ราลา โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 1UAD , 1ZC3 , 1ZC4 , 2A78 , 2A9K , 2BOV
ตัวระบุ ชื่อเรียกอื่น RALA , RAL, RALA คล้ายโปรโตออนโคยีน A, RAS คล้ายโปรโตออนโคยีน A, HINCONSรหัสภายนอก โอมิม : 179550 ; เอ็มจีไอ : 1927243 ; โฮโมโลยีน : 3942 ; GeneCards : ราลา ; OMA : RALA - ออโธโลจี รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก)สูงสุดที่แสดงใน โอโอไซต์รอง เซลล์เยื่อบุช่องปาก น้ำคร่ำ ช่องปาก เยื่อบุผิวเหงือก เยื่อบุของคอหอย พื้นที่บรอดแมน 23 ผิวหนังบริเวณสะโพก เยื่อหุ้มปอดชั้นใน ไจรัสขมับกลาง
สูงสุดที่แสดงใน แผ่นเนื้อเยื่อหู ถุงน้ำ ส่วนนูนของปมประสาทตรงกลาง ถุงน้ำในหู กระแสการอพยพของส่วนหน้า ลิ้นหัวใจเอทริโอเวนทริคูลาร์ ความนูนของขากรรไกรบน ทารกในครรภ์มนุษย์ นิวเคลียสของกล้ามเนื้อใบหน้า เบาะรองหัวใจด้านใน
ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ไบโอ GPS ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับตัวรับกรดไลโซฟอสฟาติดิก Edg-2 การจับนิวคลีโอไทด์ การผูกมัด GDP การจับกับไมโอซิน การจับกับ ATPase การจับกับ GTP การจับโปรตีน กิจกรรม GTPase การจับกันของยูบิควิตินกับโปรตีนไลเกส ส่วนประกอบของเซลล์ เมมเบรน การยึดเกาะเฉพาะจุด ปลอกไมอีลิน เยื่อหุ้มพลาสมา ถุงเอนโดไซติก ร่องอก เอ็กโซโซมนอกเซลล์ เยื่อหุ้มเวสิเคิลไซโตพลาสมิก พื้นผิวเซลล์ ร่างกายเฟลมมิง โครงสร้างทางกายวิภาคภายในเซลล์ กระบวนการทางชีวภาพ การจัดระเบียบใหม่ของโครงสร้างไซโตสเกเลตันของแอคติน การแบ่งเซลล์ การควบคุมการปล่อยสารออกนอกเซลล์ เคโมแท็กซิส การปิดท่อประสาท การกำหนดตำแหน่งของแพเมมเบรน วงจรเซลล์ การจัดระเบียบของเยื่อหุ้มเซลล์ กระบวนการไวรัส การควบคุมเชิงบวกของการประกอบฟิโลโพเดียม การส่งสัญญาณ เอ็กโซไซโทซิส การส่งสัญญาณของโปรตีน Ras เส้นทางการส่งสัญญาณที่ควบคุมโดยอินเตอร์ลิวคิน-12 แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
วิกิดาต้า
โปรตีน ที่เกี่ยวข้องกับ Ras คือRal-A (RalA) ซึ่งในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน RALA บนโครโมโซม 7 [ 5 ] [ 6 ] โปรตีนนี้เป็นหนึ่งในสองพาราล็อก ของโปรตีน Ral โดยอีกตัวหนึ่งคือRalB และเป็นส่วนหนึ่งของตระกูลRas GTPase [ 7 ] RalA ทำหน้าที่เป็นสวิตช์โมเลกุลเพื่อกระตุ้นกระบวนการทางชีวภาพหลายอย่าง โดยส่วนใหญ่คือการแบ่งเซลล์และการขนส่ง ผ่านทางเส้นทางการส่งสัญญาณ[ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] บทบาททางชีวภาพของมันจึงเกี่ยวข้องกับมะเร็ง หลาย ชนิด[ 9 ]
โครงสร้าง ไอโซฟอร์มของ Ral มีลำดับกรดอะมิโนที่ตรงกันโดยรวม 80% และบริเวณที่จับกับตัวกระตุ้นตรงกัน 100% ไอโซฟอร์มทั้งสองแตกต่างกันหลักๆ ในบริเวณไฮเปอร์แวริเอเบิลที่ปลาย C ซึ่งมีหลายตำแหน่งสำหรับการดัดแปลงหลังการแปล ทำให้เกิดตำแหน่งย่อยของเซลล์และหน้าที่ทางชีวภาพที่แตกต่างกัน ตัวอย่างเช่นการฟอสโฟรีเลชัน ของซีรีน 194 บน RalA โดยไคเนส Aurora A ส่งผลให้ RalA ย้ายไปยังเยื่อหุ้มไมโทคอนเดรียชั้นใน ซึ่ง RalA ช่วยในการแบ่งตัวของไมโทคอนเด รี ย ในขณะที่การฟอสโฟรีเลชันของซีรีน 198 บน RalB โดยไคเนสPKC ส่งผลให้ RalB ย้ายไปยังเยื่อหุ้มภายในอื่นๆ และกระตุ้นการทำงานที่ก่อให้เกิดเนื้องอก[ 9 ]
