ไรโบโซมอาร์เอ็นเอหน่วยย่อยขนาดใหญ่ของแบคทีเรีย
23S rRNA แสดงถึงจำนวนนิวคลีโอไทด์ จำนวนเกลียว และโดเมน
ตัวระบุ
เครื่องหมาย	แบคทีเรีย LSU_rRNA
อาร์แฟม	RF02541
ข้อมูลอื่นๆ
ประเภทRNA	ยีน ; อาร์เอ็นเอ
โดเมน	แบคทีเรีย
ดังนั้น	SO:0001000
โครงสร้างPDB	พีดีบี

23S rRNAเป็นส่วนประกอบของหน่วยย่อยขนาดใหญ่ (50S) ของไรโบโซมแบคทีเรีย/อาร์เคียนที่มีความยาว 2,904 นิวคลีโอไทด์ (ใน E. coli) และเป็นส่วนประกอบของศูนย์ถ่ายโอนเปปไทด์ (PTC) [ 2 ] ^{23S rRNA แบ่ง}ออกเป็นหกโดเมนโครงสร้างทุติยภูมิที่เรียกว่า I-VI โดย 5S rRNA ที่สอดคล้องกันถือเป็นโดเมน VII ^{[ 3 ]} กิจกรรม ถ่ายโอนเปปไทด์ของไรโบโซมอยู่ในโดเมน V ของ rRNA นี้ ซึ่งเป็นตำแหน่งการจับที่พบได้บ่อยที่สุดสำหรับยาปฏิชีวนะที่ยับยั้งการแปล ทำให้เป็นเป้าหมายสำหรับวิศวกรรมไรโบโซม^{[ 2 ]} คลอ แรมเฟนิคอล ซึ่งเป็นสมาชิกที่รู้จักกันดีในกลุ่มยาปฏิชีวนะนี้ออกฤทธิ์โดยการยับยั้งการสร้างพันธะเปปไทด์ โดยการศึกษาโครงสร้างสามมิติเมื่อเร็วๆ นี้แสดงให้เห็นตำแหน่งการจับที่แตกต่างกันสองตำแหน่งขึ้นอยู่กับชนิดของไรโบโซม การกลายพันธุ์จำนวนมากในโดเมนของ 23S rRNA ที่มีกิจกรรมการถ่ายโอนเปปไทด์ส่งผลให้เกิดความต้านทานต่อยาปฏิชีวนะ^{[ 4 ]} ยีน 23S rRNA โดยทั่วไปมีความแปรผันของลำดับสูงกว่า รวมถึงการแทรกและ/หรือการลบ เมื่อเทียบกับ rRNA อื่นๆ^{[ 5 ]}

โฮโมล็อกของยูคาริโอตของ 23S LSU rRNAคือ28S ribosomal RNAโดยมีบริเวณที่เติมเต็มด้วย^5.8S ribosomal RNA [ ^{6 ]}

โดยทั่วไป rRNA มีหน้าที่สำคัญในการถ่ายโอนหมู่เปปไทด์ แกนกระตุ้นของไรโบโซมมีบทบาทในการจัดเรียงพันธะเปปไทด์ ทั้งเปปไทด์-tRNA และอะมิโนเอซิล-tRNA มีความสำคัญต่อการสังเคราะห์โปรตีนและการตอบสนองต่อการถ่ายโอนหมู่เปปไทด์

อย่างไรก็ตาม ตำแหน่ง 23S rRNA (G2252, A2451, U2506 และ U2585) มีหน้าที่สำคัญในการจับ tRNA ในตำแหน่ง P ของหน่วยย่อยไรโบโซมขนาดใหญ่^{[ 7 ]}นิวคลีโอไทด์ที่ดัดแปลงเหล่านี้ในตำแหน่ง P สามารถยับยั้งการจับของ peptidyl-tRNA ได้ การดัดแปลง U2555 ยังสามารถขัดขวางการถ่ายโอน peptidyl-tRNA ไปยังพูโรไมซินได้อีกด้วย ยิ่งไปกว่านั้น การดัดแปลงทางเคมีของครึ่งหนึ่งของตำแหน่งเหล่านี้ G2251, G2253, A2439 และ U2584 ไม่สามารถป้องกันการจับของ tRNA ได้ Peptidyl-tRNA ของหน่วยย่อย 50S ซึ่งจับกับตำแหน่ง P จะรักษาตำแหน่ง 8 ตำแหน่งของ 23S rRNA จากการดัดแปลงทางเคมี^{[ 7 ]}ในทางกลับกัน การกลายพันธุ์ใน 23S rRNA อาจส่งผลกระทบต่อการเจริญเติบโตของเซลล์ได้เช่นกัน การกลายพันธุ์ A1912G, A1919G และ Ψ1917C ทำให้เกิดลักษณะการเจริญเติบโตที่รุนแรงและขัดขวางการแปล ในขณะที่การกลายพันธุ์ A1916G ทำให้เกิดลักษณะการเจริญเติบโตแบบง่ายๆ และนำไปสู่ข้อบกพร่องในหน่วยย่อย 50S ^{[ 8 ]}

RNA ไรโบโซม 23S ประกอบด้วยโดเมน 6 โดเมนที่สร้างเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุลที่ซับซ้อน บริเวณสายเดี่ยวตรงกลางเชื่อมต่อโดเมนทั้งหมดผ่านการจับคู่เบสของครึ่งทั้งสอง ทำให้เกิด Helix 26a บางคนถือว่า Helix 26a เป็นโดเมน 0 เนื่องจากทำหน้าที่เป็นแกนกลางและหน่วยการพับที่กะทัดรัด การเปรียบเทียบลำดับ RNA ไรโบโซม 23S และ 28S ในสายพันธุ์ต่างๆ แสดงให้เห็นถึงการอนุรักษ์ Helix 26a เกลียวยังคงให้การสนับสนุนในฐานะกระดูกสันหลังของสถาปัตยกรรมโดเมน^{[ 9 ]}

ไรโบโซมคลอโรพลาสต์จากพืช "ชั้นสูง" มี rRNA 4.5S เพิ่มเติมที่สร้างขึ้นจากการแตกตัวของ 23S โดยตั้งอยู่ทางด้าน 3' ของ 23S ในโอเปรอน rRNAและสอดคล้องกับปลาย 3' ของ rRNA 23S ที่ไม่แตกตัว^{[ 10 ]}

• ลวดลายเมทิลอาร์เอ็นเอ 23S
• แอลเอสยู อาร์เอ็นเอ

• รหัสเบสเทียมสำหรับปมเทียมของไรโบโซมอาร์เอ็นเอ 23S (PKB00148)