TAF9
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	TAF9 , MGC:5067, STAF31/32, TAF2G, TAFII-31, TAFII-32, TAFII31, TAFII32, TAFIID32, ปัจจัยที่เกี่ยวข้องกับโปรตีนการจับ TATA-box 9
รหัสภายนอก	โอมิม : 600822 ; เอ็มจีไอ : 1888697 ; โฮโมโลยีน : 39986 ; GeneCards : TAF9 ; OMA : TAF9 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 5 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 5q13.2 เริ่ม 69,362,026 bp [ 1 ] จบ 69,370,013 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 13 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 13 | 13 D1 เริ่ม 100,788,087 bp [ 2 ] จบ 100,792,568 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน อัณฑะซ้าย อัณฑะข้างขวา ต่อมเพศ เกาะลางเกอร์ฮันส์ ทวารหนัก ร่องหน้าผากส่วนบน เปลือกสมองส่วนหน้า โมโนไซต์ คอร์เทกซ์พรีฟรอนทัลด้านข้างส่วนหลัง บริเวณรับกลิ่นของเยื่อบุจมูก สูงสุดที่แสดงใน สเปิร์มมาติด เซลล์สเปิร์ม อัณฑะ เอพิบลาสต์ ปุ่มอวัยวะเพศ หางของตัวอ่อน โอโอไซต์รอง ไซโกต โอโอไซต์ปฐมภูมิ สมองส่วนกลาง ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอจีพีเอส ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับ DNA การจับกับ ATPase กิจกรรมตัวกระตุ้นการถอดรหัสร่วม การจับตัวของ p53 การจับกันของโดเมนซิงค์ฟิงเกอร์ C2H2 กิจกรรมของฮิสโตนอะเซทิลทรานสเฟอเรส การจับโปรตีน กิจกรรมการสร้างเฮเทอโรไดเมอร์ของโปรตีน การจับตัวของปัจจัยถอดรหัส กิจกรรมปัจจัยเริ่มต้นการถอดรหัสทั่วไปของ RNA polymerase II ส่วนประกอบของเซลล์ ปัจจัยถอดรหัส TFTC คอมเพล็กซ์ คอมเพล็กซ์พรี-สโนอาร์เอ็นพี ปัจจัยถอดรหัส TFIID คอมเพล็กซ์ คอมเพล็กซ์ MLL1 คอมเพล็กซ์ SAGA นิวเคลียส นิวคลีโอพลาสม์ กระบวนการทางชีวภาพ การตอบสนองต่ออินเตอร์ลิวคิน-1 การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การควบคุมเชิงลบของเส้นทางการส่งสัญญาณอะพอพโทซิสภายในเพื่อตอบสนองต่อความเสียหายของ DNA โดยตัวกลางในกลุ่ม p53 การทำให้โปรตีนคงตัว การควบคุมเชิงลบของกระบวนการอะพอพโทซิส การถอดรหัสโดย RNA polymerase II การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นที่ทำให้เกิดความเสียหายต่อดีเอ็นเอ การควบคุมเชิงบวกของการตอบสนองต่อสิ่งกระตุ้นไซโตไคน์ กล่อง C/D ชุดประกอบ snoRNP การควบคุมการเจริญเติบโตของเซลล์ในเชิงบวก การอะเซทิเลชันของฮิสโตน H3 การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การเริ่มต้น การควบคุมเชิงลบของกระบวนการสลายโปรตีนที่ขึ้นอยู่กับยูบิควิตินของโปรตีเอโซม การเริ่มต้นการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II การถอดรหัส snRNA โดย RNA polymerase II การควบคุมการส่งสัญญาณโดยตัวกลางคลาส p53 การประกอบคอมเพล็กซ์ก่อนการเริ่มต้นของ RNA polymerase II แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 6880 108143 วงดนตรี ENSG00000273841 ENSG00000276463 ENSMUSG00000052293 ยูนิโปรท Q16594 Q8VI33 RefSeq (mRNA) NM_003187 NM_001015892 NM_001015889 NM_027139 RefSeq (โปรตีน) NP_001015892 NP_003178 NP_001015889 NP_081415 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 5: 69.36 – 69.37 Mb Chr 13: 100.79 – 100.79 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

TAF9 RNA polymerase II, ปัจจัยที่เกี่ยวข้องกับโปรตีนที่จับกับกล่อง TATA (TBP) ขนาด 32 kDa ^หรือที่รู้จักกันในชื่อTAF9เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนTAF9 ^{[ 5 ]} [ ^{6 ]}

