อ่าน 6 นาที
รูปแบบที่หายาก (ทางพันธุกรรม)
ตัวแปรที่หายากคือตัวแปรทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในความถี่ ต่ำ ในประชากร ตัวแปรที่หายากมีบทบาทสำคัญทั้งในโรคที่ซับซ้อนและ โรค เมนเดลและเป็นสาเหตุส่วนหนึ่งของการถ่ายทอดทางพันธุกรรม...
รูปแบบที่หายาก (ทางพันธุกรรม)
ตัวแปรที่หายากคือตัวแปรทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในความถี่ ต่ำ ในประชากร[ 1 ] ตัวแปรที่หายากมีบทบาทสำคัญทั้งในโรคที่ซับซ้อนและ โรค เมนเดลและเป็นสาเหตุส่วนหนึ่งของการถ่ายทอดทางพันธุกรรม ที่หายไป ของโรคที่ซับซ้อน กรณีทางทฤษฎีสำหรับบทบาทสำคัญของตัวแปรที่หายากคืออัลลีลที่ทำให้บุคคลมีแนวโน้มที่จะเป็นโรคอย่างมากจะถูกรักษาไว้ในความถี่ต่ำในประชากรโดยการคัดเลือกแบบบริสุทธิ์ [ 2 ] ตัวแปรที่หายากกำลังได้รับการศึกษามากขึ้นเรื่อยๆ อันเป็นผลมาจาก ความพยายามในการจัดลำดับ เอ็กโซมทั้งหมดและจีโนมทั้งหมดแม้ว่าตัวแปรเหล่านี้แต่ละตัวจะมีความถี่น้อยในประชากร แต่ก็มีอยู่มากมายในประชากรมนุษย์ และอาจเป็นเอกลักษณ์เฉพาะของประชากรบางกลุ่ม พวกมันมีแนวโน้มที่จะเป็นอันตรายมากกว่าตัวแปรทั่วไป อันเป็นผลมาจากการเติบโตของประชากรอย่างรวดเร็วและการคัดเลือกแบบบริสุทธิ์ที่อ่อนแอ[ 3 ] พวกมันถูกสงสัยว่าทำงานอย่างอิสระหรือร่วมกับตัวแปรทั่วไปเพื่อก่อให้เกิดโรค[ 4 ]
วิธีการค้นพบ
บางวิธี เช่น การทดสอบภาระทางพันธุกรรม ได้รับการพัฒนาขึ้นโดยเฉพาะเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของตัวแปรที่หายาก[ 5 ]วิธีเหล่านี้จะรวบรวมตัวแปรที่หายากในบริเวณทางพันธุกรรม เช่น ยีนหรือวิถีการทำงานทั้งหมด และประเมินผลสะสมของตัวแปรทางพันธุกรรมหลายตัว วิธีเหล่านี้อาจเพิ่มประสิทธิภาพเมื่อตัวแปรหลายตัวในบริเวณนั้นมีความสัมพันธ์กับโรคหรือลักษณะเฉพาะ นอกจากนี้ เมื่อเปรียบเทียบกับการศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมการทดสอบตามบริเวณหรือยีนจะทำการทดสอบน้อยกว่ามาก ส่งผลให้การแก้ไขสมมติฐานหลายข้อมีความเข้มงวดน้อยกว่าความสำคัญทั่วทั้งจีโนม[ 6 ]ตัวอย่างของวิธีการเหล่านี้ ได้แก่ SKAT [ 7 ] SKAT-O [ 5 ]การทดสอบ ARIEL [ 8 ] aSUM [ 9 ]และ STAAR [ 10 ]คำอธิบายประกอบ SNP ช่วยในการจัดลำดับความสำคัญ ของตัวแปรการทำงานที่หายาก และการรวมคำอธิบายประกอบเหล่านี้สามารถเพิ่มประสิทธิภาพของการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของตัวแปรที่หายากของการศึกษา ลำดับ เอ็กโซมทั้งหมดและจีโนมทั้งหมด ได้อย่างมีประสิทธิภาพ [ 11 ] [ 12 ]
ดูเพิ่มเติม
- ความถี่ของอัลลีล
- จีโนมิกส์เชิงฟังก์ชัน
- การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม
- คำอธิบายประกอบ SNP
- การลำดับจีโนมทั้งหมด
- การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด
อ่านเพิ่มเติม
- การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของการค้นพบตัวแปรทางพันธุกรรมที่หายากในโรคภูมิต้านตนเอง
- การผสานรวมคำอธิบายการทำงานในคอมพิวเตอร์หลายรายการแบบไดนามิก ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของตัวแปรหายากในการศึกษาลำดับจีโนมทั้งหมดขนาดใหญ่ได้อย่างมีประสิทธิภาพ
- STAARpipeline: เครื่องมือแบบครบวงจรสำหรับวิเคราะห์ความแปรผันทางพันธุกรรมที่หายาก จากข้อมูลลำดับดีเอ็นเอทั้งจีโนมในระดับธนาคารชีวภาพ
- หลักฐานสนับสนุนความสัมพันธ์ระหว่างความแปรผันทางพันธุกรรมที่หายาก I425V ของยีนตัวขนส่งเซโรโทนินกับความเสี่ยงต่อการเกิดโรคย้ำคิดย้ำทำ
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ รูปแบบที่หายาก (ทางพันธุกรรม)
ตัวแปรที่หายากคือตัวแปรทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในความถี่ ต่ำ ในประชากร ตัวแปรที่หายากมีบทบาทสำคัญทั้งในโรคที่ซับซ้อนและ โรค เมนเดลและเป็นสาเหตุส่วนหนึ่งของการถ่ายทอดทางพันธุกรรม...
วิธีการค้นพบ
บางวิธี เช่น การทดสอบภาระทางพันธุกรรม ได้รับการพัฒนาขึ้นโดยเฉพาะเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของตัวแปรที่หายาก [ 5 ] วิธีเหล่านี้จะรวบรวมตัวแปรที่หายากในบริเวณทางพันธุกรรม เช่น ยีนหรือวิถีการทำงานทั้งหมด และประเมินผลสะสมของตัวแปรทางพันธุกรรมหลายตัว...
ดูเพิ่มเติม
ความถี่ของอัลลีล จีโนมิกส์เชิงฟังก์ชัน การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม คำอธิบายประกอบ SNP การลำดับจีโนมทั้งหมด การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด
อ่านเพิ่มเติม
การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของการค้นพบตัวแปรทางพันธุกรรมที่หายากในโรคภูมิต้านตนเอง การผสานรวมคำอธิบายการทำงานในคอมพิวเตอร์หลายรายการแบบไดนามิก ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของตัวแปรหายากในการศึกษาลำดับจีโนมทั้งหมดขนาดใหญ่ได้อย่างมีประสิทธิภาพ STAARpipeline:...