รหัสการตั้งชื่อสากลของโปรคาริโอต ( ICNP ) หรือรหัสโปรคาริโอตซึ่งเดิมคือรหัสการตั้งชื่อสากลของแบคทีเรีย ( ICNB ) หรือรหัสแบคทีเรียวิทยา ( BC ) กำหนดชื่อทางวิทยาศาสตร์สำหรับแบคทีเรียและอาร์เคีย [ ^{1 ] [ 2 ] โดย}ระบุถึงกฎสำหรับการตั้งชื่ออนุกรม วิธานของแบคทีเรียตามลำดับชั้นสัมพัทธ์ ดังนั้นจึงเป็นหนึ่งในรหัสการตั้งชื่อทางชีววิทยา

เดิมทีประมวลกฎการตั้งชื่อทางพฤกษศาสตร์สากลนั้นครอบคลุมถึงแบคทีเรีย และยังคงมีการอ้างอิงถึงแบคทีเรียจนกระทั่งถูกยกเลิกในการประชุมพฤกษศาสตร์นานาชาติ ปี 1975 ประมวลกฎการตั้งชื่อแบคทีเรียฉบับแรกได้รับการอนุมัติในการประชุมจุลชีววิทยานานาชาติครั้งที่ 4 ในปี 1947 แต่ต่อมาก็ถูกยกเลิกไป

ฉบับล่าสุดที่พิมพ์ในรูปแบบหนังสือคือฉบับแก้ไขปี 1990 ^{[ 3 ]}แต่หนังสือเล่มนี้ไม่ได้แสดงถึงกฎปัจจุบัน ฉบับแก้ไขปี 2008 และ 2022 ได้รับการตีพิมพ์ในวารสาร International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM) ^{[ 2 ]}กฎเหล่านี้ได้รับการดูแลโดยคณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยระบบอนุกรมวิธานของโปรคาริโอต (ICSP; เดิมคือคณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยระบบแบคทีเรียวิทยา ICSB)

เกณฑ์พื้นฐานสำหรับชื่อแบคทีเรียคือ Approved Lists ^{[ 4 ]}โดยมีจุดเริ่มต้นในปี 1980 ชื่อแบคทีเรียใหม่จะได้รับการตรวจสอบโดย ICSP ว่าสอดคล้องกับกฎการตั้งชื่อและเผยแพร่ใน IJSEM

ตั้งแต่ปี 1975 แบคทีเรียส่วนใหญ่ถูกจัดอยู่ในรหัสทางแบคทีเรียวิทยา อย่างไรก็ตามไซยาโนแบคทีเรียยังคงอยู่ภายใต้รหัสทางพฤกษศาสตร์ ตั้งแต่ปี 1999 ไซยาโนแบคทีเรียจึงอยู่ภายใต้ทั้งรหัสทางพฤกษศาสตร์และรหัสทางแบคทีเรียวิทยา สถานการณ์นี้ทำให้เกิดปัญหาการตั้งชื่อสำหรับไซยาโนแบคทีเรีย^{[ 5 ] [ 6 ]}ภายในปี 2020 มีข้อเสนอสามประการสำหรับวิธีการแก้ไขสถานการณ์นี้:

1. ยกเว้นไซยาโนแบคทีเรียออกจากรหัสแบคทีเรีย^{[ 7 ]}
2. ใช้รหัสแบคทีเรียกับไซยาโนแบคทีเรียทั้งหมด^{[ 8 ]}
3. ถือว่าสิ่งพิมพ์ที่ถูกต้องตามหลักเกณฑ์ทางพฤกษศาสตร์เป็นสิ่งพิมพ์ที่ถูกต้องตามหลักเกณฑ์ทางแบคทีเรียวิทยา^{[ 9 ]}

ในปี 2021 ICSP ได้จัดการลงคะแนนอย่างเป็นทางการเกี่ยวกับข้อเสนอทั้งสามข้อ และได้เลือกตัวเลือกที่สาม^{[ 10 ]}

ตั้งแต่ปี 2001 เมื่อมีการอธิบายสายพันธุ์แบคทีเรียหรืออาร์เคียใหม่ จะต้องมีการกำหนดสายพันธุ์ต้นแบบ^{[ 11 ]}สายพันธุ์ต้นแบบคือวัฒนธรรมที่มีชีวิตซึ่งชื่อวิทยาศาสตร์ของสิ่งมีชีวิตนั้นถูกกำหนดไว้อย่างเป็นทางการ สำหรับชื่อสายพันธุ์ใหม่ที่จะได้รับการเผยแพร่อย่างถูกต้อง สายพันธุ์ต้นแบบจะต้องถูกฝากไว้ในคอลเลกชันวัฒนธรรม สาธารณะ ในอย่างน้อยสองประเทศที่แตกต่างกัน^{[ 12 ]} ก่อนปี 2001 สายพันธุ์สามารถกำหนดสายพันธุ์ต้นแบบได้โดยใช้คำอธิบาย ตัวอย่างที่เก็บรักษาไว้ หรือภาพประกอบ^{[ 11 ]}มีสายพันธุ์ต้นแบบเพียงสายพันธุ์เดียวสำหรับแต่ละสายพันธุ์โปรคาริโอต แต่คอลเลกชันวัฒนธรรมที่แตกต่างกันอาจกำหนดชื่อเฉพาะสำหรับสายพันธุ์เดียวกัน ตัวอย่างเช่น สายพันธุ์ต้นแบบของE. coli (เดิมคือสายพันธุ์ U5/41) เรียกว่า ATCC 11775 โดยAmerican Type Culture Collection , DSM 30083 โดยGerman Collection of Microorganisms and Cell Cultures , JCM 1649 โดยJapan Collection of Microorganismsและ LMG 2092 โดยBelgian Coordinated Collections of Microorganisms ^{[ 13 ] [ 14 ]}

