F-FDTL ก่อตั้งขึ้นจากกองทัพกองโจรของ ขบวนการปลดปล่อยแห่งชาติ ที่รู้จักกันในชื่อFALINTIL ( ชื่อย่อภาษาโปรตุเกส ของForças Armadas de Libertação de Timor-Lesteหรือกองกำลังติดอาวุธเพื่อการปลดปล่อยติมอร์-เลสเต) ในช่วงเวลาก่อนปี 1999 ผู้นำติมอร์ตะวันออกบางคน รวมถึงประธานาธิบดีโฮเซ่ รามอส-ฮอร์ตา ในปัจจุบัน เสนอว่ารัฐติมอร์ตะวันออกในอนาคตจะไม่มีกองทัพ ความรุนแรงและการทำลายล้างที่เกิดขึ้นอย่างกว้างขวางหลังจากการลงประชามติเพื่อเอกราชในปี 1999 และความจำเป็นในการจัดหางานให้กับทหารผ่านศึก FALINTIL นำไปสู่การเปลี่ยนแปลงนโยบาย^{[ 6 ]}จำนวนเจ้าหน้าที่ตำรวจที่ไม่เพียงพอที่ถูกส่งไปประจำการในติมอร์ตะวันออกในฐานะส่วนหนึ่งของกองกำลังรักษาสันติภาพที่นำโดยสหประชาชาติมีส่วนทำให้เกิดอัตราการก่ออาชญากรรมสูง การมีบุคลากร FALINTIL ที่ติดอาวุธและไม่พอใจมากขึ้นเรื่อยๆ จำนวน 1,300 คนในค่ายทหารในช่วงปลายปี 1999 และเกือบตลอดปี 2000 ยังเป็นภัยคุกคามต่อความมั่นคงอีกด้วย^{[ 7 ]}หลังจากการสิ้นสุดการปกครองของอินโดนีเซีย FALINTIL เสนอให้จัดตั้งกองทัพขนาดใหญ่ที่มีบุคลากรประมาณ 5,000 นาย^{[ 8 ]}

ในช่วงกลางปี ​​2000 องค์การสหประชาชาติเพื่อการบริหารชั่วคราวในติมอร์ตะวันออก (UNTAET) ได้ว่าจ้างทีมงานจากคิงส์คอลเลจลอนดอนให้ทำการศึกษาทางเลือกด้านกองกำลังรักษาความปลอดภัยของติมอร์ตะวันออกและทางเลือกในการปลดประจำการกองกำลังกองโจรเดิม^{[ 9 ]}รายงานของทีมงานระบุทางเลือกสามทางสำหรับกองทัพติมอร์ตะวันออก ทางเลือกที่ 1 อิงตามความต้องการของ FALINTIL ที่ต้องการกองทัพขนาดใหญ่และติดอาวุธหนักจำนวน 3,000–5,000 นาย ทางเลือกที่ 2 คือกองกำลังทหารประจำการ 1,500 นายและทหารเกณฑ์ 1,500 นาย และทางเลือกที่ 3 คือกองกำลังทหารประจำการ 1,500 นายและทหารกองหนุนอาสาสมัคร 1,500 นาย^{[ 10 ]}ทีมวิจัยแนะนำทางเลือก ที่ 3 ว่าเหมาะสมที่สุดกับความต้องการด้านความมั่นคงและสถานการณ์ทางเศรษฐกิจของติมอร์ตะวันออก ข้อแนะนำนี้ได้รับการยอมรับจาก UNTAET ในเดือนกันยายน 2000 และเป็นพื้นฐานของการวางแผนป้องกันประเทศของติมอร์ตะวันออก^{[ 6 ] [หมายเหตุ 1 ]}แผนดังกล่าวได้รับการยอมรับจากทุกประเทศที่ส่งกองกำลังรักษาสันติภาพไปยังติมอร์ตะวันออก^{[ 12 ]}รายงานของคิงส์คอลเลจถูกวิพากษ์วิจารณ์โดยเกร็ก เชอริแดนบรรณาธิการต่างประเทศของเดอะออสเตรเลียนโดยให้เหตุผลว่ารายงานดังกล่าวทำให้ติมอร์ตะวันออกจัดตั้งกองกำลังตำรวจขนาดใหญ่และกองทัพขนาดใหญ่ ในขณะที่ความต้องการด้านความมั่นคงอาจได้รับการตอบสนองได้ดีกว่าโดยกองกำลังกึ่งทหารขนาดเล็กเพียงกองกำลังเดียว^{[ 13 ]}

แม้ว่าการตัดสินใจจัดตั้งกองทัพของติมอร์ตะวันออกจะถูกวิพากษ์วิจารณ์จากนักวิจารณ์บางคน^{[ 14 ]}แต่รัฐบาลติมอร์ตะวันออกก็เชื่อมาโดยตลอดว่ากองกำลังนี้มีความจำเป็นด้วยเหตุผลทางการเมืองและความมั่นคง นักวิจารณ์การจัดตั้ง F-FDTL โต้แย้งว่าเนื่องจากติมอร์ตะวันออกไม่ได้เผชิญกับภัยคุกคามจากภายนอก ทรัพยากรที่มีจำกัดของรัฐบาลจึงควรนำไปใช้ในการเสริมสร้างความแข็งแกร่งให้กับ PNTL แทน ในขณะที่ผู้นำทางการเมืองของติมอร์ตะวันออกยอมรับว่าประเทศไม่ได้เผชิญกับภัยคุกคามจากภายนอกในปัจจุบัน แต่พวกเขาก็เชื่อว่าจำเป็นต้องรักษาขีดความสามารถทางทหารไว้เพื่อยับยั้งการรุกรานในอนาคต การจัดตั้ง F-FDTL ยังถูกมองว่าเป็นวิธีการที่มีประสิทธิภาพในการผนวก FALINTIL เข้ากับติมอร์ตะวันออกที่เป็นอิสระ^{[ 15 ]}

