วิกิพีเดียภาษาไทย
กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 14 นาที

XIST

Xist (X-inactive specific transcript) เป็นRNA ที่ไม่มีรหัสซึ่งถอดรหัสจากโครโมโซม Xของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีรกซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้นหลักของกระบวนการปิดใช้งานโครโมโซม X...

XIST

XIST
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นXIST , DXS1089, DXS399E, LINC00001, NCRNA00001, SXI1, swd66, X inactive specific transcript (non-protein coding), X inactive specific transcript, Xist
รหัสภายนอกโอมิม : 314670 ; เอ็มจีไอ : 98974 ; GeneCards : XIST ; OMA : XIST - ออโธโลจี
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ

7503

213742

วงดนตรี

ENSG00000229807

ENSMUSG00000086503

ยูนิโปรท

นาอา

ไม่มีข้อมูล

RefSeq (mRNA)

ไม่มีข้อมูล

ไม่มีข้อมูล

RefSeq (โปรตีน)

ไม่มีข้อมูล

ไม่มีข้อมูล

สถานที่ตั้ง (UCSC)โครโมโซม X: 73.82 – 73.85 เมกะไบต์โครโมโซม X: 102.5 – 102.53 เมกะไบต์
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์

Xist (X-inactive specific transcript) เป็นRNA ที่ไม่มีรหัสซึ่งถอดรหัสจากโครโมโซม Xของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีรกซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้นหลักของกระบวนการปิดใช้งานโครโมโซม X [ 5 ]มันเป็นส่วนประกอบของXic – ศูนย์ปิดใช้งานโครโมโซม X [ 6 ] – พร้อมกับยีน RNA อีก 2 ยีน ( JpxและFtx ) และยีนโปรตีน อีก 2 ยีน ( TsxและCnbp2 ) [ 7 ]

RNA ของ Xist ซึ่งเป็นทรานสคริปต์ขนาดใหญ่ (17 kb ในมนุษย์) [ 8 ]จะถูกแสดงออกบนโครโมโซมที่ไม่ทำงาน ไม่ใช่บนโครโมโซมที่ทำงาน มันถูกประมวลผลในลักษณะเดียวกับmRNAผ่านการตัดต่อและการเติมโพลีอะดีนีนอย่างไรก็ตาม มันยังคงไม่ถูกแปลเป็นโปรตีนมีการเสนอแนะว่ายีน RNA นี้วิวัฒนาการมาจากยีนที่เข้ารหัสโปรตีนอย่างน้อยบางส่วน ซึ่งกลายเป็นยีนเทียม[ 9 ] โครโมโซม X ที่ไม่ทำงานจะถูกเคลือบด้วยทรานสคริปต์นี้ ซึ่งจำเป็นต่อการไม่ทำงาน[ 10 ]โครโมโซม X ที่ขาด Xist จะไม่ถูกทำให้ไม่ทำงาน ในขณะที่การจำลองยีน Xist บนโครโมโซมอื่นจะทำให้โครโมโซมนั้นไม่ทำงาน[ 11 ]

ยีน Xist ของมนุษย์ถูกค้นพบโดยAndrea Ballabioผ่านการคัดกรองไลบรารี cDNA จากนั้นจึงทำการศึกษาลักษณะเฉพาะร่วมกับCarolyn J. BrownและHunt Willard [ 12 ] [ 13 ]

การทำงาน

การปิดใช้งานโครโมโซม Xเป็น กระบวนการ พัฒนาการ ในช่วงต้นในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมเพศเมีย ซึ่งจะปิดการทำงานของการถอดรหัสของ โครโมโซม Xคู่หนึ่งทำให้เกิดความเท่าเทียมกันของปริมาณยีนระหว่างเพศผู้และเพศเมีย (ดูการชดเชยปริมาณยีน ) กระบวนการนี้ถูกควบคุมโดยปัจจัยหลายอย่าง รวมถึงบริเวณของโครโมโซม X ที่เรียกว่าศูนย์ปิดใช้งานโครโมโซม X (XIC) ยีน XIST จะถูกแสดงออกเฉพาะจาก XIC ของโครโมโซม X ที่ไม่ทำงานเท่านั้น ทรานสคริปต์จะถูกตัดต่อแต่เห็นได้ชัดว่าไม่ได้เข้ารหัสโปรตีนทรานสคริปต์ยังคงอยู่ในนิวเคลียสซึ่งจะเคลือบโครโมโซม X ที่ไม่ทำงาน มีการระบุทรานสคริปต์ที่มีการตัดต่อแบบอื่นแล้ว แต่ยังไม่ได้กำหนดลำดับความยาวเต็มของพวกมัน[ 5 ]

บทบาทเชิงหน้าที่ของทรานสคริปต์ Xist ได้รับการพิสูจน์อย่างชัดเจนในเซลล์ ES เพศเมียของหนูโดยใช้เทคโนโลยีแอนติเซนส์แบบใหม่ที่เรียกว่า การทำแผนที่การรบกวนของ กรดนิวคลีอิกเปปไทด์ (PNA) ในการทดลองที่รายงาน แอนติเซนส์ PNA ที่สามารถแทรกซึมผ่านเซลล์ได้ขนาด 19 bp เพียงตัวเดียวซึ่งกำหนดเป้าหมายไปยังบริเวณเฉพาะของ RNA Xist สามารถป้องกันการก่อตัวของ Xi และยับยั้งการปิดกั้นแบบซิสของยีนที่เชื่อมโยงกับ X การเชื่อมโยงของ Xi กับมาโครฮิสโตน H2A ก็ถูกรบกวนโดยการทำแผนที่การรบกวนของ PNA เช่นกัน[ 14 ]กระบวนการปิดใช้งาน X เกิดขึ้นในหนูแม้ในกรณีที่ไม่มียีนนี้ผ่านการควบคุมทางเอพิเจเนติกส์แต่ Xist จำเป็นต่อการทำให้การปิดกั้นนี้มีเสถียรภาพ[ 15 ]

นอกจากจะพบการแสดงออกในเพศหญิงเกือบทั้งหมดแล้ว XIST ยังแสดงออกในบริบทการพัฒนาที่จำกัดในเพศชาย รวมถึงตัวอ่อนก่อนการฝังตัวของมนุษย์ เซลล์สืบพันธุ์ดั้งเดิม เนื้องอก เซลล์สืบพันธุ์ ในอัณฑะ และมะเร็งในเพศชายบางกลุ่มที่มีสายพันธุ์หลากหลาย[ 16 ]อาจเกี่ยวข้องกับการชดเชยปริมาณของโครโมโซม X ที่เกินมาในสองกรณีหลังนี้

ตำแหน่งของยีน

ยีน Xist RNA ของมนุษย์ตั้งอยู่บนแขนยาว (q) ของโครโมโซม X ยีน Xist RNA มีส่วนที่ซ้ำกันที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ภายในโครงสร้างผลิตภัณฑ์ของยีนส่วนใหญ่จะอยู่ในนิวเคลียส[ 8 ]ยีน Xist RNA มีบริเวณ A ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ ซึ่งประกอบด้วยส่วนที่ซ้ำกัน 8 ส่วนคั่นด้วยตัวเว้นวรรคที่อุดมไปด้วย U บริเวณ A ดูเหมือนจะเข้ารหัสโครงสร้าง RNA แบบก้านและห่วงยาวสองโครงสร้าง ซึ่งแต่ละโครงสร้างมีส่วนที่ซ้ำกันสี่ส่วน[ 17 ]มีการระบุออร์โธล็อกของยีน Xist RNA ในมนุษย์ในหนู[ 18 ] [ 19 ]ออร์โธล็อกนี้เข้ารหัสทรานสคริปต์ Xist ขนาด 15 kb ซึ่งอยู่ในนิวเคลียสเช่นกัน อย่างไรก็ตาม ออร์โธล็อกนี้ไม่มีส่วนที่ซ้ำกันที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้[ 20 ]ยีน Xist RNA ตั้งอยู่ภายในศูนย์การปิดใช้งาน Xist (XIC) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการปิดใช้งาน X [ 21 ]

การจัดระเบียบเอกสารถอดเสียง

ภูมิภาค

แบบจำลองโครงสร้างของบริเวณซ้ำ A (repA) ของ Xist สร้างขึ้นจากการตรวจสอบโครงสร้างทางชีวเคมีในร่างกายและการวิเคราะห์ลำดับเปรียบเทียบ บริเวณซ้ำ 1 ถึง 8(1/2) มีหมายเลขกำกับและอยู่ในกรอบ – แสดงเป็นสีแดงในภาพการ์ตูนของ repA ในแผงด้านบนซ้าย นิวคลีโอไทด์ที่เกิดปฏิกิริยามีสีแดง โดยวงกลมเปิดและวงกลมปิดแสดงถึงปฏิกิริยาปานกลางและรุนแรงตามลำดับ (ปฏิกิริยาบ่งชี้ว่านิวคลีโอไทด์นั้นไม่ได้จับคู่หรือมีโครงสร้างหลวม) การกลายพันธุ์ที่สอดคล้องกันและการกลายพันธุ์ชดเชย (การกลายพันธุ์แบบจุดเดียวและสองจุดที่รักษาการจับคู่) ถูกระบุด้วยสีน้ำเงินและสีม่วงตามลำดับ คู่เบสที่อนุรักษ์ไว้ 100% ในสัตว์ฟันแทะเป็นตัวหนาและสีดำ ในขณะที่คู่เบสที่อนุรักษ์ไว้ในสัตว์ฟันแทะและสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมเป็นสีเขียว ข้อมูลและแบบจำลองนำมาจากFang R, Moss WN, Rutenberg-Schoenberg M, Simon MD (ธันวาคม 2015) "การตรวจสอบโครงสร้าง RNA ของ Xist ในเซลล์โดยใช้ Structure-Seq ที่กำหนดเป้าหมาย" . PLoS Genetics . 11 (12) e1005668. doi : 10.1371/journal.pgen.1005668 . PMC  4672913 . PMID  26646615 ..

RNA ของ Xist มีบริเวณที่มีการอนุรักษ์ที่เรียกว่าบริเวณซ้ำ A (repA) ซึ่งประกอบด้วยองค์ประกอบที่ซ้ำกันได้มากถึงเก้าองค์ประกอบ[ 17 ]ในตอนแรกมีการเสนอว่าการซ้ำของ repA สามารถพับกลับเข้าหากันเพื่อสร้าง โครงสร้าง ก้านห่วง ภายในซ้ำได้ ต่อมางานวิจัยที่ใช้ การตรวจสอบโครงสร้างทางชีวเคมี ในหลอดทดลอง ได้เสนอ โครงสร้างก้านห่วงระหว่างซ้ำหลายแบบ[ 8 ] [ 17 ]การศึกษาล่าสุดที่ใช้ การตรวจสอบทางชีวเคมี ในร่างกายและการวิเคราะห์ลำดับเปรียบเทียบได้เสนอการแก้ไขแบบจำลองโครงสร้าง repA ซึ่งรวมถึงการพับภายในซ้ำและระหว่างซ้ำที่พบในแบบจำลองก่อนหน้านี้ ตลอดจนคุณลักษณะใหม่ๆ (ดูรูป) นอกจากจะสอดคล้องกับข้อมูลในร่างกายแล้ว แบบจำลองที่แก้ไขนี้ยังได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างสูงในสัตว์ฟันแทะและสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (รวมถึงมนุษย์) ซึ่งบ่งชี้ถึงความสำคัญเชิงหน้าที่ของโครงสร้าง repA แม้ว่าหน้าที่ที่แน่นอนของบริเวณ repA จะไม่แน่นอน แต่ก็แสดงให้เห็นว่าจำเป็นต้องใช้บริเวณทั้งหมดเพื่อการจับกับโปรตีน Suz12 อย่างมีประสิทธิภาพ[ 17 ]

ภูมิภาคซี

RNA ของ Xist จับกับโครโมโซม X ที่ไม่ทำงานโดยตรงผ่านบริเวณการจับโครมาตินของ RNA ที่ถอดรหัส บริเวณการจับโครมาตินของ Xist ได้รับการอธิบายครั้งแรกในเซลล์ไฟโบรบลาสต์ของหนูตัวเมีย บริเวณการจับโครมาตินหลักแสดงให้เห็นว่าอยู่ในบริเวณ C-repeat บริเวณการจับโครมาตินได้รับการทำแผนที่การทำงานและประเมินโดยใช้วิธีการศึกษาการทำงานของ RNA ที่ไม่เข้ารหัสในเซลล์ที่มีชีวิตที่เรียกว่าการทำแผนที่การรบกวนของกรดนิวคลีอิกเปปไทด์ (PNA) ในการทดลองที่รายงาน PNA แอนติเซนส์ 19 bp ที่สามารถซึมผ่านเซลล์ได้ซึ่งกำหนดเป้าหมายไปยังบริเวณเฉพาะของ RNA ของ Xist ทำให้เกิดการหยุดชะงักของ Xi การเชื่อมโยงของ Xi กับมาโครฮิสโตน H2A ก็ถูกรบกวนโดยการทำแผนที่การรบกวนของ PNA เช่นกัน[ 14 ]

ศูนย์ปิดใช้งานโครโมโซม X (XIC)

ยีน RNA Xist อยู่ภายในศูนย์การปิดใช้งาน X (XIC) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการแสดงออกของ Xist และการปิดใช้งาน X [ 22 ] XIC ตั้งอยู่บนแขน q ของโครโมโซม X (Xq13) XIC ควบคุม Xist ในการปิดใช้งาน X แบบ cis โดยที่ Tsix ซึ่งเป็นแอนติเซนส์ของ Xist จะลดการแสดงออกของ Xist โปรโมเตอร์ Xist ของ XIC เป็นตัวควบคุมหลักของการปิดใช้งาน X [ 21 ]การปิดใช้งาน X มีบทบาทสำคัญในการชดเชยปริมาณ

ทรานสคริปต์แอนติเซนส์ Tsix

ยีน แอนติเซนส์ Tsixเป็นทรานสคริปต์ของยีน Xist ที่ศูนย์ XIC [ 23 ]ทรานสคริปต์แอนติเซนส์ Tsix ทำหน้าที่แบบซิสเพื่อยับยั้งการถอดรหัสของ Xist ซึ่งควบคุมการแสดงออกของมันในเชิงลบ กลไกเบื้องหลังที่ Tsix ปรับเปลี่ยนกิจกรรมของ Xist ในแบบซิสยังไม่เป็นที่เข้าใจอย่างถ่องแท้ อย่างไรก็ตาม มีทฤษฎีเกี่ยวกับกลไกนี้อยู่บ้าง ทฤษฎีหนึ่งคือ Tsix มีส่วนเกี่ยวข้องกับ การดัดแปลง โครมาตินที่ตำแหน่ง Xist และอีกทฤษฎีหนึ่งคือปัจจัยการถอดรหัสของเซลล์ที่มีศักยภาพหลายอย่างมีบทบาทในการยับยั้ง Xist [ 24 ]

การควบคุมผู้ส่งเสริมลัทธิซิสต์

เมทิลเลชัน

เชื่อกันว่าแอนติเซนส์ Tsix จะกระตุ้น DNA เมทิลทรานสเฟอเรสที่ทำการเมทิลเลชันโปรโมเตอร์ Xist ซึ่งส่งผลให้โปรโมเตอร์ Xist ถูกยับยั้งและทำให้การแสดงออกของยีน Xist ถูกยับยั้ง[ 25 ]ในทางตรงกันข้ามกับการทำงานของ Tsix ซึ่งเป็นตัวยับยั้ง Xist การเมทิลเลชันของฮิสโตน 3 ไลซีน 4 (H3K4) จะเพิ่มการควบคุมการถอดรหัสโดยการเปิดโครงสร้างโครมาติน โครมาตินที่เปิดออกทำให้สามารถดึงดูดปัจจัยการถอดรหัสได้ และทำให้การถอดรหัสเกิดขึ้นได้[ 26 ]

dsRNA และ RNAi

นอกจากนี้ ยังมีการเสนอเส้นทาง dsRNA และRNAiให้มีบทบาทในการควบคุมโปรโมเตอร์ Xist ด้วยDicer เป็นเอนไซม์ RNAi และเชื่อกันว่าจะตัดคู่ของ Xist และ Tsix ในช่วงเริ่มต้นของการปิดใช้งาน X ให้เป็น RNA ขนาดเล็กประมาณ 30 นิวคลีโอไทด์ ซึ่งเรียกว่า xiRNAs เชื่อกันว่า xiRNAs เหล่านี้มีส่วนเกี่ยวข้องในการยับยั้ง Xist บนโครโมโซม X ที่อาจทำงานอยู่ โดยอิงจากการศึกษา มีการศึกษาหนึ่งที่ลดระดับ Dicer ภายในเซลล์ปกติลงเหลือ 5% ซึ่งนำไปสู่การเพิ่มขึ้นของการแสดงออกของ Xist ในเซลล์ที่ยังไม่แตกต่างกัน ดังนั้นจึงสนับสนุนบทบาทของ xiRNAs ในการยับยั้ง Xist [ 27 ]บทบาทและกลไกของ xiRNAs ยังคงอยู่ระหว่างการตรวจสอบและถกเถียงกัน

กลไกอิสระหกอย่าง

ปัจจัยการถอดรหัสของเซลล์ที่มีศักยภาพหลายอย่าง

เซลล์ต้นกำเนิดที่มีศักยภาพหลายอย่างแสดงออกถึงปัจจัยการถอดรหัสNanog , Oct4และSox2ซึ่งดูเหมือนจะมีบทบาทในการยับยั้ง Xist ในกรณีที่ไม่มี Tsix ในเซลล์ที่มีศักยภาพหลายอย่าง Xist จะถูกยับยั้ง โดยมีกลไกที่เสนอว่าปัจจัยการถอดรหัสเหล่านี้ทำให้เกิดการตัดต่อที่อินทรอน 1 ที่ตำแหน่งการจับของปัจจัยเหล่านี้บนยีน Xist ซึ่งยับยั้งการแสดงออกของ Xist [ 24 ]มีการศึกษาที่ทำการลดปริมาณปัจจัยการถอดรหัส Nanog หรือ Oct4 ในเซลล์ที่มีศักยภาพหลายอย่าง ซึ่งส่งผลให้มีการเพิ่มการแสดงออกของ Xist จากการศึกษานี้ จึงเสนอว่า Nanog และ Oct4 มีส่วนเกี่ยวข้องในการยับยั้งการแสดงออกของ Xist [ 28 ]

คอมเพล็กซ์ยับยั้งโพลีคอมบ์

คอมเพล็กซ์ยับยั้งโพลีคอมบ์ 2 ( PRC2 ) ประกอบด้วยโปรตีนกลุ่มโพลีคอมบ์ที่เกี่ยวข้องกับการเร่งปฏิกิริยาการเติมหมู่เมทิลสามหมู่ให้กับฮิสโตน H3บนไลซีน 27 (K27) ซึ่งส่งผลให้เกิดการยับยั้งโครมาติน และนำไปสู่การปิดกั้นการถอดรหัส RNA Xist จะดึงดูดคอมเพล็กซ์โพลีคอมบ์ไปยังโครโมโซม X ที่ไม่ทำงานเมื่อเริ่ม XCI [ 29 ] SUZ12เป็นส่วนประกอบของ PRC2 และมี โดเมน นิ้วสังกะสีเชื่อกันว่าโดเมนนิ้วสังกะสีจะจับกับโมเลกุล RNA [ 30 ]พบว่า PRC2 ยับยั้งการแสดงออกของ Xist โดยไม่ขึ้นอยู่กับทรานสคริปต์แอนติเซนส์ Tsix แม้ว่ากลไกที่แน่นอนยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด

การชดเชยปริมาณยา

การปิดใช้งานโครโมโซม X มีบทบาทสำคัญใน กลไก การชดเชยปริมาณยีนที่ช่วยให้โครโมโซม X และโครโมโซมร่างกายแสดงออกอย่างเท่าเทียมกัน[ 31 ]สิ่งมีชีวิตต่างชนิดกันมีวิธีการชดเชยปริมาณยีนที่แตกต่างกัน โดยทุกวิธีเกี่ยวข้องกับการควบคุมโครโมโซม X จากเพศใดเพศหนึ่ง[ 31 ]บางวิธีที่เกี่ยวข้องกับการชดเชยปริมาณยีนเพื่อปิดใช้งานโครโมโซม X ตัวใดตัวหนึ่งจากเพศใดเพศหนึ่ง ได้แก่ ยีนแอนติเซนส์ Tsix, การเมทิลเลชั่นของ DNA และการอะเซทิเลชั่นของ DNA [ 32 ]อย่างไรก็ตาม กลไกที่แน่ชัดของการปิดใช้งานโครโมโซม X ยังไม่เป็นที่เข้าใจอย่างถ่องแท้ หากโครโมโซม X ตัวใดตัวหนึ่งไม่ถูกปิดใช้งานหรือแสดงออกเพียงบางส่วน อาจนำไปสู่การแสดงออกของโครโมโซม X มากเกินไป และอาจเป็นอันตรายถึงชีวิตในบางกรณี

กลุ่มอาการเทอร์เนอร์เป็นตัวอย่างหนึ่งของการชดเชยปริมาณที่ไม่แสดงโครโมโซม X อย่างเท่าเทียมกัน และในเพศหญิง โครโมโซม X ตัวหนึ่งหายไปหรือมีความผิดปกติ ซึ่งนำไปสู่ความผิดปกติทางกายภาพและการทำงานของต่อมเพศในเพศหญิงเนื่องจากโครโมโซม X ที่หายไปหรือผิดปกติหนึ่งตัว กลุ่มอาการเทอร์เนอร์ยังถูกเรียกว่าภาวะโมโนโซมี X อีกด้วย[ 33 ]

วงจรการปิดใช้งาน X

การแสดงออกของยีน Xist และการปิดใช้งานโครโมโซม X เปลี่ยนแปลงไปตลอดการพัฒนาของตัวอ่อน ในช่วงต้นของการเกิดตัวอ่อนเซลล์ไข่และเซลล์อสุจิจะไม่แสดงออกยีน Xist และโครโมโซม X ยังคงทำงานอยู่ หลังจากปฏิสนธิ เมื่อเซลล์อยู่ในระยะ 2-4 เซลล์ ยีน Xist จะถูกแสดงออกโดยโครโมโซม X จากพ่อ (Xp) ในทุกเซลล์ ทำให้โครโมโซม X นั้นถูกประทับตราและปิดใช้งาน เซลล์บางส่วนพัฒนาไปเป็นเซลล์ที่มีศักยภาพหลายอย่าง (มวลเซลล์ภายใน) เมื่อเกิดบลาสโตซิสต์ ในบริเวณนั้น การประทับตราจะถูกลบออก นำไปสู่การลดการแสดงออกของยีน Xist และทำให้โครโมโซม X ที่ปิดใช้งานกลับมาทำงานอีกครั้งข้อมูลล่าสุดชี้ให้เห็นว่ากิจกรรมของยีน Xist ถูกควบคุมโดยสารถอดรหัสแบบแอนติเซนส์[ 34 ] จากนั้น เซลล์เอพิบลาสต์จะถูกสร้างขึ้นและเริ่มมีการแยกแยะ และ Xist จะถูกควบคุมขึ้นจากโครโมโซม X ทั้งสองตัวและแบบสุ่มในICMแต่ Xist จะคงอยู่ในเอพิบลาสต์ โครโมโซม X จะถูกปิดใช้งานและอัลลีล Xist จะถูกปิดในโครโมโซม X ที่ทำงานอยู่ ในเซลล์สืบพันธุ์ดั้งเดิม XX ที่เจริญเติบโต Xist จะถูกควบคุมลงและการเปิดใช้งาน X จะเกิดขึ้นอีกครั้ง[ 35 ]

การเชื่อมโยงโรค

การกลายพันธุ์ในโปรโมเตอร์ XIST ทำให้เกิด การปิดใช้ งานX ที่ไม่สมดุล ในครอบครัว [ 5 ]

ปฏิสัมพันธ์

XIST ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับBRCA1 [ 36 ] [ 37 ]

ดูเพิ่มเติม

อ่านเพิ่มเติม

  • Brown CJ, Ballabio A, Rupert JL, Lafreniere RG, Grompe M, Tonlorenzi R และคณะ (มกราคม 1991). "ยีนจากบริเวณศูนย์กลางการปิดใช้งานโครโมโซม X ของมนุษย์แสดงออกเฉพาะจากโครโมโซม X ที่ไม่ทำงาน" Nature . 349 (6304): 38– 44. Bibcode : 1991Natur.349...38B . doi : 10.1038/349038a0 . PMID  1985261 . S2CID  4332325 .
  • Brown CJ, Lafreniere RG, Powers VE, Sebastio G, Ballabio A, Pettigrew AL และคณะ (มกราคม 1991). "การระบุตำแหน่งของศูนย์การปิดใช้งาน X บนโครโมโซม X ของมนุษย์ใน Xq13" Nature . 349 (6304): 82– 84. Bibcode : 1991Natur.349...82B . doi : 10.1038/349082a0 . PMID  1985270 . S2CID  4360783 .
  • Clemson CM, McNeil JA, Willard HF, Lawrence JB (กุมภาพันธ์ 1996). "XIST RNA ระบายสีโครโมโซม X ที่ไม่ทำงานในระยะอินเตอร์เฟส: หลักฐานสำหรับ RNA ใหม่ที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างนิวเคลียส/โครโมโซม"วารสารชีววิทยาของเซลล์ 132 ( 3): 259– 275. doi : 10.1083/jcb.132.3.259 . PMC  2120729 . PMID  8636206 .
  • Hendrich BD, Plenge RM, Willard HF (กรกฎาคม 1997). "การระบุและลักษณะเฉพาะของโปรโมเตอร์ยีน XIST ของมนุษย์: นัยสำคัญสำหรับแบบจำลองการปิดใช้งานโครโมโซม X" . Nucleic Acids Research . 25 (13): 2661– 2671. doi : 10.1093/nar/25.13.2661 . PMC  146792 . PMID  9185579 .
  • Plenge RM, Hendrich BD, Schwartz C, Arena JF, Naumova A, Sapienza C และคณะ (พฤศจิกายน 1997). "การกลายพันธุ์ของโปรโมเตอร์ในยีน XIST ในสองครอบครัวที่ไม่เกี่ยวข้องกันซึ่งมีการปิดใช้งานโครโมโซม X ที่ไม่สมดุล" Nature Genetics . 17 (3): 353– 356. doi : 10.1038/ng1197-353 . PMID  9354806 . S2CID  23338176 .
  • Hong YK, Ontiveros SD, Strauss WM (มีนาคม 2000). "การแก้ไขโครงสร้างยีน XIST ของมนุษย์และการเปรียบเทียบโครงสร้างกับ Xist ของหนู" Mammalian Genome . 11 (3): 220– 224. doi : 10.1007/s003350010040 . PMID  10723727 . S2CID  21921352 .
  • Hall LL, Byron M, Sakai K, Carrel L, Willard HF, Lawrence JB (มิถุนายน 2545). "ยีน XIST ของมนุษย์ที่อยู่ผิดที่สามารถชักนำให้เกิดการปิดใช้งานโครโมโซมในเซลล์ HT-1080 ของมนุษย์หลังการเปลี่ยนแปลงสภาพ" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 ( 13): 8677– 8682. Bibcode : 2002PNAS...99.8677H . doi : 10.1073/pnas.132468999 . PMC  124357. PMID  12072569 .
  • Ganesan S, Silver DP, Greenberg RA, Avni D, Drapkin R, Miron A และคณะ (พฤศจิกายน 2545) "BRCA1 สนับสนุนความเข้มข้นของ RNA XIST บนโครโมโซม X ที่ไม่ทำงาน" . Cell . 111 (3): 393– 405. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01052-8 . PMID  12419249 . S2CID  372211 .
  • คาวาคามิ ที, โอคาโมโตะ เค, ซูกิฮาระ เอช, ฮัตโตริ ที, รีฟ AE, โอกาวะ โอ และคณะ (เมษายน 2546). "บทบาทของโครโมโซม X เหนือตัวเลขและการแสดงออกของ XIST ในเนื้องอกเซลล์สืบพันธุ์อัณฑะ" วารสารระบบทางเดินปัสสาวะ . 169 (4): 1546– 1552 ดอย : 10.1097 / 01.ju.0000044927.23323.5a PMID12629412  .​
  • Pugacheva EM, Tiwari VK, Abdullaev Z, Vostrov AA, Flanagan PT, Quitschke WW และคณะ (เมษายน 2548) "กรณีการกลายพันธุ์แบบจุดในโปรโมเตอร์ XIST ในครอบครัวเผยให้เห็นความสัมพันธ์ระหว่างการจับของ CTCF และการเลือกการปิดใช้งานโครโมโซม X ก่อนกำหนด"พันธุศาสตร์โมเลกุลของมนุษย์14 (7): 953– 965. doi : 10.1093/hmg/ddi089 . PMID  15731119 .
  • Vasques LR, Stabellini R, Xue F, Tian XC, Soukoyan M, Pereira LV (2007). "การยับยั้ง XIST ในกรณีที่ไม่มี DNMT1 และ DNMT3B" . DNA Research . 12 (5): 373– 378. doi : 10.1093/dnares/dsi013 . PMID  16769694 .
  • Cohen HR, Panning B (สิงหาคม 2550). "XIST RNA แสดงการกักเก็บในนิวเคลียสและแสดงการเชื่อมโยงที่ลดลงกับปัจจัยการส่งออก TAP/NXF1" Chromosoma . 116 (4): 373– 383. doi : 10.1007/s00412-007-0100-1 . PMID  17333237 . S2CID  7947134 .
  • Chow JC, Hall LL, Baldry SE, Thorogood NP, Lawrence JB, Brown CJ (มิถุนายน 2550). "การปิดใช้งานโครโมโซม X ที่เหนี่ยวนำได้โดยขึ้นอยู่กับ XIST ในเซลล์โซมาติกของมนุษย์สามารถย้อนกลับได้" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 104 (24): 10104– 10109. Bibcode : 2007PNAS..10410104C . doi : 10.1073/ pnas.0610946104 . PMC  1891207. PMID  17537922 .
  • Vincent-Salomon A, Ganem-Elbaz C, Manié E, Raynal V, Sastre-Garau X, Stoppa-Lyonnet D และคณะ (มิถุนายน 2550) "การเคลือบ RNA ทรานสคริปต์เฉพาะที่ไม่ทำงานของ X และความไม่เสถียรทางพันธุกรรมของโครโมโซม X ในเนื้องอกเต้านม BRCA1" Cancer Research . 67 (11): 5134– 5140. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-0465 . PMID  17545591 .
  • Plath K, Mlynarczyk-Evans S, Nusinow DA, Panning B (2002). "Xist RNA และกลไกการปิดใช้งานโครโมโซม X" Annual Review of Genetics . 36 : 233– 278. doi : 10.1146/annurev.genet.36.042902.092433 . PMID  12429693 .
  • Brockdorff N (กรกฎาคม 2545). "การปิดใช้งานโครโมโซม X: เข้าใกล้โปรตีนที่จับกับ Xist RNA". Trends in Genetics . 18 (7): 352– 358. doi : 10.1016/S0168-9525(02)02717-8 . PMID  12127775 .
  • Panning B, Dausman J, Jaenisch R (กันยายน 1997). "การปิดใช้งานโครโมโซม X เกิดขึ้นโดยการทำให้ RNA Xist มีเสถียรภาพ" . Cell . 90 (5): 907– 916. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80355-4 . PMID  9298902 . S2CID  17987743 .
  • Chaumeil J, Le Baccon P, Wutz A, Heard E (สิงหาคม 2549). "บทบาทใหม่ของ Xist RNA ในการสร้างช่องนิวเคลียร์ที่กดข่มซึ่งยีนจะถูกดึงเข้ามาเมื่อถูกปิดการทำงาน" Genes & Development . 20 (16): 2223– 2237. doi : 10.1101/gad.380906 . PMC  1553206 . PMID  16912274 .
  • Brockdorff N, Ashworth A, Kay GF, Cooper P, Smith S, McCabe VM และคณะ (พฤษภาคม 1991). "การอนุรักษ์ตำแหน่งและการแสดงออกเฉพาะของยีน Xist ในหนูจากโครโมโซม X ที่ไม่ทำงาน" Nature . 351 (6324): 329– 331. Bibcode : 1991Natur.351..329B . doi : 10.1038/351329a0 . PMID  2034279 . S2CID  4342551 .
  • Sado T, Brockdorff N (มกราคม 2013). "ความก้าวหน้าในการทำความเข้าใจการปิดการทำงานของโครโมโซมโดย RNA ที่ไม่เข้ารหัสแบบยาว Xist" . Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences . 368 (1609) 20110325. doi : 10.1098/rstb.2011.0325 . PMC  3539355 . PMID  23166390 .
  • Pennisi E (พฤษภาคม 2013). "RNA ที่ไม่เข้ารหัสแบบยาวอาจเปลี่ยนแปลงโครงสร้างสามมิติของโครโมโซม" Science . 340 (6135): 910. Bibcode : 2013Sci...340Q.910P . doi : 10.1126/science.340.6135.910-a . PMID  23704542 .
  • รายการ NCBI Xist
  • ข้อมูล lncRNAdb Xist ถูกเก็บถาวรเมื่อวันที่ 22 ธันวาคม 2015 ที่Wayback Machine
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=XIST&oldid=1353428444 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ XIST

Xist (X-inactive specific transcript) เป็นRNA ที่ไม่มีรหัสซึ่งถอดรหัสจากโครโมโซม Xของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีรกซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้นหลักของกระบวนการปิดใช้งานโครโมโซม X...

การทำงาน

การปิดใช้งานโครโมโซม X เป็น กระบวนการ พัฒนาการ ในช่วงต้นในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมเพศเมีย ซึ่งจะปิดการทำงานของการถอดรหัสของ โครโมโซม X คู่หนึ่งทำให้เกิดความเท่าเทียมกันของปริมาณยีนระหว่างเพศผู้และเพศเมีย (ดู การชดเชยปริมาณยีน )...

ตำแหน่งของยีน

ยีน Xist RNA ของมนุษย์ตั้งอยู่บนแขนยาว (q) ของโครโมโซม X ยีน Xist RNA มีส่วนที่ซ้ำกันที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ภายในโครงสร้าง ผลิตภัณฑ์ของยีน ส่วนใหญ่จะอยู่ในนิวเคลียส [ 8 ] ยีน Xist RNA มีบริเวณ A ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ ซึ่งประกอบด้วยส่วนที่ซ้ำกัน 8...

ภูมิภาค

RNA ของ Xist มีบริเวณที่มีการอนุรักษ์ที่เรียกว่าบริเวณซ้ำ A (repA) ซึ่งประกอบด้วยองค์ประกอบที่ซ้ำกันได้มากถึงเก้าองค์ประกอบ [ 17 ] ในตอนแรกมีการเสนอว่าการซ้ำของ repA สามารถพับกลับเข้าหากันเพื่อสร้าง โครงสร้าง ก้านห่วง ภายในซ้ำได้ ต่อมางานวิจัยที่ใช้...