กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 9 นาที

โอมิกส์

โอมิกส์คือลักษณะโดยรวมและการหาปริมาณของชุดโมเลกุลทางชีวภาพ ทั้งหมด และการตรวจสอบว่าโมเลกุลเหล่านั้นแปลความหมายอย่างไรในโครงสร้าง หน้าที่ และพลวัตของสิ่งมีชีวิตหรือกลุ่มสิ่งมีชีวิต

โอมิกส์

แผนภาพแสดงหลักการทางจีโนมิกส์

โอมิกส์คือลักษณะโดยรวมและการหาปริมาณของชุดโมเลกุลทางชีวภาพ ทั้งหมด และการตรวจสอบว่าโมเลกุลเหล่านั้นแปลความหมายอย่างไรในโครงสร้าง หน้าที่ และพลวัตของสิ่งมีชีวิตหรือกลุ่มสิ่งมีชีวิต[ 1 ] [ 2 ]สาขาวิทยาศาสตร์ที่เรียกกันอย่างไม่เป็นทางการว่าโอมิกส์คือสาขาวิชาต่างๆ ในชีววิทยาที่มีชื่อลงท้ายด้วยคำต่อท้าย-omicsเช่นจีโนมิกส์โปรตีโอมิกส์เมตาโบโลมิกส์เมตาจีโนมิกส์ ฟีโนมิกส์ และท ราน สคริปโตมิกส์

คำต่อท้ายที่เกี่ยวข้องอย่าง-omeใช้เพื่ออ้างถึงสิ่งที่ศึกษาในสาขาต่างๆ เช่นจีโนมโปรตีโอมหรือเมตาโบโลม ตามลำดับ คำต่อท้าย-omeที่ใช้ในชีววิทยาระดับโมเลกุลหมายถึงความเป็นทั้งหมดบางอย่าง เป็นตัวอย่างของ "คำต่อท้ายใหม่" ที่เกิดจากการดัดแปลงจากคำศัพท์ภาษากรีกต่างๆ ใน ​​-ωμαซึ่งเป็นลำดับที่ไม่สามารถระบุเป็นคำต่อท้ายในภาษากรีกได้

จีโนมิกส์เชิงฟังก์ชันมีเป้าหมายเพื่อระบุหน้าที่ของยีนให้ได้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ในสิ่งมีชีวิตที่กำหนด โดยจะรวมเทคนิค -omics ต่างๆ เช่น ทรานสคริปโตมิกส์และโปรตีโอมิกส์เข้ากับชุดการกลายพันธุ์ที่อิ่มตัว[ 3 ]

ต้นทาง

"โอมิคุม": อาคารของศูนย์ชีววิทยาแห่งเอสโตเนียซึ่งเป็นที่ตั้งของศูนย์จีโนมแห่งเอสโตเนียและสถาบันชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์แห่งมหาวิทยาลัยตาร์ตูในเมืองตาร์ตู ประเทศเอสโตเนีย

พจนานุกรมภาษาอังกฤษฉบับออก ซ์ฟอร์ด ( OED ) จำแนกคำต่อท้าย -omeออกเป็น 3 สาขาการใช้งานที่แตกต่างกัน:

  1. ในทางการแพทย์ การสร้างคำนามที่มีความหมายว่า "บวม, เนื้องอก"
  2. ในทางพฤกษศาสตร์หรือสัตววิทยา การสร้างคำนามในความหมายว่า "ส่วนหนึ่งของสัตว์หรือพืชที่มีโครงสร้างเฉพาะ"
  3. ในชีววิทยาของเซลล์และโมเลกุล การสร้างคำนามที่มีความหมายว่า "ส่วนประกอบทั้งหมดโดยรวม"

คำ ต่อท้าย -omeมีต้นกำเนิดมาจากรูปแบบหนึ่งของ-omaและเริ่มใช้กันอย่างแพร่หลายในช่วงไตรมาสสุดท้ายของศตวรรษที่ 19 เดิมทีคำนี้ปรากฏในคำต่างๆ เช่นsclerome [ 4 ] หรือ rhizome [ 5 ] คำเหล่านี้ทั้งหมดมาจากคำภาษากรีกในรูปแบบ -ωμα [ 6 ]ซึ่งเป็นลำดับที่ไม่ใช่คำต่อท้ายเพียงคำเดียว แต่สามารถวิเคราะห์ได้เป็น -ω-μαโดยที่-ω-เป็นส่วนหนึ่งของรากคำ (โดยปกติจะเป็นคำกริยา) และ-μαเป็นคำต่อท้ายภาษากรีกแท้ที่ใช้สร้างคำนามนามธรรม