การทำงาน RalA เป็นหนึ่งในสองโปรตีนในตระกูล Ral ซึ่งเป็นตระกูลย่อยภายในตระกูล Ras ของ GTPase ขนาดเล็ก[ 7 ] ในฐานะ Ras GTPase, RalA ทำหน้าที่เป็นสวิตช์โมเลกุลที่จะทำงานเมื่อจับกับ GTP และไม่ทำงานเมื่อจับกับ GDP RalA สามารถถูกกระตุ้นโดย RalGEFs และในทางกลับกันจะกระตุ้นตัวกระตุ้นในเส้นทางการส่งสัญญาณที่นำไปสู่ผลลัพธ์ทางชีวภาพ[ 7 ] [ 8 ] ตัวอย่างเช่น RalA มีปฏิสัมพันธ์กับส่วนประกอบสองส่วนของexocyst คือExo84 และSec5 เพื่อส่งเสริมการประกอบออโตฟาโกโซม การขนส่งเวสิเคิลหลั่ง และการยึดเกาะ ฟังก์ชันปลายน้ำอื่นๆ ได้แก่เอ็กโซ ไซ โทซิส เอนโดไซโทซิ ส ที่อาศัย ตัวรับ การสร้าง ไทต์ จังก์ ชัน การสร้าง ฟิโลโพเดีย การแบ่ง ตัว ของไมโทคอนเดรีย และไซ โทคิเนซิ ส[ 7 ] [ 9 ] [ 10 ] การปล่อยสารออกนอกเซลล์โดยอาศัย Ral ยังเกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพต่างๆ เช่น การกระตุ้น เกล็ดเลือด การทำงานของเซลล์ภูมิคุ้มกัน ความยืดหยุ่น ของระบบประสาทและการควบคุมการทำงาน ของ อินซูลิน [ 11 ]
แม้ว่าฟังก์ชันข้างต้นดูเหมือนจะถูกแบ่งปันระหว่างไอโซฟอร์ม Ral ทั้งสอง แต่ตำแหน่งย่อยของเซลล์ที่แตกต่างกันส่งผลให้มีส่วนร่วมในกระบวนการทางชีววิทยาที่แตกต่างกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง RalA มีส่วนเกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์ที่ไม่ขึ้นกับการยึดเกาะ การขนส่งเวสิเคิล และการจัดระเบียบโครงสร้างเซลล์ มากกว่า [ 8 ] [ 12 ] ยิ่งไปกว่านั้น RalA ยังมีปฏิสัมพันธ์กับ Exo84 และ Sec5 โดยเฉพาะเพื่อควบคุมการขนส่งโปรตีนเยื่อหุ้มเซลล์ในเซลล์เยื่อบุผิวที่มีขั้วและGLUT4 ไปยังเยื่อหุ้มพลาสมา ตลอดจนการแบ่งตัวของไมโทคอนเดรียเพื่อการแบ่งเซลล์[ 7 ]
ความสำคัญทางคลินิก โปรตีน Ral มีความเกี่ยวข้องกับการลุกลามของมะเร็งหลายชนิด รวมถึงมะเร็งกระเพาะปัสสาวะและมะเร็งต่อมลูกหมาก[ 9 ] แม้ว่ากลไกที่แน่นอนยังไม่ชัดเจน แต่การศึกษาพบว่า RalA ส่งเสริมการเจริญเติบโตแบบไม่ขึ้นกับการยึดเกาะในเซลล์มะเร็ง[ 8 ] ดังนั้น การยับยั้ง RalA จึงยับยั้งการเริ่มต้นของมะเร็ง[ 9 ]
Due to its exocytotic role in platelets, immune cells, neurons, and insulin regulation, downregulation of Ral may lead to pathological conditions such as thrombosis and metabolic syndrome . In chronic thromboembolic pulmonary hypertension patients, Ral GTPases have been observed to be highly active in their platelets.[ 11]
Interactions RalA has been shown to interact with:
อ่านเพิ่มเติม Kinsella BT, Erdman RA, Maltese WA (พฤษภาคม 1991). "การเติมไอโซพรีนิลที่ปลายคาร์บอกซิลของโปรตีนจับ GTP ที่เกี่ยวข้องกับ ras ซึ่งเข้ารหัสโดย rac1, rac2 และ ralA"วารสารเคมีชีวภาพ 266 ( 15): 9786– 94. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92889-9 . PMID 1903399 . Polakis PG, Weber RF, Nevins B, Didsbury JR, Evans T, Snyderman R (ต.ค. 1989). "การระบุผลิตภัณฑ์ยีน ral และ rac1 โปรตีนจับ GTP มวลโมเลกุลต่ำจากเกล็ดเลือดมนุษย์"วารสารชีวเคมี 264 ( 28 ): 16383– 9. doi : 10.1016/S0021-9258(19)84717-8 . PMID 2550440 . Chardin P, Tavitian A (มิถุนายน 1989). "ลำดับการเข้ารหัสของ cDNA ralA และ ralB ของมนุษย์" . Nucleic Acids Research . 17 (11): 4380. doi : 10.1093/nar/17.11.4380 . PMC 317954 . PMID 2662142 . Cantor SB, Urano T, Feig LA (สิงหาคม 1995). "การระบุและลักษณะเฉพาะของโปรตีนที่จับกับ Ral 1 ซึ่งเป็นเป้าหมายปลายทางที่เป็นไปได้ของ Ral GTPases" . Molecular and Cellular Biology . 15 (8): 4578– 84. doi : 10.1128/mcb.15.8.4578 . PMC 230698 . PMID 7623849 . Jullien-Flores V, Dorseuil O, Romero F, Letourneur F, Saragosti S, Berger R, Tavitian A, Gacon G, Camonis JH (ก.ย. 1995). "การเชื่อมโยง Ral GTPase กับเส้นทาง Rho RLIP76 ซึ่งเป็นตัวกระตุ้น Ral ที่มีกิจกรรมโปรตีนกระตุ้น CDC42/Rac GTPase"วารสารชีวเคมี270 ( 38): 22473– 7. doi : 10.1074/jbc.270.38.22473 . PMID 7673236 . Wang KL, Khan MT, Roufogalis BD (มิถุนายน 1997). "การระบุและลักษณะเฉพาะของโดเมนที่จับกับแคลโมดูลินใน Ral-A โปรตีนที่จับกับ GTP ที่เกี่ยวข้องกับ Ras ซึ่งบริสุทธิ์จากเยื่อหุ้มเซลล์เม็ดเลือดแดงของมนุษย์" วารสารชีวเคมี 272 ( 25 ) : 16002– 9. doi : 10.1074/jbc.272.25.16002 . PMID 9188503 . Luo JQ, Liu X, Hammond SM, Colley WC, Feig LA, Frohman MA, Morris AJ, Foster DA (มิถุนายน 1997). "RalA มีปฏิสัมพันธ์โดยตรงกับฟอสโฟลิเปส D1 ที่ตอบสนองต่อ Arf และขึ้นอยู่กับ PIP2" . Biochemical and Biophysical Research Communications . 235 (3): 854– 9. doi : 10.1006/bbrc.1997.6793 . PMID 9207251 . Ikeda M, Ishida O, Hinoi T, Kishida S, Kikuchi A (ม.ค. 1998). "การระบุและลักษณะเฉพาะของโปรตีนใหม่ที่โต้ตอบกับโปรตีนที่จับกับ Ral 1 ซึ่งเป็นโปรตีนตัวกระตุ้นที่คาดว่าจะเป็นของ Ral"วารสารเคมีชีวภาพ 273 ( 2): 814– 21. doi : 10.1074/jbc.273.2.814 . PMID 9422736 . Vavvas D, Li X, Avruch J, Zhang XF (มีนาคม 1998). "การระบุ Nore1 ว่าเป็นตัวกระตุ้น Ras ที่มีศักยภาพ"วารสารเคมีชีวภาพ 273 ( 10): 5439– 42. doi : 10.1074/jbc.273.10.5439 . PMID 9488663 . Kim JH, Lee SD, Han JM, Lee TG, Kim Y, Park JB, Lambeth JD, Suh PG, Ryu SH (กรกฎาคม 1998). "การกระตุ้นฟอสโฟลิเปส D1 โดยการโต้ตอบโดยตรงกับ ADP-ribosylation factor 1 และ RalA" FEBS Letters . 