อ่าน 7 นาที
สมาร์กา2
SNF2L2 ซึ่งเป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสทั่วโลกที่เป็นไปได้เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMARCA2
สมาร์กา2
| สมาร์กา2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | SMARCA2 , BAF190, BRM, NCBRS, SNF2, SNF2L2, SNF2LA, SWI2, Sth1p, hBRM, hSNF2a, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, BIS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | OMIM : 600014 ; MGI : 99603 ; HomoloGene : 2308 ; GeneCards : SMARCA2 ; OMA : SMARCA2 - orthologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNF2L2 ซึ่งเป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสทั่วโลกที่เป็นไปได้เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMARCA2 [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นสมาชิกของตระกูลโปรตีนSWI/SNF และมีความคล้ายคลึงกับโปรตีน บราห์มาของแมลงหวี่ อย่างมาก สมาชิกในตระกูลนี้มี กิจกรรม เฮลิเคสและATPaseและเชื่อกันว่าควบคุมการถอดรหัสของยีนบางชนิดโดยการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างโครมาตินรอบๆ ยีนเหล่านั้น โปรตีนที่เข้ารหัสเป็นส่วนหนึ่งของคอมเพล็กซ์การปรับโครงสร้างโครมาตินขนาดใหญ่ที่ขึ้นอยู่กับ ATPชื่อ SNF/SWI ซึ่งจำเป็นสำหรับการกระตุ้นการถอดรหัสของยีนที่ปกติถูกยับยั้งโดยโครมาติน มีการค้นพบตัวแปรการถอดรหัสสองแบบที่เข้ารหัส ไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันสำหรับยีนนี้ ซึ่งมีโพลีมอร์ ฟิ ซึม ความยาวของ การทำซ้ำไตรนิวคลีโอไทด์ (CAG) [ 6 ]
ปฏิสัมพันธ์
มีการค้นพบว่า SMARCA2 มีปฏิสัมพันธ์กับ:
- นิโคไลเดส บาไรต์เซอร์ ซินโดรม (NCBRS)
อ่านเพิ่มเติม
- Aves SJ, Hindley J, Phear GA, Tongue N (ส.ค. 1995) "การทำแผนที่ยีนฟิชชันยีสต์ใกล้กับ suc1 จะเข้ารหัสโปรตีนที่มีโบรโมโดเมน 2 โดเมน" อณูและพันธุศาสตร์ทั่วไป . 248 (4): 491– 8. ดอย : 10.1007/BF02191650 . PMID7565614 . S2CID 10281349 .
- Chiba H, Muramatsu M, Nomoto A, Kato H (พฤษภาคม 1994). "โฮโมล็อกของมนุษย์สองตัวของ Saccharomyces cerevisiae SWI2/SNF2 และ Drosophila brahma เป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสร่วมที่ทำงานร่วมกับตัวรับเอสโตรเจนและตัวรับกรดเรติโนอิก" . Nucleic Acids Research . 22 (10): 1815– 20. doi : 10.1093/nar/22.10.1815 . PMC 308079 . PMID 8208605 .
- Muchardt C, Yaniv M (พ.ย. 1993). "ยีนโฮโมล็อกของมนุษย์ของ Saccharomyces cerevisiae SNF2/SWI2 และยีน brm ของ Drosophila ช่วยเพิ่มศักยภาพการกระตุ้นการถอดรหัสโดยตัวรับกลูโคคอร์ติคอยด์" The EMBO Journal . 12 (11): 4279– 90. doi : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb06112.x . PMC 413724 . PMID 8223438 .
- Muchardt C, Reyes JC, Bourachot B, Leguoy E, Yaniv M (กรกฎาคม 1996). "โปรตีน hbrm และ BRG-1 ซึ่งเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ SNF/SWI ของมนุษย์ จะถูกฟอสโฟรีเลตและถูกแยกออกจากโครโมโซมที่ควบแน่นระหว่างการแบ่งเซลล์"วารสารEMBO 15 ( 13): 3394– 402. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00705.x . PMC 451903 . PMID 8670841 .