มีการจัดตั้งสำนักงานพัฒนากองกำลังป้องกันประเทศซึ่งมีเจ้าหน้าที่ส่วนใหญ่เป็นเจ้าหน้าที่ทหารต่างชาติ เพื่อดูแลกระบวนการจัดตั้งกองกำลังติดอาวุธของติมอร์-เลสเตและปลดประจำการอดีตกองโจร สำนักงานดังกล่าวได้มอบหมายความรับผิดชอบในการสรรหาบุคลากรให้กับผู้นำของ FALINTIL ^{[ 9 ]}

FALINTIL เปลี่ยนชื่ออย่างเป็นทางการเป็น F-FDTL เมื่อวันที่ 1 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2544 สมาชิก 650 คนแรกของ F-FDTL ได้รับการคัดเลือกจากผู้สมัคร FALINTIL เดิม 1,736 คน และเริ่มการฝึกอบรมเมื่อวันที่ 29 มีนาคม กองพันที่ 1 ของ FDTL ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 29 มิถุนายน พ.ศ. 2544 และมีกำลังพลเต็มจำนวนเมื่อวันที่ 1 ธันวาคม สมาชิกส่วนใหญ่ของกองพันมาจากจังหวัดทางตะวันออกของติมอร์-เลสเต^{[ 16 ]}กองพันที่ 2 ก่อตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 2545 จากบุคลากรของกองพันที่ 1 และประกอบด้วยบุคลากรใหม่ส่วนใหญ่ที่มีอายุต่ำกว่า 21 ปี ซึ่งไม่ได้มีส่วนร่วมในการต่อสู้เพื่อเอกราช^{[ 17 ]}เนื่องจากชื่อเสียงของกองกำลังและค่าตอบแทนที่ค่อนข้างสูง จึงมีผู้สมัคร 7,000 คนสำหรับตำแหน่ง 267 ตำแหน่งแรกในกองพัน^{[ 18 ]}กองกำลังทางเรือขนาดเล็กของ F-FDTL ก่อตั้งขึ้นในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2544 ^{[ 19 ]}กองกำลัง UNTAET ของออสเตรเลียเป็นผู้ให้การฝึกอบรมส่วนใหญ่แก่ F-FDTL และสหรัฐอเมริกาเป็นผู้จัดหาอุปกรณ์ให้กับกองกำลัง^{[ 20 ]}

ปัญหาบางประการที่ส่งผลกระทบต่อ F-FDTL ตลอดระยะเวลาการดำรงอยู่เกิดจากกระบวนการที่ใช้ในการจัดตั้งกองกำลัง ข้อบกพร่องที่สำคัญในกระบวนการนี้คือ กองบัญชาการระดับสูงของ FALINTIL ได้รับอนุญาตให้คัดเลือกผู้สมัครเข้ารับราชการทหารจากสมาชิกของ FALINTIL โดยไม่มีการกำกับดูแลจากภายนอก ส่งผลให้การคัดเลือกส่วนใหญ่ขึ้นอยู่กับความจงรักภักดีทางการเมืองของผู้สมัคร ซึ่งทำให้ทหารผ่านศึก FALINTIL หลายคนรู้สึกว่าพวกเขาถูกกีดกันออกจากกองทัพอย่างไม่เป็นธรรมและลดความน่าเชื่อถือของกองกำลังในสายตาประชาชน^{[ 21 ]}การตัดสินใจรับสมัครคนหนุ่มสาวที่ยังไม่เคยรับราชการใน FALINTIL ในรอบการรับสมัครครั้งต่อๆ มา นำไปสู่ความตึงเครียดเพิ่มเติมภายใน F-FDTL เนื่องจากช่องว่างอายุที่มักจะมากระหว่างทหารผ่านศึกและผู้รับสมัครใหม่ และข้อเท็จจริงที่ว่าในขณะที่เจ้าหน้าที่อาวุโสมีแนวโน้มที่จะมาจากทางตะวันออกของประเทศ เจ้าหน้าที่ระดับล่างและทหาร ราบส่วนใหญ่ มาจากทางตะวันตก^{[ 22 ]}ยิ่งไปกว่านั้น UNTAET ล้มเหลวในการวางรากฐานที่เพียงพอสำหรับภาคความมั่นคงของติมอร์ตะวันออกโดยการพัฒนากฎหมายและเอกสารการวางแผน การจัดเตรียมการสนับสนุนด้านการบริหาร และกลไกสำหรับการควบคุมกองทัพโดยประชาธิปไตย การละเลยเหล่านี้ยังคงไม่ได้รับการแก้ไขหลังจากที่ติมอร์-เลสเตได้รับเอกราชเมื่อวันที่ 20 พฤษภาคม 2545 ^{[ 23 ]}

F-FDTL ค่อยๆ รับผิดชอบด้านความมั่นคงของติมอร์-เลสเตจากกองกำลังรักษาสันติภาพของสหประชาชาติเขตเลาเต็มเป็นพื้นที่แรกที่ตกอยู่ภายใต้การดูแลของ F-FDTL ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2545 หลังจากได้รับการฝึกอบรมเพิ่มเติม F-FDTL ก็รับผิดชอบด้านความมั่นคงภายนอกของประเทศทั้งหมดในวันที่ 20 พฤษภาคม พ.ศ. 2547 แม้ว่าจะมีกองกำลังรักษาสันติภาพต่างชาติบางส่วนยังคงอยู่ในติมอร์-เลสเตจนถึงกลางปี ​​พ.ศ. 2548 ก็ตาม^{[ 24 ]} F-FDTL ดำเนินการปฏิบัติการครั้งแรกในเดือนมกราคม พ.ศ. 2546 เมื่อหน่วยทหารถูกเรียกตัวเข้าไปปราบปรามกิจกรรมทางอาชญากรรมที่เกิดจากกลุ่มติดอาวุธชาวติมอร์ตะวันตกในเขตเออร์เมราแม้ว่า F-FDTL จะปฏิบัติการใน "ลักษณะที่มีระเบียบวินัยและเป็นระเบียบเรียบร้อยพอสมควร" ในระหว่างปฏิบัติการนี้ แต่ก็มีการจับกุมผู้คนเกือบ 100 คนอย่างผิดกฎหมาย ซึ่งได้รับการปล่อยตัวในอีก 10  วันต่อมาโดยไม่มีการตั้งข้อหา^{[ 25 ]}

กองกำลัง F-FDTL ประสบปัญหาด้านขวัญกำลังใจและวินัยอย่างร้ายแรงนับตั้งแต่ก่อตั้งขึ้น^{[ 26 ]}ปัญหาเหล่านี้เกิดจากความไม่แน่นอนเกี่ยวกับบทบาทของ F-FDTL สภาพการทำงานที่ย่ำแย่เนื่องจากทรัพยากรที่จำกัด ความตึงเครียดที่เกิดจากการเปลี่ยนผ่านของ FALINTIL จากองค์กรกองโจรไปเป็นกองทัพปกติ และการแข่งขันทางการเมืองและระดับภูมิภาค ปัญหาด้านขวัญกำลังใจและวินัยของ F-FDTL ส่งผลให้ทหารจำนวนมากถูกลงโทษทางวินัยหรือถูกไล่ออก^{[ 27 ]}รัฐบาลติมอร์ตะวันออกตระหนักถึงปัญหาเหล่านี้ก่อนวิกฤตการณ์ปี 2549 แต่ไม่ได้แก้ไขปัจจัยที่ส่งผลต่อขวัญกำลังใจที่ต่ำ^{[ 28 ]}

ความตึงเครียดระหว่าง F-FDTL และ PNTL ยังลดประสิทธิภาพของหน่วยงานรักษาความปลอดภัยของติมอร์-เลสเตอีกด้วย ในปี 2546 รัฐบาลติมอร์ตะวันออกได้จัดตั้งกองกำลังตำรวจกึ่งทหารใหม่ 3 กองกำลังซึ่งติดตั้งอาวุธที่ทันสมัยระดับกองทัพ การจัดตั้งหน่วยเหล่านี้ทำให้เกิดความไม่พอใจต่อรัฐบาลในหมู่สมาชิกบางส่วนของ F-FDTL ^{[ 29 ] [ 30 ]}ในช่วงปี 2546 และ 2547 สมาชิกของตำรวจและ F-FDTL ปะทะกันหลายครั้ง และกลุ่มทหารได้โจมตีสถานีตำรวจในเดือนกันยายน 2546 และธันวาคม 2547 ^{[ 28 ]}ความตึงเครียดเหล่านี้เกิดจากบทบาทที่ทับซ้อนกันของหน่วยงานรักษาความปลอดภัยทั้งสอง ความเห็นที่แตกต่างกันระหว่างสมาชิกของผู้นำติมอร์-เลสเต และข้อเท็จจริงที่ว่าสมาชิกหลายคนของ PNTL เคยรับราชการกับตำรวจแห่งชาติอินโดนีเซียก่อนที่ติมอร์-เลสเตจะได้รับเอกราช ในขณะที่ F-FDTL มีฐานอยู่ที่ FALINTIL ^{[ 29 ]}

ภาพภายนอก
ทหารติมอร์ตะวันออกระหว่างการสู้รบในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2549 [ 31 ]

ความตึงเครียดภายใน F-FDTL ปะทุขึ้นในปี 2549 ในเดือนมกราคม ทหาร 159 นายจากหน่วยส่วนใหญ่ใน F-FDTL ได้ร้องเรียนต่อประธานาธิบดีXanana Gusmão ในขณะนั้น ว่า ทหารจากทางตะวันออกของประเทศได้รับการปฏิบัติที่ดีกว่าทหารจากทางตะวันตก ผู้ร้องเรียนได้รับการตอบสนองเพียงเล็กน้อยและออกจากค่ายทหารสามสัปดาห์ต่อมา โดยทิ้งอาวุธไว้เบื้องหลัง^{[ 32 ]}ทหารอีกหลายร้อยนายเข้าร่วมด้วย และในวันที่ 16 มีนาคม ผู้บัญชาการ F-FDTL พลตรีTaur Matan Ruakได้ปลดทหาร 594 นาย ซึ่งเกือบครึ่งหนึ่งของกำลังพล^{[ 28 ]}ทหารที่ถูกปลดไม่ได้จำกัดเฉพาะผู้ร้องเรียนเท่านั้น แต่ยังรวมถึงนายทหารและพลทหารอีกประมาณ 200 นายที่ขาดงานโดยไม่ได้รับอนุญาต อย่างต่อเนื่อง ในช่วงหลายเดือนและหลายปีก่อนเดือนมีนาคม 2549 ^{[ 32 ]}

วิกฤตการณ์ทวีความรุนแรงขึ้นในช่วงปลายเดือนเมษายน ในวันที่ 24 เมษายน ผู้ร้องและผู้สนับสนุนบางส่วนได้จัดการประท้วงเป็นเวลาสี่วันหน้าทำเนียบรัฐบาลในเมืองดิลี เรียกร้องให้จัดตั้งคณะกรรมการอิสระเพื่อแก้ไขข้อร้องเรียนของพวกเขา ความรุนแรงปะทุขึ้นในวันที่ 28 เมษายน เมื่อผู้ร้องและกลุ่มวัยรุ่นบางส่วนที่เข้าร่วมการประท้วงได้โจมตีทำเนียบรัฐบาล กองกำลัง PNTL ไม่สามารถควบคุมการประท้วงได้ และทำเนียบได้รับความเสียหายอย่างหนัก หลังจากความรุนแรงลุกลามไปยังพื้นที่อื่นๆ ของเมืองดิลี นายกรัฐมนตรีมารี อัลกาติรีได้ขอให้กองกำลัง F-FDTL ช่วยฟื้นฟูความสงบเรียบร้อย กองกำลังที่ไม่มีประสบการณ์ในการควบคุมฝูงชนถูกส่งไปยังเมืองดิลีในวันที่ 29 เมษายน และส่งผลให้มีผู้เสียชีวิต 3 ราย ในวันที่ 3 พฤษภาคม พันตรีอัลเฟรโด เรนาโด ผู้บัญชาการหน่วย ตำรวจทหารของ F-FDTL และทหารส่วนใหญ่ รวมถึงร้อยโทกัสเตา ซัลซินญาได้ละทิ้งตำแหน่งเพื่อประท้วงสิ่งที่พวกเขาเห็นว่าเป็นการยิงพลเรือนโดยเจตนาของกองทัพ^{[ 33 ]}

