พีเอสเอ็มซี5
โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 2KRK , 3KW6
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	PSMC5 , S8, SUG-1, SUG1, TBP10, TRIP1, p45, p45/SUG, หน่วยย่อย 26S ของโปรตีเอโซม, ATPase 5, RPT6
รหัสภายนอก	โอมิม : 601681 ; เอ็มจีไอ : 105047 ; โฮโมโลยีน : 2098 ; GeneCards : PSMC5 ; OMA : PSMC5 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 17 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 17q23.3 เริ่ม 63,827,152 bp [ 1 ] จบ 63,832,026 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 11 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 11|11 E1 เริ่ม 106,146,980 bp [ 2 ] จบ 106,153,946 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน เอ็นของกล้ามเนื้อไบเซปส์ เปลือกสมองน้อย ซีกสมองน้อย ซีกขวาของสมองน้อย อัณฑะข้างขวา กล้ามเนื้อน่อง อัณฑะซ้าย ต่อมใต้สมองส่วนหน้า เยื่อบุของกระเพาะอาหาร เกาะลางเกอร์ฮันส์ สูงสุดที่แสดงใน แผ่นเนื้อเยื่อหู ถุงน้ำ นิวเคลียสเวสติบูลาร์ส่วนกลาง นิวเคลียสสมองน้อยส่วนลึก นิวเคลียสเทกเมนทัลด้านหลัง นิวเคลียสพอนไทน์ หางของตัวอ่อน โซไมต์ ถุงน้ำในหู ฮาเบนูลา ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอจีพีเอส ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับนิวคลีโอไทด์ การจับกับตัวรับฮอร์โมนไทรอยด์รีลีสซิ่ง การจับโปรตีน การจับกับ ATP การจับตัวของตัวรับสัญญาณ กิจกรรมไฮโดรเลส กิจกรรม ATPase การจับโปรตีนคลาส TBP การจับตัวของปัจจัยถอดรหัส กิจกรรมการกระตุ้นโปรตีเอโซม ส่วนประกอบของเซลล์ ไซโตซอล อนุภาคควบคุมโปรตีเอโซม ซับคอมเพล็กซ์ฐาน ไมโครพาร์ติเคิลในเลือด เมมเบรน อนุภาคควบคุมโปรตีเอโซม นิวคลีโอพลาสม์ หน่วยงานรวม เอ็กโซโซมนอกเซลล์ ถุงไซโตพลาสมิก คอมเพล็กซ์โปรตีเอโซม คอมเพล็กซ์โปรตีเอโซมในไซโตพลาสซึม ไซโตพลาซึม คอมเพล็กซ์เสริมโปรตีเอโซม นิวเคลียส คอมเพล็กซ์โปรตีเอโซมนิวเคลียร์ หลังไซแนปส์ กระบวนการทางชีวภาพ การควบคุมเชิงบวกของการประกอบคอมเพล็กซ์ก่อนการเริ่มต้นการถอดรหัสของ RNA polymerase II การควบคุมกระบวนการเผาผลาญกรดอะมิโนในเซลล์ กระบวนการประมวลผลและการนำเสนอแอนติเจนเปปไทด์จากภายนอกผ่านทาง MHC class I โดยอาศัย TAP การควบคุมความเสถียรของ mRNA การควบคุมเชิงบวกของวิถีการส่งสัญญาณ Wnt แบบดั้งเดิม การโพลียูบิควิทิเนชันของโปรตีน เส้นทางการส่งสัญญาณตัวรับเลคตินชนิดซีที่กระตุ้น เส้นทางการส่งสัญญาณที่ควบคุมโดยปัจจัยเนโครซิสของเนื้องอก การควบคุมเชิงบวกของการประกอบอินคลูชันบอดี้ MAPK cascade การควบคุมการถอดรหัสเชิงบวกโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ วิถีการส่งสัญญาณของตัวรับ Fc-epsilon กระบวนการสลายโปรตีน การส่งสัญญาณ NIK/NF-kappaB วิถี ERAD ที่ขึ้นอยู่กับยูบิควิติน การควบคุมเชิงลบของการตายของเซลล์ตามโปรแกรม กระบวนการสลายตัวที่ขึ้นอยู่กับคอมเพล็กซ์ส่งเสริมระยะแอนาเฟส การควบคุมการถอดรหัสเชิงลบโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ เส้นทางการส่งสัญญาณของตัวรับทีเซลล์ การควบคุมเชิงลบของวิถีการส่งสัญญาณ Wnt แบบดั้งเดิม กระบวนการสลายโปรตีนที่ขึ้นอยู่กับยูบิควิตินโดยอาศัยโปรตีเอโซม วิถีการส่งสัญญาณ Wnt, วิถีขั้วเซลล์ระนาบ การควบคุมเชิงบวกของกระบวนการสลายโปรตีนโดยโปรตีเอโซม การควบคุมเชิงลบของการเปลี่ยนผ่าน G2/M ของวงจรการแบ่งเซลล์แบบไมโทซิส การกำจัดยูบิควิตินออกจากโปรตีน กระบวนการสลายโปรตีนที่ขึ้นอยู่กับยูบิควิตินในโปรตีเอโซมที่ขึ้นอยู่กับ SCF การขนส่งผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ การควบคุมการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II เพื่อตอบสนองต่อภาวะขาดออกซิเจน การปรับเปลี่ยนการส่งสัญญาณประสาททางเคมี การควบคุมการถอดรหัสโดย RNA polymerase II การดัดแปลงโปรตีนหลังการแปล การควบคุมการแยกตัวของเซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือด เส้นทางการส่งสัญญาณที่ควบคุมโดยอินเตอร์ลิวคิน-1 การควบคุมการเปลี่ยนผ่านระยะของวงจรเซลล์ไมโทซิส แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 5705 19184 วงดนตรี ENSG00000087191 ENSMUSG00000020708 ยูนิโปรท พี62195 พี62196 RefSeq (mRNA) NM_001199163 NM_002805 NM_008950 RefSeq (โปรตีน) NP_001186092 NP_002796 NP_032976 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 17: 63.83 – 63.83 Mb Chr 11: 106.15 – 106.15 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

หน่วยย่อยควบคุมโปรตีเอส 26S 8หรือที่รู้จักกันในชื่อหน่วยย่อย AAA-ATPase ของโปรตีเอโซม 26S Rpt6เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนPSMC5 [ ^{5 ] [ 6 ] [ 7 ] โปรตีน}นี้เป็นหนึ่งใน 19 หน่วยย่อยที่จำเป็นของคอมเพล็กซ์โปรตีเอโซม 19S ที่ประกอบขึ้นอย่างสมบูรณ์^{[ 8 ]}หน่วยย่อย AAA-ATPase ของโปรตีเอโซม 26S จำนวน 6 หน่วย ( Rpt1 , Rpt2 , Rpt3 , Rpt4 , Rpt5และ Rpt6 (โปรตีนนี้)) ร่วมกับหน่วยย่อยที่ไม่ใช่ ATPase จำนวน 4 หน่วย ( Rpn1 , Rpn2 , Rpn10และRpn13 ) ก่อตัวเป็นซับคอมเพล็กซ์พื้นฐานของอนุภาคควบคุม 19S สำหรับคอมเพล็กซ์โปรตีเอโซม^{[ 8 ]}

ยีนPSMC5เข้ารหัสซับยูนิต ATPase ตัวหนึ่ง ซึ่งเป็นสมาชิกของตระกูล ATPase แบบ triple-A ที่มีกิจกรรมคล้าย chaperone นอกจากจะมีส่วนร่วมในหน้าที่ของโปรตีเอโซมแล้ว ซับยูนิตนี้อาจมีส่วนร่วมในการควบคุมการถอดรหัส เนื่องจากมีการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับตัวรับฮอร์โมนไทรอยด์และตัวรับเรตินอยด์ X อัลฟา^{[ 7 ]} ยีน PSMC5 ของมนุษย์มี 13 เอ็กซอนและตั้งอยู่ที่แถบโครโมโซม 17q23.3

โปรตีนของมนุษย์ 26S protease regulatory subunit 8 มีขนาด 45.6 kDa และประกอบด้วยกรดอะมิโน 406 ตัว ค่า pI ทางทฤษฎีที่คำนวณได้ของโปรตีนนี้คือ 8.23 ^{​​[ 9 ]}

คอมเพล็กซ์ โปรตีเอโซม 26S โดยทั่วไปประกอบด้วยอนุภาคแกนกลาง 20S (CP หรือโปรตีเอโซม 20S) และอนุภาคควบคุม 19S (RP หรือโปรตีเอโซม 19S) หนึ่งหรือสองอนุภาคอยู่ด้านใดด้านหนึ่งหรือทั้งสองด้านของอนุภาค 20S รูปทรงกระบอก CP และ RP มีลักษณะโครงสร้างและหน้าที่ทางชีวภาพที่แตกต่างกัน โดยสรุปแล้ว คอมเพล็กซ์ย่อย 20S มีกิจกรรมการย่อยโปรตีนสามประเภท ได้แก่ กิจกรรมคล้ายแคสเปส กิจกรรมคล้ายทริปซิน และกิจกรรมคล้ายไคโมทริปซิน ตำแหน่งที่ออกฤทธิ์ในการย่อยโปรตีนเหล่านี้ตั้งอยู่ด้านในของห้องที่เกิดจากการเรียงซ้อนกันของวงแหวน 20S 4 วง ซึ่งป้องกันการพบกันโดยบังเอิญระหว่างโปรตีนและเอนไซม์ และการย่อยสลายโปรตีนที่ไม่สามารถควบคุมได้ อนุภาคควบคุม 19S สามารถจดจำ โปรตีนที่ติดฉลาก ยูบิควิตินเป็นสารตั้งต้นในการย่อยสลาย คลี่โปรตีนให้เป็นเส้นตรง เปิดประตูของอนุภาคแกนกลาง 20S และนำสารตั้งต้นเข้าไปในห้องย่อยโปรตีน เพื่อรองรับความซับซ้อนในการทำงานดังกล่าว อนุภาคควบคุม 19S จึงประกอบด้วยหน่วยย่อยอย่างน้อย 18 หน่วย หน่วยย่อยเหล่านี้สามารถแบ่งออกเป็นสองประเภทตามการพึ่งพา ATP ของหน่วยย่อย ได้แก่ หน่วยย่อยที่พึ่งพา ATP และหน่วยย่อยที่ไม่พึ่งพา ATP จากปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนและลักษณะทางโครงสร้างของคอมเพล็กซ์หลายหน่วยย่อยนี้ อนุภาคควบคุม 19S จึงประกอบด้วยส่วนฐานและส่วนฝาปิด ส่วนฐานประกอบด้วยวงแหวนของ AAA ATPase หกหน่วย (หน่วยย่อย Rpt1-6 ตามระบบการตั้งชื่อ) และหน่วยย่อยที่ไม่ใช่ ATPase สี่หน่วย ( Rpn1 , Rpn2 , Rpn10และRpn13 ) ดังนั้น หน่วยย่อยควบคุมโปรตีเอส 26S หน่วยที่ 4 (Rpt2) จึงเป็นส่วนประกอบสำคัญในการสร้างส่วนฐานของอนุภาคควบคุม 19S สำหรับการประกอบซับคอมเพล็กซ์ฐาน 19S กลุ่มวิจัยสี่กลุ่มอิสระได้ระบุชุดของชาเปอรอนการประกอบที่สำคัญ (Hsm3/S5b, Nas2/P27, Nas6/P28 และ Rpn14/PAAF1 ซึ่งเป็นชื่อที่ใช้ในยีสต์/สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม) ^{[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]}ชาเปอรอนที่จำเพาะต่อฐานของอนุภาคควบคุม 19S เหล่านี้จะจับกับซับยูนิต ATPase แต่ละตัวผ่านทางบริเวณปลาย C ตัวอย่างเช่น Hsm3/S5b จับกับซับยูนิตRpt1และ Rpt2 (โปรตีนนี้), Nas2/p27 จับกับRpt5 , Nas6/p28 จับกับRpt3และ Rpn14/PAAAF1 จับกับ Rpt6 (โปรตีนนี้) ตามลำดับ ต่อมา โมดูลประกอบขั้นกลางสามโมดูลจะถูกสร้างขึ้นดังต่อไปนี้ โมดูล Nas6/p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14/PAAF1 โมดูล Nas2/p27-Rpt4-Rpt5 และโมดูล Hsm3/S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2 ในที่สุด โมดูลทั้งสามนี้จะประกอบเข้าด้วยกันเพื่อสร้างวงแหวนเฮเทอโรเฮกซาเมริกของ Atlas 6 ตัวกับ Rpn1 การเพิ่ม Rpn13 ในขั้นตอนสุดท้าย^แสดงถึงการประกอบซับคอมเพล็กซ์ฐาน 19S เสร็จสมบูรณ์^{8 ]}

โปรตีเอโซมคอมเพล็กซ์ (โปรตีเอโซม 26S) ซึ่งเป็นกลไกการย่อยสลายที่รับผิดชอบการสลายโปรตีนภายในเซลล์ประมาณ 70% ^{[ 16 ]}มีบทบาทสำคัญในการรักษาสภาวะสมดุลของโปรตีนในเซลล์ ดังนั้น โปรตีนที่พับผิดรูปและโปรตีนที่เสียหายจะต้องถูกกำจัดออกอย่างต่อเนื่องเพื่อนำกรดอะมิโนกลับมาใช้ใหม่สำหรับการสังเคราะห์ใหม่ ในขณะเดียวกัน โปรตีนควบคุมที่สำคัญบางชนิดจะทำหน้าที่ทางชีวภาพผ่านการย่อยสลายแบบเลือกสรร นอกจากนี้ โปรตีนจะถูกย่อยเป็นเปปไทด์สำหรับการนำเสนอแอนติเจน MHC คลาส I เพื่อตอบสนองความต้องการที่ซับซ้อนดังกล่าวในกระบวนการทางชีวภาพผ่านการสลายโปรตีนในเชิงพื้นที่และเวลา โปรตีนที่เป็นสารตั้งต้นจะต้องได้รับการจดจำ คัดเลือก และในที่สุดก็ถูกไฮโดรไลซ์ในลักษณะที่มีการควบคุมอย่างดี ดังนั้น อนุภาคควบคุม 19S จึงมีคุณสมบัติที่สำคัญหลายประการเพื่อจัดการกับความท้าทายในการทำงานเหล่านี้ ในการจดจำโปรตีนเป็นสารตั้งต้นที่กำหนด คอมเพล็กซ์ 19S มีหน่วยย่อยที่สามารถจดจำโปรตีนที่มีแท็กการย่อยสลายพิเศษ คือ ยูบิควิตินิเลชัน นอกจากนี้ มันยังมีหน่วยย่อยที่สามารถจับกับนิวคลีโอไทด์ (เช่น ATP) เพื่ออำนวยความสะดวกในการเชื่อมโยงระหว่างอนุภาค 19S และ 20S ตลอดจนทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของปลาย C-terminal ของหน่วยย่อยอัลฟาซึ่งเป็นทางเข้าของสารตั้งต้นในคอมเพล็กซ์ 20S

หน่วยย่อย ATPases ประกอบกันเป็นวงแหวนหกเหลี่ยมที่มีลำดับ Rpt1–Rpt5–Rpt4–Rpt3–Rpt6–Rpt2 ซึ่งมีปฏิสัมพันธ์กับวงแหวนอัลฟาเจ็ดเหลี่ยมของอนุภาคแกนกลาง 20S และสร้างอินเทอร์เฟซที่ไม่สมมาตรระหว่าง 19S RP และ 20S CP ^{[ 17 ] [ 18 ]}หางปลาย C สามเส้นที่มีโมทีฟ HbYX ของ Rpt ATPases ที่แตกต่างกันจะแทรกเข้าไปในช่องระหว่างหน่วยย่อยอัลฟาที่กำหนดไว้สองหน่วยของ CP และควบคุมการเปิดประตูของช่องกลางในวงแหวนอัลฟาของ CP ^{[ 19 ] [ 20 ]}หลักฐานแสดงให้เห็นว่าซับยูนิต ATPase Rpt5 พร้อมกับซับยูนิตโปรตีเอโซม 19S ที่ถูกยูบิควิติน ( Rpn13 , Rpn10 ) และเอนไซม์ดีบูบิควิตินเนต Uch37 สามารถถูกยูบิควิตินในตำแหน่งเดิมโดยเอนไซม์ยูบิควิตินเนตที่เกี่ยวข้องกับโปรตีเอโซม การยูบิควิตินเนตของซับยูนิตโปรตีเอโซมสามารถควบคุมกิจกรรมของโปรตีเอโซมเพื่อตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงระดับยูบิควิตินเนตของเซลล์^{[ 21 ]}

จากการศึกษาพบว่า PSMC5 มีปฏิสัมพันธ์กับสารต่างๆ ดังนี้:

• PSMC3 , ^{[ 22 ]}
• PSMC4 , ^{[ 23 ] [ 24 ]}
• ปัจจัยการ ถอดรหัสSp1 [ ^{25 ] [ 26 ] และ}
• XPB . ^{[ 27 ]}

ณ ปี 2021 มีรายงานการค้นพบเด็กที่มีการกลายพันธุ์ของยีน PSMC5 เพียง 18 รายเท่านั้น <GeneMatcher> มีมูลนิธิหนึ่งที่ทำการวิจัยเกี่ยวกับเด็กที่มีการกลายพันธุ์ของยีน PSMC5 ชื่อมูลนิธิ PSMC5 www.psmc5.orgโดยมีเป้าหมายเพื่อค้นหาวิธีการรักษาและเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับวิธีแก้ไขปัญหาที่เกิดจากการกลายพันธุ์ ผลกระทบที่พบบ่อยคือพัฒนาการล่าช้า ตั้งแต่พัฒนาการด้านการเคลื่อนไหวไปจนถึงความสามารถในการใช้ภาษาต่ำ