430 (3): 231– 5. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00661-9 . PMID 9688545 . S2CID 36075513 . Ohta Y, Suzuki N, Nakamura S, Hartwig JH, Stossel TP (มีนาคม 1999). "GTPase ขนาดเล็ก RalA กำหนดเป้าหมายฟิลาเมนเพื่อชักนำให้เกิดฟิโลโพเดีย" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (5): 2122– 8. Bibcode : 1999PNAS...96.2122O . doi : 10.1073/pnas.96.5.2122 . PMC 26747 . PMID 10051605 . Wang KL, Roufogalis BD (พฤษภาคม 1999). "Ca2+/calmodulin กระตุ้นการจับ GTP กับโปรตีน ral-A ที่เกี่ยวข้องกับ ras" วารสารชีวเคมี 274 ( 21 ) : 14525– 8. doi : 10.1074/jbc.274.21.14525 . PMID 10329639 . Suzuki J, Yamazaki Y, Li G, Kaziro Y, Koide H, Guang L (กรกฎาคม 2543). "การมีส่วนร่วมของ Ras และ Ral ในการเคลื่อนที่แบบเคโมแทกติกของเซลล์กล้ามเนื้อโครงร่าง" . Molecular and Cellular Biology . 20 (13): 4658– 65. doi : 10.1128/MCB.20.13.4658-4665.2000 . PMC 85875 . PMID 10848592 . เดอ บรอยน์ KM, เด รอยจ์ เจ, โวลทุยส์ อาร์เอ็ม, เรห์มันน์ เอช, เวเซ่นบีค เจ, คูล RH, วิตติงโฮเฟอร์ AH, บอส เจแอล (ก.ย. 2000) "RalGEF2 ซึ่งเป็นโดเมนที่คล้ายคลึงกันของเพล็กสทรินที่มีปัจจัยแลกเปลี่ยนนิวคลีโอไทด์กัวนีนสำหรับ Ral " วารสารเคมีชีวภาพ . 275 (38): 29761– 6. ดอย : 10.1074/jbc.M001160200 . PMID 10889189 . Brymora A, Valova VA, Larsen MR, Roufogalis BD, Robinson PJ (สิงหาคม 2544). "คอมเพล็กซ์เอ็กโซซิสต์ในสมองมีปฏิสัมพันธ์กับ RalA ในลักษณะที่ขึ้นอยู่กับ GTP: การระบุยีน Sec3 ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดใหม่และยีน Sec15 ตัวที่สอง"วารสารเคมีชีวภาพ 276 ( 32): 29792– 7. doi : 10.1074/jbc.C100320200 . PMID 11406615 . Sugihara K, Asano S, Tanaka K, Iwamatsu A, Okawa K, Ohta Y (ม.ค. 2545). "คอมเพล็กซ์เอ็กโซซิสต์จับกับ GTPase ขนาดเล็ก RalA เพื่อเป็นตัวกลางในการสร้างฟิโลโพเดีย" Nature Cell Biology . 4 (1): 73– 8. doi : 10.1038/ncb720 . PMID 11744922 . S2CID 9528945 . Clough RR, Sidhu RS, Bhullar RP (สิงหาคม 2545). "แคลโมดูลินจับกับ RalA และ RalB และจำเป็นสำหรับการกระตุ้น Ral ที่เกิดจากทรอมบินในเกล็ดเลือดมนุษย์"วารสารชีวเคมี 277 ( 32): 28972– 80. doi : 10.1074/jbc.M201504200 . PMID 12034722 . Xu L, Frankel P, Jackson D, Rotunda T, Boshans RL, D'Souza-Schorey C , Foster DA (ม.ค. 2546). "กิจกรรมของฟอสโฟลิเปส D ที่เพิ่มขึ้นในเซลล์ที่ถูกแปลงสภาพด้วย H-Ras แต่ไม่ใช่ K-Ras โดยการทำงานร่วมกันของ RalA และ ARF6" . Molecular and Cellular Biology . 23 (2): 645– 54. doi : 10.1128/MCB.23.2.645-654.2003 . PMC 151535 . PMID 12509462 .
ลิงก์ภายนอก Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt : P11233 (Ras-related protein Ral-A) at the PDBe-KB .