- Wang W, Xue Y, Zhou S, Kuo A, Cairns BR, Crabtree GR (ก.ย. 1996). "ความหลากหลายและความเชี่ยวชาญเฉพาะด้านของคอมเพล็กซ์ SWI/SNF ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม" Genes & Development . 10 (17): 2117– 30. doi : 10.1101/gad.10.17.2117 . PMID 8804307 .
- Wang W, Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (ต.ค. 1996) "การทำให้บริสุทธิ์และความหลากหลายทางชีวเคมีของคอมเพล็กซ์ SWI-SNF ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม " วารสารEMBO 15 (19): 5370– 82. ดอย : 10.1002/ j.1460-2075.1996.tb00921.x PMC 452280 . PMID8895581 .
- Ichinose H, Garnier JM, Chambon P, Losson R (มีนาคม 1997). "ปฏิสัมพันธ์ที่ขึ้นอยู่กับลิแกนด์ระหว่างตัวรับเอสโตรเจนและโฮโมล็อกของมนุษย์ของ SWI2/SNF2" Gene . 188 (1): 95– 100. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00785-8 . PMID 9099865 .
- Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (ก.ย. 1998). "คอมเพล็กซ์ RNA polymerase II ของมนุษย์ที่มีปัจจัยที่ปรับเปลี่ยนโครงสร้างโครมาติน" . Molecular and Cellular Biology . 18 (9): 5355– 63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
- Thaete C, Brett D, Monaghan P, Whitehouse S, Rennie G, Rayner E, Cooper CS, Goodwin G (เมษายน 1999). "โดเมนการทำงานของโปรตีนการย้ายตำแหน่งของมะเร็งซาร์โคมาไซโนเวียล SYT และ SYT-SSX และการอยู่ร่วมกันกับโปรตีน SNF BRM ในนิวเคลียส" Human Molecular Genetics . 8 (4): 585– 91. doi : 10.1093/hmg/8.4.585 . PMID 10072425 .
- Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (กุมภาพันธ์ 1999). "การสร้างใหม่ของคอมเพล็กซ์การปรับโครงสร้างโครมาตินหลักจากหน่วยย่อย SWI/SNF" . Molecular Cell . 3 (2): 247– 53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID 10078207 .
- Lee DW, Zhang K, Ning ZQ, Raabe EH, Tintner S, Wieland R, Wilkins BJ, Kim JM, Blough RI, Arceci RJ (กรกฎาคม 2000). "ยีนคล้าย SNF2 ที่เกี่ยวข้องกับการแพร่กระจาย (PASG): สมาชิกในตระกูล SNF2 ที่เปลี่ยนแปลงในมะเร็งเม็ดเลือดขาว" Cancer Research . 60 (13): 3612– 22. PMID 10910076 .
- Phelan ML, Schnitzler GR, Kingston RE (ก.ย. 2000). "การถ่ายโอนอ็อกตาเมอร์และการสร้างนิวคลีโอโซมที่ปรับโครงสร้างใหม่ได้อย่างเสถียรโดย SWI-SNF ของมนุษย์และ ATPases ที่แยกได้" . Molecular and Cellular Biology . 20 (17): 6380– 9. doi : 10.1128/MCB.20.17.6380-6389.2000 . PMC 86113 . PMID 10938115 .
- Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (พ.ย. 2000). "คอมเพล็กซ์การปรับโครงสร้างโครมาติน SWI/SNF-B ของมนุษย์มีความสัมพันธ์กับ rsc ของยีสต์และอยู่บริเวณไคเนโตคอร์ของโครโมโซมในระยะไมโทซิส" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (24): 13015– 20. Bibcode : 2000PNAS...9713015X . doi : 10.1073/pnas.240208597 . PMC 27170 . PMID 11078522 .
