ในชีววิทยาโมเลกุลปัจจัยการยุติการถอดรหัสคือโปรตีนที่ทำหน้าที่ยุติการถอดรหัส RNAโดยการจดจำตัวยุติการถอดรหัสและทำให้mRNA ที่สร้างขึ้นใหม่ถูกปล่อยออก มา นี่เป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการที่ควบคุมการถอดรหัส RNA เพื่อรักษา ความสมบูรณ์ ของการแสดงออกของยีนและมีอยู่ในทั้งยูคาริโอตและโปรคาริโอตแม้ว่ากระบวนการในแบคทีเรียจะเป็นที่เข้าใจกันอย่างกว้างขวางมากกว่า^{[ 1 ]}ปัจจัยการยุติการถอดรหัสที่ได้รับการศึกษาและรายละเอียดมากที่สุดคือโปรตีน Rho (ρ)ของE. coli ^{[ 2 ]}

โปรคาริโอตใช้ RNA polymerase ชนิดเดียวในการถอดรหัส mRNA ที่เข้ารหัสโปรตีนมากกว่าหนึ่งชนิด การถอดรหัส การแปล และการย่อยสลาย mRNA เกิดขึ้นพร้อมกัน การยุติการถอดรหัสมีความสำคัญในการกำหนดขอบเขตในหน่วยการถอดรหัส ซึ่งเป็นหน้าที่ที่จำเป็นในการรักษาความสมบูรณ์ของสายและให้การควบคุมคุณภาพ การยุติในE. coliอาจขึ้นอยู่กับ Rho โดยใช้ปัจจัย Rho หรือไม่ขึ้นอยู่กับ Rho หรือที่เรียกว่าการยุติภายในแม้ว่า โอ เปรอน ส่วนใหญ่ ใน DNA จะไม่ขึ้นอยู่กับ Rho แต่การยุติที่ขึ้นอยู่กับ Rho ก็มีความสำคัญต่อการรักษาการถอดรหัสที่ถูกต้องเช่นกัน^{[ 1 ]}

ปัจจัย ρ โปรตีน Rho เป็นทรานสโลเคส RNA ที่จดจำ บริเวณที่อุดมไปด้วย ไซโตซีนของ mRNA ที่กำลังยืดออก แต่ลักษณะที่แน่นอนของลำดับที่จดจำและวิธีการตัดยังคงไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด Rho สร้างเฮกซาเมอร์รูปวงแหวนและเคลื่อนที่ไปตาม mRNA โดยไฮโดรไลซ์ATP ไปยังRNA โพลีเมอเรส (จาก 5' ไป 3' เมื่อเทียบกับ mRNA) ^{[ 3 ] [ 4 ]}เมื่อโปรตีน Rho ไปถึง คอมเพล็กซ์ RNA โพลีเมอเรส การถอดรหัสจะสิ้นสุดลงโดยการแยกตัวของRNA โพลีเมอเรส ออก จากDNAโครงสร้างและกิจกรรมของโปรตีน Rho คล้ายกับของซับยูนิต F ₁ของATP ซินเทสซึ่งสนับสนุนทฤษฎีที่ว่าทั้งสองมีความเชื่อมโยงทางวิวัฒนาการร่วมกัน^{[ 4 ]}

ปัจจัย Rho มีอยู่ทั่วไปในลำดับแบคทีเรียที่แตกต่างกันและรับผิดชอบต่อขั้วทางพันธุกรรมในE. coliมันทำหน้าที่เป็นเซนเซอร์สถานะการแปล ยับยั้งการถอดรหัสที่ไม่ก่อให้เกิดประโยชน์^{[ 5 ]}ยับยั้ง การถอดรหัส แบบแอนติเซนส์และแก้ไขความขัดแย้งที่เกิดขึ้นระหว่างการถอดรหัสและการจำลองแบบ^{[ 6 ]}กระบวนการยุติโดยปัจจัย Rho ถูกควบคุมโดย กลไก การลดทอนและการต่อต้านการยุติแข่งขันกับปัจจัยการยืดตัวสำหรับไซต์การใช้งานที่ทับซ้อนกัน ( rutsและnut s) และขึ้นอยู่กับว่า Rho สามารถเคลื่อนที่ได้เร็วแค่ไหนในระหว่างการถอดรหัสเพื่อตามทัน RNA polymerase และกระตุ้นกระบวนการยุติ^{[ 7 ]}

การยับยั้งการยุติที่ขึ้นอยู่กับ Rho โดยไบไซโคลไมซินใช้ในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย การใช้กลไกนี้ร่วมกับยาปฏิชีวนะประเภทอื่นกำลังได้รับการศึกษาเพื่อแก้ไขปัญหาการดื้อยาปฏิชีวนะ โดยการยับยั้งปัจจัยป้องกันในการถอดรหัส RNA ในขณะที่ทำงานร่วมกันกับสารยับยั้งการแสดงออกของยีนอื่นๆ เช่นเตตราไซคลินหรือริแฟมพิซิน^{[ 8 ]}

กระบวนการยุติการถอดรหัสยังไม่เป็นที่เข้าใจอย่างถ่องแท้ในยูคาริโอต เนื่องจากมีการประมวลผล RNA หลังการถอดรหัสอย่างกว้างขวาง และพอลิเมอเรส RNA ทั้งสามประเภทในยูคาริโอตก็มีระบบการยุติที่แตกต่างกัน

ใน เอนไซม์ RNA polymerase Iซึ่งเป็นปัจจัยยุติการถอดรหัส RNA polymerase Iจะจับกับบริเวณปลายน้ำของส่วนที่เข้ารหัส pre-rRNA ทำให้ RNA polymerase แยกตัวออกจากแม่แบบและปล่อยสาย RNA ใหม่ขึ้นมา

ในเอนไซม์ RNA polymerase IIการยุติการถอดรหัสเกิดขึ้นผ่านคอมเพล็กซ์การเติมหมู่โพลีอะดีนีน/การตัด หาง 3' ที่ปลายสายจะถูกจับที่ ตำแหน่ง เติมหมู่โพลีอะดีนีนแต่สายนั้นจะยังคงถอดรหัสต่อไป ไรโบนิวคลีโอไทด์ที่สังเคราะห์ขึ้นใหม่จะถูกตัดออกทีละตัวโดยปัจจัยการตัดCSTFและCPSFในกระบวนการที่ยังไม่เป็นที่เข้าใจอย่างสมบูรณ์ ส่วนที่เหลือของสายจะถูกตัดออกโดยเอนไซม์ 5'-exonuclease เมื่อการถอดรหัสเสร็จสิ้น

RNA polymerase IIIยุติการทำงานหลังจากมี สารตกค้าง ยูราซิลพอลิเมอไรเซชันหลายชุดใน mRNA ที่ถอดรหัส^{[ 1 ]}ต่างจากในแบคทีเรียและใน polymerase I แฮร์พิน RNA ที่ยุติการทำงานจะต้องอยู่ต้นน้ำเพื่อให้สามารถตัดได้อย่างถูกต้อง^{[ 9 ]}

• ปัจจัยโร