อ่าน 8 นาที
สมาร์ซีบี1
SWI/SNF -related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMARCB1
สมาร์ซีบี1
| สมาร์ซีบี1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | SMARCB1 , BAF47, INI1, MRD15, PPP1R144, RDT, RTPS1, SNF5, SNF5L1, SWNTS1, Sfh1p, Snr1, hSNFS, CSS3, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1, INI-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 601607 ; เอ็มจีไอ : 1328366 ; โฮโมโลยีน : 2310 ; GeneCards : SMARCB1 ; OMA : SMARCB1 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWI/SNF -related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMARCB1 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นส่วนหนึ่งของคอมเพล็กซ์ที่คลายโครงสร้างโครมาติน ที่กดข่ม ทำให้กลไกการถอดรหัสสามารถเข้าถึงเป้าหมายได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น โปรตีนนิวเคลียร์ ที่เข้ารหัส อาจจับกับและเพิ่มกิจกรรมการเชื่อมต่อ DNA ของอินทิเกรส HIV-1ยีนนี้พบว่าเป็นยีนยับยั้งเนื้องอกและการกลายพันธุ์ในยีนนี้มีความเกี่ยวข้องกับเนื้องอกร้ายชนิดแรบดอยด์มีการค้นพบตัวแปรการถอดรหัสสองแบบที่เข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันสำหรับยีนนี้[ 8 ]
ปฏิสัมพันธ์
มีการค้นพบว่า SMARCB1 มีปฏิสัมพันธ์กับ:
- ARID1A , [ 9 ] [ 10 ]
- BAZ1B , [ 11 ]
- BRCA1 , [ 12 ]
- โปรตีนที่จับ กับ CREB [ 13 ]
- ไคเนสที่ขึ้นอยู่กับไซคลิน 8 , [ 13 ]
- ไมค , [ 6 ]
- P53 , [ 14 ]
- POLR2A , [ 9 ] [ 13 ] [ 15 ]
- PPP1CA , [ 16 ]
- PPP1CB , [ 16 ]
- PPP1CC , [ 16 ]
- PPP1R15A , [ 16 ] [ 17 ]
- SMARCA2 , [ 9 ] [ 15 ]
- สมาร์กา4 , [ 9 ] [ 15 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]
- SMARCC1 , [ 9 ] [ 15 ]
- SMARCE1 , [ 9 ] [ 18 ]
- SS18 , [ 10 ] และ
- XPO1 [ 21 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Miller MD, Bushman FD (1995). "การรวมตัวของ HIV Ini1 สำหรับการรวมตัวหรือไม่?" Curr . Biol . 5 (4): 368– 70. doi : 10.1016/S0960-9822(95)00074-1 . PMID 7627549 . S2CID 17647431 .
- Van Maele B, Debyser Z (2005). " การรวมตัวของ HIV-1 : ปฏิสัมพันธ์ระหว่างอินทิเกรสของ HIV-1 โปรตีนของเซลล์และไวรัส" AIDS Reviews . 7 (1): 26– 43. PMID 15875659 .
- ฟาน เมเล บี, บุสชอตส์ เค, ฟานเดเคอร์คโฮฟ แอล, คริส เอฟ, เดบีเซอร์ ซี (2006) “ปัจจัยร่วมของเซลล์ในการบูรณาการ HIV-1 ” เทรนด์ไบโอเคม วิทยาศาสตร์ 31 (2): 98– 105. ดอย : 10.1016/j.tibs.2005.12.002 . PMID 16403635 .
- Judkins AR (2007). "การตรวจภูมิคุ้มกันเคมีของการแสดงออกของ INI1: เครื่องมือใหม่สำหรับความท้าทายเก่าๆ ในพยาธิวิทยาของระบบประสาทส่วนกลางและเนื้อเยื่ออ่อน" Advances in Anatomic Pathology . 14 (5): 335– 9. doi : 10.1097/PAP.0b013e3180ca8b08 . PMID 17717433 . S2CID 27654280 .
- Muchardt C, Sardet C, Bourachot B, Onufryk C, Yaniv M (1995). "โปรตีนของมนุษย์ที่มีความคล้ายคลึงกับ SNF5 ของ Saccharomyces cerevisiae ทำปฏิกิริยากับเฮลิเคส hbrm ที่มีศักยภาพ" . Nucleic Acids Res . 23 (7): 1127– 32. doi : 10.1093/nar/23.7.1127 . PMC 306820 . PMID 7739891 .
- Wu DY, Kalpana GV, Goff SP, Schubach WH (1996). "โปรตีนนิวเคลียร์ 2 ของไวรัส Epstein-Barr (EBNA2) จับกับส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ SNF-SWI ของมนุษย์ hSNF5/Ini1" . J. Virol . 70 (9): 6020– 8. doi : 10.1128/JVI.70.9.6020-6028.1996 . PMC 190622 . PMID 8709224 .