การต่อสู้ปะทุขึ้นระหว่างกองกำลังรักษาความมั่นคงติมอร์ตะวันออกที่เหลืออยู่กับกลุ่มกบฏและแก๊งต่างๆ ในช่วงปลายเดือนพฤษภาคม เมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม กลุ่มกบฏของเรนาโดได้เปิดฉากยิงใส่เจ้าหน้าที่ F-FDTL และ PNTL ในพื้นที่ฟาตูอาฮี เมื่อวันที่ 24 พฤษภาคม เจ้าหน้าที่ F-FDTL ใกล้กับสำนักงานใหญ่ของกองกำลังถูกโจมตีโดยกลุ่มเจ้าหน้าที่ตำรวจกบฏ ผู้ร้องเรียน และพลเรือนติดอาวุธ การโจมตีถูกปราบปรามเมื่อเรือลาดตระเวนลำหนึ่งของหน่วยนาวิกโยธิน F-FDTL ยิงใส่ผู้โจมตี^{[ 34 ]}ในช่วงวิกฤต ความสัมพันธ์ระหว่าง F-FDTL และ PNTL แย่ลงไปอีก และเมื่อวันที่ 25 พฤษภาคม สมาชิกของ F-FDTL ได้โจมตีสำนักงานใหญ่ของ PNTL สังหารเจ้าหน้าที่ตำรวจที่ไม่มีอาวุธ 9 นาย^{[ 28 ]}

ผลจากความรุนแรงที่ทวีความรุนแรงขึ้น รัฐบาลจึงต้องขอความช่วยเหลือจากกองกำลังรักษาสันติภาพระหว่างประเทศในวันที่ 25 พฤษภาคม กองกำลังรักษาสันติภาพเริ่มเดินทางมาถึงดิลีในวันถัดมาและในที่สุดก็สามารถฟื้นฟูความสงบเรียบร้อยได้ มีผู้เสียชีวิตจากการสู้รบในเดือนเมษายนและพฤษภาคมรวม 37 คน และประชาชน 155,000 คนต้องอพยพออกจากบ้าน การสอบสวนของสหประชาชาติพบว่ารัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทยและกระทรวงกลาโหม รวมถึงผู้บัญชาการของ F-FDTL ได้โอนอาวุธให้กับพลเรือนอย่างผิดกฎหมายในช่วงวิกฤต และแนะนำให้ดำเนินคดีกับพวกเขา^{[ 35 ]}

ภายในเดือนกันยายน F-FDTL ได้ลดขนาดลงอย่างมาก และประกอบด้วยกองบัญชาการ (บุคลากร 95 นาย) หน่วยสื่อสารกำลังพล (21 นาย) หน่วยตำรวจทหาร (18 นาย) กองพันที่ 1 (317 นาย) หน่วยนาวิกโยธิน (83 นาย) หน่วยโลจิสติกส์กำลังพล (63 นาย) และศูนย์ฝึกอบรมนิโคเลา โลบาโต เมตินาโร (118 นาย) นอกจากนี้ อดีตสมาชิกกองพันที่ 2 อีก 43 นายกำลังเข้ารับการอบรม^{[ 23 ]}

วิกฤตการณ์ในปี 2549 ทำให้ F-FDTL "พังพินาศ" ^{[ 36 ]}กำลังพลของ F-FDTL ลดลงจาก 1,435 คนในเดือนมกราคม 2549 เหลือ 715 คนในเดือนกันยายน และสัดส่วนของชาวตะวันตกในกองทัพลดลงจาก 65  เปอร์เซ็นต์เหลือ 28  เปอร์เซ็นต์^{[ 23 ]} F-FDTL เริ่มกระบวนการฟื้นฟูโดยได้รับการสนับสนุนจากหลายประเทศและสหประชาชาติ แต่ก็ยังไม่พร้อมที่จะกลับมารับผิดชอบด้านความมั่นคงภายนอกของติมอร์-เลสเต สองปีหลังจากวิกฤตการณ์^{[ 36 ]}

ในปี 2547 ผู้บัญชาการของ F-FDTL ได้จัดตั้งทีมซึ่งรวมถึงผู้รับเหมาระหว่างประเทศ เพื่อพัฒนาเอกสารวิสัยทัศน์เชิงกลยุทธ์ระยะยาวสำหรับกองทัพ การศึกษานี้ได้รับการสนับสนุนจากรัฐบาลออสเตรเลีย^{[ 37 ]} เอกสาร Force 2020ที่ได้จัดทำเสร็จสมบูรณ์ในปี 2549 และเผยแพร่สู่สาธารณะในปี 2550 ^{[ 38 ]}เอกสารนี้ได้กำหนดวิสัยทัศน์ที่ "มุ่งหวัง" สำหรับการพัฒนา F-FDTL ไปจนถึงปี 2563 และหลังจากนั้น และมีสถานะเทียบเท่ากับเอกสารนโยบายกลาโหมโดยเสนอให้ขยายกองทัพให้มีกำลังพลประจำการ 3,000 นายในระยะกลางผ่านการนำระบบเกณฑ์ทหาร มา ใช้ นอกจากนี้ยังกำหนดเป้าหมายระยะยาว เช่น การจัดตั้งหน่วยบิน และการจัดซื้ออาวุธที่ทันสมัย ​​เช่นอาวุธต่อต้านรถถัง รถลำเลียงพลหุ้มเกราะและเรือมิสไซล์ภายในปี 2563 ^{[ 39 ]}

