รูฟเอบีซี
RuvABCเป็นคอมเพล็กซ์ของโปรตีน สามชนิด ที่ทำหน้าที่ควบคุมการเคลื่อนย้ายกิ่งก้านและแก้ไขจุดเชื่อมต่อฮอลลิเดย์ที่เกิดขึ้นระหว่างการรวมตัวของโฮโมโลกัสในแบคทีเรีย[ 1 ]ด้วยเหตุนี้ RuvABC จึงมีความสำคัญต่อการซ่อมแซม DNA ของ แบคทีเรีย
RuvA และ RuvB จับกับโครงสร้าง DNA สี่สายที่เกิดขึ้นในตัวกลาง Holliday junction และเคลื่อนย้ายสายผ่านกันและกันโดยใช้กลไกการม้วนที่คาดการณ์ไว้[ 2 ]คอมเพล็กซ์ RuvAB สามารถดำเนินกิจกรรม DNA helicaseซึ่งช่วยคลายเกลียว DNA แบบคู่ การจับกันของโปรตีน RuvC กับคอมเพล็กซ์ RuvAB เชื่อว่าเป็นการตัดสาย DNA จึงทำให้ Holliday junction ได้รับการแก้ไข
โปรตีนคอมเพล็กซ์
RuvABC เป็นคอมเพล็กซ์ของโปรตีนสามชนิดที่แก้ไข Holliday junction ที่เกิดขึ้นระหว่างการรวมตัวกันของโฮโมโลกัสใน แบคทีเรีย ในEscherichia coliการจำลองดีเอ็นเอจะหยุดชะงักอย่างน้อยหนึ่งครั้งต่อรอบเซลล์ ดังนั้นการจำลองดีเอ็นเอจะต้องเริ่มต้นใหม่หากเซลล์จะอยู่รอดได้[ 3 ]การเริ่มต้นการจำลองใหม่เป็นกระบวนการหลายขั้นตอนในE. coliที่ต้องอาศัยการทำงานตามลำดับของโปรตีนหลายชนิด เมื่อความคืบหน้าของการจำลองถูกขัดขวางโปรตีนที่จับกับสายเดี่ยว และ เฮลิเคส RecG พร้อมกับคอมเพล็กซ์ RuvABC จะจำเป็นสำหรับการกู้คืน[ 3 ]การแก้ไข Holliday junction ที่สะสมหลังจากการจำลองบนแม่แบบดีเอ็นเอที่เสียหายในE. coliต้องอาศัยคอมเพล็กซ์ RuvABC [ 4 ]
รูวา
RuvAเป็นโปรตีนที่จับกับ DNA ซึ่งจับกับ Holliday junction ด้วยความสัมพันธ์สูง โครงสร้างของคอมเพล็กซ์ได้รับการอธิบายแตกต่างกันไปผ่านการวิเคราะห์ด้วยรังสีเอกซ์และข้อมูลจาก EM [ 5 ] RuvA สร้างเทตราเมอร์ที่จับกับ Holliday junction และบังคับให้มันอยู่ในโครงสร้างระนาบ[ 2 ] [ 6 ]ในบางกรณี เทตราเมอร์ตัวที่สองจะจับกับด้านตรงข้ามของ DNA ทำให้เกิดเปลือกหุ้มรอบ junction [ 2 ] [ 6 ]เทตราเมอร์ของ RuvA มีหมุดที่เป็นกรดอยู่ใกล้ศูนย์กลางซึ่งช่วยในการคลายเกลียวและมีส่วนช่วยในการกำหนดความจำเพาะของสารตั้งต้น[ 1 ] [ 6 ]
รูฟบี
RuvB เป็น ATPaseที่ขึ้นอยู่กับ DNA ซึ่งสร้างวงแหวนเฮกซาเมอร์รอบแขนของ Holliday junction [ 2 ] [ 5 ]เชื่อกันว่า RuvB ทำหน้าที่สูบฉีด DNA ผ่าน RuvA โดยใช้พลังงานที่เกิดจากการไฮโดรไลซิสของ ATP ซึ่งจะเปลี่ยน DNA แบบโฮโมดูเพล็กซ์ให้เป็นเฮเทโรดูเพล็ก ซ์ [ 1 ]
รูฟซี
RuvC เป็นเอนไซม์รี โซลเวสที่ตัดฮอลลิเดย์จังก์ชัน RuvC จับกับฮอลลิเดย์จังก์ชันในรูปของโฮโมไดเมอร์[ 1 ]ในรูปของโฮโมไดเมอร์ จะมีตำแหน่งเอนโดนิวคลีเอสที่ทำงานได้สองตำแหน่ง ซึ่งแต่ละตำแหน่งสามารถสร้างการแตกของสายคู่ได้[ 2 ] RuvC สามารถจับกับคอมเพล็กซ์ได้ทั้งสองทิศทาง ดังนั้นจึงสามารถแก้ไขฮอลลิเดย์จังก์ชันได้ทั้งในแนวนอนและแนวตั้ง[ 5 ]มีทฤษฎีหลายอย่างเกี่ยวกับวิธีที่ RuvC สามารถเข้าถึงคอมเพล็กซ์การเคลื่อนย้ายกิ่งได้[ 6 ]ทฤษฎีหนึ่งคือ เตตระเมอร์ของ RuvA จับกับ DNA เพียงด้านเดียว ทำให้มีด้านที่เปิดโล่งให้ RuvC จับได้ อีกทฤษฎีหนึ่งคือ RuvA ไม่รักษาโครงสร้างคล้ายเปลือกที่มันสร้างขึ้นรอบๆ จังก์ชันในตอนแรก แต่จะเปิดออกเพื่อให้ RuvC สามารถเข้าถึง DNA ได้[ 2 ]
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- เวสต์, สตีเฟน ซี. (มิถุนายน 2546). "มุมมองระดับโมเลกุลของโปรตีนการรวมตัวใหม่และการควบคุม" Nature Reviews Molecular Cell Biology . 4 (6): 435– 445. doi : 10.1038/nrm1127 . PMID 12778123 . S2CID 28474965 .
- Kowalczykowski, Stephen C (เมษายน 2543). "การเริ่มต้นของการรวมตัวทางพันธุกรรมและการจำลองแบบที่ขึ้นอยู่กับการรวมตัว". แนวโน้มในวิทยาศาสตร์ชีวเคมี 25 ( 4): 156– 165. doi : 10.1016/S0968-0004(00)01569-3 . PMID 10754547 .
ลิงก์ภายนอก
- Holliday+Junction+Resolvases ที่ US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)