โซกซ์6

Q: ปฏิสัมพันธ์

SOX6 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามี ปฏิสัมพันธ์ กับ CTBP2 [ 7 ] และ CENPK [ 8 ]

โซกซ์6
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	SOX6 , HSSOXD, SRY-box 6, ปัจจัยการถอดรหัส SRY-box 6, TOLCAS
รหัสภายนอก	โอมิม : 607257 ; เอ็มจีไอ : 98368 ; โฮโมโลยีน : 22631 ; การ์ดยีน : SOX6 ; OMA : SOX6 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 11 (มนุษย์)
จบ	16,739,591 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 7 (เมาส์)
จบ	116,038,796 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	เซลล์เยื่อบุผิวตับอ่อน; กระดูกหน้าแข้ง; กล้ามเนื้อเดลทอยด์; อสุจิ; เส้นประสาทน่อง; เยื่อบุลำไส้เล็กส่วนปลาย; กล้ามเนื้อทิบิอาลิสแอนทีเรียร์; เซลล์ท่อตับอ่อน; โซนโพรงสมอง; เยื่อบุลำไส้เล็กส่วนเจจูนัม;
	สูงสุดที่แสดงใน
	กล้ามเนื้อไตรเซปส์ เบรคิไอ; กล้ามเนื้อวาสตัส ลาเทอราลิส; เซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือดในตับทารกในครรภ์; กล้ามเนื้อขมับ; กล้ามเนื้อสเตอร์โนไคลโดมาสทอยด์; กล้ามเนื้อต้นขา; ข้อเข่า; โซนโพรงสมอง; ส่วนนูนของปมประสาทตรงกลาง; ส่วนหัวด้านในของกล้ามเนื้อน่อง;
	ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
	ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับกับ DNA; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับ; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA; การจับโปรตีน; กิจกรรมการสร้างเฮเทอโรไดเมอร์ของโปรตีน; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II; กิจกรรมยับยั้งการถอดรหัสโดยการจับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II;
ส่วนประกอบของเซลล์	นิวคลีโอพลาสม์; นิวเคลียส;
กระบวนการทางชีวภาพ	การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นจากทรานส์ฟอร์มิงโกรทแฟคเตอร์เบตา; การกำหนดชะตากรรมของเซลล์; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การแยกแยะเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ; การพัฒนาอวัยวะกล้ามเนื้อ; การแยกแยะเซลล์โอลิโกเดนโดรไซต์; การพัฒนาตัวอ่อนในครรภ์; การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การพัฒนาหลังระยะตัวอ่อน; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมเชิงบวกของการแตกต่างของเซลล์ต้นกำเนิดมีเซนไคม์; การพัฒนาสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์; การควบคุมการถอดรหัสเชิงบวกโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การกำหนดชะตากรรมของเซลล์โอลิโกเดนโดรไซต์; การแยกเซลล์กล้ามเนื้อ; การพัฒนาของกระดูกอ่อน; การแยกแยะเซลล์แอสโทรไซต์; การควบคุมเชิงบวกของการพัฒนาของกระดูกอ่อน; การควบคุมเชิงบวกของการเปลี่ยนแปลงเซลล์กระดูกอ่อน; การสร้างรูปร่างของเซลล์; การควบคุมการแสดงออกของยีน; การจำแนกเซลล์เม็ดเลือดแดง; การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II; การพัฒนาของเม็ดเลือดแดง; การควบคุมเชิงลบของการแบ่งเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ; การสร้างเม็ดเลือด;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	55553
	20679
	ENSG00000110693
	ENSMUSG00000051910
	พี35712
	พี40645
NM_033326 NM_001145811 NM_001145819 NM_017508 NM_001367872
	NM_001367873
NM_001025559 NM_001025560 NM_001277326 NM_001277327 NM_001277328
	NM_011445
NP_001139283 NP_001139291 NP_059978 NP_201583 NP_001354801
	NP_001354802
NP_001020730 NP_001020731 NP_001264255 NP_001264256 NP_001264257
	NP_035575
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

ปัจจัยการถอดรหัส SOX-6เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSOX6 ^[⁵^]^[⁶^]

การทำงาน

ตระกูลยีน SOX เข้ารหัสกลุ่มของปัจจัยการถอดรหัสที่กำหนดโดยโดเมนการจับ DNA ของกลุ่มเคลื่อนที่สูง (HMG) ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ แตกต่างจากปัจจัยการถอดรหัสส่วนใหญ่ ปัจจัยการถอดรหัส SOX จะจับกับร่องเล็กของ DNA ทำให้เกิดการโค้งงอ 70 ถึง 85 องศา และทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างเฉพาะที่ [จัดหาโดย OMIM] ^{[ 6 ]}

ปฏิสัมพันธ์

SOX6 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับCTBP2 ^{[ 7 ]}และCENPK ^{[ 8 ]}

นอกจากนี้ ยังมีการแสดงให้เห็นว่าโปรตีน SOX6 สะสมอยู่ในเม็ดเลือดแดงของมนุษย์ที่กำลังเปลี่ยนแปลง และจากนั้นสามารถลดการถอดรหัสของตัวเองลงได้ โดยการจับกับลำดับคอนเซนซัสที่ได้รับการอนุรักษ์ทางวิวัฒนาการซึ่งอยู่ใกล้กับตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัสของSOX6 โดยตรง ^{[ 9 ]}

Sox6 ดูเหมือนจะมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการถอดรหัสของยีนโกลบิน และในการกำหนดทิศทางการแยกตัวขั้นสุดท้ายของเซลล์เม็ดเลือดแดง^{[ 10 ]}นอกจากนี้ SOX6 อาจมีบทบาทในการเจริญเติบโตของเนื้องอก Ewing sarcoma ^{[ 11 ]}บทบาทใหม่ของ Sox6 ในการควบคุมเรนินและโปรเรนินได้รับการศึกษาโดยใช้แบบจำลองหนู Sox KO ซึ่ง Sox6 จะถูกน็อคเอาท์เฉพาะในเซลล์ที่แสดงเรนินเท่านั้น การศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าโปรโมเตอร์ของเรนินมีตำแหน่งการจับสำหรับ Sox6 จุดเด่นของการศึกษาคือ Sox6 เป็นหนึ่งในตัวควบคุมหลักของการควบคุมเรนินและโปรเรนิน และการขยายตัวของเซลล์ JG ในระหว่างภาวะเกลือต่ำและภาวะขาดน้ำในหนู PMID 31760770; DOI: 10.1152/ajprenal.00095.2019

