การเรียงลำดับเน็กซิน
โปรตีน Sorting nexinsเป็นกลุ่มโปรตีนขนาดใหญ่ที่อยู่ในไซโตพลาสซึมและมีศักยภาพในการเชื่อมโยงกับเยื่อหุ้มเซลล์ ไม่ว่าจะผ่านโดเมน PX ที่จับกับลิปิด ( โมทีฟที่จับ กับ ฟอสโฟลิปิด ) หรือผ่านปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนกับโปรตีนกับโปรตีนเชิงซ้อนที่เกี่ยวข้องกับเยื่อหุ้มเซลล์[ 2 ] [ 3 ] สมาชิกบางส่วนของตระกูลนี้ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าช่วยอำนวยความสะดวกในการคัดแยกโปรตีน
สมาชิกในครอบครัว
ในมนุษย์ โปรตีน sorting nexin ถูกถอดรหัสจากยีนต่อไปนี้:
| ยีน | องค์ประกอบของโดเมน | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| ปลายเอ็น | กลาง-1 | กลาง 2 | กลาง3 | ปลายซี | |
| SNX1 , SNX2 | การเรียงลำดับ_เน็กซิน_เอ็น | – | พีเอ็กซ์ | – | บาร์[ 4 ] (Vps5) |
| SNX4 , SNX7 , SNX8 , SNX30 | – | – | พีเอ็กซ์ | – | บาร์[ 4 ] (Vsp5) |
| SNX5 , SNX6 , SNX32 | – | – | พีเอ็กซ์ | – | บาร์[ 4 ] |
| SNX9 , SNX18 , SNX33 | SH3 | – | พีเอ็กซ์ | – | บาร์[ 4 ] (BAR_3_WASP_bdg) [ 5 ] |
| SNX13 , SNX14 , SNX19 , SNX25 | PXA [ 6 ] | อาร์จีเอส | พีเอ็กซ์ | – | เน็กซิน_ซี |
| SNX15 | – | – | พีเอ็กซ์ | – | MIT [ 7 ] |
| SNX17 , SNX31 | – | – | พีเอ็กซ์ | RA [ 8 ] | FERM_M [ 9 ] |
| SNX23 | ไคเนซินมอเตอร์ | SMAD_FHA [ 10 ] | พีเอ็กซ์ | – | – |
| SNX26 | – | – | พีเอ็กซ์ | SH3 | โรแกป |
| SNX27 | พีดีเอส | – | พีเอ็กซ์ | - | FERM_M [ 9 ] |
| SNX28 | – | – | พีเอ็กซ์ | SH3 | SH3 |
| SNX3 , SNX10 , SNX11 , SNX12 , SNX16 , SNX20 , SNX21 , SNX22 , SNX24 , SNX29 | – | – | พีเอ็กซ์ | – | – |
โครงสร้าง
โปรตีน Sorting nexins อาจประกอบด้วยโดเมน PX เพียงอย่างเดียว (เช่น SNX3) หรืออาจมีโครงสร้างแบบโมดูลาร์ที่ประกอบด้วยโดเมน PX และ โดเมน เพิ่มเติมอื่น ๆ
กลุ่มย่อยของโปรตีน Sorting Nexin (ซึ่งประกอบด้วย SNX1, SNX2, SNX4, SNX5, SNX6, SNX7, SNX8, SNX9, SNX18, SNX30, SNX32 และ SNX33 ในมนุษย์) มี โดเมน BARอยู่ที่ปลาย C-terminus (โดเมน BAR ของ SNX 1, 2, 4, 7, 8 และ 30 ถูกจัดประเภทโดย pfam ว่าเป็น 'Vps5 C terminal like')
ตัวอย่างโครงสร้างโดเมนของโปรตีน Sorting Nexin สำหรับ SNX1 สามารถดูได้ที่นี่:
- NTD – โดเมนปลายเอ็น (N-terminal domain)
- โดเมน PX
- CTD – โดเมน BAR ปลายซี
ลิงก์ภายนอก
- Sorting+Nexins ที่ หัวข้อเรื่องทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา