ในปี 1897 วิลสันออกจากบริสตอลและย้ายไปคาร์ดิฟฟ์ [ ^{5 ] เขา}เป็นแฟนกีฬาคริกเก็ตและในไม่ช้าก็เข้าไปมีส่วนร่วมกับสโมสรคริกเก็ตริเวอร์ไซด์ เขาและเจ้าหน้าที่ของสโมสรกังวลว่าทีมคริกเก็ตจะพลัดพรากกันในช่วงฤดูหนาว วิลสันสังเกตเห็นว่าฟุตบอลสมาคมได้หยั่งรากในบ้านเกิดของเขาที่บริสตอล โดยบริสตอลซิตี้และบริสตอลอีสต์วิลล์โรเวอร์สต่างก็กลายเป็นทีมอาชีพในปี 1897 วิลสันจึงเกิดความคิดที่จะจัดตั้งทีมฟุตบอลในเมืองคาร์ดิฟฟ์ที่เขาอาศัยอยู่ และโฆษณาความคิดนี้ในริเวอร์ไซด์พาวิลเลียน การประชุมครั้งแรกจัดขึ้นที่ 1 โคลด์สตรีมเทอร์เรซ แต่มีผู้เข้าร่วมน้อยมากเพียงห้าคน อย่างไรก็ตาม การประชุมครั้งที่สองมีสมาชิกเข้าร่วมประมาณสิบสองคน และต่อมาริเวอร์ไซด์เอเอฟซีก็ก่อตั้งขึ้นในปี 1899 คณะกรรมการซึ่งมีบาร์ทลีย์ วิลสันได้รับเลือกเป็นเลขานุการประกอบด้วย เอเจ สโตน, จอร์จ เพียร์ซ, จิมมี่ เรดเฟิร์น, สแตนลีย์ บาร์เร็ตต์, แอนดรูว์ ชีแอน, อีดับบลิว โฮลเดอร์, บิลลี่ แคนเตอร์ และแฟรงค์ เบอร์ฟิตต์ กลุ่มตัดสินใจเลือกชุดเสื้อสี่ส่วนสีช็อกโกแลตและสีอำพัน และกำหนดค่าธรรมเนียมสมาชิกรายปีไว้ที่ 2 ชิลลิง 6 เพนนี^{[ 6 ]}

สโมสรก่อตั้งขึ้นช้าเกินไปที่จะเข้าร่วมลีกคาร์ดิฟฟ์แอนด์ดิสทริกต์ในฤดูกาล 1899–1900 และเริ่มต้นด้วยการเล่นแมตช์กระชับมิตรกับทีมท้องถิ่น โดยแมตช์แรกเกิดขึ้นในวันที่ 7 ตุลาคม 1899 กับแบร์รีเวสต์เอนด์^{[ 6 ]}วิลสันทำหน้าที่เลขานุการสโมสรควบคู่ไปกับงานประจำที่โรงพิมพ์ในท้องถิ่น เขาใช้เวลาว่างส่วนใหญ่ที่สำนักงานใหญ่ของสโมสร ซึ่งเป็นคอกม้าร้างในถนนมาร์ค ห่างจากบ้านของเขา ไม่ถึง 100 หลา (91 เมตร) ^{[ 7 ]}ในปี 1900 สโมสรได้รับการยอมรับให้เข้าร่วมลีกคาร์ดิฟฟ์แอนด์ดิสทริกต์เพื่อเล่นในดิวิชั่นที่มีการจัดระเบียบเป็นครั้งแรก^{[ 8 ]}วิลสันดูแลการรวมทีมริเวอร์ไซด์และริเวอร์ไซด์อัลเบียนในปี 1902 สามปีต่อมา คาร์ดิฟฟ์ได้รับการประกาศอย่างเป็นทางการให้เป็นเมืองโดยพระเจ้าเอ็ดเวิร์ดที่ 7 และวิลสันได้ยื่นเรื่องต่อ สมาคมฟุตบอลเซาท์เวลส์และมอนมัธเชอร์ (SWMFA ) ทันทีเพื่อเปลี่ยนชื่อทีมเป็นคาร์ดิฟฟ์ซิตี้อย่างไรก็ตาม สโมสรถูกพิจารณาว่าเล่นในระดับที่ต่ำเกินไปที่จะเป็นตัวแทนของเมือง เพื่อปรับปรุงสถานะของสโมสร คณะกรรมการจึงยื่นสมัครเข้ารับการเลือกตั้งในลีกสมัครเล่นเซาท์เวลส์ได้สำเร็จ^{[ 9 ]} 