แผน Force 2020คล้ายกับตัวเลือก ที่ 1 ในรายงานของ King's College ทีมศึกษาของ King's College แนะนำอย่างยิ่งให้คัดค้านโครงสร้างกำลังพลดังกล่าว โดยระบุว่าเป็น "ไม่สามารถจ่ายได้" และแสดงความกังวลเกี่ยวกับผลกระทบของการเกณฑ์ทหารต่อสังคมและความพร้อมทางทหารของติมอร์ตะวันออก ทีมงานประเมินว่าการรักษาโครงสร้างกำลังพลดังกล่าวจะมีค่าใช้จ่าย 2.6 ถึง 3.3  เปอร์เซ็นต์ของผลิตภัณฑ์มวลรวมภายในประเทศประจำปีของติมอร์-เลสเต และจะ "เป็นภาระหนักต่อเศรษฐกิจของติมอร์ตะวันออก" ^{[ 40 ]}ยิ่งไปกว่านั้น แผน Force 2020อาจไม่สมจริงหรือเหมาะสม เนื่องจากดูเหมือนว่าจะเน้นการขยายกำลังทหารเพื่อรับมือกับภัยคุกคามจากภายนอกมากกว่าการใช้จ่ายในบริการของรัฐบาลอื่นๆ และความมั่นคงภายใน และได้ร่างแนวคิดต่างๆ เช่น การพัฒนากองกำลังอวกาศ ในระยะยาว (~ ²⁰⁷⁵ ) [ ^{41 ]}

แม้ว่า แผน Force 2020จะเป็นที่ถกเถียงกัน แต่ดูเหมือนว่ารัฐบาลติมอร์ตะวันออกจะยอมรับแผนนี้แล้ว แผนดังกล่าวถูกวิพากษ์วิจารณ์โดยสหประชาชาติ รัฐบาลออสเตรเลีย และสหรัฐอเมริกา ว่ามีราคาแพงเกินไปและเกินความต้องการของติมอร์-เลสเต^{[ 42 ]}อย่างไรก็ตาม ประธานาธิบดีโฮเซ่ รามอส-ฮอร์ตา แห่งติมอร์ตะวันออก ได้ปกป้องแผนนี้ โดยให้เหตุผลว่าการยอมรับแผนนี้จะเปลี่ยน F-FDTL ให้เป็นกองกำลังมืออาชีพที่สามารถปกป้องอธิปไตยของติมอร์-เลสเตและมีส่วนช่วยสร้างเสถียรภาพให้กับประเทศ^{[ 43 ]}เจ้าหน้าที่กลาโหมของติมอร์ตะวันออกยังเน้นย้ำว่าForce 2020เป็นแผนระยะยาวและไม่ได้เสนอให้จัดหาอาวุธขั้นสูงในอีกหลายปีข้างหน้า^{[ 38 ]}

ผลกระทบจากวิกฤตการณ์ปี 2549 ยังคงอยู่เป็นเวลาหลายปี ในวันที่ 11 กุมภาพันธ์ 2551 กลุ่มกบฏที่นำโดยอัลเฟรโด เรนนาโดพยายามสังหารหรือลักพาตัวประธานาธิบดีรามอส-ฮอร์ตาและนายกรัฐมนตรีกุสเมา แม้ว่ารามอส-ฮอร์ตาและองครักษ์คนหนึ่งของเขาจะได้รับบาดเจ็บสาหัส แต่การโจมตีเหล่านี้ก็ไม่ประสบความสำเร็จ และเรนนาโดและกบฏอีกคนหนึ่งถูกสังหาร มีการจัดตั้งกองบัญชาการร่วม F-FDTL และ PNTL ขึ้นเพื่อติดตามกบฏที่รอดชีวิต และกองทัพและตำรวจได้แสดงให้เห็นถึงความร่วมมือในระดับสูงระหว่างปฏิบัติการนี้^{[ 44 ]}กองบัญชาการร่วมถูกยุบในวันที่ 19 มิถุนายน 2551 แม้ว่ากองบัญชาการร่วมจะมีส่วนทำให้ผู้ร่วมงานของเรนนาโดหลายคนยอมจำนน แต่ก็มีข้อกล่าวหาว่าสมาชิกของหน่วยนี้ได้ละเมิดสิทธิมนุษยชน^{[ 45 ]}ในวงกว้างขึ้น ความตกใจที่เกิดจากการโจมตีรามอส-ฮอร์ตาและกุสเมานำไปสู่การปรับปรุงความร่วมมืออย่างยั่งยืนระหว่าง F-FDTL และ PNTL ^{[ 46 ]}ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2551 รัฐบาลเสนอที่จะให้ค่าชดเชยทางการเงินแก่ผู้ร้องที่ประสงค์จะกลับไปใช้ชีวิตพลเรือน ข้อเสนอนี้ได้รับการยอมรับ และผู้ร้องทั้งหมดได้กลับบ้านภายในเดือนสิงหาคมของปีนั้น^{[ 47 ]}

ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2552 F-FDTL ได้รับผู้เข้ารับการฝึกอบรมรุ่นแรกนับตั้งแต่เกิดวิกฤตการณ์ในปี พ.ศ. 2549 แม้ว่าความหลากหลายทางภูมิภาคของผู้เข้ารับการฝึกอบรมใหม่ 579 คนโดยทั่วไปจะมากกว่าผู้เข้ารับการฝึกอบรมก่อนเกิดวิกฤตการณ์มาก แต่ร้อยละ 60.3 ของผู้สมัครเป็นเจ้าหน้าที่มาจากเขตทางตะวันออกของประเทศ^{[ 48 ]}ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2552 F-FDTL ได้จัดตั้งด่านขนาดหมวดเพื่อสนับสนุนตำรวจชายแดน PNTL ในเขตชายแดนโบโบนาโรและโคว่าลิมา และได้รับการส่งไปปฏิบัติภารกิจด้านความมั่นคงภายในมากขึ้นเรื่อยๆ^{[ 14 ]}ตั้งแต่เดือนกุมภาพันธ์ถึงสิงหาคม พ.ศ. 2553 สมาชิก 200 คนของ F-FDTL ถูกส่งไปสนับสนุนปฏิบัติการของ PNTL ต่อต้านแก๊ง "นินจา" กองกำลังเหล่านี้ปฏิบัติภารกิจการมีส่วนร่วมกับชุมชน และไม่มีอาวุธและไม่ได้บูรณาการอย่างใกล้ชิดกับความพยายามของ PNTL ^{[ 49 ]}

