ฝูงบินนี้ถูกส่งไปประจำการบนเรือรบรูสเวลต์ ในช่วงต้นปี 1991 เพื่อสนับสนุนปฏิบัติการพายุทะเลทราย (Operation Desert Storm ) ฝูงบิน VAQ-141 เป็นฝูงบินแรกของ CVW-8 ที่ส่งอาวุธยุทโธปกรณ์ในความขัดแย้งนั้น โดยยิง ขีปนาวุธ AGM-88 HARMในคืนแรก หลังจากการสู้รบสิ้นสุด ลง เรือรบ รูสเวลต์ และ CVW-8 ได้แล่นกลับไปยังทะเลเมดิเตอร์เรเนียนตะวันออก และให้การคุ้มครองทางอากาศแก่ปฏิบัติการบรรเทาทุกข์ด้านมนุษยธรรมในภาคเหนือของอิรัก ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของปฏิบัติการช่วยเหลือ (Operation Provide Comfort )

ในปี 1993 ฝูงบิน VAQ-141 ได้ถูกส่งไปประจำการอีกครั้งบนเรือ บรรทุกเครื่องบินรู สเวลต์คราวนี้ไปยังทะเล เอเดรียติก เพื่อสนับสนุนปฏิบัติการ Provide Promise ซึ่งเป็นปฏิบัติการบรรเทาทุกข์ด้านมนุษยธรรม และปฏิบัติการ Deny Flightซึ่งเป็นปฏิบัติการบังคับใช้เขตห้ามบินเหนือบอสเนียและเฮอร์เซโกวีนา หลังจากภารกิจ Deny Flight หลายครั้ง ทีม TR/CVW-8 ได้แล่นเรือไปยังทะเลแดงเพื่อสนับสนุนปฏิบัติการ Southern Watchเพื่อให้แน่ใจว่าอิรักปฏิบัติตามมติของสหประชาชาติหลังสงครามอ่าว เปอร์เซีย

ฝูงบินได้ถูกส่งไปประจำการอีกครั้งพร้อมกับ กองเรือรบ รูสเวลต์ ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2538 เพื่อสนับสนุนภารกิจปฏิบัติการเซาเทิร์นวอทช์จากทะเลแดงและอ่าวเปอร์เซียในเดือนมิถุนายน ฝูงบินได้บินขึ้นฝั่งที่ฐานทัพอากาศอาเวียโนประเทศอิตาลี เพื่อสนับสนุนปฏิบัติการเดนีไฟลท์เหนือบอสเนีย ในช่วงเวลานี้ ฝูงบิน VAQ-141 ได้บินคุ้มกันการโจมตีทางอากาศเพื่อสนับสนุนปฏิบัติการค้นหาและกู้ภัยทางอากาศ (CSAR) ที่ประสบความสำเร็จสำหรับกัปตันสก็อตต์ โอ'เกรดี้นักบิน กองทัพอากาศที่เครื่องบินตก ปฏิบัติการเดลิเบอเรทฟอร์ซเริ่มต้นขึ้นในปลายเดือนสิงหาคม และฝูงบินได้ให้การคุ้มครองการโจมตีทางอากาศของนาโต้ ( SEAD ) อีกครั้งทั่วบอสเนีย ฝูงบินเดินทางกลับบ้านในเดือนกันยายน

ในปี 1996 ฝูงบิน VAQ-141 และ CVW-8 ได้ขึ้นประจำการบนเรือบรรทุกเครื่องบินUSS John F. Kennedy และทำการเยือนดับลิน ประเทศไอร์แลนด์เป็นครั้งแรกของเรือบรรทุกเครื่องบิน ในเดือนเมษายน ปี 1997 ฝูงบินได้ถูกส่งไปประจำการในทะเลเมดิเตอร์เรเนียน/ทะเลเอเดรียติก และอ่าวเปอร์เซีย เพื่อสนับสนุนปฏิบัติการ Deliberate Guardและปฏิบัติการ Southern Watch ตามลำดับ

ในปี 1999 ฝูงบินและ CVW-8 ได้กลับมารวมตัวกับเรือ บรรทุกเครื่องบิน รูสเวลต์อีกครั้ง โดยถูกส่งไปปฏิบัติการรบครั้งใหญ่เหนือเซอร์เบีย มอนเตเนโกร และโคโซโว ในเดือนมีนาคม ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการทิ้งระเบิดยูโกสลาเวียของนาโตในช่วงความขัดแย้งอันดุเดือด 70 วันนั้น ฝูงบินได้สร้างชื่อเสียงโดดเด่นด้วยการไม่สูญเสียเครื่องบินของฝ่ายสัมพันธมิตรแม้แต่ลำเดียวให้กับระบบป้องกันภัยทางอากาศของศัตรูในขณะที่เครื่องบินของฝูงบินปฏิบัติหน้าที่อยู่ หลังจากปฏิบัติการ Allied Force เสร็จสิ้นลง กลุ่มเรือรบ TR ได้แล่นผ่านคลองสุเอซและเริ่มปฏิบัติการรบเพื่อสนับสนุนปฏิบัติการ Southern Watch ในเดือนถัดมา และในที่สุดก็เดินทางกลับบ้านในเดือนกันยายน ปี 1999

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2544 ฝูงบินได้ถูกส่งไปประจำการในฐานะส่วนหนึ่งของกองบินประจำเรือบรรทุกเครื่องบินที่ 8 บนเรือUSS Enterprise พวกเขาเข้าร่วมการฝึกซ้อมในทะเลเมดิเตอร์เรเนียนและทะเลเหนือและมีส่วนร่วมในการบังคับใช้เขตห้ามบินของอิรักในฐานะส่วนหนึ่งของปฏิบัติการ Southern Watch ฝูงบินกำลังเดินทางกลับบ้านเมื่อ เกิด เหตุการณ์โจมตี 11 กันยายนการประจำการของ CVW-8 ถูกขยายออกไปและพวกเขาถูกส่งไปร่วมกับกองกำลังอื่นๆ ของกองทัพเรือสหรัฐฯ ในทะเลอาหรับ ตอนเหนือ หลังจากนั้นไม่นาน VAQ-141 ได้ให้การสนับสนุนการโจมตีทางอิเล็กทรอนิกส์แก่กองกำลังทางอากาศและภาคพื้นดินของพันธมิตรในช่วงเริ่มต้นของการรุกรานอัฟกานิสถานหรือที่รู้จักกันในชื่อ^{ปฏิบัติการ} Enduring Freedom [ ^{3 ]}

ในช่วงปลายเดือนมกราคม ปี 2003 ขณะที่เรือบรรทุกเครื่องบิน USS Theodore Rooseveltเพิ่งเสร็จสิ้นการฝึกซ้อมร่วมกับฝูงบิน VAQ-141 และ CVW-8 บนเรือ ฝูงบิน CVW-8 ก็ได้ถูกส่งไปยังทะเลเมดิเตอร์เรเนียนก่อนกำหนดถึง 5 เดือน เพื่อสนับสนุนฝูงบินVAQ-135และCVW-11 ในเดือนมีนาคม ฝูงบิน VAQ-141 ได้ให้การสนับสนุนเครื่องบินโจมตี โดยเป็นผู้นำในการโจมตีแบกแดดครั้งแรกเพื่อสนับสนุนสงครามอิรัก

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2548 ฝูงบินได้ถูกส่งไปประจำการที่อ่าวเปอร์เซียอีกครั้งพร้อมกับ CVW-8 เพื่อสนับสนุนปฏิบัติการอิรักเสรีขณะที่ยังคงอยู่ในทะเลเมดิเตอร์เรเนียน เครื่องบิน EA-6B จำนวน 2 ลำและหน่วยสนับสนุนจาก VAQ-141 ได้ออกจากเรือบรรทุกเครื่องบิน USS Theodore Rooseveltและบินไปยังฐานทัพอากาศ Al Asadในอิรัก เพื่อเสริมกำลังVMAQ-1เพื่อเติมเต็มช่องว่างที่เกิดจากการที่เรือบรรทุกเครื่องบินลำก่อนหน้าออกจากพื้นที่ปฏิบัติการ ด้วยเหตุนี้ VAQ-141 จึงกลายเป็นฝูงบิน EA-6B ฝูงแรกที่ดำเนินการปฏิบัติการแบบแยกส่วนระหว่างเรือและฝั่งในอิรัก^{[ 4 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2551 ฝูงบิน VAQ-141 ออกเดินทางจากฐานทัพเรือนอร์ฟอล์กบนเรือ USS Theodore Rooseveltมุ่งหน้าลงใต้ไปยังเมืองเคปทาวน์ประเทศแอฟริกาใต้กลายเป็นเรือบรรทุกเครื่องบินพลังงานนิวเคลียร์ลำแรกที่เข้าเทียบท่า เรือได้แล่นอ้อมแหลมกู๊ดโฮปและมุ่งหน้าไปทางเหนือ ตั้งฐานทัพในอ่าวเปอร์เซียตอนเหนือ ปฏิบัติภารกิจสนับสนุนกองกำลังพันธมิตรในอัฟกานิสถาน ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2552 ฝูงบิน VAQ-141 ได้บินออกจากเรือRooseveltและลงจอดที่ฐานทัพเรือ Whidbey Island เป็นครั้งสุดท้ายในฐานะฝูงบิน EA-6B ^{[ 5 ] [ 6 ]}

เมื่อวันที่ 12 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2553 ฝูงบินดังกล่าวได้รับการพิจารณาว่า "ปลอดภัยสำหรับการบิน" ด้วยเครื่องบิน EA-18G Growler ซึ่งกลายเป็นฝูงบินปฏิบัติการที่สองที่เปลี่ยนไปใช้เครื่องบินดังกล่าว^{[ 7 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2554 ฝูงบินได้ถูกส่งไปประจำการที่ตะวันออกกลางบนเรือUSS George HW Bush ฝูงบินได้ดำเนินการปฏิบัติการรบครั้งแรกของ EA-18G จากทางทะเล โดยสนับสนุนทั้งปฏิบัติการ New Dawnและปฏิบัติการ Enduring Freedom ระหว่างการประจำการ ผู้บังคับบัญชาของฝูงบิน นาวาโท Karl Pugh ถูกปลดออกจากตำแหน่งผู้บังคับบัญชาหลังจาก "เหตุการณ์ที่เกี่ยวข้องกับแอลกอฮอล์" ในบาห์เรน^{[ 8 ]}

ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2555 กองทัพเรือประกาศว่า VAQ-141 จะถูกโอนไปยังNAF Atsugiในฤดูใบไม้ผลิ พ.ศ. 2555 เพื่อเข้าร่วมCarrier Air Wing 5และUSS George Washington  / Carrier Strike Group Fiveแทนที่VAQ- 136 ^{[ 9 ]}

ในเดือนพฤศจิกายนปี 2013 เรือรบยูเอสเอสจอร์จ วอชิงตันร่วมกับกองพลนาวิกโยธินที่ 3ให้ความช่วยเหลือรัฐบาลฟิลิปปินส์ในภารกิจบรรเทาภัยพิบัติหลังพายุไต้ฝุ่นไฮยัน /โยลันดาพัดถล่มสาธารณรัฐฟิลิปปินส์

ในปี 2015 กองบิน Carrier Air Wing Five ได้ย้ายไปประจำการบนเรือ^{USS Ronald Reagan [} 10 ] ซึ่ง^{เข้ามา}แทนที่เรือ George Washington ในฐานะเรือบรรทุกเครื่องบินที่ประจำการล่วงหน้าและมีฐานทัพอยู่ที่โยโกสุกะ เมื่อเรือบรรทุกเครื่องบินจอดเทียบท่า ฝูงบินจะประจำการอยู่ที่ฐานทัพอากาศนาวิกโยธินอัตสึกิในจังหวัดคานากาวะ ที่อยู่ใกล้เคียง ต่อมาได้ย้ายไปที่ฐานทัพอากาศนาวิกโยธินอิวาคุนิในจังหวัดยามากุจิทางตะวันตกของญี่ปุ่นในวันที่ 28 พฤศจิกายน หลังจากสิ้นสุดการลาดตระเวนฤดูใบไม้ร่วงของเรือ USS Ronald Reaganในปี 2017 ^{[ 11 ]}

ปัจจุบัน VAQ-141 เป็นฝูงบินโจมตีทางอิเล็กทรอนิกส์ที่ใหญ่ที่สุดและประจำการถาวรเพียงแห่งเดียวในกองทัพเรือสหรัฐฯ