อ่าน 9 นาที
เอ็กซ์พีบี
XPB ( xeroderma pigmentosum type B) เป็นเอนไซม์ DNA helicase ที่ต้องพึ่งพา ATP ในมนุษย์ ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม ปัจจัยการถอดรหัส TFIIH
เอ็กซ์พีบี
| ERCC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | ERCC3 , กลุ่มการซ่อมแซมการตัดออกที่เสริมกัน 3, BTF2, GTF2H, RAD25, TFIIH, XPB, TTD2, การซ่อมแซมการตัดออก ERCC 3, หน่วยย่อยเฮลิเคสของคอมเพล็กซ์หลักของ TFIIH, Ssl2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 133510 ; เอ็มจีไอ : 95414 ; โฮโมโลยีน : 96 ; GeneCards : ERCC3 ; OMA : ERCC3 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
XPB ( xeroderma pigmentosum type B) เป็นเอนไซม์DNA helicaseที่ต้องพึ่งพาATPในมนุษย์ ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม ปัจจัยการถอดรหัสTFIIH
โครงสร้าง
โครงสร้างสามมิติของโฮโมล็อกอาร์เคียของ XPB ได้รับการแก้ไขโดยการวิเคราะห์ผลึกด้วยรังสีเอกซ์โดย ดร. จอห์น ไทเนอร์ และกลุ่มของเขาที่สถาบันวิจัยสคริปส์[ 5 ]
การทำงาน
XPB มีบทบาทสำคัญในการถอดรหัสพื้นฐานตามปกติการซ่อมแซมที่เชื่อมโยงกับการถอดรหัส (TCR) และการซ่อมแซมโดยการตัดนิวคลีโอไทด์ (NER) มีการแสดงให้เห็นว่า XPB ที่บริสุทธิ์สามารถคลายเกลียว DNA ด้วยขั้ว 3'-5' ได้
หน้าที่ของโปรตีน XPB(ERCC3) ใน NER คือการช่วยคลายเกลียว คู่ DNAหลังจากตรวจพบความเสียหายในเบื้องต้น NER เป็นกระบวนการหลายขั้นตอนที่กำจัดความเสียหายของ DNA ที่หลากหลายซึ่งทำให้การจับคู่เบสปกติผิดเพี้ยนไป ความเสียหายดังกล่าวรวมถึงสารประกอบทางเคมีขนาดใหญ่ ไดเมอร์ไพริมิดีนที่เกิดจากรังสียูวี และความเสียหายจากออกซิเดชัน หลายรูปแบบ การกลายพันธุ์ในยีน XPB(ERCC3) อาจนำไปสู่โรคxeroderma pigmentosum (XP) หรือ XP ร่วมกับกลุ่มอาการ Cockayne (XPCS) ในมนุษย์ได้ [ 6 ] เซลล์ XPB กลายพันธุ์จากบุคคลที่มีฟีโนไทป์ XPCS มีความไวต่อรังสียูวีและความเครียดจากออกซิเดชันเฉียบพลัน[ 7 ]
XPB helicase ยังเป็นส่วนประกอบของ เส้นทาง การตายของเซลล์แบบโปรแกรม ( apoptosis ) ที่ควบคุมโดย p53 อีกด้วย [ 8 ]
ความผิดปกติ
การกลายพันธุ์ในยีน XPB และกลุ่มการเสริมฤทธิ์ที่เกี่ยวข้องอื่นๆ เช่น XPA-XPG นำไปสู่ความผิดปกติทางพันธุกรรมหลายอย่าง เช่น โรคผิวหนังแห้งเป็นฝ้า(Xeroderma pigmentosum) , กลุ่มอาการค็อกเคน (Cockayne's syndrome ) และโรคผมบาง (Trichothiodystrophy )
ปฏิสัมพันธ์
จากการศึกษาพบว่า XPB มีปฏิกิริยากับสารต่างๆ ดังนี้:
สารยับยั้งโมเลกุลขนาดเล็ก
ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง เช่น ทริปโทไลด์ ที่ยับยั้งการถอดรหัสของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมผ่านการยับยั้งหน่วยย่อย XPB ของปัจจัยการถอดรหัสทั่วไป TFIIH ได้รับการรายงานเมื่อเร็ว ๆ นี้ว่าเป็นสารประกอบกลูโคสสำหรับการกำหนดเป้าหมายเซลล์มะเร็งที่มีภาวะขาดออกซิเจนซึ่งมีการแสดงออกของตัวขนส่งกลูโคสเพิ่มขึ้น[ 19 ]
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- Jeang KT (1998). "Tat, Tat-associated kinase และการถอดรหัส". J. Biomed. Sci . 5 (1): 24– 7. doi : 10.1007/BF02253352 . PMID 9570510 .