- Wang W, Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (1996) "การทำให้บริสุทธิ์และความหลากหลายทางชีวเคมีของคอมเพล็กซ์ SWI-SNF ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม " เอ็มโบ เจ . 15 (19): 5370– 82. ดอย : 10.1002/ j.1460-2075.1996.tb00921.x PMC 452280 . PMID8895581 .
- Morozov A, Yung E, Kalpana GV (1998). "การวิเคราะห์โครงสร้างและหน้าที่ของอินทิเกรสอินทีคเตอร์ 1/hSNF5L1 เผยให้เห็นคุณสมบัติที่แตกต่างกันของโมทีฟซ้ำสองแบบที่มีอยู่ในบริเวณที่มีการอนุรักษ์สูง" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 (3): 1120– 5. Bibcode : 1998PNAS...95.1120M . doi : 10.1073/pnas.95.3.1120 . PMC 18693 . PMID 9448295 .
- Versteege I, Sévenet N, Lange J, Rousseau-Merck MF, Ambros P, Handgretinger R, Aurias A, Delattre O (1998). "การกลายพันธุ์แบบตัดทอนของ hSNF5/INI1 ในมะเร็งเด็กชนิดรุนแรง" Nature . 394 (6689): 203– 6. Bibcode : 1998Natur.394..203V . doi : 10.1038/28212 . PMID 9671307 . S2CID 6019090 .
- Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998). "คอมเพล็กซ์ RNA polymerase II ของมนุษย์ที่มีปัจจัยที่ปรับเปลี่ยนโครงสร้างโครมาติน" . Mol. Cell. Biol . 18 (9): 5355– 63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
- Biegel JA, Zhou JY, Rorke LB, Stenstrom C, Wainwright LM, Fogelgren B (1999). "การกลายพันธุ์ของยีน INI1 ในเซลล์สืบพันธุ์และที่ได้รับมาในเนื้องอกชนิด atypical teratoid และ rhabdoid" Cancer Res . 59 (1): 74– 9. PMID 9892189 .
- Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). "การสร้างใหม่ของคอมเพล็กซ์การปรับโครงสร้างโครมาตินหลักจากหน่วยย่อย SWI/SNF" . Mol. Cell . 3 (2): 247– 53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID 10078207 .
- Bruder CE, Dumanski JP, Kedra D (1999). "ยีน SMARCB1 ของมนุษย์ในหนูที่เป็นออร์โธล็อกเข้ารหัสรูปแบบการต่อเชื่อมสองแบบ" Biochem. Biophys. Res. Commun . 257 (3): 886– 90. doi : 10.1006/bbrc.1999.0563 . PMID 10208879 .
- Adler HT, Chinery R, Wu DY, Kussick SJ, Payne JM, Fornace AJ, Tkachuk DC (2000). "โปรตีนฟิวชั่น HRX ของเม็ดเลือดขาว ยับยั้งการเกิดอะพอพโทซิสที่เกิดจาก GADD34 และเชื่อมโยงกับโปรตีน GADD34 และ hSNF5/INI1" . Mol. Cell. Biol . 19 (10): 7050– 60. doi : 10.1128/mcb.19.10.7050 . PMC 84700 . PMID 10490642 .
- Sévenet N, Sheridan E, Amram D, Schneider P, Handgretinger R, Delattre O (1999). "การกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมของยีน hSNF5/INI1 ทำให้เกิดความเสี่ยง ต่อมะเร็งหลายชนิด" Am . J. Hum. Genet . 65 (5): 1342– 8. doi : 10.1086/302639 . PMC 1288286. PMID 10521299 .
- Kowenz-Leutz E, Leutz A (2000). "AC/EBP beta isoform recruits the SWI/SNF complex to activate myeloid genes" . Mol. Cell . 4 (5): 735– 43. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80384-6 . PMID 10619021 .
ลิงก์ภายนอก
- FactorBook Ini1
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ สมาร์ซีบี1
SWI/SNF -related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMARCB1
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นส่วนหนึ่งของคอมเพล็กซ์ที่คลายโครงสร้าง โครมาติน ที่กดข่ม ทำให้กลไกการถอดรหัสสามารถเข้าถึงเป้าหมายได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น โปรตีนนิวเคลียร์ ที่เข้ารหัส อาจจับกับและเพิ่มกิจกรรมการเชื่อมต่อ DNA ของ อินทิเกรส HIV-1...
ปฏิสัมพันธ์
มีการค้นพบว่า SMARCB1 มีปฏิสัมพันธ์ กับ:
อ่านเพิ่มเติม
Miller MD, Bushman FD (1995). "การรวมตัวของ HIV Ini1 สำหรับการรวมตัวหรือไม่?" Curr . Biol . 5 (4): 368– 70. doi : 10.1016/S0960-9822(95)00074-1 . PMID 7627549 . S2CID 17647431 . Van Maele B, Debyser Z (2005).