- Machida Y, Murai K, Miyake K, Iijima S (ม.ค. 2544). "การแสดงออกของปัจจัยการปรับโครงสร้างโครมาตินระหว่างการแยกตัวของเซลล์ประสาท". Journal of Biochemistry . 129 (1): 43– 9. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002834 . PMID 11134956 .
- เดอลาเซอร์นา IL, Carlson KA, Imbalzano AN (ก.พ. 2544) คอมเพล็กซ์สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม SWI/SNF ส่งเสริมการสร้างความแตกต่างของกล้ามเนื้อที่ใช้ MyoD พันธุศาสตร์ธรรมชาติ . 27 (2): 187– 90. ดอย : 10.1038/84826 . PMID11175787 . S2CID 20495742 .
- Ruhf ML, Braun A, Papoulas O, Tamkun JW, Randsholt N, Meister M (เมษายน 2544). "ยีนโดมิโนของ Drosophila เข้ารหัสสมาชิกใหม่ของตระกูล SWI2/SNF2 ของ DNA-dependent ATPases ซึ่งมีส่วนช่วยในการปิดการทำงานของยีนโฮมีโอติก" Development . 128 (8): 1429– 41. doi : 10.1242/dev.128.8.1429 . PMID 11262242 .
- Strobeck MW, Reisman DN, Gunawardena RW, Betz BL, Angus SP, Knudsen KE, Kowalik TF, Weissman BE, Knudsen ES (กุมภาพันธ์ 2545). "การชดเชยการทำงานของ BRG-1 โดย Brm: ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับบทบาทของหน่วยย่อย SWI-SNF หลักในการส่งสัญญาณยับยั้งเนื้องอกเรตินอบลาสโตมา"วารสารชีวเคมี277 ( 7): 4782– 9. doi : 10.1074/jbc.M109532200 . PMID 11719516 .
- Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (ก.พ. 2545) "SYT เชื่อมโยงกับคอมเพล็กซ์ SNF/SWI ของมนุษย์และบริเวณเทอร์มินัล C ของพันธมิตรฟิวชั่น SSX1 ที่จะกำหนดเป้าหมายฮิสโตน " วารสารเคมีชีวภาพ . 277 (7): 5498– 505. ดอย : 10.1074/jbc.M108702200 . hdl : 2066/170683 . PMID11734557 .
- Mizutani T, Ito T, Nishina M, Yamamichi N, Watanabe A, Iba H (พฤษภาคม 2545). "การรักษาการแสดงออกของยีนโปรไวรัสแบบบูรณาการต้องอาศัย Brm ซึ่งเป็นหน่วยย่อยเร่งปฏิกิริยาของคอมเพล็กซ์ SWI/SNF"วารสารเคมีชีวภาพ 277 ( 18): 15859– 64. doi : 10.1074/jbc.M112421200 . PMID 11850427 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ สมาร์กา2
SNF2L2 ซึ่งเป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสทั่วโลกที่เป็นไปได้เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMARCA2
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นสมาชิกของตระกูลโปรตีน SWI/SNF และมีความคล้ายคลึงกับโปรตีน บราห์มา ของ แมลงหวี่ อย่างมาก สมาชิกในตระกูลนี้มี กิจกรรม เฮลิเคส และ ATPase และเชื่อกันว่าควบคุม การถอดรหัส ของยีนบางชนิดโดยการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างโครมาตินรอบๆ...
ปฏิสัมพันธ์
มีการค้นพบว่า SMARCA2 มีปฏิสัมพันธ์ กับ:
อ่านเพิ่มเติม
Aves SJ, Hindley J, Phear GA, Tongue N (ส.ค. 1995) "การทำแผนที่ยีนฟิชชันยีสต์ใกล้กับ suc1 จะเข้ารหัสโปรตีนที่มีโบรโมโดเมน 2 โดเมน" อณูและพันธุศาสตร์ทั่วไป . 248 (4): 491– 8. ดอย : 10.1007/BF02191650 . PMID7565614 . S2CID 10281349 .