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2451 Riverside AFC ได้รับอนุญาตอย่างเป็นทางการจาก SWMFA ให้ใช้ชื่อ Cardiff City แม้ว่าจะได้รับข้อแม้ว่าหากมีสโมสรอาชีพเกิดขึ้นในเมือง สโมสรนั้นจะต้องสละชื่อดังกล่าว^{[ 10 ]}

เมื่อเปลี่ยนชื่อใหม่แล้ว วิลสันพยายามใช้ประโยชน์จากความนิยมที่เพิ่มขึ้นของกีฬาชนิดนี้ อย่างไรก็ตาม เมื่อแฮร์รี่ แบรดชอว์ เลขาธิการของเซาเทิร์นฟุตบอลลีก ติดต่อมา สโมสรก็ถูกบังคับให้ปฏิเสธข้อเสนอเข้าร่วมลีกเนื่องจากสิ่งอำนวยความสะดวกในสนามโซเฟียการ์เดนส์ ไม่ดีพอ ^{[ 10 ]}สโมสรจัดการแข่งขันกระชับมิตรกับหลายทีมจากเดอะฟุตบอลลีกได้แก่บริสตอลซิตี้มิดเดิลสโบโรห์และคริสตัลพาเลซซึ่งทั้งหมดเดินทางมาที่คาร์ดิฟฟ์ วิลสันและคณะกรรมการของสโมสรได้รับกำลังใจจากจำนวนผู้ชมในการแข่งขัน และตัดสินใจที่จะมุ่งเน้นไปที่การหาสนามที่เหมาะสม เขาติดต่อบิวต์เอสเตทโดยหวังว่าจะซื้อที่ดินที่เล็ควิธคอมมอน แต่จอห์น แมนเดอร์ สมาชิกสภาท้องถิ่น กลับเสนอที่ดินบนถนนสโลเปอร์ให้สโมสร พร้อมกับแรงจูงใจเพิ่มเติมว่าเทศบาลเมืองคาร์ดิฟฟ์จะช่วยเหลือในการก่อสร้างสนาม สโมสรกลายเป็นผู้เช่าที่ดินเมื่อวันที่ 1 เมษายน 1909 และเริ่มปรับพื้นที่ทิ้งขยะเดิมให้เรียบเพื่อสร้างสนามฟุตบอลแห่งใหม่^{[ 12 ]}

วิลสันและทนายความนอร์แมน โรเบิร์ตสัน ได้จดทะเบียนบริษัท Cardiff City Association Football Club Ltd อย่างเป็นทางการเมื่อวันที่ 21 เมษายน พ.ศ. 2453 โดยระบุสำนักงานของโรเบิร์ตสันเป็นที่อยู่จดทะเบียนของสโมสร^{[ 13 ]} ในปี พ.ศ. 2453 คาร์ดิฟฟ์ซิตี้ได้กลายเป็นสโมสรอาชีพ โดยเข้าร่วมSouthern Football Leagueหลังจากที่สโมสรเข้าร่วม เฮอร์เบิร์ต เฟรว์ โจนส์ ผู้อำนวยการสโมสร ได้ยกย่องวิลสันว่ามีส่วนสำคัญในการพัฒนาสโมสรจากทีมสมัครเล่นที่มีสมาชิก 12 คน ไปสู่สโมสรอาชีพอย่างเต็มตัวในเวลาเพียงกว่าทศวรรษ โดยกล่าวว่า "บาร์ตเป็นผู้ขับเคลื่อนหลักเสมอ คาร์ดิฟฟ์ซิตี้จะไม่มีวันเป็นคาร์ดิฟฟ์ซิตี้ได้หากไม่มีบาร์ต" ^{[ 8 ]}ในตอนแรก วิลสันได้รับมอบหมายให้ดูแลทีมชุดใหญ่ และได้ทำการซื้อขายนักเตะครั้งแรกในประวัติศาสตร์ของสโมสร โดยเซ็นสัญญากับแจ็ค อีแวนส์จากทีมสมัครเล่นคัมปาร์ค ในราคา 6 ชิลลิง ต่อมาวิลสันได้พูดติดตลกว่า ค่าตัวของอีแวนส์นั้น "เป็นเงินทั้งหมดที่เรามี และรวมค่าเดินทางรถไฟจากเทรออร์ชี ด้วย !" สโมสรได้แต่งตั้งผู้จัดการทีมคนแรกอย่างเป็นทางการในเวลาไม่นานหลังจากนั้น โดยเดวี แมคดักกัลรับหน้าที่ดูแลทีมชุดใหญ่^{[ 14 ]}แมคดักกัลดำรงตำแหน่งเพียงฤดูกาลเดียว ก่อนที่สโมสรจะตัดสินใจว่าจำเป็นต้องมีผู้จัดการทีมที่มีประสบการณ์มากกว่า และแต่งตั้งเฟร็ด สจ๊วตเข้ามาแทนที่^{[ 15 ]}ส่วนวิลสันรับหน้าที่ดูแลทีมสำรองของสโมสรแทน^{[ 16 ]}

ในปี พ.ศ. 2463 คาร์ดิฟฟ์กลายเป็นสโมสรแรกของเวลส์ที่ได้รับเลือกเข้าสู่ฟุตบอลลีกโดยเข้าร่วมดิวิชั่นสองสโมสรประสบความสำเร็จในช่วงแรก โดยได้เลื่อนชั้นสู่ดิวิชั่นหนึ่งในฤดูกาลแรก จบอันดับรองชนะเลิศในฤดูกาล พ.ศ. 2466–24และเข้าถึง รอบชิงชนะ เลิศเอฟเอคัพ สองครั้ง โดยชนะครั้งที่สองใน ปี พ.ศ. 2460 ^{[ 17 ]}อย่างไรก็ตาม ความสำเร็จนี้ตามมาด้วยการตกชั้นอย่างรวดเร็วของสโมสร ซึ่งต้องตกชั้นสู่ดิวิชั่นสามใต้ ติดต่อกัน จนถึงปี พ.ศ. 2475 ^{[ 18 ]}

ความยากลำบากของทีมส่งผลกระทบต่อสโมสรในด้านการเงินด้วย และวิลสันเป็นหนึ่งในเจ้าหน้าที่หลายคนที่ถูกบังคับให้ลดเงินเดือนลง 20 เปอร์เซ็นต์ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2475 ^{[ 18 ]}ในปีต่อมา เฟร็ด สจ๊วต ลาออกจากตำแหน่งผู้จัดการทีมหลังจากดำรงตำแหน่งมา 22 ปี โดยวิลสันได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้สืบทอดตำแหน่งเมื่ออายุ 63 ปี วิลสันแต่งตั้งจิมมี่ แบลร์ อดีตกัปตันทีม เป็นโค้ช แต่สโมสรประสบปัญหาทางการเงินอย่างหนัก^{[ 19 ]}การเซ็นสัญญาที่สำคัญที่สุดของเขาก่อนเริ่มฤดูกาลใหม่คือการกลับมาของเออร์นี เคอร์ติสซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของทีมที่คว้าแชมป์เอฟเอคัพในปี พ.ศ. 2460 ด้วยราคา 1,250 ปอนด์^{[ 19 ]}ช่วงเวลาที่วิลสันดำรงตำแหน่งพิสูจน์แล้วว่าเป็นช่วงเวลาที่ย่ำแย่ และสโมสรอยู่อันดับสุดท้ายของดิวิชั่น 3 ใต้ในช่วงกลางฤดูกาลในเดือนมกราคม ตามมาด้วยความพ่ายแพ้ 5 นัดจาก 6 นัดถัดมา และในวันที่ 7 มีนาคม พ.ศ. 2477 วิลสันลาออกจากตำแหน่งและถูกแทนที่โดยเบน วัตต์ส-โจนส์วิลสันกลับไปทำหน้าที่บริหารภายในสโมสรแทน^{[ 20 ] [ 21 ]} อย่างไรก็ตาม นักข่าวของ Western Mailได้ให้การสนับสนุนวิลสัน โดยเขียนว่าผู้จัดการ "ถูกจำกัดหน้าที่อย่างไม่เหมาะสม เนื่องจากกรรมการเข้ามาควบคุมด้านการจัดการมากเกินไป แทนที่จะปล่อยให้ผู้จัดการได้ทำหน้าที่ของตนเอง" ^{[ 22 ]}

เพื่อเป็นการฉลองวันเกิดครบรอบ 80 ปี วิลสันได้รับมอบดินสอสีทองหลังจากที่ผู้เล่นของสโมสร นำโดยเคน ฮอลลีแมนได้ร่วมกันออกเงินซื้อของขวัญ^{[ 23 ]}วิลสันเกษียณอายุในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2497 หลังจากทำงานให้กับสโมสรที่เขาช่วยก่อตั้งเมื่อกว่า 50 ปีก่อนเป็นเวลา 44 ปี คณะกรรมการบริหารตกลงที่จะจ่ายเงินเดือนให้เขา 4 ปอนด์ต่อสัปดาห์ไปตลอดชีวิต^{[ 24 ]}ในช่วงที่เขาทำงานกับสโมสร เขาเคยดำรงตำแหน่งผู้จัดการทีมชุดใหญ่ ผู้จัดการทีมสำรอง และเลขานุการในหลายช่วงเวลา และยังเคยเขียนรายงานการแข่งขันของสโมสรในหนังสือพิมพ์South Wales Echoเป็นระยะเวลาหนึ่งด้วย^{[ 25 ]}