OED แนะนำว่าคำจำกัดความที่สามมีต้นกำเนิดมาจากการสร้างย้อนกลับจากไมโตม [ 7 ] หลักฐานแรกๆ ได้แก่ไบโอม (1916) [ 8 ]และจีโนม (บัญญัติครั้งแรกในภาษาเยอรมันว่าGenomในปี 1920 [ 9 ] ) [ 10 ]

ความเชื่อมโยงกับโครโมโซมในชีววิทยาโมเลกุลเกิดจากรากศัพท์ที่ผิดพลาดคำว่าโครโมโซมมาจากรากศัพท์ ภาษา กรีกχρωμ(ατ)- "สี" และσωμ(ατ)- "ร่างกาย" [ 10 ]ในขณะที่σωμα "ร่างกาย" มีคำ ต่อท้าย -μα อยู่จริง แต่ -ω- ที่อยู่ข้างหน้า ไม่ใช่คำต่อท้ายที่สร้างรากศัพท์ แต่เป็นส่วนหนึ่งของรากศัพท์เนื่องจากจีโนมหมายถึง องค์ประกอบทางพันธุกรรม ทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต คำต่อท้ายใหม่ -omeจึงถูกเสนอขึ้นมาเพื่อหมายถึง "ความสมบูรณ์" หรือ "ความครบถ้วน" [ 11 ]

นักชีวสารสนเทศและนักชีววิทยาโมเลกุลเป็นกลุ่มนักวิทยาศาสตร์กลุ่มแรกๆ ที่ใช้คำต่อท้าย "-ome" อย่างแพร่หลายผู้สนับสนุนในช่วงแรกๆ ได้แก่ นักชีวสารสนเทศใน เค มบริดจ์สหราชอาณาจักร ซึ่งมีห้องปฏิบัติการชีวสารสนเทศในช่วงแรกๆ มากมาย เช่นศูนย์ MRC ศูนย์ Sangerและ EBI ( สถาบันชีวสารสนเทศแห่งยุโรป ) ตัวอย่างเช่น ศูนย์ MRC ดำเนินโครงการจีโนมและโปรตีโอมเป็นครั้งแรก[ 12 ]

การใช้งานปัจจุบัน

คำว่า "omes" นอกเหนือจาก " genome " ดั้งเดิมนั้นมีประโยชน์และได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางจากนักวิทยาศาสตร์ด้านการวิจัย คำว่า " proteomics " ได้รับการยอมรับอย่างดีในฐานะคำที่ใช้ศึกษาโปรตีนในระดับใหญ่ คำว่า "omes" สามารถใช้เป็นคำย่อเพื่อสรุปขอบเขตของสาขาได้ ตัวอย่างเช่น การศึกษา interactomicsนั้นสามารถระบุได้อย่างชัดเจนว่าเกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างยีนกับยีน โปรตีนกับโปรตีน หรือโปรตีนกับลิแกนด์ในระดับใหญ่ นักวิจัยกำลังนำคำว่า omes และ omics มาใช้อย่างรวดเร็ว ดังที่เห็นได้จากการใช้คำเหล่านี้อย่างแพร่หลายในPubMedตั้งแต่กลางทศวรรษ 1990 [ 13 ]

ประเภทของการศึกษาโอไมซ์

จีโนมิกส์

  • จีโนมิกส์ : การศึกษาจีโนมของสิ่งมีชีวิต[ 14 ]
    • จีโนมิกส์เชิงปัญญา : การศึกษาการเปลี่ยนแปลงในกระบวนการทางปัญญาที่เกี่ยวข้องกับลักษณะทางพันธุกรรม
    • จีโนมิกส์เชิงเปรียบเทียบ : การศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและหน้าที่ของจีโนมในสิ่งมีชีวิตหรือสายพันธุ์ต่างๆ
    • จีโนมิกส์เชิงฟังก์ชัน : อธิบายถึงหน้าที่และปฏิสัมพันธ์ของยีนและโปรตีน (มักใช้ทรานสคริปโตมิกส์)
    • เมตาจีโนมิกส์ : การศึกษาเมตาจีโนม ซึ่งก็คือสารพันธุกรรมที่ได้มาจากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมโดยตรง
    • นิวโรจีโนมิกส์ : การศึกษาอิทธิพลของพันธุกรรมต่อการพัฒนาและการทำงานของระบบประสาท
    • พันจีโนมิกส์ : การศึกษาชุดยีนหรือจีโนมทั้งหมดที่พบในสปีชีส์ที่กำหนด[ 15 ]
    • จีโนมิกส์ส่วนบุคคล : สาขาหนึ่งของจีโนมิกส์ที่เกี่ยวข้องกับการจัดลำดับและวิเคราะห์จีโนมของแต่ละบุคคล เมื่อทราบจีโนไทป์แล้ว สามารถนำจีโนไทป์ของบุคคลนั้นไปเปรียบเทียบกับข้อมูลที่ตีพิมพ์ในวรรณกรรมเพื่อกำหนดโอกาสในการแสดงออกของลักษณะและปัจจัยเสี่ยงต่อโรค ช่วยในการแพทย์เฉพาะบุคคล
    • อิเล็กโตมิกส์: สาขาหนึ่งของจีโนมิกส์ที่เกี่ยวข้องกับบทบาทของสนามไฟฟ้าภายนอกในการเพิ่มศักยภาพการแสดงออกของยีนในเซลล์ เนื้อเยื่อ และออร์แกนอยด์[ 16 ]

