ซีบีพีบี
| ซีบีพีบี | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | CEBPB , C/EBP-beta, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, โปรตีนจับ CCAAT/enhancer beta, โปรตีนจับ CCAAT enhancer beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 189965 ; เอ็มจีไอ : 88373 ; โฮโมโลยีน : 3807 ; GeneCards : CEBPB ; OMA : CEBPB - ออร์โธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
โปรตีน CCAAT/enhancer-binding เบต้าเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนCEBPB [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนที่ไม่มีอินทรอนนี้เป็น ปัจจัยการถอดรหัส bZIPที่สามารถจับเป็นโฮโมไดเมอร์กับบริเวณควบคุม DNA บางแห่งได้ นอกจากนี้ยังสามารถสร้างเฮเทโรไดเมอร์กับโปรตีนที่เกี่ยวข้องCEBP-alpha , CEBP-deltaและCEBP-gammaได้อีกด้วย โปรตีนที่เข้ารหัสมีความสำคัญในการควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันและการอักเสบ และพบว่าสามารถจับกับ องค์ประกอบการตอบสนอง IL-1ใน ยีน IL-6เช่นเดียวกับบริเวณควบคุมของยีนระยะเฉียบพลันและ ยีน ไซโตไคน์ หลายตัว นอกจากนี้ โปรตีนที่เข้ารหัสยังสามารถจับกับโปรโมเตอร์และองค์ประกอบต้นน้ำ และกระตุ้นการแสดงออกของยีนคอลลาเจนชนิดที่ 1 ได้ อีกด้วย [ 7 ]
CEBP-beta มีความสำคัญต่อการทำงานปกติของแมโครฟาจ ซึ่งเป็น เซลล์ภูมิคุ้มกันชนิดย่อยที่สำคัญหนูที่ไม่สามารถแสดงออก CEBP-beta จะมีแมโครฟาจที่ไม่สามารถแยกแยะ (เชี่ยวชาญ) ได้ และด้วยเหตุนี้จึงไม่สามารถทำหน้าที่ทางชีวภาพทั้งหมดได้ รวมถึงการซ่อมแซมกล้ามเนื้อโดยแมโครฟาจ[ 8 ] งาน วิจัยเชิงสังเกตแสดงให้เห็นว่าการแสดงออกของ CEBP-beta ในเม็ดเลือด ขาว มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับความแข็งแรงของกล้ามเนื้อในมนุษย์[ 9 ] ซึ่งเน้นย้ำถึงความสำคัญของระบบภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งแมโครฟาจ ในการรักษาการทำงานของกล้ามเนื้อ
ฟังก์ชันของยีน CEBPB สามารถตรวจสอบได้อย่างมีประสิทธิภาพโดยการน็อคดาวน์ด้วย siRNA โดยอาศัยการตรวจสอบความถูกต้องอิสระ[ 10 ]
จากการตรวจสอบเพิ่มเติม พบว่า CEBPB มีความสัมพันธ์ที่คล้ายคลึงกันเกือบ 8,600 รายการกับกระบวนการทางชีวภาพต่างๆ ตั้งแต่โมเลกุล โปรตีน ไปจนถึงไมโครอาร์เอ็นเอที่สกัดออกมา โปรตีนนี้พบในเลือดและมีการเพิ่มขึ้นในโรคต่างๆ เช่น มะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลัน เนื้องอกในสมอง และมะเร็งต่อมลูกหมาก แนวคิดนี้ตั้งอยู่บนสมมติฐานว่าโปรตีนนี้อยู่ภายในเซลล์และระบุตำแหน่งได้อย่างแม่นยำในนิวเคลียส
ยีนเป้าหมาย
CEBPB สามารถเพิ่มการแสดงออกของยีนเป้าหมายหลายตัว ในจำนวนนี้ บางตัวมีบทบาทเฉพาะในระบบประสาท เช่น ยีน preprotachykinin-1ซึ่งก่อให้เกิดสาร Pและneurokinin A [ 11 ]และcholine acetyltransferaseซึ่งรับผิดชอบการสังเคราะห์สารสื่อประสาท ที่สำคัญ อย่างacetylcholine [ 12 ] เป้าหมายอื่นๆ ได้แก่ ยีนที่เข้ารหัสไซโตไค น์ เช่นIL-6 [ 13 ] IL - 4 [ 14 ] IL-5 [ 15 ]และTNF-alpha [ 16 ] นอกจาก นี้ยังพบว่ายีนที่เข้ารหัส โปรตีน ขนส่งที่ทำให้เซลล์ต้านทานยาหลายชนิดก็ถูกกระตุ้นโดย CEBPB ด้วย ยีนดังกล่าวได้แก่ ABCC2 [ 17 ]และABCB1 [ 18 ]
โปรตีนที่จับกับตัวเสริม
ยีนCEBPBเข้ารหัสปัจจัยการถอดรหัส ดังที่กล่าวไว้ก่อนหน้านี้ว่า "ประกอบด้วยโดเมน leucine zipper (bZIP) และโปรตีนที่เข้ารหัสทำหน้าที่เป็นโฮโมไดเมอร์ นอกจากนี้ยังสามารถสร้างเฮเทอโรไดเมอร์กับโปรตีนที่จับกับตัวเร่งปฏิกิริยา เช่น อัลฟา เดลต้า และแกมมา กิจกรรมของโปรตีนนี้มีความสำคัญในการควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันและการอักเสบ รวมถึงกระบวนการอื่นๆ โคดอนเริ่มต้น "AUG" ส่งผลให้เกิดโปรตีนไอโซฟอร์มหลายชนิด" [ 19 ] นอกจากนี้ยังกล่าวถึงว่าแต่ละโคดอนเหล่านี้มีหน้าที่ทางชีวภาพที่แตกต่างกันในร่างกาย
เส้นทางนี้ช่วยให้เกิดการแพร่กระจาย การยับยั้ง และแม้กระทั่งการอยู่รอด ยีนนี้เป็นส่วนสำคัญของการแพร่กระจายและการแบ่งแยก มีความสำคัญ "เนื่องจากปัจจัยการถอดรหัสควบคุมการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันและการอักเสบ ซึ่งรวมถึงเส้นทางกลูโคเนโอเจนิคและการฟื้นตัวของตับ มีผลโปรไบโอติกต่อเซลล์หลายชนิด เช่น เซลล์ตับและเซลล์ไขมัน อย่างไรก็ตาม มันออกฤทธิ์แตกต่างกัน "ต่อเซลล์ T โดยการยับยั้งการแสดงออกของ MYC และส่งเสริมการแยกตัวของสายพันธุ์ T helper" มันจับกับบริเวณควบคุมของยีนเฟสและไซโตไคน์หลายตัว" [ 20 ]
มะเร็ง
CEBPB เป็นทรานสคริปต์ CEBP ชนิดหนึ่ง ยีน CEBPB [ 21 ]พบในแมคโครฟาจใน SKCM และให้การพยากรณ์โรคที่ดีกับมะเร็งที่แพร่กระจายโดยทำหน้าที่เป็นไบโอมาร์กเกอร์สำหรับการแบ่งชั้นการวินิจฉัยของผู้ป่วย ผ่านการวิเคราะห์แบบบูรณาการของชุดข้อมูลลำดับ RNA ของเซลล์เดี่ยวและแบบกลุ่ม เนื่องจาก CEBPB เป็นปัจจัยการถอดรหัสในการควบคุมการแสดงออกของยีน ผู้ป่วยที่เป็นมะเร็งผิวหนังชนิดแพร่กระจายอาจได้รับประโยชน์ในระยะยาวจากการปิดกั้นโปรตีนเช่น CTLA-4 อื่นๆ เส้นทางการกระตุ้นภูมิคุ้มกันอื่นๆ เช่น การกำหนดเป้าหมาย CEBPB ซึ่งมีการแสดงออกอย่างกว้างขวางในมะเร็งหลายชนิด
ปฏิสัมพันธ์
จากการศึกษาพบว่า CEBPB มีปฏิกิริยากับสารดังต่อไปนี้:
- CREB1 , [ 22 ]
- CRSP3 [ 23 ]
- ทรานสคริปต์ที่เหนี่ยวนำความเสียหายของ DNA 3 , [ 24 ] [ 25 ]
- EP300 , [ 26 ]
- ตัวรับเอสโตรเจนอัลฟา [ 27 ] [ 28 ]
- ตัวรับกลูโคคอ ร์ติคอยด์ [ 27 ]
- HMGA1 , [ 29 ]
- HSF1 , [ 30 ]
- โปรตีนฟอสโฟนิวคลีโอลาร์ p130 , [ 31 ]
- RELA , [ 32 ] [ 33 ]
- ปัจจัยการตอบสนองของเซรั่ม [ 34 ] [ 35 ]
- SMARCA2 , [ 36 ]
- ปัจจัยการถอดรหัส Sp1 [ 29 ] [ 37 ]
- TRIM28 , [ 38 ] [ 39 ] และ
- Zif268 . [ 40 ]
ดูเพิ่มเติม
ลิงก์ภายนอก
- ตำแหน่งจีโนมของยีน CEBPBในมนุษย์และรายละเอียดเกี่ยวกับยีนCEBPB ใน UCSC Genome Browser
- CEBPB+โปรตีน+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- แฟกเตอร์บุ๊คซีบีพีบี
บทความนี้ได้นำข้อความจากหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาด้านการแพทย์ มา ใช้ซึ่งเป็นข้อมูลสาธารณะ