ในปี 2011 กองกำลัง F-FDTL ยังคงมีกำลังพลไม่เพียงพอและยังไม่ได้ปฏิรูปมาตรฐานการฝึกอบรมและระเบียบวินัย^{[ 50 ]}ความตึงเครียดภายในกองกำลัง F-FDTL ยังคงคุกคามเสถียรภาพของกองกำลัง^{[ 51 ]}อย่างไรก็ตาม รัฐบาลติมอร์ตะวันออกให้ความสำคัญอย่างยิ่งกับการฟื้นฟูกองกำลัง F-FDTL และพัฒนาให้เป็นกองกำลังที่สามารถปกป้องประเทศได้^{[ 50 ]}ในปี 2012 รัฐบาลได้อนุมัติการขยายกองกำลัง F-FDTL เป็น 3,600 นายภายในปี 2020 ซึ่งประมาณหนึ่งในสี่จะเป็นสมาชิกของกองทัพเรือ^{[ 52 ]}ในฉบับปี 2016 ของ สิ่งพิมพ์ The Military Balance ของ สถาบันระหว่างประเทศเพื่อการศึกษาเชิงกลยุทธ์ (IISS) ระบุว่ากองกำลัง F-FDTL "สามารถทำหน้าที่ได้เฉพาะด้านความมั่นคงภายในและชายแดนเท่านั้น" ^{[ 53 ]}

รัฐบาลติมอร์ตะวันออกได้เผยแพร่แนวคิดเชิงกลยุทธ์ด้านการป้องกันและความมั่นคงฉบับใหม่ในปี 2016 เอกสารฉบับนี้กำหนดบทบาทของ F-FDTL ให้เป็นการปกป้องประเทศจากภัยคุกคามภายนอกและการปราบปรามอาชญากรรมรุนแรงภายในติมอร์-เลสเต แนวคิดเชิงกลยุทธ์ด้านการป้องกันและความมั่นคงยังเรียกร้องให้มีการปรับปรุงขีดความสามารถทางทะเลของ F-FDTL เพื่อปกป้องเขตเศรษฐกิจพิเศษ ของติมอร์-เลสเตอย่างเพียงพอ ในปี 2020 IISS ตัดสินว่า F-FDTL "ได้รับการจัดตั้งใหม่แล้ว แต่ยังห่างไกลจากการบรรลุเป้าหมายโครงสร้างกำลังพลที่ทะเยอทะยานตามที่กำหนดไว้ในแผน Force 2020" ^{[ 1 ]}ในทำนองเดียวกันสถาบันวิจัยสันติภาพระหว่างประเทศสตอกโฮล์ม ในปี 2019 ตั้งข้อสังเกตว่ามีความคืบหน้าเพียงเล็กน้อยในการดำเนินการตามโครงการจัดซื้อจัดจ้างที่กำหนดไว้ในแผน Force 2020 ซึ่งอาจเป็นเพราะขาดแคลนเงินทุนและ "อาจเป็นเพราะดูเหมือนจะไม่มีเหตุผลในการจัดซื้ออุปกรณ์บางอย่าง" ^{[ 54 ]}

เมื่อวันที่ 29 ตุลาคม พ.ศ. 2563 คณะรัฐมนตรีได้อนุมัติแผนการเริ่มการเกณฑ์ทหารภาคบังคับสำหรับพลเมืองติมอร์ที่มีอายุ 18 ปีขึ้นไป^{[ 55 ]}

ในบทความวารสารปี 2023 นักวิชาการ Deniz Kocak ตั้งข้อสังเกตว่า F-FDTL ไม่มีหลักคำสอนที่ เป็นลายลักษณ์อักษร และบทบาทของกองกำลังนั้นไม่ชัดเจน เขาสังเกตว่า F-FDTL ยังคงถือว่าตนเองเป็นผู้สืบทอดโดยตรงของ FALINTIL และมุ่งเน้นไปที่สงครามกองโจร^{[ 56 ]}

เมื่อเริ่มก่อตั้ง กองกำลังภาคพื้นดิน F-FDTL ประกอบด้วยกองพันทหารราบเบา 2 กองพัน โดยแต่ละกองพันมีกำลังพลที่ได้รับอนุญาต 600 นาย^{[ 74 ]}ณ ปี 2547แต่ละกองพันมีกองร้อยปืนยาว 3 กองร้อย กองร้อยสนับสนุน 1 กองร้อย และกองร้อยกองบัญชาการ 1 กองร้อย^{[ 75 ]}แม้ว่ากองทัพจะมีขนาดเล็ก แต่ยุทธวิธีแบบกองโจรที่ FALINTIL ใช้ก่อนการถอนกำลังของกองทัพแห่งชาติอินโดนีเซีย ในปี 1999 นั้นมีประสิทธิภาพในการต่อต้านกองกำลังที่มีจำนวนมากกว่า และมีศักยภาพที่จะสร้างการป้องปรามที่น่าเชื่อถือต่อการรุกราน^{[ 76 ]}หลักคำสอนปัจจุบันของกองทัพมุ่งเน้นไปที่ยุทธวิธีการรบของทหารราบที่มีความเข้มข้นต่ำ รวมถึงภารกิจต่อต้านการก่อความไม่สงบ^{[ 69 ]}การฝึกอบรมและการปฏิบัติการส่วนใหญ่ของกองกำลังดำเนินการใน ระดับ หมวดและการฝึกซ้อมขนาดกองร้อยหรือกองพันนั้นหายาก^{[ 77 ]}

