ราจ1
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	RAG1 , RAG-1, RNF74, ยีนกระตุ้นการรวมตัวใหม่ 1, ยีนกระตุ้นการรวมตัวใหม่ 1
รหัสภายนอก	โอมิม : 179615 ; เอ็มจีไอ : 97848 ; โฮโมโลยีน : 387 ; GeneCards : RAG1 ; OMA : RAG1 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 11 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 11p12 เริ่ม 36,510,709 bp [ 1 ] จบ 36,593,156 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 2 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 2 E2|2 53.88 cM เริ่ม 101,468,627 bp [ 2 ] จบ 101,479,846 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน ต่อมไทมัส เซลล์เยื่อบุช่องปาก อัณฑะ ไขกระดูก ม้าม ยอดหัวใจ เอ็นของกล้ามเนื้อไบเซปส์ เซลล์สโตรมัลของเยื่อบุโพรงมดลูก เซลล์ไขกระดูก ต่อมหมวกไตด้านขวา สูงสุดที่แสดงใน ต่อมไทมัส ข้อต่อกระดูกหน้าแข้งและกระดูกต้นขา ไขกระดูก กระดูกต้นขา แกรนูโลไซต์ กล้ามเนื้อสเตอร์โนไคลโดมาสทอยด์ มวลเซลล์ภายใน สิ่งมีชีวิตที่ยังไม่เจริญพันธุ์ทางเพศ หลอดลม เลนส์ ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอจีพีเอส ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับ DNA การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับ กิจกรรมการสร้างโฮโมไดเมอร์ของโปรตีน กิจกรรมของยูบิควิตินโปรตีนไลเกส การจับตัวของฮิสโตน การจับไอออนสังกะสี การจับไอออนโลหะ กิจกรรมยูบิควิติน-โปรตีนทรานสเฟอเรส การจับโปรตีน กิจกรรมเร่งปฏิกิริยา กิจกรรมนิวคลีเอส กิจกรรมเอนโดนิวคลีเอส กิจกรรมไฮโดรเลส กิจกรรมทรานสเฟอเรส การจับโปรตีนที่เหมือนกัน กิจกรรมเอนโดดีออกซีไรโบนิวคลีเอสของดีเอ็นเอสายคู่ ส่วนประกอบของเซลล์ นิวคลีโอพลาสม์ นิวเคลียส คอมเพล็กซ์ดีเอ็นเอรีคอมบิเนส เอนโดดีออกซีไรโบนิวคลีเอสคอมเพล็กซ์ กระบวนการทางชีวภาพ การควบคุมเชิงบวกของการแยกแยะเซลล์ T การเติมโมโนยูบิควิตินให้กับฮิสโตน การรวมตัวใหม่ของดีเอ็นเอ การควบคุมเชิงลบของกิจกรรมเอนโดเปปติเดสชนิดซิสเทอีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการอะพอพโทซิส การตอบสนองทางภูมิคุ้มกันแบบปรับตัว การจำแนกเซลล์ T ในต่อมไทมัส การไฮโดรไลซิสพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ของกรดนิวคลีอิก การพัฒนาของต่อมไทมัส การควบคุมเชิงลบของกระบวนการอะพอพโทซิสของเซลล์ไทโมไซต์ การรักษาสมดุลของเซลล์ T การควบคุมเชิงลบของกระบวนการอะพอพโทซิสของเซลล์ T การตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน การรวมตัวใหม่ของ V(D)J การกีดกันอัลลีลของเซลล์พรีบี การแยกแยะเซลล์บี การเผาผลาญ การควบคุมการแยกแยะเซลล์ T การเติมยูบิควิตินให้กับโปรตีนด้วยตนเอง การเรียนรู้ด้วยภาพ การควบคุมการตอบสนองต่อความกลัวทางพฤติกรรม การจัดระเบียบโครมาติน แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 5896 19373 วงดนตรี ENSG00000166349 ENSMUSG00000061311 ยูนิโปรท พี15918 พี15919 RefSeq (mRNA) NM_000448 NM_009019 RefSeq (โปรตีน) NP_000439 NP_001364206 NP_001364207 NP_001364208 NP_001364209 NP_033045 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 11: 36.51 – 36.59 Mb Chr 2: 101.47 – 101.48 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

ยีนกระตุ้นการรวมตัวใหม่ 1หรือที่รู้จักกันในชื่อ^RAG -1เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนRAG1 [ ^{5 ]}

ยีน RAG1 และRAG2ส่วนใหญ่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในมนุษย์ กรดอะมิโนที่เข้ารหัส 55.99% และ 55.98% ไม่มีตัวแปรที่รายงานไว้ ตามลำดับ^{[ 6 ]}

โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้มีส่วนเกี่ยวข้องกับ การรวมตัวใหม่ ของแอนติบอดีและตัวรับทีเซลล์V(D)J RAG-1 มีส่วนเกี่ยวข้องกับการจดจำสารตั้งต้น DNA แต่การจับและการตัดที่เสถียรยังต้องอาศัยRAG-2 ด้วย คอมเพล็กซ์ RAG -1/2จดจำลำดับสัญญาณการรวมตัวใหม่ (RSS) ที่อยู่ขนาบข้างบริเวณ V, D และ J ในยีนที่เข้ารหัส สาย หนักและสายเบาของแอนติบอดีและส่วนประกอบของตัวรับทีเซลล์ คอมเพล็กซ์จะจับกับ RSS และตัด DNA ซึ่งนำไปสู่การกำจัด DNA ที่อยู่ระหว่างกลางและการเชื่อมต่อลำดับ V, D และ J ในที่สุด^{[ 7 ]} ความบกพร่องในยีนนี้สามารถทำให้เกิดโรคต่างๆ ได้หลายชนิด^{[ 5 ]}

เนื่องจากผลกระทบเหล่านี้ การลบ Rag1 จึงถูกนำมาใช้ในแบบจำลองโรคในหนูเพื่อทำให้ การพัฒนา เซลล์ Tและเซลล์ B บกพร่อง และลบเซลล์ T และ B ที่โตเต็มที่ออกจากระบบภูมิคุ้มกันโดยสมบูรณ์^{[ 8 ]}

ในมนุษย์ ภาวะขาด RAG ถูกค้นพบครั้งแรกว่าเป็นรูปแบบหนึ่งของความผิดปกติของระบบภูมิคุ้มกันที่เรียกว่ากลุ่ม อาการโอเมนน์ ( Omenn syndrome ) ภาวะขาด RAG ถือเป็น โรค ทางพันธุกรรมแบบยีนด้อยที่ถ่ายทอดทางโครโมโซมร่างกายโดยทั่วไปจะตรวจพบความผิดปกตินี้ในทารก การสูญเสียการทำงานอย่างสมบูรณ์ของ RAG1/2 ซึ่งเป็นส่วนประกอบหลักที่รับผิดชอบกิจกรรมการรวมตัวของ V(D)J ทำให้เกิดภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่องอย่างรุนแรงในมนุษย์ RAG ชนิดกลายพันธุ์แบบไฮโปมอร์ฟิกสามารถคงกิจกรรมการรวมตัวบางส่วนไว้ได้^{[ 9 ]}และส่งผลให้เกิดฟีโนไทป์ที่แตกต่างกันของภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่องร่วมกับแกรนูโลมาและ/หรือภาวะภูมิคุ้มกันทำลายตนเอง (CID-G/A) ^{[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]}รวมถึงรูปแบบที่อ่อนกว่าอื่นๆ เช่น ภาวะขาดแอนติบอดี^{[ 13 ]} ภาวะเม็ดเลือดขาว CD4 ⁺ T ต่ำ โดยไม่ทราบสาเหตุ ^{[ 14 ]}หรือหลอดเลือดอักเสบ^{[ 15 ]}ภาวะขาด RAG สามารถวัดได้โดยการวัดปริมาณกิจกรรมการรวมตัวในหลอดทดลอง^{[ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]}มีการทดสอบการทำงานของ RAG1 จำนวน 71 รายการและ RAG2 จำนวน 39 รายการจนถึงปัจจุบัน (2019) (น้อยกว่า 10% ของการกลายพันธุ์แบบจุดที่อาจก่อให้เกิดโรค) อย่างไรก็ตาม ตัวแปรที่เป็นตัวเลือกอันดับต้น ๆ ได้รับการจัดอันดับตามความเกี่ยวข้องทางคลินิกที่คาดการณ์ไว้^{[ 6 ]}

RAG1 ถูกใช้เป็นเครื่องหมายใน การศึกษา วิวัฒนาการ บ่อยครั้ง กล่าวคือ ลำดับ RAG1 มักถูกใช้เพื่อสร้างแผนภูมิวิวัฒนาการเพื่อตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างสปีชีส์หรือกลุ่มอนุกรมวิธาน ที่สูงกว่า แม้ว่าการเลือก RAG1 จะค่อนข้างเป็นไปตามอำเภอใจ แต่ก็เป็นหนึ่งในตำแหน่งการเข้ารหัสโปรตีนนิวเคลียร์สากล (NPCL) หลายตำแหน่งที่สามารถใช้ได้กับกลุ่มอนุกรมวิธานที่หลากหลายและแสดงการจำแนกวิวัฒนาการที่ดี ตัวอย่างเช่น RAG1 ถูกนำมาใช้ประสบความสำเร็จในการอนุมานวิวัฒนาการภายในกลุ่มปลาและสัตว์เลื้อยคลาน ที่สำคัญทั้งหมด ^{[ 19 ] [ 20 ]}ในหลายกรณี RAG1 ถูกใช้ร่วมกับลำดับไมโทคอนเดรียเนื่องจากลำดับเหล่านี้วิวัฒนาการได้เร็วกว่ามากและให้ข้อมูลเกี่ยวกับกลุ่มอนุกรมวิธานที่มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกันมากขึ้น^{[ 21 ]} โดย ทั่วไปแนะนำให้ใช้ DNA นิวเคลียร์และไมโทคอนเดรียร่วมกัน เนื่องจากอาจให้ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการที่ไม่สอดคล้องกัน ซึ่งเป็นปรากฏการณ์ที่เรียกว่าความไม่สอดคล้องกันระหว่างไมโทคอนเดรียและนิวเคลียร์^{[ 22 ]}