เมื่อไม่สามารถเพาะเลี้ยงสปีชีส์โปรคาริโอตในห้องปฏิบัติการได้ (และด้วยเหตุนี้จึงไม่สามารถฝากไว้ในคอลเลกชันวัฒนธรรมได้) อาจได้รับ ชื่อ Candidatus ชั่วคราว แต่จะไม่ถือว่าได้รับการตีพิมพ์อย่างถูกต้อง^{[ 15 ]}ตั้งแต่ปี 2024 ชื่อเหล่านี้สามารถ "ได้รับการตีพิมพ์อย่างถูกต้อง" และกลายเป็น "ถูกต้องตามกฎหมาย" และ "ถูกต้องแม่นยำ" ซึ่งต้องใช้ชื่อที่ตรงตามข้อกำหนดที่มีอยู่ส่วนใหญ่สำหรับการตีพิมพ์ที่ถูกต้อง (และในทำนองเดียวกันสำหรับความถูกต้องตามกฎหมายและความแม่นยำ) ยกเว้นการฝากวัฒนธรรมในกฎข้อ 30 สามารถแทนที่ด้วยวัฒนธรรมที่มีชีวิตที่ไม่ตรงตามข้อกำหนดของกฎข้อ 30 ตัวอย่างที่เก็บรักษาไว้ จีโนมที่จัดลำดับแล้วที่ฝากไว้ในINSDC หรือลำดับยีนเดี่ยวที่ฝากไว้ใน INSDC ชื่อ Candidatusที่ถูกต้องตามกฎหมายจะแข่งขันกันเองเพื่อลำดับความสำคัญ แต่จะไม่แข่งขันกับชื่อที่ถูกต้องตามกฎหมาย "จริง" ^{[ 16 ]}

ก่อนกลไกการเผยแพร่ที่รับรองความถูกต้อง การตรวจสอบความถูกต้องของ ชื่อ Candidatusตกอยู่ภายใต้ประมวลกฎการตั้งชื่อโปรคาริโอตที่อธิบายจากข้อมูลลำดับ ( SeqCode ) ซึ่งเผยแพร่โดยสมาคมนิเวศวิทยาจุลินทรีย์ระหว่างประเทศ ซึ่งเป็น องค์กรที่แยกต่างหากจาก ICSP ในปี 2022 ^{[ 17 ]}

ความแตกต่างที่เห็นได้ชัดในกฎเกณฑ์:

• ไม่อนุญาตให้ใช้เครื่องหมายยัติภังค์ ชื่อที่เคยใช้เครื่องหมายยัติภังค์และคำประสมใหม่จะต้องเชื่อมเข้าด้วยกันเฉยๆ^{[ 18 ] : กฎข้อ 12a}
• ไม่อนุญาตให้ใช้เครื่องหมายกำกับเสียง มีตัวอักษรสองตัวที่ใช้แทนตัวอักษรที่มีเครื่องหมายกำกับเสียงบางตัว^{[ 18 ] : กฎข้อ 64} ไม่มีข้อยกเว้นที่ชัดเจนสำหรับเครื่องหมายกำกับเสียง (ë) เหมือนในกฎข้อ 60.7 ของรหัสเซินเจิ้น^{[ 19 ]}

ความแตกต่างที่สำคัญในแนวทางปฏิบัติที่แนะนำ:

• แนะนำให้ระบุชื่อวิทยาศาสตร์ให้แตกต่างกัน "โดยใช้แบบอักษรที่แตกต่างกัน เช่น ตัวเอียง หรือโดยวิธีอื่น" การใช้ตัวเอียงไม่ใช่ข้อบังคับ^{[ 18 ] : 4.A.(3)}
  • ใน ICNP ไม่มีกฎเกณฑ์เฉพาะสำหรับการใช้ตัวเอียงตามลำดับชั้นทางอนุกรมวิธาน แม้ว่าสำนักพิมพ์หลายแห่งจะเลือกใช้ตัวเอียงเฉพาะสกุลและชนิดเท่านั้น แต่ในวารสารIJSEM ที่เกี่ยวข้อง และในเนื้อหาของ ICNP เองนั้นจะใช้ตัวเอียงกับชื่อวิทยาศาสตร์ทั้งหมด (ยกเว้นการจัดรูปแบบเฉพาะของสกุล Candidatus )
  • คำหรือตัวย่อภาษาละตินที่ตามหลังชื่อวิทยาศาสตร์ที่เป็นตัวเอียงไม่ควรใช้ตัวเอียง อาจใช้แบบอักษรโรมัน (ปกติ) หรือตัวหนาหากต้องการแยกความแตกต่าง^{[ 18 ] : กฎ 33a:หมายเหตุ 2}
• คำศัพท์อ้างอิงผู้เขียนexจะต้องใช้ในวงเล็บ ในรูปแบบ " Taxon (ex ก่อนหน้า) ภายหลัง " การแก้ไขในภายหลังควรอ้างอิงในรูปแบบ " Taxon (ภายหลัง ex ก่อนหน้า) ภายหลัง " nonก็ควรอยู่ในวงเล็บเช่นกัน เช่น " Achromobacter Yabuuchi and Yano 1981 (non Achromobacter Bergey et al. 1923 )" ^{[ 18 ] : 4.B.(3)}