จนกระทั่งเกิดวิกฤตการณ์ในปี 2549 หน่วยรบหลักของกองกำลังภาคพื้นดินประกอบด้วยสองกองพัน ตามแนวคิดดั้งเดิมของพลตรีชาวออสเตรเลียผู้เสนอแนะ หน่วยเหล่านี้ตั้งอยู่ในฐานทัพที่แยกจากกัน ( ณ ปี 2547)กองพันที่ 1 ประจำการอยู่ที่Baucauโดยมีกำลังพลส่วนหนึ่งอยู่ในหมู่บ้านชายฝั่งทะเล Laga ^{[ 78 ]}ในปี 2549 กองพันที่ 2 ประจำการอยู่ที่ศูนย์ฝึกอบรม Nicolau Lobatoใกล้กับMetinaro [ ^{79 ] [ 80 ] ทหาร}เกือบทั้งหมดของกองพันที่ 2 ถูกปลดประจำการในช่วงวิกฤตการณ์ปี 2549 ^{[ 23 ]}ควรสังเกตให้ชัดเจนว่ารายชื่อบุคลากรข้างต้นหลังจากวิกฤตการณ์ปี 2549 หมายถึงเฉพาะกองพันที่ 2 "เดิม" เท่านั้น หน่วยทหารหลักอื่นๆ ได้แก่ หมวด ตำรวจทหารและกองร้อยสนับสนุนด้านโลจิสติกส์^{[ 1 ]}ณ ปี 2562 F-FDTL กำลังวางแผนที่จะจัดตั้งกองร้อยหน่วยรบพิเศษ^{[ 81 ]} The Military Balanceฉบับปี 2563 ระบุว่ากองทัพบกมีกำลังพล 2,200 นาย^{[ 1 ]}

การสนับสนุนด้านโลจิสติกส์และบริการต่างๆ จัดทำโดยกองบัญชาการ F-FDTL ในดิลี กองร้อยตำรวจทหารทำหน้าที่ดูแลความเรียบร้อยใน F-FDTL และปฏิบัติภารกิจรักษาความสงบเรียบร้อยแบบดั้งเดิม ส่งผลให้มีบทบาทที่ขัดแย้งกับ PNTL นอกจากนี้ ตำรวจทหารยังรับผิดชอบด้านความปลอดภัยของประธานาธิบดีตั้งแต่เดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2550 ^{[ 82 ]}ในปี พ.ศ. 2553 สถานทูตสหรัฐอเมริกาในดิลีรายงานว่า F-FDTL วางแผนที่จะจัดตั้งกองร้อยวิศวกร 2 กองร้อยในปีนั้น โดยทั้งสองหน่วยจะมีกำลังพลรวม 125 นาย^{[ 83 ]}

F-FDTL ติดอาวุธด้วยอาวุธขนาดเล็ก เท่านั้น และไม่มีอาวุธประจำหน่วยJane's Sentinelฉบับปี 2007 ระบุว่า F-FDTL มีอุปกรณ์ใช้งานดังต่อไปนี้: ปืนไรเฟิล M16 จำนวน 1,560 กระบอก และเครื่องยิงระเบิด M203 จำนวน 75 เครื่อง ปืนกลประจำหน่วยFN Minimi จำนวน 75 กระบอก ปืนไรเฟิลซุ่มยิง 8 กระบอกและ ปืนพก M1911A1ขนาด .45 จำนวน 50 กระบอก มีการสั่งซื้อ Minimi เพิ่มอีก 75 กระบอกในเวลานั้น อาวุธส่วนใหญ่ของ F-FDTL ได้รับการบริจาคจากประเทศอื่น^{[ 84 ]}การประเมินกองกำลังรักษาความปลอดภัยของติมอร์-เลสเตที่เผยแพร่โดยศูนย์นวัตกรรมการปกครองระหว่างประเทศในปี 2010 ระบุว่า "ระบบการจัดการและควบคุมอาวุธของ F-FDTL แม้จะเหนือกว่าของ PNTL แต่ก็ยังไม่ได้รับการพัฒนาอย่างเต็มที่" ^{[ 48 ]} F-FDTL สั่งซื้อรถยนต์ขับเคลื่อนสี่ล้อติดอาวุธเบาจำนวน 8 คันจากจีนในปี 2550 ^{[ 85 ]} รถบรรทุก Weststar GS ของมาเลเซียจำนวน 10 ถึง 50 คันถูกส่งมอบในปี 2557 ^{[ 86 ]}

กองกำลังทางเรือของ F-FDTL ก่อตั้งขึ้นในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2544 เมื่อโปรตุเกสโอนเรือลาดตระเวน ขนาดเล็ก ชั้นAlbatroz สองลำจาก กองทัพเรือโปรตุเกสการก่อตั้งไม่ได้รับการสนับสนุนจากทีมศึกษาของ King's College, UN หรือประเทศผู้บริจาคอื่นๆ ของติมอร์-เลสเต เนื่องจากติมอร์-เลสเตไม่มีงบประมาณเพียงพอที่จะดำเนินการกองกำลังทางเรือได้^{[ 19 ]}บทบาทของกองกำลังทางเรือคือการลาดตระเวนประมงและป้องกันชายแดน และเพื่อให้แน่ใจว่าเส้นทางการสื่อสารทางทะเลไปยัง เขตปกครอง Oecussiยังคงเปิดอยู่^{[ 87 ]}ซึ่งเทียบได้กับบทบาทของกองทัพเรือโปรตุเกสซึ่งทำหน้าที่ ทางทหารและ รักษาชายฝั่ง เช่นกัน ^{[ 88 ]}เรือรบทั้งหมดของกองกำลังประจำการอยู่ที่ท่าเรือเฮรา ซึ่งอยู่ห่างจากดิลีไปทางตะวันออกไม่กี่กิโลเมตร^{[ 87 ]}ฐานทัพขนาดเล็กตั้งอยู่ที่อาตาเบใกล้ชายแดนอินโดนีเซีย^{[ 88 ]}ภายใต้ แผน Force 2020ส่วนประกอบทางเรืออาจขยายไปสู่กองกำลังลาดตระเวนเบาที่มี เรือขนาด คอร์เว็ตและเรือยกพลขึ้นบกใน ที่สุด ^{[ 89 ]}

