ในปี ค.ศ. 1847 โรงพยาบาลแห่งแรกสำหรับเขตเมืองโอ๊คแลนด์ก่อตั้งขึ้นภายใต้การควบคุมของรัฐบาลประจำจังหวัดโอ๊คแลนด์โรงพยาบาลได้รับการบริหารจัดการโดยรัฐบาลแห่งชาติหลังจากการยกเลิกจังหวัดในปี ค.ศ. 1877 จนถึงปี ค.ศ. 1885 เมื่อมีการผ่านพระราชบัญญัติโรงพยาบาลและสถาบันการกุศล ซึ่งจัดตั้งคณะกรรมการโรงพยาบาลโอ๊คแลนด์ที่มาจากการเลือกตั้งในท้องถิ่น^{[ 5 ]}โทมัส มัวร์ ฟิลสันเป็นผู้ดูแลโรงพยาบาลตั้งแต่ปี ค.ศ. 1859 ถึง ค.ศ. 1883 ^{[ 6 ]}

ในปี ค.ศ. 1877 อาคารใหม่ในสไตล์อิตาเลียนถูกสร้างขึ้นด้วยงบประมาณ 25,000 ปอนด์ ออกแบบโดยฟิลิป เฮราพาธสถาปนิกของรัฐบาลประจำจังหวัด โรงพยาบาลแห่งใหม่นี้บริหารงานโดยทีเอ็ม ฟิลสัน และเป็นที่รู้จักในด้านการรับผู้ป่วยยากไร้จำนวนมาก แต่ด้วยเหตุนี้จึงประสบปัญหาขาดแคลนบุคลากรและแออัดอยู่ตลอดเวลานอกจากนี้ยังมีการร้องเรียนเกี่ยวกับการฝึกอบรมบุคลากรที่จำกัด ซึ่งเปลี่ยนแปลงไปก็ต่อเมื่อมีการจ้างหัวหน้าพยาบาลคนใหม่แอนนี่ คริสป์ในปี ค.ศ. 1883 ^{[ 7 ]} เธอ ได้รับการฝึกอบรมตามแบบอย่างใหม่ของฟลอเรนซ์ ไนติงเกลและได้รับการยกย่องว่าเปลี่ยนโรงพยาบาลจาก 'สถานพยาบาลสำหรับผู้สูงอายุที่เป็นโรคพิษสุราเรื้อรัง' ให้กลายเป็นโรงพยาบาลที่แท้จริงและริเริ่มการฝึกอบรมพยาบาลอย่างจริงจัง^{[ 8 ]}เธอมีตำแหน่งเป็นหัวหน้าพยาบาลหญิง และได้รับพระราชทานเครื่องราชอิสริยาภรณ์กาชาดหลวงในปี ค.ศ. 1894 ^{[ 9 ]}

อาคาร Herapath ถูกรื้อถอนในปี พ.ศ. 2507 เพื่อสร้างทางให้กับโครงสร้างใหม่ที่ออกแบบโดยสถาปนิกStephenson & Turnerซึ่งแล้วเสร็จในปี พ.ศ. 2510 และยังคงอยู่จนถึงปัจจุบัน^{[ 8 ]}

ในช่วงการปฏิรูปด้านสุขภาพของระบบสาธารณสุขของนิวซีแลนด์ในช่วงต้นทศวรรษ 1990 โรงพยาบาลโอ๊คแลนด์ดำเนินการในรูปแบบธุรกิจ - ตามแบบอย่างของรัฐวิสาหกิจของนิวซีแลนด์กล่าวคือ มีคำสั่งให้สร้างผลกำไร ตามนโยบายนี้ โรงพยาบาลโอ๊คแลนด์จึงมีชื่ออย่างเป็นทางการว่า^Auckland Crown Health Enterprise [ ^{10 ]}

โรงพยาบาลปัจจุบันซึ่งเปิดให้บริการในปี 2546 เป็นการรวมโรงพยาบาลแยกกัน 4 แห่งก่อนหน้านี้ ได้แก่ โรงพยาบาลโอ๊คแลนด์ (การดูแลผู้ใหญ่เฉียบพลัน) โรงพยาบาลสตาร์ชิป (การดูแลเด็กเฉียบพลัน) โรงพยาบาลกรีนเลน (การดูแลหัวใจและทรวงอก) และโรงพยาบาลสตรีแห่งชาติ (แผนกคลอดบุตร ทารกแรกเกิด และสูติศาสตร์และนรีเวชวิทยา ) ^{[ 2 ]}

โรงพยาบาลตั้งอยู่ในอาคารมูลค่า 180 ล้านดอลลาร์นิวซีแลนด์ ซึ่งสร้างขึ้นระหว่างปี 2000 ถึง 2003 ^{[ 11 ]}อาคารมีความสูง 9 ชั้น (รวมโรงงาน 10 ชั้น) น้อยกว่าส่วนเก่าของโรงพยาบาล 5 ชั้น ซึ่งปัจจุบันกลายเป็นอาคารสนับสนุน โครงสร้างใหม่มีพื้นที่ 75,575 ตารางเมตร^{[ 11 ] เป็น}หนึ่งในอาคารสาธารณะที่ใหญ่ที่สุดของนิวซีแลนด์ ออกแบบโดยJasmaxร่วมกับ McConnel Smith และ Johnson Architects Sydney และสร้างโดยFletcher Construction ^{[ 12 ]}

ตั้งแต่ปี 2001 จนถึงปี 2022 โรงพยาบาล Auckland City Hospital เป็นส่วนหนึ่งของ Auckland District Health Board เมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 2022 Te Whatu Ora – Health New ZealandและTe Aka Whai Ora – Māori Health Authorityได้กลายเป็นหน่วยงานด้านสุขภาพแห่งชาติแห่งใหม่ของ Aotearoa (นิวซีแลนด์) และ Auckland DHB ในฐานะหน่วยงานก็ถูกยุบและกลายเป็นส่วนหนึ่งของ Health New Zealand