วิกิพีเดียภาษาไทย
กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 8 นาที

ซีทีบีพี2

โปรตีนที่จับกับปลาย C 2 หรือที่รู้จักกันในชื่อ CtBP2 เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน CTBP2 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

ซีทีบีพี2

ซีทีบีพี2
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบีการค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นCTBP2 , โปรตีนจับปลายซี 2
รหัสภายนอกโอมิม : 602619 ; เอ็มจีไอ : 1201686 ; โฮโมโลยีน : 75187 ; GeneCards : CTBP2 ; OMA : CTBP2 - ออร์โธล็อก
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ

1488

13017

วงดนตรี

ENSG00000175029

ENSMUSG00000030970

ยูนิโปรท

พี56545

พี56546

RefSeq (mRNA)

NM_001170744 NM_009980 NM_001347623

RefSeq (โปรตีน)

NP_001164215 NP_001334552 NP_034110

สถานที่ตั้ง (UCSC)Chr 10: 124.98 – 125.16 MbChr 7: 132.99 – 133.12 Mb
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีนที่จับกับปลาย C 2หรือที่รู้จักกันในชื่อCtBP2เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนCTBP2 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

การทำงาน

CtBPs - CtBP1และ CtBP2 ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม - เป็นหนึ่งในโคเรเพรสเซอร์การ ถอดรหัสที่มีลักษณะเฉพาะดีที่สุด [ 8 ]โดยทั่วไปแล้วพวกมันจะปิดยีนเป้าหมาย พวกมันทำเช่นนั้นโดยการจับกับโปรตีนที่จับกับ DNA ที่มีลำดับจำเพาะซึ่งมีโมทีฟสั้นๆ ในรูปแบบทั่วไปของโพรลีน-ไอโซลิวซีน-แอสปาร์เทต-ลิวซีน-เซรีน (โมทีฟ PIDLS) จากนั้นพวกมันจะดึงดูดเอนไซม์ที่ปรับเปลี่ยนฮิสโตนฮิสโตนดีอะเซทิเลส ฮิสโตนเมทิเลสและฮิสโตนดีเมทิเล ส เอนไซม์เหล่านี้เชื่อว่าทำงานร่วมกันเพื่อกำจัดเครื่องหมายฮิสโตนที่กระตุ้นและเพิ่มเครื่องหมายฮิสโตนที่ยับยั้ง ตัวอย่างเช่น ฮิสโตนดีอะเซทิเลส 1 ( HDAC1 ) และHDAC2สามารถกำจัดเครื่องหมายกระตุ้นฮิสโตน 3 อะเซทิลไลซีน 9 (H3K9Ac) จากนั้นฮิสโตนเมทิเลสG9aสามารถเพิ่มกลุ่มเมทิล ในขณะที่ฮิสโตนดีเมทิเลสไลซีนเฉพาะดีเมทิเลส 1 ( LSD1 ) สามารถกำจัดเครื่องหมายกระตุ้น H3K4me ได้[ 9 ]

CtBP จับกับโปรตีนที่จับกับ DNA หลายชนิด และยังจับกับโครีเพรสเซอร์ที่จับกับโปรตีนที่จับกับ DNA เช่น Friend of GATA ( Fog ) [ 10 ] CtBP ยังสามารถรวมตัวเป็นไดเมอร์และมัลติเมอร์เพื่อเชื่อมต่อคอมเพล็กซ์การถอดรหัสขนาดใหญ่ขึ้นได้ ดูเหมือนว่าพวกมันจะเป็นโปรตีนโครงร่างหลักที่ช่วยให้การประกอบคอมเพล็กซ์การยับยั้งยีนเกิดขึ้นได้

แง่มุมที่น่าสนใจอย่างหนึ่งของ CtBP คือความสามารถในการจับกับNADHและในระดับที่น้อยกว่าคือ NAD +มีการเสนอว่าสิ่งนี้จะช่วยให้พวกมันสามารถรับรู้สถานะการเผาผลาญของเซลล์และควบคุมยีนเพื่อตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงในอัตราส่วน NADH/NAD +ดังนั้น CtBP จึงถูกพบว่ามีความสำคัญในชีววิทยาของไขมัน โดยจับกับโปรตีนสำคัญ เช่นPRDM16 , NRIPและFOG2 [ 11 ]

บทบาทการทำงานเต็มรูปแบบของโปรตีน CtBP ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมนั้นประเมินได้ยากเนื่องจากความซ้ำซ้อนบางส่วนระหว่าง CtBP1 และ CtBP2 [ 12 ]ในทำนองเดียวกัน การตายก่อนวัยอันควรของหนูที่ขาด CtBP2 และหนูที่ขาดทั้งสองยีนทำให้ไม่สามารถวิเคราะห์ผลกระทบของการลบโปรตีนเหล่านี้ในระดับเซลล์ได้อย่างละเอียด ผลลัพธ์ที่สำคัญได้เกิดขึ้นจากสิ่งมีชีวิตต้นแบบที่มีเพียงยีน CtBP เดียว ในแมลงหวี่ CtBP มีส่วนเกี่ยวข้องกับการพัฒนาและจังหวะชีวภาพ[ 13 ]ในหนอนC. elegans CtBP มีส่วนเกี่ยวข้องกับอายุขัย[ 14 ]ทั้งจังหวะชีวภาพและอายุขัยดูเหมือนจะเชื่อมโยงกับการเผาผลาญ ซึ่งสนับสนุนบทบาทของ CtBP ในการรับรู้การเผาผลาญ

ยีน CtBP2 ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมสร้างทรานสคริปต์ทางเลือกที่เข้ารหัสโปรตีนสองชนิดที่แตกต่างกัน นอกเหนือจากตัวยับยั้งการถอดรหัส ( corepressor ) ที่กล่าวถึงข้างต้นแล้ว ยังมีไอโซฟอร์มที่ยาวกว่าซึ่งเป็นส่วนประกอบหลักของไซแนปส์เฉพาะที่เรียกว่าsynaptic ribbonsโปรตีนทั้งสองชนิดมีโดเมนจับ NAD +คล้ายกับNAD + -dependent 2-hydroxyacid dehydrogenasesส่วนหนึ่งของบริเวณที่ไม่ถูกแปล 3'ถูกนำมาใช้เพื่อแมปยีนนี้ไปยังโครโมโซม 21q21.3 อย่างไรก็ตาม มีข้อสังเกตว่าตำแหน่งที่คล้ายกันในที่อื่น ๆ ในจีโนมก็มีแนวโน้มเช่นกัน การวิเคราะห์ Blast แสดงให้เห็นว่ายีนนี้มีอยู่บนโครโมโซม 10 [ 7 ]

การใช้โปรโมเตอร์ทางเลือก

ในเรตินา ของสัตว์มีกระดูกสันหลัง ยีน CtBP2 จะถูกถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ทางเลือกในระหว่างการพัฒนาเรตินา ทำให้เกิดตัวควบคุมการถอดรหัส CTBP2 รวมถึงโปรตีนโครงสร้างไซแนปส์แบบริบบอนขนาดใหญ่ RIBEYE [ 15 ]ฟังก์ชันการทำงานหลายอย่างของตำแหน่ง CtBP2 ดูเหมือนจะได้รับการอนุรักษ์ไว้ระหว่างเรตินาของนกและไพรเมต โดยการผลิต mRNA ของ RIBEYE จะล่าช้าในระหว่างการพัฒนาเนื่องจากกลไกการปิดกั้นทางเอพิเจเนติก[ 16 ] ในเรตินาของมนุษย์ที่กำลังพัฒนา การถอดรหัสของไอโซฟอร์ม mRNA ของ RIBEYE จะถูกควบคุมทางเอพิเจเนติกโดยการเมทิลเลชั่นของ DNAลำดับ DNA ที่ประกอบเป็นโปรโมเตอร์ RIBEYE ที่อยู่ใกล้เคียงจะอุดมไปด้วยเมทิลเลชั่นของ DNA และทำให้การถอดรหัสของไอโซฟอร์มนี้ล่าช้า อาจโดยการยับยั้งการจับของปัจจัยการถอดรหัสCone-rod homeobox (CRX) [ 16 ] การวิเคราะห์การถอดรหัสทั่วโลกของ ออร์แกนอยด์เรตินา 3 มิติที่ได้จากเซลล์ต้นกำเนิดแบบหลายศักยภาพของมนุษย์ (hPSC) แสดงให้เห็นการแสดงออกของไอโซฟอร์ม CTPB2 ในระยะเริ่มต้นและต่อเนื่อง ตามด้วยการแสดงออกของ RIBEYE ที่ล่าช้าในดวงตาของมนุษย์ที่กำลังพัฒนา[ 17 ]

ปฏิสัมพันธ์

มีการค้นพบว่า CTBP2 มีปฏิสัมพันธ์กับ:

อ่านเพิ่มเติม

  • Schaeper U, Boyd JM, Verma S, Uhlmann E, Subramanian T, Chinnadurai G (พฤศจิกายน 1995). "การโคลนโมเลกุลและลักษณะเฉพาะของฟอสโฟโปรตีนในเซลล์ที่โต้ตอบกับโดเมน C-terminal ที่อนุรักษ์ไว้ของอะดีโนไวรัส E1A ที่เกี่ยวข้องกับการปรับเปลี่ยนเชิงลบของการเปลี่ยนแปลงทางมะเร็ง" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (23): 10467– 71. Bibcode : 1995PNAS...9210467S . doi : 10.1073/pnas.92.23.10467 . PMC  40632 . PMID  7479821 .
  • Sewalt RG, Gunster MJ, van der Vlag J, Satijn DP, Otte AP (มกราคม 1999). "โปรตีนที่จับกับปลาย C เป็นตัวยับยั้งการถอดรหัสที่โต้ตอบกับโปรตีน Polycomb ของสัตว์มีกระดูกสันหลังกลุ่มเฉพาะ" . Mol. Cell. Biol . 19 (1): 777– 87. doi : 10.1128/MCB.19.1.777 . PMC  83934 . PMID  9858600 .
  • Furusawa T, Moribe H, Kondoh H, Higashi Y (ธันวาคม 1999). "การระบุ CtBP1 และ CtBP2 ว่าเป็นโคเรเพรสเซอร์ของปัจจัยซิงค์ฟิงเกอร์-โฮมีโอโดเมนเดลต้าEF1" . Mol. Cell. Biol . 19 (12): 8581– 90. doi : 10.1128/mcb.19.12.8581 . PMC  84984 . PMID  10567582 .
  • Yu X, Baer R (มิถุนายน 2000). "การแปลตำแหน่งในนิวเคลียสและการแสดงออกเฉพาะรอบเซลล์ของ CtIP โปรตีนที่เชื่อมโยงกับยีนยับยั้งเนื้องอก BRCA1" . J. Biol. Chem . 275 (24): 18541– 9. doi : 10.1074/jbc.M909494199 . PMID  10764811 .
  • Schmitz F, Königstorfer A, Südhof TC (ธันวาคม 2000). "RIBEYE ส่วนประกอบของริบบอนไซแนปส์: การเดินทางผ่านวิวัฒนาการของโปรตีนให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับหน้าที่ของริบบอนไซแนปส์" . Neuron . 28 (3): 857– 72. doi : 10.1016/S0896-6273(00)00159-8 . PMID  11163272 . S2CID  15695695 .
  • Valenta T, Lukas J, Korinek V (พฤษภาคม 2546). "ปฏิสัมพันธ์ของปัจจัยถอดรหัส HMG box TCF-4 กับ CtBP1 ควบคุมการแสดงออกของเป้าหมาย Wnt Axin2/Conductin ในเซลล์ไตของตัวอ่อนมนุษย์" Nucleic Acids Res . 31 (9): 2369–80 . doi : 10.1093/nar/ gkg346 . PMC  154232. PMID  12711682 .
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (มิถุนายน 2547). "การจำแนกลักษณะทรานสคริปโตมช่วยให้เข้าใจเครือข่ายสัญญาณที่ควบคุมการเจริญเติบโตและการแยกตัวของเซลล์ ES ของมนุษย์" Nat . Biotechnol . 22 (6): 707–16 . doi : 10.1038/nbt971 . PMID  15146197. S2CID  27764390 .
  • Alpatov R, Munguba GC, Caton P, Joo JH, Shi Y, Shi Y, Hunt ME, Sugrue SP (ธันวาคม 2004). "โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับจุดนิวเคลียร์ Pnn/DRS จับกับตัวยับยั้งการถอดรหัส CtBP และปลดปล่อยการยับยั้งยีน E-cadherin ที่เกิดจาก CtBP" . Mol. Cell. Biol . 24 (23): 10223– 35. doi : 10.1128/MCB.24.23.10223-10235.2004 . PMC  529029 . PMID  15542832 .
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=CTBP2&oldid=1314383622 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ซีทีบีพี2

โปรตีนที่จับกับปลาย C 2 หรือที่รู้จักกันในชื่อ CtBP2 เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน CTBP2 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

การทำงาน

CtBPs - CtBP1 และ CtBP2 ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม - เป็นหนึ่งใน โคเรเพรสเซอร์ การ ถอดรหัสที่มีลักษณะเฉพาะดีที่สุด [ 8 ] โดยทั่วไปแล้วพวกมันจะปิดยีนเป้าหมาย พวกมันทำเช่นนั้นโดยการจับกับโปรตีนที่จับกับ DNA ที่มีลำดับจำเพาะซึ่งมีโมทีฟสั้นๆ...

การใช้โปรโมเตอร์ทางเลือก

ใน เรตินา ของสัตว์มีกระดูกสันหลัง ยีน CtBP2 จะถูกถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ทางเลือกในระหว่างการพัฒนาเรตินา ทำให้เกิดตัวควบคุมการถอดรหัส CTBP2 รวมถึงโปรตีนโครงสร้างไซแนปส์แบบริบบอนขนาดใหญ่ RIBEYE [ 15 ] ฟังก์ชันการทำงานหลายอย่างของตำแหน่ง CtBP2...

อ่านเพิ่มเติม

Schaeper U, Boyd JM, Verma S, Uhlmann E, Subramanian T, Chinnadurai G (พฤศจิกายน 1995).