ดูเพิ่มเติม

ยีน SOX

อ่านเพิ่มเติม

Denny P, Swift S, Brand N, Dabhade N, Barton P, Ashworth A (มิถุนายน 1992). "ตระกูลยีนที่อนุรักษ์ไว้ซึ่งเกี่ยวข้องกับยีนกำหนดอัณฑะ SRY" . Nucleic Acids Research . 20 (11): 2887. doi : 10.1093/nar/20.11.2887 . PMC 336939 . PMID 1614875 .
Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B (ตุลาคม 1998). "รูปแบบยาวใหม่ของ Sox5 (L-Sox5), Sox6 และ Sox9 ถูกแสดงออกร่วมกันในกระบวนการสร้างกระดูกอ่อนและกระตุ้นยีนคอลลาเจนชนิดที่ 2 อย่างร่วมมือกัน"วารสารEMBO . 17 (19): 5718– 5733. doi : 10.1093/emboj/17.19.5718 . PMC 1170900 . PMID 9755172 .
Hagiwara N, Klewer SE, Samson RA, Erickson DT, Lyon MF, Brilliant MH (เมษายน 2543). "Sox6 เป็นยีนที่อาจเกี่ยวข้องกับโรคกล้ามเนื้ออ่อนแรง p100H, ภาวะหัวใจเต้นผิดจังหวะ และการเสียชีวิตเฉียบพลันในทารกแรกเกิด" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (8): 4180– 4185. Bibcode : 2000PNAS...97.4180H . doi : 10.1073 / pnas.97.8.4180 . PMC 18189. PMID 10760285 .
Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T (กันยายน 2000). "ลักษณะเฉพาะของ Solt โปรตีนที่จับกับ SoxLZ/Sox6 ชนิดใหม่ที่แสดงออกในอัณฑะของหนูโตเต็มวัย" FEBS Letters . 481 (2): 147– 151. Bibcode : 2000FEBSL.481..147Y . doi : 10.1016/S0014-5793(00)01987-6 . PMID 10996314 . S2CID 20831354 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (พฤศจิกายน 2000). "การโคลน DNA โดยใช้การรวมตัวใหม่เฉพาะตำแหน่งในหลอดทดลอง" . Genome Research . 10 (11): 1788– 1795. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W และคณะ (มีนาคม 2544). "สู่แคตตาล็อกของยีนและโปรตีนของมนุษย์: การจัดลำดับและการวิเคราะห์ cDNA ของมนุษย์ที่เข้ารหัสโปรตีนอย่างสมบูรณ์ 500 รายการใหม่" . Genome Research . 11 (3): 422– 435. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (สิงหาคม 2544). "SOX6 จับกับ CtBP2 เพื่อยับยั้งการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ Fgf-3" . Nucleic Acids Research . 29 (16): 3347– 3355. doi : 10.1093/nar/29.16.3347 . PMC 55854 . PMID 11504872 .
โคเฮน-บารัค โอ, ยี ซี, ฮากิวาระ เอ็น, มอนเซน เค, โคมูโระ 1, บริลเลียนท์ เอ็มเอช (ตุลาคม 2546) "การควบคุม Sox6 ของการพัฒนา myocyte หัวใจ " การวิจัยกรดนิวคลีอิก31 (20): 5941– 5948. ดอย : 10.1093/nar/ gkg807 พีเอ็มซี 219484 . PMID14530442 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A และคณะ (ตุลาคม 2547). "จาก ORFeome สู่ชีววิทยา: กระบวนการจีโนมิกส์เชิงฟังก์ชัน" . Genome Research . 14 (10B): 2136– 2144. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, Kawase T, Toda M (2005). "การแสดงออกของปัจจัยการถอดรหัส SOX6 ในเนื้องอกสมองของมนุษย์" Brain Tumor Pathology . 21 (1): 35– 38. doi : 10.1007/BF02482175 . PMID 15696967 . S2CID 23632021 .
Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, Kawase T, Toda M (2005). "การวิเคราะห์อิมมูโนฮิสโตเคมีของการแสดงออกของ SOX6 ในเนื้องอกสมองของมนุษย์" Brain Tumor Pathology . 21 (3): 117– 120. doi : 10.1007/BF02482186 . PMID 15696972 . S2CID 27841927 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F และคณะ (มกราคม 2549). "ฐานข้อมูล LIFEdb ในปี 2549" . Nucleic Acids Research . 34 (ฉบับฐานข้อมูล): D415– D418. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Fernández-Lloris R, Osses N, Jaffray E, Shen LN, Vaughan OA, Girwood D และคณะ (กุมภาพันธ์ 2549). "การยับยั้งกิจกรรมการถอดรหัสของ SOX6 โดยการดัดแปลง SUMO" FEBS Letters 580 ( 5): 1215– 1221. Bibcode : 2006FEBSL.580.1215F . doi : 10.1016/j.febslet.2006.01.031 . PMID 16442531 . S2CID 38625057 .
Ikeda T, Saito T, Ushita M, Yano F, Kan A, Itaka K และอื่นๆ (มิถุนายน 2550). "การระบุและลักษณะเฉพาะของโปรโมเตอร์ SOX6 ของมนุษย์" การสื่อสารการวิจัยทางชีวเคมีและชีวฟิสิกส์357 (2): 383– 390. Bibcode : 2007BBRC..357..383I . ดอย : 10.1016/j.bbrc.2007.03.133 . PMID17433257 .

ลิงก์ภายนอก

SOX6+โปรตีน+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา

บทความนี้ได้นำข้อความจากหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาด้านการแพทย์ มา ใช้ ซึ่งเป็นข้อมูลสาธารณะ

บทความเกี่ยวกับยีนบนโครโมโซมคู่ที่ 11 ของมนุษย์นี้ ยังไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]