- Yankulov K, Bentley D (1998). "การควบคุมการถอดรหัส: ปัจจัยร่วม Tat และการยืดตัวของการถอดรหัส" . Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y . doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670 . S2CID 15480646 .
- Cleaver JE, Thompson LH, Richardson AS, States JC (1999). "บทสรุปของการกลายพันธุ์ในโรคที่ไวต่อรังสียูวี: xeroderma pigmentosum, Cockayne syndrome และ trichothiodystrophy" Hum . Mutat . 14 (1): 9– 22. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1<9::AID - HUMU2>3.0.CO;2-6 . PMID 10447254. S2CID 24148589 .
- Ma L, Weeda G, Jochemsen AG, Bootsma D, Hoeijmakers JH, van der Eb AJ (1992). "การวิเคราะห์ระดับโมเลกุลและหน้าที่ของโปรโมเตอร์ XPBC/ERCC-3: กิจกรรมการถอดรหัสขึ้นอยู่กับความสมบูรณ์ของไซต์การจับ Sp1" . Nucleic Acids Res . 20 (2): 217– 24. doi : 10.1093/nar/20.2.217 . PMC 310357 . PMID 1741247 .
- วีดา จี, วีแกนต์ เจ, ฟาน เดอร์ โพลเอก เอ็ม, เกิร์ตส์ ฟาน เคสเซล AH, ฟาน เดอร์ เอบ เอเจ, Hoeijmakers JH (1991) "การแปลยีนแก้ไขซีโรเดอร์มาเม็ดสีกลุ่ม B ERCC3 ให้เป็นโครโมโซม 2q21 ของมนุษย์ " จีโนมิกส์ . 10 (4): 1035– 1040 ดอย : 10.1016/0888-7543(91)90195- K hdl : 1765/3025 . PMID 1916809 .
- Weeda G, Ma LB, van Ham RC, van der Eb AJ, Hoeijmakers JH (1991). "โครงสร้างและการแสดงออกของยีน XPBC/ERCC-3 ของมนุษย์ที่เกี่ยวข้องกับความผิดปกติของการซ่อมแซม DNA เช่น xeroderma pigmentosum และ Cockayne's syndrome" Nucleic Acids Res . 19 (22): 6301– 6308. doi : 10.1093/nar/19.22.6301 . PMC 329143. PMID 1956789 .
- วีดา จี, ฟาน แฮม อาร์ซี, มาซูเรล อาร์, เวสเตอร์เวลด์ เอ, โอไดจค์ เอช, เดอ วิท เจ, บู๊ทส์มา ดี, ฟาน เดอร์ เอ็บ เอเจ, เฮอยเมกเกอร์ เจเอช (1990) "การโคลนระดับโมเลกุลและลักษณะทางชีววิทยาของยีนซ่อมแซมการตัดตอนของมนุษย์ ERCC-3 " โมล เซลล์ ไบโอล10 (6): 2570– 2581. ดอย : 10.1128/MCB.10.6.2570 . PMC 360615 . PMID2111438 .
- วีดา จี, ฟาน แฮม อาร์ซี, แวร์เมอเลน ดับบลิว, บู๊ทส์ม่า ดี, ฟาน เดอร์ เอ็บ เอเจ, เฮอยเมกเกอร์ เจเอช (1990) "สันนิษฐานว่า DNA helicase ที่เข้ารหัสโดย ERCC-3 เกี่ยวข้องกับความผิดปกติของการซ่อมแซมของมนุษย์ xeroderma pigmentosum และกลุ่มอาการ Cockayne " เซลล์ 62 (4): 777– 91. ดอย : 10.1016/0092-8674(90)90122-U . hdl : 1765/3020 . PMID2167179 . S2CID 31743602 .
- Wang XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (1995). "การปรับเปลี่ยน p53 ของกิจกรรมการซ่อมแซมการตัดนิวคลีโอไทด์ที่เกี่ยวข้องกับ TFIIH" Nat . Genet . 10 (2): 188–95 . doi : 10.1038 / ng0695-188 . hdl : 1765/54884 . PMID 7663514. S2CID 38325851 .
- Maxon ME, Goodrich JA, Tjian R (1994). "ปัจจัยการถอดรหัส IIE จับกับ RNA polymerase IIa ได้อย่างเฉพาะเจาะจงและดึงดูด TFIIH: แบบจำลองสำหรับการกำจัดโปรโมเตอร์" Genes Dev . 8 (5): 515– 24. doi : 10.1101/gad.8.5.515 . PMID 7926747 .
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (1994). "บทบาทคู่ของ TFIIH ในการซ่อมแซม DNA ที่ถูกตัดออกและการถอดรหัสโดย RNA polymerase II" Nature . 368 (6473): 769– 72. Bibcode : 1994Natur.368..769D . doi : 10.1038/368769a0 . PMID 8152490 . S2CID 4363484 .
- ฟาน วูเรน AJ, แวร์เมอเลน ดับเบิลยู, มา แอล, วีดา จี, อัพเปลดอร์น อี, แจสเปอร์ส เอ็นจี, ฟาน เดอร์ เอ็บ เอเจ, บู๊ทส์มา ดี, เฮอยเมกเกอร์ เจเอช, ฮัมเบิร์ต เอส (1994) "การแก้ไขข้อบกพร่องในการซ่อมแซมซีโรเดอร์มา รงควัตถุโดย basal transcription factor BTF2 (TFIIH) " เอ็มโบ เจ . 13 (7): 1645– 1653. ดอย : 10.1002/ j.1460-2075.1994.tb06428.x PMC 394995 . PMID8157004 .
- แชฟเฟอร์ แอล, มอนคอลลิน วี, รอย อาร์, สเตาบ เอ, เมซซินา เอ็ม, สารซิน เอ, วีดา จี, ฮอยเมกเกอร์ส เจเอช, เอกลี่ เจเอ็ม (1994) "โปรตีนซ่อมแซม ERCC2/DNA มีความเกี่ยวข้องกับปัจจัยการถอดรหัส class II BTF2/TFIIH " เอ็มโบ เจ . 13 (10): 2388– 2392. ดอย : 10.1002/ j.1460-2075.1994.tb06522.x PMC 395103 . PMID8194528 .
- Guzder SN, Sung P, Bailly V, Prakash L, Prakash S (1994). "RAD25 เป็นเฮลิเคส DNA ที่จำเป็นสำหรับการซ่อมแซม DNA และการถอดรหัส RNA polymerase II" Nature . 369 (6481): 578– 81. Bibcode : 1994Natur.369..578G . doi : 10.1038/369578a0 . PMID 8202161 . S2CID 4332757 .
- แฟร์เมอเลน ดับเบิลยู, สกอตต์ อาร์เจ, ร็อดเจอร์ส เอส, มุลเลอร์ เอชเจ, โคล เจ, อาร์เลตต์ ซีเอฟ, ไคลเกอร์ ดับบลิวเจ, บู๊ทส์มา ดี, เฮอยเมกเกอร์ส เจเอช, วีดา จี (1994) "ความแตกต่างทางคลินิกภายในเม็ดสี xeroderma ที่เกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์ในการซ่อมแซม DNA และยีนการถอดรหัส ERCC3 " เช้า. เจ. ฮัม. เจเนท . 54 (2): 191– 200. PMC 1918172 . PMID8304337 .
- Scott RJ, Itin P, Kleijer WJ, Kolb K, Arlett C, Muller H (1993). "กลุ่มอาการ Xeroderma pigmentosum-Cockayne ในผู้ป่วยสองราย: ไม่มีเนื้องอกที่ผิวหนังแม้จะมีภาวะขาดการซ่อมแซม DNA อย่างรุนแรง" J. Am. Acad. Dermatol . 29 (5 Pt 2): 883–9 . doi : 10.1016/0190-9622(93)70263-S . PMID 8408834 .
- Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). "โดเมนการกระตุ้นการถอดรหัสสามประเภทตามหน้าที่" . Mol. Cell. Biol . 16 (5): 2044– 2055. doi : 10.1128/MCB.16.5.2044 . PMC 231191 . PMID 8628270 .
- Iyer N, Reagan MS, Wu KJ, Canagarajah B, Friedberg EC (1996). "ปฏิสัมพันธ์ที่เกี่ยวข้องกับคอมเพล็กซ์การถอดรหัส/การซ่อมแซมการตัดนิวคลีโอไทด์ของ RNA polymerase II ของมนุษย์ TFIIH โปรตีนการซ่อมแซมการตัดนิวคลีโอไทด์ XPG และโปรตีนกลุ่มอาการ Cockayne กลุ่ม B (CSB)" Biochemistry . 35 (7): 2157– 2167. doi : 10.1021/bi9524124 . PMID 8652557 .
- ฮวาง เจอาร์, มอนคอลลิน วี, แวร์เมอเลน ดับเบิลยู, เซรอซ ที, ฟาน วูเรน เอช, ฮอยเมกเกอร์ เจเอช, เอ็กลี่ เจเอ็ม (1996) "ข้อบกพร่องของเฮลิเคส XPB 3' → 5' ในปัจจัยการซ่อมแซม/การถอดรหัส TFIIH ของ xeroderma pigmentosum กลุ่ม B ส่งผลต่อทั้งการซ่อมแซมและการถอดรหัส DNA " เจ. ไบโอล. เคมี . 271 (27): 15898– 904. ดอย : 10.1074/jbc.271.27.15898 . hdl : 1765/3098 . PMID8663148 .
ลิงก์ภายนอก
- ข้อมูลเกี่ยวกับโรค Xeroderma Pigmentosum จาก GeneReviews/NIH/NCBI/UW
- XPBC-ERCC-3+โปรตีน ใน หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอ็กซ์พีบี
XPB ( xeroderma pigmentosum type B) เป็นเอนไซม์ DNA helicase ที่ต้องพึ่งพา ATP ในมนุษย์ ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม ปัจจัยการถอดรหัส TFIIH
โครงสร้าง
โครงสร้างสามมิติของโฮโมล็อกอาร์เคียของ XPB ได้รับการแก้ไขโดยการวิเคราะห์ผลึกด้วยรังสีเอกซ์โดย ดร. จอห์น ไทเนอร์ และกลุ่มของเขาที่ สถาบันวิจัยสคริป ส์ [ 5 ]
การทำงาน
XPB มีบทบาทสำคัญในการถอดรหัสพื้นฐานตามปกติ การซ่อมแซมที่เชื่อมโยงกับการถอดรหัส (TCR) และ การซ่อมแซมโดยการตัดนิวคลีโอไทด์ (NER) มีการแสดงให้เห็นว่า XPB ที่บริสุทธิ์สามารถคลายเกลียว DNA ด้วยขั้ว 3'-5' ได้
ความผิดปกติ
การกลายพันธุ์ในยีน XPB และกลุ่มการเสริมฤทธิ์ที่เกี่ยวข้องอื่นๆ เช่น XPA-XPG นำไปสู่ความผิดปกติทางพันธุกรรมหลายอย่าง เช่น โรคผิวหนังแห้งเป็นฝ้า (Xeroderma pigmentosum) , กลุ่มอาการค็อกเคน (Cockayne's syndrome ) และ โรคผมบาง (Trichothiodystrophy )