เอสเอฟ3บี3
หน่วยย่อย 3 ของปัจจัยการตัดต่อ 3B เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSF3B3 [ 5 ] [ 6 ]
ยีนนี้เข้ารหัสซับยูนิต 3 ของโปรตีนคอมเพล็กซ์ตัวกระตุ้นการตัดต่อ 3b ตัวกระตุ้นการตัดต่อ 3b ร่วมกับตัวกระตุ้นการตัดต่อ 3a และหน่วย RNA 12S ก่อตัวเป็นคอมเพล็กซ์ไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์ขนาดเล็ก U2 (U2 snRNP) คอมเพล็กซ์ตัวกระตุ้นการตัดต่อ 3b/3a จับกับพรี-mRNAเหนือตำแหน่งกิ่งของอินทรอนในลักษณะที่ไม่ขึ้นกับลำดับ และอาจยึด U2 snRNP ไว้กับพรี-mRNA ตัวกระตุ้นการตัดต่อ 3b ยังเป็นส่วนประกอบของสไปโซโซมชนิด U12 ขนาดเล็กอีกด้วย นอกจากนี้ ซับยูนิต 3 ยังได้รับการระบุว่าเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ตัวกระตุ้นการถอดรหัส STAGA (SPT3-TAF(II)31-GCN5L acetylase) และคอมเพล็กซ์ TFTC (TATA-binding-protein-free TAF(II)) คอมเพล็กซ์เหล่านี้อาจทำหน้าที่ในการปรับเปลี่ยนโครมาติน การถอดรหัส การตัดต่อ และการซ่อมแซม DNA [ 6 ]
ปฏิสัมพันธ์
SF3B3 ได้รับการแสดงให้เห็นว่าโต้ตอบกับ SF3B1 [ 5 ] [ 7 ] โปรตีนเริ่มต้นการถอดรหัส SPT3 homolog [ 8 ]และTAF9 [ 8 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Nomura N, Miyajima N, Sazuka T และ คณะ (1995). "การทำนายลำดับรหัสของยีนมนุษย์ที่ไม่ทราบชนิด I. ลำดับรหัสของยีนใหม่ 40 ยีน (KIAA0001-KIAA0040) ที่ได้จากการวิเคราะห์โคลน cDNA ที่สุ่มตัวอย่างจากเซลล์เม็ดเลือดขาวชนิดไมอีลอยด์ที่ยังไม่เจริญเต็มที่ของมนุษย์ KG-1" DNA Res . 1 (1): 27– 35. doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID 7584026 .
- Nomura N, Miyajima N, Sazuka T และ คณะ (1995). "การทำนายลำดับรหัสของยีนมนุษย์ที่ไม่ทราบชนิด I. ลำดับรหัสของยีนใหม่ 40 ยีน (KIAA0001-KIAA0040) ที่ได้จากการวิเคราะห์โคลน cDNA ที่สุ่มตัวอย่างจากเซลล์เม็ดเลือดขาวชนิดไมอีลอยด์ที่ยังไม่เจริญเต็มที่ของมนุษย์ KG-1 (ภาคผนวก)" DNA Res . 1 (1): 47– 56. doi : 10.1093/dnares/1.1.47 . PMID 7584028 .
- Bonaldo MF; Lennon G; Soares MB (1997). "การทำให้เป็นมาตรฐานและการลบ: สองแนวทางเพื่ออำนวยความสะดวกในการค้นพบยีน" . Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Mintz PJ, Patterson SD, Neuwald AF และ คณะ (1999). "การทำให้บริสุทธิ์และลักษณะทางชีวเคมีของกลุ่มเม็ดแกรนูลระหว่างโครโมโซม" EMBO J . 18 (15): 4308– 20. doi : 10.1093/emboj/18.15.4308 . PMC 1171507 . PMID 10428969 .
- Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M และ คณะ (2001). "โปรตีนที่จับกับ DNA ที่เสียหายจากรังสียูวีในคอมเพล็กซ์ TFTC เชื่อมโยงการรับรู้ความเสียหายของ DNA กับการอะเซทิเลชันของนิวคลีโอโซม" . EMBO J . 20 (12): 3187– 96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
- Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S และ คณะ (2001). "ส่วนประกอบ TFIID ของมนุษย์ TAFII140 และแมลงหวี่ BIP2 (TAFII155) เป็นโฮโมล็อกของ TAFII47 ในยีสต์ชนิดใหม่ที่มีโครงสร้างฮิสโตนและนิ้ว PHD" . Mol. Cell. Biol . 21 (15): 5109– 21. doi : 10.1128/MCB.21.15.5109-5121.2001 . PMC 87236 . PMID 11438666 .
- Will CL, Schneider C, MacMillan AM และ คณะ (2001). "โปรตีน U2 และ U11/U12 snRNP ชนิดใหม่ที่เชื่อมโยงกับตำแหน่งกิ่งของ pre-mRNA" . EMBO J . 20 (16): 4536– 46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
- Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A และ คณะ (2001). "คอมเพล็กซ์ STAGA ของมนุษย์เป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสที่อะซิทิลเลตโครมาตินซึ่งมีปฏิสัมพันธ์กับปัจจัยการตัดต่อ pre-mRNA และปัจจัยการจับกับความเสียหายของ DNA ในร่างกาย" . Mol. Cell. Biol . 21 (20): 6782– 95. doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR และ คณะ (2002). "การทำให้บริสุทธิ์และลักษณะเฉพาะของสไปโซโซมดั้งเดิมที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์โครงสร้างสามมิติ" . RNA . 8 (4): 426– 39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
- Scott MP, Zappacosta F, Kim EY และ คณะ (2002). "การระบุลิแกนด์โดเมน SH3 ใหม่สำหรับไคเนสตระกูล Src Hck โปรตีน Wiskott-Aldrich syndrome (WASP), โปรตีนที่ทำปฏิกิริยากับ WASP (WIP) และ ELMO1" . J. Biol. Chem . 277 (31): 28238– 46. doi : 10.1074/jbc.M202783200 . PMID 12029088 .
- Will CL, Urlaub H, Achsel T และ คณะ (2002). "การจำแนกลักษณะของโปรตีน SF3b และ 17S U2 snRNP ใหม่ รวมถึงโฮโมล็อก Prp5p ของมนุษย์และโปรตีน SF3b DEAD-box" EMBO J . 21 (18): 4978– 88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และ คณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Cavusoglu N; Brand M; Tora L; Van Dorsselaer A (2003). "หน่วยย่อยใหม่ของโปรตีนที่จับกับ TATA ที่มี TAFII อิสระที่ระบุโดยแมสสเปกโทรเมตรีแบบเลเซอร์ช่วยการดูดซับ/ไอออนไนเซชัน-ไทม์ออฟไฟลต์หลังจากการแยกด้วยเจลอิเล็กโทรโฟเรซิสแบบหนึ่งมิติ" Proteomics . 3 (2): 217– 23. doi : 10.1002/pmic.200390030 . PMID 12601814 . S2CID 6035986 .
- Li J, Hawkins IC, Harvey CD และ คณะ (2003). "การควบคุมการตัดต่อทางเลือกโดย SRrp86 และโปรตีนที่ทำปฏิกิริยาด้วย" . Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7437– 47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T และ คณะ (2004). "การจัดลำดับและลักษณะเฉพาะของ cDNA มนุษย์ความยาวเต็ม 21,243 รายการ" Nat . Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Will CL, Schneider C, Hossbach M และ คณะ (2004). "snRNP 18S U11/U12 ของมนุษย์ประกอบด้วยโปรตีนชุดใหม่ที่ไม่พบในสไปโซโซมที่ขึ้นอยู่กับ U2" . RNA . 10 (6): 929– 41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
- Jin J, Smith FD, Stark C และ คณะ (2004). "การวิเคราะห์โปรตีนที่จับกับ 14-3-3 ในร่างกายที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมโครงสร้างเซลล์และการจัดระเบียบเซลล์" Curr . Biol . 14 (16): 1436– 50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA และ คณะ (2004). "สถานะ คุณภาพ และการขยายตัวของโครงการ cDNA ความยาวเต็มของ NIH: ชุดยีนสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Ewing RM, Chu P, Elisma F และ คณะ (2007). "การทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนของมนุษย์ในระดับใหญ่ด้วยแมสสเปกโทรเมตรี" Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .