ปรากฏการณ์เงา^{[ 1 ]}เป็นปรากฏการณ์ที่พบในการศึกษาทางพันธุกรรมที่ใช้ วิธีการเก็บรวบรวมข้อมูล ทางพันธุกรรม แบบไม่รุกราน เกิดขึ้นเมื่อมีโลคัสไม่เพียงพอและ/หรือโลคัสที่มีความแปรปรวนของอัลลีลต่ำในประชากร ส่งผลให้นักวิจัยสามารถจับบุคคลสองคนแยกกันได้และติดป้ายกำกับผิดพลาดว่าเป็นบุคคลเดียวกัน ซึ่งอาจสร้างอคติเชิงลบในข้อมูลและแสดงให้เห็นว่าประชากรมีขนาดเล็กกว่าและมีความหลากหลายทางพันธุกรรม น้อย กว่าที่เป็นจริง ปรากฏการณ์นี้มักพบในวิธีการเก็บรวบรวมที่อาศัยดีเอ็นเอสิ่งแวดล้อม (eDNA) ซึ่งเก็บรวบรวมโดยตรงจากสิ่งแวดล้อม (เช่น อุจจาระหรือเส้นผมที่เก็บจากพื้นดิน) ^{[ 2 ]}ความแม่นยำของข้อมูลการเก็บรวบรวมแบบไม่รุกรานสามารถเพิ่มขึ้นได้โดยการเพิ่มจำนวนโลคัสที่ตรวจสอบในระหว่างการศึกษา^{[ 1 ]}

มีวิธีการลดจำนวนประชากร หลายประเภท ที่สามารถใช้เพื่อประมาณขนาดของประชากรจิ้งจกมอนิเตอร์ชนิดแข็งได้ การศึกษาขนาดและความหนาแน่นของประชากรจัดอยู่ในขอบเขตของประชากรศาสตร์ซึ่งเป็นการศึกษาประชากรของสิ่งมีชีวิตทุกชนิด

การทำเครื่องหมายและจับซ้ำเป็นวิธีการเก็บรวบรวมข้อมูลที่ใช้กันทั่วไปสำหรับสัตว์ที่มีประชากรจำนวนมาก การที่สามารถจับและทำเครื่องหมายสัตว์ได้โดยไม่รบกวนธรรมชาติ ทำให้สามารถวัดขนาดประชากรได้อย่างแม่นยำ ทั้งจำนวนรวมและจำนวนที่แท้จริงตลอดหลายรอบการจับซ้ำ อย่างไรก็ตาม สำหรับสัตว์ที่จับหรือมองเห็นได้โดยตรงได้ยาก เช่นสัตว์ใกล้สูญพันธุ์การใช้วิธีทำเครื่องหมายและจับซ้ำเพื่อเก็บตัวอย่างทางพันธุกรรมอาจเป็นไปได้ยากมาก

อีกวิธีหนึ่งในการประมาณขนาดประชากรคือปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสแบบเรียลไทม์ (qPCR) qPCR เป็นวิธีการทางโมเลกุลที่วัดการขยายของ DNA เมื่อเวลาผ่านไปแทนที่จะวัดเฉพาะตอนสิ้นสุดปฏิกิริยา^{[ 3 ]}วิธีนี้มีประโยชน์เพราะสามารถใช้ eDNA เพื่อประมาณความอุดมสมบูรณ์ของสายพันธุ์ในถิ่นที่อยู่ที่กำหนดได้

รูปแบบการเก็บรวบรวมข้อมูลแบบไม่รุกรานสามารถทำได้โดยการเก็บขน อุจจาระ หรือเศษวัสดุที่มีดีเอ็นเอสูงอื่นๆ ที่เหลืออยู่ (eDNA) ^{[ 1 ]}ในอดีตเคยถือว่ามีราคาแพง แต่ความก้าวหน้าในปัจจุบันทำให้การเก็บรวบรวมข้อมูลแบบไม่รุกรานทำได้ง่ายขึ้นและให้ข้อมูลทางพันธุกรรมเกี่ยวกับประชากรมากขึ้น^{[ 4 ]} DNA-Barcodingเป็นวิธีการระบุชนิดพันธุ์โดยใช้ eDNA เพื่อกำหนดองค์ประกอบทางพันธุกรรมเฉพาะของแต่ละบุคคลและสายพันธุ์ วิธีนี้ต้องอาศัยความสมดุลระหว่างการรักษาจำนวนเครื่องหมายโลคัสในข้อมูลทางพันธุกรรมให้เพียงพอ และการคงความคุ้มค่าด้านต้นทุน

ความน่าจะเป็นของเอกลักษณ์ (PI _AV ) คือความน่าจะเป็นที่ตัวอย่างที่สุ่มเลือกจากประชากรจะสร้างจีโนไทป์เดียวกันสองครั้ง หากไม่ได้ใช้โลคัสเพียงพอในระหว่างการศึกษา หากเลือกโลคัสที่มีความแปรผันทางพันธุกรรมน้อยหรือโลคัสจำนวนน้อย มีแนวโน้มว่าบุคคลหลายคนจะถูกระบุว่ามีความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมมากเกินไป โดยบุคคลเหล่านั้นจะถูกตัดออกจากชุดข้อมูล ซึ่งจะสร้างอคติทางสถิติเชิงลบ ผลักดันผลลัพธ์ไปสู่ค่าเฉลี่ยที่เล็กกว่าและมีความหลากหลายทางพันธุกรรมน้อยกว่าที่ถูกต้องตามประชากร ปรากฏการณ์นี้เรียกว่าผลกระทบเงา^{[ 1 ]}

หนูคาเบรรา ( Microtus cabrerae )เป็นหนูขนาดเล็กที่ใกล้สูญพันธุ์ซึ่งอยู่ใน สกุล Microtusอาศัยอยู่เป็นหลักในโปรตุเกส การประเมินจำนวนประชากรโดยใช้วิธีการจับและปล่อยแบบทั่วไปทำได้ยาก เนื่องจากขนาดที่เล็กและความสามารถในการกระจายตัวอย่างรวดเร็วไปทั่วพื้นที่ทุ่งหญ้ากว้างใหญ่^{[ 4 ]}ด้วยการนำ DNA จากสิ่งแวดล้อม (ในกรณีนี้คืออุจจาระ) มาใช้และต้นทุนที่ลดลง ทำให้สามารถใช้ในการทดลองที่มีต้นทุนค่อนข้างต่ำเพื่อประเมินขนาดประชากรของหนูคาเบรราในภาคใต้ของโปรตุเกส โดยแลกกับการสูญเสียข้อมูลทางประชากรศาสตร์ (อายุ เพศ สุขภาพ) ^{[ 4 ]}

• พระราชบัญญัติคุ้มครองสัตว์ใกล้สูญพันธุ์ พ.ศ. 2516