การเริ่มต้นการถอดรหัสโดยRNA polymerase IIต้องอาศัยการทำงานของโปรตีนมากกว่า 70 ชนิด โปรตีนคอมเพล็กซ์ที่ประสานงานการทำงานเหล่านี้คือปัจจัยการถอดรหัส IID ( TFIID ) ซึ่งจับกับ โปรโมเตอร์หลักเพื่อจัดตำแหน่ง polymerase ให้ถูกต้อง ทำหน้าที่เป็นโครงสร้างสำหรับการประกอบส่วนที่เหลือของคอมเพล็กซ์การถอดรหัส และทำหน้าที่เป็นช่องทางสำหรับสัญญาณควบคุม TFIID ประกอบด้วยโปรตีนที่จับกับ TATA ( TBP ) และกลุ่มโปรตีนที่ได้รับการอนุรักษ์ทางวิวัฒนาการที่รู้จักกันในชื่อปัจจัยที่เกี่ยวข้องกับ TBP หรือ TAFs TAFs อาจมีส่วนร่วมในการถอดรหัสพื้นฐาน ทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้นร่วม ทำหน้าที่ในการจดจำโปรโมเตอร์ หรือปรับเปลี่ยนปัจจัยการถอดรหัสทั่วไป (GTFs) เพื่ออำนวยความสะดวกในการประกอบคอมเพล็กซ์และการเริ่มต้นการถอดรหัส ยีนนี้เข้ารหัสหนึ่งในหน่วยย่อยที่เล็กกว่าของ TFIID ซึ่งจับกับปัจจัยการถอดรหัสพื้นฐานGTF2B เช่นเดียวกับตัวกระตุ้นการถอดรหัสหลาย ตัวเช่นp53และVP16พบยีนที่คล้ายกันแต่แตกต่างกัน ( TAF9B ) บน โครโมโซม Xและพบยีนเทียม บน โครโมโซม 19การตัดต่อทางเลือกส่งผลให้เกิดรูปแบบการถอดรหัสหลายแบบที่เข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกัน^{[ 5 ]}

โดเมนทรานส์แอคติเวติง (TAD) ที่มีความยาว 17 กรดอะมิโนของปัจจัยการถอดรหัสหลายชนิดได้รับการรายงานว่าจับกับ TAF9 โดยตรง ได้แก่ p53, VP16, HSF1 , NF-IL6 , NFAT1 , NF-κBและ ALL1/MLL1 ^{[ 7 ]}ภายในกรดอะมิโน 17 ตัวนี้ มีการระบุโดเมน ทรานส์แอคติเวติงที่ มีความยาว 9 กรดอะมิโน (9aaTAD) ที่เป็นเอกลักษณ์สำหรับปัจจัยการถอดรหัสแต่ละตัวที่ได้รับการรายงาน^{[ 8 ]} 9aaTAD เป็นโดเมนใหม่ที่พบได้ทั่วไปในกลุ่มใหญ่ของปัจจัยการถอดรหัสยูคาริโอต ซึ่งแสดงโดยGal4 , Oaf1, Leu3, Rtg3, Pho4 , Gln4, Gcn4 ในยีสต์ และโดย p53, NFAT, NF-κB และ VP16 ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม^{[ 9 ]} TAF9 ถือเป็นโคแฟคเตอร์ทรานส์แอคติเวติงสากลสำหรับปัจจัยการถอดรหัส 9aaTAD ^{[ 8 ]}

จากการศึกษาพบว่า TAF9 มีปฏิกิริยากับสารต่างๆ ดังนี้:

• GCN5L2 , ^{[ 10 ]}
• ไมค , ^{[ 11 ]}
• SF3B3 , ^{[ 10 ]}
• SUPT7L , ^{[ 10 ]}
• TADA3L , ^{[ 10 ]}
• TAF5 , ^{[ 10 ] [ 12 ]}
• TAF6L , ^{[ 10 ]}
• TAF10 , ^{[ 10 ]}
• TAF12 , ^{[ 10 ]}
• TAF5L , ^{[ 10 ]}
• ^{โปรตีนที่จับ กับ} TATA [ ^{10 ] [ 13 ]}
• ^{โปรตีน}เริ่มต้นการถอดรหัส SPT3 homolog [ ^{10 ]} และ
• โปรตีน ที่เกี่ยวข้องกับโดเมนการเปลี่ยนแปลง/การถอดรหัส^{[ 10 ]}