• Buchanan, RE และ Ralph St. John-Brooks (มิถุนายน 1947) (บรรณาธิการ) ประมวลกฎการตั้งชื่อทางแบคทีเรียที่เสนอ พัฒนาจากข้อเสนอที่ได้รับการอนุมัติจากคณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยการตั้งชื่อทางแบคทีเรียในการประชุมสภาจุลชีววิทยานานาชาติครั้ง ที่3 ได้รับอนุญาตให้ตีพิมพ์ในการประชุมใหญ่ หน้า 61 สำนักพิมพ์วิทยาลัยรัฐไอโอวา เอมส์ ไอโอวา สหรัฐอเมริกาHathiTrust
• Buchanan RE, St, John-Brooks R., Breed RS (1948). "รหัสการตั้งชื่อแบคทีเรียสากล"วารสารแบคทีเรียวิทยา 55 ( 3): 287– 306. doi : 10.1128/jb.55.3.287-306.1948 . PMC  518444 . PMID  16561459 .{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list ( link )พิมพ์ซ้ำในปี 1949, Journal of General Microbiology 3, 444–462.
• คณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยการตั้งชื่อทางแบคทีเรียวิทยา (มิถุนายน 1958) ประมวลกฎการ ตั้งชื่อแบคทีเรียและไวรัสระหว่างประเทศเอมส์ สำนักพิมพ์วิทยาลัยรัฐไอโอวาBHL
• Lapage, SP, Sneath, PHA, Lessel, EF, Skerman, VBD, Seeliger, HPR & Clark, WA (1975). ประมวล กฎการตั้งชื่อแบคทีเรียสากล ฉบับแก้ไขปี 1975 สมาคมจุลชีววิทยาแห่งอเมริกา วอชิงตัน ดี.ซี.
• Lapage, SP, Sneath, PHA, Lessel, EF, Skerman, VBD, Seeliger, HPR & Clark, WA (1992). ประมวล กฎการตั้งชื่อแบคทีเรียสากล ประมวลกฎทางแบคทีเรียวิทยา ฉบับแก้ไขปี 1990 สมาคมจุลชีววิทยาแห่งอเมริกา วอชิงตันดี.ซี. ลิงก์
• Parker, CT, Tindall, BJ & Garrity, GM, บรรณาธิการ (2019). รหัสการตั้งชื่อสากลของโปรคาริโอต รหัสโปรคาริโอต (ฉบับแก้ไขปี 2008)วารสารนานาชาติว่าด้วยจุลชีววิทยาเชิงระบบและวิวัฒนาการ 69(1A): S1–S111. doi: 10.1099/ijsem.0.000778
• Oren, Aharon; Arahal, David R.; Göker, Markus; Moore, Edward RB; Rossello-Mora, Ramon; Sutcliffe, Iain C. (1 พฤษภาคม 2023). "รหัสการตั้งชื่อสากลของโปรคาริโอต รหัสโปรคาริโอต (ฉบับแก้ไข 2022)"วารสารนานาชาติว่าด้วยระบบและวิวัฒนาการจุลชีววิทยา 73 ( 5a). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . PMID  37219928 .

• อภิธานศัพท์การตั้งชื่อทางวิทยาศาสตร์
• คณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยการจำแนกประเภทไวรัส
• สมาคมจุลชีววิทยา
• หลักเกณฑ์การตั้งชื่อจุลินทรีย์โปรคาริโอตที่อธิบายจากข้อมูลลำดับดีเอ็นเอ – ระบบแยกต่างหาก

• วารสารนานาชาติจุลชีววิทยาเชิงระบบและวิวัฒนาการออนไลน์
• Tindall BJ (กรกฎาคม 1999). "ความเข้าใจผิดเกี่ยวกับรหัสแบคทีเรีย". Int. J. Syst. Bacteriol . 49 (3): 1313– 6. doi : 10.1099/00207713-49-3-1313 . PMID  10425796 .
• รายชื่อชื่อจุลินทรีย์โปรคาริโอตพร้อมสถานะในระบบการตั้งชื่อ
• ค้นหาข้อมูลเกี่ยวกับระบบการตั้งชื่อของสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียว (Prokaryotic Nomenclature) โดย NamesforLife