Ebert A., Krauss V., Fischer A., Hoffmann J., Rea S., Jenuwein T., Dorn R., Reuter G. (2002). "บทบาทสำคัญของ Drosophila SU(VAR)3-9 ในการเมทิลเลชั่นของฮิสโตน H3-K9 และการปิดกั้นยีนเฮเทอโรโครมาติน" . EMBO J . 21 (5): 1121– 31. doi : 10.1093/emboj/21.5.1121 . PMC 125909 . PMID 11867540 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link ) - Tschiersch B., Hofmann A., Krauss V., Dorn R., Korge G., Reuter G. (1994). "โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีน Su(var)3-9 ซึ่งเป็นยีนยับยั้งการแปรผันตามตำแหน่งของ Drosophila รวมโดเมนของตัวควบคุมที่เป็นปฏิปักษ์ต่อกันของยีนคอมเพล็กซ์โฮมีโอติก" . EMBO J . 13 (16): 3822– 31. doi : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06693.x . PMC 395295 . PMID 7915232 .
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link )
ลิงก์ภายนอก
- ฟลายเบส
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ การแปรผันของผลกระทบจากตำแหน่ง
การแปรผันตามตำแหน่ง ( PEV ) คือ การแปรผัน ที่เกิดจากการปิดกั้น ยีน ในบางเซลล์ผ่านการวางตำแหน่งที่ผิดปกติกับ เฮเท อโรโครมาติน ผ่านการจัดเรียงใหม่หรือ การเคลื่อนย้าย [ 1 ] นอกจาก...
ภาพรวม
ตัวอย่างคลาสสิกคือ การย้ายตำแหน่ง w m4 (speak white-mottled-4) ของ Drosophila ใน การกลายพันธุ์ นี้ การ ผกผัน บน โครโมโซม X ทำให้ ยีน white อยู่ ติดกับเฮเทอโรโครมาตินรอบเซนโทรเมียร์ หรือลำดับของลำดับซ้ำที่กลายเป็นเฮเทอโรโครมาติน [ 3 ] โดยปกติ ยีน white...
นิรุกติศาสตร์
PEV เป็น ผลกระทบจากตำแหน่ง เนื่องจากการเปลี่ยนแปลง ตำแหน่ง ของยีนจากตำแหน่งเดิมไปยังบริเวณใกล้กับเฮเทอโรโครมาตินมี ผล ต่อ การแสดงออก ของ ยีน [ 7 ] ผลกระทบดังกล่าวคือ ความแปรปรวน ในฟีโนไทป์ที่เฉพาะเจาะจง กล่าวคือ...
กลไก
ในบรรดาแบบจำลองจำนวนมาก แบบจำลอง เอพิเจเนติกส์ สองแบบ เป็นที่นิยม แบบหนึ่งคือ การแพร่กระจาย แบบซิส ของเฮเทอโรโครมาตินผ่านจุดแตกหักของการจัดเรียงใหม่ ปฏิสัมพันธ์ แบบทรานส์ จะเข้ามามีบทบาทเมื่อ แบบจำลองการแพร่กระจาย แบบซิส ไม่สามารถอธิบายปรากฏการณ์บางอย่างได้ [...