ไซโกทีน (มาจากภาษากรีกที่แปลว่า "เส้นใยคู่") ^{[ 1 ]}เป็นระยะที่สองของโปรเฟส Iในระหว่างไมโอซิส ซึ่ง เป็นการแบ่งเซลล์แบบพิเศษที่ลดจำนวนโครโมโซมลงครึ่งหนึ่งเพื่อสร้างแกมีตแฮพลอยด์ ระยะนี้ตามหลังระยะเลปโททีนและตามด้วยระยะแพคีทีน

เหตุการณ์สำคัญในช่วงไซโกทีนคือการเสร็จสิ้นการจับคู่ระหว่างโครโมโซมคู่เหมือน การจับคู่เริ่มต้นในช่วงระยะเลปโททีนก่อนหน้านี้ โดยโครโมโซมคู่เหมือนเริ่มจับคู่กันและเชื่อมโยงกันตามแนวยาว โดยได้รับการอำนวยความสะดวกจากโครงสร้างโปรตีนของคอมเพล็กซ์ไซแนปโทนีมอ ล ^{[ 2 ]}

ในระยะไซโกทีน คอมเพล็กซ์ซินาปโทนีมอลจะก่อตัวขึ้นอย่างกว้างขวางมากขึ้นระหว่างโครโมโซมคู่ โดยจะเชื่อมโฮโมล็อกเข้าด้วยกันตลอดความยาวทั้งหมด โดยองค์ประกอบด้านข้างของคอมเพล็กซ์จะเชื่อมโยงกับโครโมโซมแต่ละตัว และบริเวณตรงกลางจะยึดพวกมันไว้ด้วยกัน ซึ่งช่วยให้เกิดการจับคู่ที่ใกล้ชิดและเหตุการณ์การรวมตัวทางพันธุกรรม^{[ 3 ] [ 4 ]}

ในระหว่างไซโกทีน โครโมโซมจะหดตัวลงอย่างต่อเนื่องจนกลายเป็นโครงสร้างคล้ายเส้นด้ายที่ชัดเจน โครโมโซมแต่ละตัวจะดูหนาขึ้นเนื่องจากโครมาทิดคู่แฝดเรียงตัวกันอย่างใกล้ชิด^{[ 5 ]}

เมื่อการสร้างไซแนปส์เสร็จสมบูรณ์ ก้อนโปรตีนที่เกิดจากการรวมตัวใหม่จะเริ่มปรากฏขึ้นตามแนวไซแนปโทนีมอลคอมเพล็กซ์ระหว่างโครโมโซมคู่เหมือน ก้อนเหล่านี้แสดงถึงตำแหน่งของเหตุการณ์ครอสโอเวอร์ทางพันธุกรรม ซึ่งมีการแลกเปลี่ยนส่วนของโครโมโซมเกิดขึ้นระหว่างโครมาทิดที่ไม่ใช่พี่น้อง^{[ 6 ] [ 7 ]}

โปรตีนรีคอมบิเนชันที่สำคัญ เช่น MLH1/3 และ MSH4/5 ทำเครื่องหมายตำแหน่งการเกิดครอสโอเวอร์ จำนวนและตำแหน่งของครอสโอเวอร์เหล่านี้ได้รับการควบคุมเพื่อให้แน่ใจว่ามีครอสโอเวอร์อย่างน้อยหนึ่งครั้งต่อแขนโครโมโซมสำหรับการแยกตัวที่เหมาะสมในระยะไมโอซิสตอนปลาย^{[ 8 ]}

เมื่อการสร้างไซแนปส์และการไขว้กันเสร็จสมบูรณ์ เซลล์จะเปลี่ยนไปสู่ ระยะ แพคีทีนของโปรเฟส I แพคีทีนมีโครโมโซมที่ควบแน่นและจับคู่กันอย่างสมบูรณ์ตลอดความยาว โดยมีปุ่มการรวมตัวใหม่ที่มองเห็นได้ชัดเจน^{[ 9 ] [ 10 ]}

ระยะไซโกทีนมีความสำคัญต่อการรวมตัวทางพันธุกรรมและการแยกโครโมโซม อย่างถูกต้อง ในไมโอซิส^{[ 1 ]}ข้อบกพร่องในการควบคุมไซแนปซิส การรวมตัว หรือการไขว้กันอาจนำไปสู่ภาวะแอนยูพลอยดีและความผิดปกติของโครโมโซมในแกมีต^{[ 11 ]}