เมื่อวันที่ 12 เมษายน 2551 ติมอร์-เลสเตได้ลงนามในสัญญาซื้อเรือปืน Type 062ขนาด 43 เมตรที่สร้างโดยจีนจำนวน 2 ลำ เรือเหล่านี้จะมาแทนที่ เรือชั้น Albatrozและใช้เพื่อปกป้องการประมงของติมอร์-เลสเต สัญญานี้ยังรวมถึงการฝึกอบรมบุคลากรชาวติมอร์ตะวันออกจำนวน 30 ถึง 40 คนในประเทศจีนด้วย^{[ 90 ] [ 91 ]}เรือลาดตระเวนใหม่ 2 ลำเดินทางมาถึงจากจีนในเดือนมิถุนายน 2553 และได้รับการขึ้นระวางประจำการในชั้นJacoในวันที่ 11 ของเดือน^{[ 92 ] [ 93 ]}การจัดซื้อครั้งนี้เป็นที่ถกเถียงกันในติมอร์-เลสเตเนื่องจากขาดความโปร่งใสเกี่ยวกับการซื้อและข้อกังวลว่าเรือลาดตระเวนไม่เหมาะสมกับสภาพทะเลที่รุนแรงและสภาพอากาศเขตร้อนที่พวกเขาจะต้องปฏิบัติการ นักวิชาการ Ian Storey ได้เขียนไว้ว่า "การทุจริตอาจมีส่วนเกี่ยวข้องในข้อตกลงนี้" ^{[ 94 ]}รัฐบาลติมอร์ตะวันออกให้เหตุผลในการซื้อโดยอ้างว่าเรือลาดตระเวนมีความจำเป็นต่อการรักษาเอกราชของประเทศ^{[ 95 ]}

รัฐบาลเกาหลีใต้บริจาคเรือลาดตระเวนชั้นชัมซูรี หนึ่งลำ จากกองทัพเรือสาธารณรัฐเกาหลี และเรือลาดตระเวนขนาดเล็กอีกสองลำในปี 2011 โดยเรือเหล่านี้เข้าประจำการในกองทัพเรือเมื่อวันที่ 26 กันยายน 2011 ^{[ 96 ]}รัฐบาลติมอร์ตะวันออกยังได้สั่งซื้อเรือลาดตระเวนเร็วสองลำจากบริษัท PT Pal ของอินโดนีเซียในเดือนมีนาคม 2011 ในราคา 40 ล้าน ดอลลาร์สหรัฐ ^{[ 97 ]} 

รายงาน IISS Military Balance ฉบับปี 2020 ระบุขนาดของกองกำลังทางเรือไว้ที่ 80 นาย^{[ 1 ]}รายงานJane's Sentinel ฉบับปี 2011 ระบุจำนวนกำลังพลของกองกำลังทางเรือไว้ที่ 250 นาย แหล่งข้อมูลนี้ยังระบุด้วยว่าการรับสมัครหน่วย นาวิกโยธินที่มีกำลังพลประมาณ 60 นายเริ่มขึ้นในปี 2011 จากบุคลากรของกองกำลังทางเรือที่มีอยู่ สมาชิกของกองทัพบก และพลเรือน นาวิกโยธินจะทำหน้าที่เป็นกองกำลังปฏิบัติการพิเศษ^{[ 98 ]}

ในปี 2017 ติมอร์-เลสเตยอมรับข้อเสนอเรือลาดตระเวนชั้นการ์เดียน ใหม่ 2 ลำ พร้อมการฝึกอบรมและความช่วยเหลือด้านโลจิสติกส์ที่เกี่ยวข้องจากรัฐบาลออสเตรเลีย เรือเหล่านี้มีกำหนดส่งมอบในปี 2023 ^{[ 99 ]}และจะตั้งชื่อว่าไอทานาและลาลีน [ ^{100 ] [ 101 ] ออสเตรเลีย} ยังให้ทุนสนับสนุนท่าเทียบเรือใหม่ที่อ่าวเฮรา ซึ่งจะช่วยให้เรือลาดตระเวนชั้นการ์เดียนทั้งสองลำสามารถปฏิบัติการได้^{[ 102 ]}

ส่วนประกอบการบินเบาของ F-FDTL ก่อตั้งขึ้นในเดือนพฤษภาคม 2018 เมื่อ เครื่องบิน Cessna 172Pหมายเลขทะเบียน 4W-FAT ถูกซื้อจากสหรัฐอเมริกาโดยAero Diliสำหรับ F-FDTL ^{[ 103 ]}ณ ปี 2020 ส่วนประกอบการบินเบาของ F-FDTL ดำเนินการด้วยเครื่องบิน Cessna 172P เพียงลำเดียว^{[ 1 ]}

ในปี 2019 รัฐบาลติมอร์ตะวันออกกำลังพิจารณาซื้อ เฮลิคอปเตอร์ Mil Mi-17 รุ่นจีนจำนวน 3 ลำ บุคลากร F-FDTL จำนวนเล็กน้อยได้รับการฝึกอบรมให้ใช้งานเฮลิคอปเตอร์ประเภทนี้ในฟิลิปปินส์^{[ 81 ]}

รัฐบาลสหรัฐอเมริกาและติมอร์ตะวันออกได้บรรลุข้อตกลงในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2564 โดยสหรัฐอเมริกาจะสนับสนุนเงินทุนเพื่อยกระดับสนามบินเบาเคาเพื่อรองรับ F-FDTL และการดำเนินงานเชิงพาณิชย์ และบริจาคเครื่องบินเซสนา 206หมายเลขทะเบียน 4W-FAM ให้กับ F-FDTL งานปรับปรุงสนามบินเริ่มขึ้นในเดือนมกราคม พ.ศ. 2565 กองทัพสหรัฐฯ ระบุว่าวัตถุประสงค์ของข้อตกลงนี้คือการสนับสนุนการสร้างหน่วยบินเพื่อ "ช่วยเหลือรัฐบาลติมอร์ในการปรับปรุงการรับรู้ทางทะเล ตอบสนองต่อภัยพิบัติทางธรรมชาติ และส่งเสริมการพัฒนาเศรษฐกิจ" ^{[ 104 ]}เครื่องบินเซสนา 206 ได้รับการส่งมอบในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2566 ^{[ 105 ]}

ตั้งแต่ปี 2022 หน่วย รบพิเศษ F-FDTL Unidade Falintil ได้ขึ้นตรงต่อเสนาธิการทหารสูงสุด^{[ 66 ] [ 106 ] [ 107 ]}ขนาดของหน่วยเทียบเท่ากับกองร้อย โดยมีกำลังพลที่ได้รับอนุญาต 162 นาย ซึ่งสวมหมวก เบเรต์สีเขียว^{[ 108 ]}