เอพิเจโนมิกส์

เอพิเจโนมคือโครงสร้างค้ำจุนของจีโนม ซึ่งรวมถึงโปรตีนและสารยึดเกาะอาร์เอ็นเอ โครงสร้างดีเอ็นเอทางเลือก และการดัดแปลงทางเคมีบนดีเอ็นเอ

  • เอพิเจโนมิกส์ : เทคโนโลยีสมัยใหม่ ได้แก่ การกำหนดโครงสร้างโครโมโซมด้วยHi-C , ChIP-seqและวิธีการจัดลำดับอื่นๆ ที่รวมกับการแยกส่วนโปรตีน และวิธีการจัดลำดับที่ค้นหาการดัดแปลงทางเคมีของไซโตซีน เช่น การจัดลำดับด้วยไบซัลไฟต์
  • นิวคลีโอมิกส์: การศึกษาชุดองค์ประกอบจีโนมทั้งหมดซึ่งประกอบเป็น "นิวเคลียสของเซลล์ในฐานะระบบชีวภาพที่ซับซ้อนและไดนามิก ซึ่งเรียกว่านิวคลีโอม" [ 17 ] [ 18 ]กลุ่ม 4D Nucleome Consortium ได้เข้าร่วม IHEC ( International Human Epigenome Consortium ) อย่างเป็นทางการในปี 2017

ไมโครไบโอมิกส์

ไมโครไบโอมคือชุมชนจุลินทรีย์ที่อาศัยอยู่ในถิ่นที่อยู่ที่มีการกำหนดไว้อย่างชัดเจน โดยมีคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีที่แตกต่างกัน ประกอบด้วยจุลินทรีย์ที่เกี่ยวข้องและพื้นที่กิจกรรมของพวกมัน ซึ่งก่อให้เกิดนิเวศวิทยาเฉพาะถิ่นไมโครไบโอมก่อให้เกิดระบบนิเวศขนาดเล็กที่มีพลวัตและมีการโต้ตอบกัน ซึ่งมีแนวโน้มที่จะเปลี่ยนแปลงไปตามพื้นที่และเวลา พวกมันถูกรวมเข้ากับระบบนิเวศขนาดใหญ่ เช่น โฮสต์ยูคาริโอต และมีความสำคัญต่อการทำงานและสุขภาพที่เหมาะสมของโฮสต์[ 19 ]ระบบโฮสต์-จุลินทรีย์ที่มีการโต้ตอบกันประกอบขึ้นเป็นโฮโลไบออนต์[ 20 ]

ไมโครไบโอมิกส์คือการศึกษาพลวัต หน้าที่ และโครงสร้างของไมโครไบโอม[ 21 ]สาขาการศึกษานี้ใช้วิธีการหลายอย่างในการศึกษาไมโครไบโอมในสภาพแวดล้อมของโฮสต์: [ 20 ]

  • วิธีการสุ่มตัวอย่างมุ่งเน้นไปที่การเก็บตัวอย่างที่เป็นตัวแทนของสภาพแวดล้อมในท้องถิ่น ไม่ว่าจะเป็นจากไม้สำลีเช็ดช่องปากหรืออุจจาระ[ 20 ]
  • คัลตูโรมิกส์ (จุลชีววิทยา)คือการเพาะเลี้ยงเซลล์แบคทีเรียที่มีประสิทธิภาพสูง โดยมีเป้าหมายเพื่อระบุสายพันธุ์หรือชนิดในตัวอย่างที่ได้จากเนื้อเยื่อ เช่นลำไส้ของมนุษย์หรือจากสิ่งแวดล้อมอย่าง ครอบคลุม [ 22 ] [ 23 ]
  • อุปกรณ์ ไมโครฟลูอิดิกส์แบบลำไส้บนชิปซึ่งจำลองสภาวะของลำไส้และช่วยให้สามารถวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของไมโครไบโอมที่สามารถตรวจสอบได้อย่างแม่นยำกว่าในสถานที่จริง[ 20 ]
  • เทคนิคการสกัด DNA เชิงกลและวิธีการขยายยีน เช่นPCRเพื่อวิเคราะห์โปรไฟล์จีโนมของไมโครไบโอมทั้งหมด[ 20 ]
  • การตรวจสอบลายนิ้วมือ DNAโดยใช้ไมโครอาร์เรย์และเทคนิคการผสมพันธุ์ช่วยให้สามารถวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงในประชากรจุลินทรีย์ได้[ 20 ]
  • การศึกษามัลติโอมิกส์ช่วยให้สามารถวิเคราะห์การทำงานของจุลินทรีย์ได้[ 20 ]
  • แบบจำลองสัตว์สามารถใช้เพื่อเก็บตัวอย่างไมโครไบโอมในสถานที่ ได้อย่างแม่นยำยิ่งขึ้น สัตว์ปลอดเชื้อจะถูกนำมาใช้เพื่อปลูกถ่ายไมโครไบโอมเฉพาะจากสิ่งมีชีวิตอื่นเพื่อสร้างแบบจำลองกโนโตไบโอติก ซึ่งสามารถศึกษาเพื่อดูว่ามีการเปลี่ยนแปลงอย่างไรภายใต้สภาวะแวดล้อมที่แตกต่างกัน[ 20 ]

ลิปิดโอมิกส์

ลิพิโดม คือ ลิปิดทั้งหมดในเซลล์รวมทั้งการดัดแปลงที่เกิดขึ้นกับลิปิดชุดใดชุดหนึ่ง ซึ่งผลิตขึ้นโดยสิ่งมีชีวิตหรือระบบนั้นๆ

  • ลิปิดโอไมซ์ (Lipidomics) : การศึกษาในระดับใหญ่เกี่ยวกับเส้นทางและเครือข่ายของลิปิด โดยใช้เทคนิคแมสสเปกโทรเมตรี

โปรตีโอมิกส์

โปรตีโอม คือ โปรตีนทั้งหมดรวมทั้งการดัดแปลงที่เกิดขึ้นกับโปรตีนชุดใดชุดหนึ่ง ซึ่งผลิตโดยสิ่งมีชีวิตหรือระบบใดระบบหนึ่ง

  • โปรตีโอมิกส์ : การศึกษาโปรตีนในระดับใหญ่ โดยเฉพาะโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน โดยใช้เทคนิคแมสสเปกโทรเมตรี
    • เคโมโปรตีโอมิกส์ : ชุดเทคนิคที่ใช้ในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและโมเลกุลขนาดเล็ก
    • อิมมูโนโปรตีโอมิกส์ : การศึกษาชุดโปรตีนขนาดใหญ่ (โปรตีโอมิกส์) ที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน
    • นูไตรโปรตีโอมิกส์: การระบุเป้าหมายระดับโมเลกุลของส่วนประกอบทางโภชนาการและไม่ใช่ทางโภชนาการในอาหาร โดยใช้ข้อมูลโปรตีโอมิกส์แมสสเปกโทรเมตรีในการศึกษาการแสดงออกของโปรตีน
    • โปรตีโอจีโนมิกส์ : สาขาใหม่ของการวิจัยทางชีววิทยาที่อยู่ระหว่างกลางระหว่างโปรตีโอมิกส์และจีโนมิกส์ โดยใช้ข้อมูลโปรตีโอมิกส์ในการระบุตำแหน่งยีน
    • จีโนมิกส์เชิงโครงสร้าง : การศึกษาโครงสร้างสามมิติของโปรตีนทุกตัวที่ถูกเข้ารหัสโดยจีโนมที่กำหนด โดยใช้การผสมผสานระหว่างวิธีการทดลองและการสร้างแบบจำลอง

ไกลโคมิกส์

ไกลโคมิกส์คือการศึกษาอย่างครอบคลุมเกี่ยวกับไกลโคมซึ่งก็คือ น้ำตาลและคาร์โบไฮเดรต

ฟู้ดโอมิกส์

Foodomicsได้รับการนิยามโดยAlejandro Cifuentesในปี 2009 ว่าเป็น "สาขาวิชาที่ศึกษาด้านอาหารและโภชนาการผ่านการประยุกต์ใช้และการบูรณาการเทคโนโลยีโอมิกส์ขั้นสูงเพื่อปรับปรุงความเป็นอยู่ที่ดี สุขภาพ และความรู้ของผู้บริโภค" [ 24 ] [ 25 ]

ทรานสคริปโตมิกส์

ทรานสคริปโทมคือชุดของ โมเลกุล RNA ทั้งหมด ซึ่งรวมถึง mRNA, rRNA, tRNA และ RNA ที่ไม่เข้ารหัสอื่นๆ ที่ผลิตขึ้นในเซลล์หนึ่งเซลล์หรือกลุ่มเซลล์

  • ทรานสคริปโตมิกส์ : การศึกษาเกี่ยวกับทรานสคริปโตม โครงสร้าง และหน้าที่ของทรานส คริปโตม

เมตาโบโลมิกส์

เมตาโบโลมคือกลุ่มของโมเลกุลขนาดเล็กที่พบภายในเมทริกซ์ทางชีวภาพ

  • เมตาโบโลมิกส์ : การศึกษาทางวิทยาศาสตร์เกี่ยวกับกระบวนการทางเคมีที่เกี่ยวข้องกับสารเมตาโบไลต์ เป็น "การศึกษาอย่างเป็นระบบเกี่ยวกับร่องรอยทางเคมีเฉพาะที่กระบวนการในเซลล์แต่ละชนิดทิ้งไว้" ซึ่งเป็นการศึกษาโปรไฟล์ของสารเมตาโบไลต์โมเลกุลขนาดเล็ก
  • เมตาโบโนมิกส์ : การวัดเชิงปริมาณของการตอบสนองทางเมตาบอลิซึมแบบหลายพารามิเตอร์ที่เปลี่ยนแปลงตลอดเวลาของสิ่งมีชีวิตต่อสิ่งเร้าทางพยาธิสรีรวิทยาหรือการดัดแปลงทางพันธุกรรม

โภชนาการ เภสัชวิทยา และพิษวิทยา

  • จีโนมิกส์เชิงโภชนาการ : วิทยาศาสตร์ที่ศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างจีโนมมนุษย์ โภชนาการ และสุขภาพ
    • พันธุศาสตร์โภชนาการศึกษาผลกระทบของความแปรผันทางพันธุกรรมต่อปฏิสัมพันธ์ระหว่างอาหารและสุขภาพ โดยมีนัยสำคัญต่อกลุ่มย่อยที่มีความเสี่ยง
    • โภชนาการเชิงพันธุกรรม (Nutrigenomics) : การศึกษาผลกระทบของอาหารและส่วนประกอบของอาหารต่อการแสดงออกของยีน ศึกษาผลกระทบของสารอาหารต่อจีโนม โปรตีโอม และเมตาโบโลม
  • เภสัชพันธุศาสตร์ศึกษาผลกระทบของการเปลี่ยนแปลงต่างๆ ภายในจีโนมมนุษย์ที่มีต่อยา
  • เภสัชจุลชีววิทยาศึกษาผลกระทบของการเปลี่ยนแปลงภายในจุลินทรีย์ในร่างกายมนุษย์ต่อยา และในทางกลับกัน
  • พิษวิทยา เชิงพันธุกรรม (Toxicogenomics ): สาขาวิทยาศาสตร์ที่เกี่ยวข้องกับการรวบรวม การตีความ และการจัดเก็บข้อมูลเกี่ยวกับกิจกรรมของยีนและโปรตีนภายในเซลล์หรือเนื้อเยื่อเฉพาะของสิ่งมีชีวิตเพื่อตอบสนองต่อสารพิษ

วัฒนธรรม

ด้วยแรงบันดาลใจจากคำถามพื้นฐานในชีววิทยาวิวัฒนาการ ทีมงานฮาร์วาร์ดที่นำโดย Jean-Baptiste Michel และErez Lieberman Aidenได้สร้างคำศัพท์ใหม่ของอเมริกาว่าculturomicsเพื่อประยุกต์ใช้การรวบรวมและวิเคราะห์ข้อมูลขนาดใหญ่กับ การศึกษา ทางวัฒนธรรม[ 26 ]

เบ็ดเตล็ด

นักวิทยาศาสตร์ จากองค์การบริหารมหาสมุทรและบรรยากาศแห่งชาติ (NOAA)ใช้จุลชีววิทยาในการศึกษาระบบนิเวศทางทะเล
  • ไมโตอินเตอร์แอคโตม
  • จิตพันธุศาสตร์ (Psychogenomics ): กระบวนการประยุกต์ใช้เครื่องมืออันทรงพลังของจีโนมิกส์และโปรตีโอมิกส์เพื่อให้เข้าใจถึงพื้นฐานทางชีววิทยาของพฤติกรรมปกติและโรคของสมองที่แสดงออกในรูปของความผิดปกติทางพฤติกรรมได้ดียิ่งขึ้น การประยุกต์ใช้จิตพันธุศาสตร์ในการศึกษาการติดยาเสพติด เป้าหมายสูงสุดคือการพัฒนาวิธีการรักษาที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นสำหรับความผิดปกติเหล่านี้ ตลอดจนเครื่องมือวินิจฉัยที่เป็นกลาง มาตรการป้องกัน และในที่สุดก็คือการรักษาให้หายขาด
  • จีโนมิกส์ของเซลล์ต้นกำเนิด : ช่วยในด้านชีววิทยาของเซลล์ต้นกำเนิด จุดมุ่งหมายคือการสร้างเซลล์ต้นกำเนิดให้เป็นระบบแบบจำลองชั้นนำสำหรับการทำความเข้าใจชีววิทยาของมนุษย์และสภาวะของโรค และท้ายที่สุดเพื่อเร่งความก้าวหน้าไปสู่การนำไปใช้ในทางคลินิก
  • คอนเน็กโทมิกส์ : การศึกษาคอนเน็กโทม ซึ่งเป็นเครือข่ายการเชื่อมต่อของเซลล์ประสาททั้งหมดในสมอง
  • เซลโลมิกส์ : การวิเคราะห์และศึกษาเซลล์เชิงปริมาณโดยใช้วิธีการสร้างภาพทางชีวภาพและชีวสารสนเทศ
  • Tomomics: A combination of tomography and omics methods to understand tissue or cell biochemistry at high spatial resolution, typically using imaging mass spectrometry data.[27]
  • Viral metagenomics: Using omics methods in soil, ocean water, and humans to study the Virome and Human virome.
  • Ethomics: The high-throughput machine measurement of animal behaviour.[28]
  • Videomics (or vide-omics): A video analysis paradigm inspired by genomics principles, where a continuous image sequence (or video) can be interpreted as the capture of a single image evolving through time through mutations revealing 'a scene'.
  • Multiomics: Integration of different omics in a single study or analysis pipeline.[29]

Unrelated words in -omics

The word "comic" does not use the "omics" suffix; it derives from Greek "κωμ(ο)-" (merriment) + "-ικ(ο)-" (an adjectival suffix), rather than presenting a truncation of "σωμ(ατ)-".

Similarly, the word "economy" is assembled from Greek "οικ(ο)-" (household) + "νομ(ο)-" (law or custom), and "economic(s)" from "οικ(ο)-" + "νομ(ο)-" + "-ικ(ο)-". The suffix -omics is sometimes used to create names for schools of economics, such as Reaganomics.

See also

Notes

  1. Yamada R, Okada D, Wang J, Basak T, Koyama S (2021). "Interpretation of omics data analyses". Journal of Human Genetics. 66 (1): 93–102. doi:10.1038/s10038-020-0763-5. PMC 7728595. PMID 32385339.
  2. Subedi, Prabal; Moertl, Simone; Azimzadeh, Omid (2022). "Omics in Radiation Biology: Surprised but Not Disappointed". Radiation. 2: 124–129. doi:10.3390/radiation2010009.
  3. Holtorf, Hauke; Guitton, Marie-Christine; Reski, Ralf (2002). "Plant functional genomics". Naturwissenschaften. 89 (6): 235–249. Bibcode:2002NW.....89..235H. doi:10.1007/s00114-002-0321-3. PMID 12146788. S2CID 7768096.
  4. "scleroma, n: Oxford English Dictionary". Retrieved 2011-04-25.
  5. "rhizome, n: Oxford English Dictionary". Retrieved 2011-04-25.
  6. "-oma, comb. form: Oxford English Dictionary". Retrieved 2011-04-25.
  7. "Home: Oxford English Dictionary". Retrieved 2011-04-25.
  8. "biome, n.: Oxford English Dictionary". Retrieved 2011-04-25.
  9. Hans Winkler (1920). Verbreitung und Ursache der Parthenogenesis im Pflanzen – und Tierreiche. Verlag Fischer, Jena. p. 165. Ich schlage vor, für den haploiden Chromosomensatz, der im Verein mit dem zugehörigen Protoplasma die materielle Grundlage der systematischen Einheit darstellt den Ausdruck: das Genom zu verwenden ... " In English: " I propose the expression Genom for the haploid chromosome set, which, together with the pertinent protoplasm, specifies the material foundations of the species ...
  10. 12 Coleridge, H.; et alii. The Oxford English Dictionary
  11. Liddell, H.G.; Scott, R.; et alii. A Greek-English Lexicon [1996]. (Search at Perseus Project.)
  12. Grieve, IC; Dickens, NJ; Pravenec, M; Kren, V; Hubner, N; Cook, SA; Aitman, TJ; Petretto, E; Mangion, J (2008). "Genome-wide co-expression analysis in multiple tissues". PLOS ONE. 3 (12) e4033. Bibcode:2008PLoSO...3.4033G. doi:10.1371/journal.pone.0004033. ISSN 1932-6203. PMC 2603584. PMID 19112506.
  13. "O M E S Table". Gerstein Lab. Yale. 2002. Archived from the original on 15 April 2023.
  14. "Genomics - Global". www.who.int.
  15. O'Connell, Mary J.; McNally, Alan; McInerney, James O. (2017-03-28). "Why prokaryotes have pangenomes"(PDF). Nature Microbiology. 2 (4): 17040. doi:10.1038/nmicrobiol.2017.40. ISSN 2058-5276. PMID 28350002. S2CID 19612970.
  16. Abasi, Sara; Jain, Abhishek; Cooke, John P.; Guiseppi-Elie, Anthony (2023-05-04). "Electrically Stimulated Gene Expression under Exogenously Applied Electric Fields". Frontiers in Molecular Biosciences. 10. doi:10.3389/fmolb.2023.1161191. PMC 10192815. PMID 37214334.
  17. Tashiro, Satoshi; Lanctôt, Christian (2015-03-04). "The International Nucleome Consortium". Nucleus. 6 (2): 89–92. doi:10.1080/19491034.2015.1022703. PMC 4615172. PMID 25738524.
  18. Cremer, Thomas; Cremer, Marion; Hübner, Barbara; Strickfaden, Hilmar; Smeets, Daniel; Popken, Jens; Sterr, Michael; Markaki, Yolanda; Rippe, Karsten (2015-10-07). "The 4D nucleome: Evidence for a dynamic nuclear landscape based on co-aligned active and inactive nuclear compartments". FEBS Letters. 589 (20PartA): 2931–2943. Bibcode:2015FEBSL.589.2931C. doi:10.1016/j.febslet.2015.05.037. ISSN 1873-3468. PMID 26028501. S2CID 10254118.
  19. Berg, Gabriele; Rybakova, Daria; Fischer, Doreen; Cernava, Tomislav; Vergès, Marie-Christine Champomier; Charles, Trevor; Chen, Xiaoyulong; Cocolin, Luca; Eversole, Kellye; Corral, Gema Herrero; Kazou, Maria; Kinkel, Linda; Lange, Lene; Lima, Nelson; Loy, Alexander; MacKlin, James A.; Maguin, Emmanuelle; Mauchline, Tim; McClure, Ryan; Mitter, Birgit; Ryan, Matthew; Sarand, Inga; Smidt, Hauke; Schelkle, Bettina; Roume, Hugo; Kiran, G. Seghal; Selvin, Joseph; Souza, Rafael Soares Correa de; Van Overbeek, Leo; et al. (2020). "Microbiome definition re-visited: Old concepts and new challenges". Microbiome. 8 (1): 103. doi:10.1186/s40168-020-00875-0. PMC 7329523. PMID 32605663. Material was copied from this source, which is available under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
  20. 1 2 3 4 5 6 7 8 González, Adriana; Fullaondo, Asier; Odriozola, Adrián (2024-01-01), Martínez, Adrián Odriozola (บรรณาธิการ), "บทที่สอง - เทคนิค ขั้นตอน และการประยุกต์ใช้ในการวิเคราะห์ไมโครไบโอม" , Advances in Genetics , Advances in Host Genetics และไมโครไบโอมในฟีโนไทป์ที่เกี่ยวข้องกับวิถีชีวิต, 111 , Academic Press: 81– 115, doi : 10.1016/bs.adgen.2024.01.003 , PMID 38908906 , สืบค้น เมื่อ 2024-11-22 
  21. Kumar, Purnima S. (กุมภาพันธ์ 2021). "ไมโครไบโอมิกส์: เราเข้าใจผิดมาตลอดหรือเปล่า?" Periodontology 2000 . 85 (1): 8– 11. doi : 10.1111/prd.12373 . ISSN 1600-0757 . PMID 33226670 .  
  22. Lagier J, Armougom F, Million M และคณะ (ธันวาคม 2012). "จุลชีววิทยาเชิงวัฒนธรรม: การเปลี่ยนแปลงกระบวนทัศน์ในการศึกษาจุลชีววิทยาในลำไส้ของมนุษย์" . จุลชีววิทยาทางคลินิกและการติดเชื้อ . 18 (12): 1185– 1193. doi : 10.1111/1469-0691.12023 . 
  23. Greub, G. (ธันวาคม 2012). "Culturomics: แนวทางใหม่ในการศึกษาไมโครไบโอมของมนุษย์" . Clinical Microbiology and Infection . 18 (12): 1157– 1159. doi : 10.1111/1469-0691.12032 . PMID 23148445 . 
  24. Gunn, Sharon (27 พฤศจิกายน 2020). "Foodomics: วิทยาศาสตร์แห่งอาหาร" . Front Line Genomics . สืบค้นเมื่อ2 มิถุนายน 2022 .
  25. Cifuentes, Alejandro (ตุลาคม 2009). "การวิเคราะห์อาหารและ Foodomics" . Journal of Chromatography A . 1216 (43): 7109. doi : 10.1016/j.chroma.2009.09.018 . hdl : 10261/154212 . PMID 19765718 . สืบค้นเมื่อ2 มิถุนายน 2022 . 
  26. Michel, JB; Shen, YK; Aiden, AP; Veres, A; Gray, MK; Google Books Team; Pickett, JP; Hoiberg, D; Clancy, D; Norvig, P; Orwant, J (2011). "การวิเคราะห์เชิงปริมาณของวัฒนธรรมโดยใช้หนังสือดิจิทัลหลายล้านเล่ม" . Science . 331 (6014): 176– 182. Bibcode : 2011Sci...331..176M . doi : 10.1126/science.1199644 . ISSN 1095-9203 . PMC 3279742 . PMID 21163965 .   
  27. Cumpson, Peter; Fletcher, Ian; Sano, Naoko; Barlow, Anders (2016). "การวิเคราะห์หลายตัวแปรอย่างรวดเร็วของข้อมูล 3D ToF-SIMS: หน่วยประมวลผลกราฟิก (GPU) และการสุ่มตัวอย่างย่อยที่มีความคลาดเคลื่อนต่ำสำหรับการวิเคราะห์ส่วนประกอบหลักขนาดใหญ่"การวิเคราะห์พื้นผิวและส่วนต่อประสาน48 (12): 1328. doi : 10.1002/sia.6042 .
  28. Reiser, Michael (2009). "ยุคเอโทมิกส์?" Nature Methods . 6 (6): 413– 414. doi : 10.1038/nmeth0609-413 . PMID 19478800 . S2CID 5151763 .  
  29. Chu, Su H.; Huang, Mengna; Kelly, Rachel S.; Benedetti, Elisa; Siddiqui, Jalal K.; Zeleznik, Oana A.; Pereira, Alexandre; Herrington, David; Wheelock, Craig E.; Krumsiek, Jan; McGeachie, Michael (2019-06-18). "การบูรณาการข้อมูลเมตาโบโลมิกและข้อมูลโอไมซ์อื่นๆ ในการออกแบบการศึกษาตามประชากร: มุมมองทางระบาดวิทยา" Metabolites . 9 ( 6) E117. doi : 10.3390/metabo9060117 . ISSN 2218-1989 . PMC 6630728 . PMID 31216675 .   

อ่านเพิ่มเติม

  • Lederberg, Joshua ; McCray, Alexa T. (2 เมษายน 2544). "บทวิจารณ์: 'Ome Sweet 'Omics — คลังคำศัพท์ลำดับวงศ์ตระกูล" . The Scientist . 15 (7): 8 . สืบค้นเมื่อ1 มิถุนายน 2557 .
  • Hotz, Robert Lee (13 สิงหาคม 2555). "นี่คือเรื่องราวทางโอไมซ์: นักวิทยาศาสตร์ค้นพบคำต่อท้ายที่แพร่กระจาย" . วอลล์สตรีทเจอร์นัล .
  • Omics.org ถูกเก็บถาวรเมื่อวันที่ 2 มกราคม 2014 ที่Wayback Machineหน้าหลักของคำศัพท์และแนวคิดเกี่ยวกับ Omics น่าจะเป็นเว็บเพจแรกๆ ที่ถูกสร้างขึ้นเกี่ยวกับ Omics
  • List of omicsArchived 2015-07-09 at the Wayback Machine, including references/origins. Maintained by the (CHI) Cambridge Health Institute.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Omics&oldid=1354319375"

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ โอมิกส์

โอมิกส์คือลักษณะโดยรวมและการหาปริมาณของชุดโมเลกุลทางชีวภาพ ทั้งหมด และการตรวจสอบว่าโมเลกุลเหล่านั้นแปลความหมายอย่างไรในโครงสร้าง หน้าที่ และพลวัตของสิ่งมีชีวิตหรือกลุ่มสิ่งมีชีวิต

ต้นทาง

พจนานุกรม ภาษาอังกฤษฉบับออก ซ์ฟอร์ด ( OED ) จำแนกคำต่อท้าย -ome ออกเป็น 3 สาขาการใช้งานที่แตกต่างกัน:

การใช้งานปัจจุบัน

คำว่า "omes" นอกเหนือจาก " genome " ดั้งเดิมนั้นมีประโยชน์และได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางจากนักวิทยาศาสตร์ด้านการวิจัย คำว่า " proteomics " ได้รับการยอมรับอย่างดีในฐานะคำที่ใช้ศึกษา โปรตีน ในระดับใหญ่ คำว่า "omes" สามารถใช้เป็นคำย่อเพื่อสรุปขอบเขตของสาขาได้...

จีโนมิกส์

จีโนมิกส์ : การศึกษา จีโนม ของสิ่งมีชีวิต [ 14 ] จีโนมิกส์เชิงปัญญา : การศึกษาการเปลี่ยนแปลงใน กระบวนการทางปัญญา ที่เกี่ยวข้องกับลักษณะทางพันธุกรรม จีโนมิกส์เชิงเปรียบเทียบ :...