อ่าน 5 นาที
เบต้า-แอคติน
เบต้า-แอคติน หรือ แอคตินเบต้า (ตัวย่อของคณะกรรมการตั้งชื่อยีน HUGO คือ ACTB / ACTB ) เป็นหนึ่งในหก ไอโซฟอร์ม ของแอคติน ที่แตกต่างกัน ซึ่งได้รับการระบุในมนุษย์...
เบต้า-แอคติน
| เอซีทีบี | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | ACTB , BRWS1, PS1TP5BP1, เบต้า-แอคติน, แอคติน, เบต้า, แอคตินเบต้า | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 102630 ; เอ็มจีไอ : 87904 ; โฮโมโลยีน : 110648 ; GeneCards : ACTB ; OMA : ACTB - ออร์โธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
เบต้า-แอคตินหรือแอคตินเบต้า (ตัวย่อของคณะกรรมการตั้งชื่อยีน HUGO คือACTB / ACTB ) เป็นหนึ่งในหก ไอโซฟอร์ม ของแอคติน ที่แตกต่างกัน ซึ่งได้รับการระบุในมนุษย์ นี่เป็นหนึ่งในสองแอคตินโครงสร้างเซลล์ที่ไม่ใช่กล้ามเนื้อแอคตินเป็นโปรตีนที่มีการอนุรักษ์สูง[ 5 ] [ 6 ]ซึ่งเกี่ยวข้องกับการเคลื่อนที่ โครงสร้าง และความสมบูรณ์ของเซลล์ อัลฟาแอคตินเป็นส่วนประกอบหลักของกลไกการหดตัว[ 7 ]
ปฏิสัมพันธ์
แอคตินเบตาได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับSPTBN2 [ 8 ] [ 9 ]นอกจากนี้ ยังพบว่าโปรตีนที่จับกับ RNA ชื่อ Sam68 มีปฏิสัมพันธ์กับ mRNA ที่เข้ารหัสแอคตินเบตา ซึ่งควบคุมการสร้างไซแนปส์ของเดนไดรต์สไปน์ด้วยส่วนประกอบของไซโตสเกเลตัน
แอคตินเบตาได้รับการแสดงให้เห็นว่าสามารถกระตุ้นeNOS ได้ จึงทำให้การผลิต NO เพิ่มขึ้น พบว่าโมทีฟกรดอะมิโนแปดตัว (326-333) ใน eNOS ทำหน้าที่เป็นตัวกลางในปฏิสัมพันธ์ระหว่างแอคตินและ eNOS [ 10 ]
ความสำคัญทางคลินิก
การกลายพันธุ์ซ้ำในยีนนี้มีความเกี่ยวข้องกับกรณีของ มะเร็งต่อมน้ำ เหลืองชนิดบีเซลล์ขนาดใหญ่แบบกระจาย[ 11 ] การกลายพันธุ์ แบบเพิ่มฟังก์ชันใหม่ที่เกิดขึ้นเอง ในยีนนี้มีความเกี่ยวข้องกับกลุ่มอาการ Baraitser-Winter [ 12 ]
แอปพลิเคชัน
แอคตินเบตา มักใช้ในเวสเทิร์นบลอตติ้งเป็นตัวควบคุมการโหลดเพื่อปรับปริมาณโปรตีนทั้งหมดให้เป็นมาตรฐาน และตรวจสอบการเสื่อมสภาพของโปรตีนในตัวอย่าง[ 13 ]นอกจากนี้ ทรานสคริปต์ของมันยังถูกใช้เป็นมาตรฐานยีนควบคุมในqPCRทั่วไป อีกด้วย [ 14 ]น้ำหนักโมเลกุลของมันอยู่ที่ประมาณ 42 kDa [ 15 ]
ลิงก์ภายนอก
- หน้าแสดงตำแหน่งจีโนม ACTBของมนุษย์และรายละเอียดเกี่ยวกับยีนACTB ใน UCSC Genome Browser
- ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : P60709 (แอคติน ไซโตพลาสมิก 1) ที่PDBe- KB
อ่านเพิ่มเติม
- Vandekerckhove J, Leavitt J, Kakunaga T, Weber K (ธันวาคม 1980). "การแสดงออกร่วมกันของเบต้า-แอคตินกลายพันธุ์และเบต้า-และแกมมา-แอคตินไซโตพลาสมิกปกติสองชนิดในสายเซลล์มนุษย์ที่เปลี่ยนแปลงอย่างเสถียร" Cell . 22 (3): 893– 899. doi : 10.1016/0092-8674(80)90566-8 . PMID 6893954 . S2CID 54299848 .
- Leavitt J, Gunning P, Porreca P, Ng SY, Lin CS, Kedes L (1984). "การโคลนโมเลกุลและลักษณะเฉพาะของยีนเบต้า-แอคตินของมนุษย์กลายพันธุ์และชนิดปกติ" . Molecular and Cellular Biology . 4 (10): 1961– 1969. doi : 10.1128/mcb.4.10.1961 . PMC 369012 . PMID 6095033 .
- Ng SY, Gunning P, Eddy R, Ponte P, Leavitt J, Shows T และคณะ (ตุลาคม 1985). "วิวัฒนาการของยีนเบต้า-แอคตินของมนุษย์ที่มีฟังก์ชันการทำงานและตระกูลยีนเทียมหลายตัว: การอนุรักษ์บริเวณที่ไม่เข้ารหัสและการกระจายตัวของยีนเทียมบนโครโมโซม"ชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์5 (10): 2720– 2732. doi : 10.1128/mcb.5.10.2720 . PMC 367010 . PMID 3837182 .
- Snásel J, Pichová I (1997). "การตัดโปรตีนของเซลล์โฮสต์โดยโปรตีเอสของ HIV-1" Folia Biologica . 42 (5): 227– 230. doi : 10.1007/BF02818986 . PMID 8997639 . S2CID 7617882 .
- Gunning P, Weinberger R, Jeffrey P (เมษายน 1997). "ไอโซฟอร์มของแอคตินและทรอปโปไมโอซินในการสร้างรูปร่าง" Anatomy and Embryology . 195 (4): 311– 315. doi : 10.1007/s004290050050 . PMID 9108196 . S2CID 9692297 .
- Kimura T, Hashimoto I, Nishikawa M, Fujisawa JI (1997). "บทบาทของ Rev ในการเชื่อมโยง mRNA ของ HIV-1 gag กับเบต้าแอคตินของโครงสร้างเซลล์และการแสดงออกของโปรตีนไวรัส" Biochimie . 78 ( 11– 12): 1075– 1080. doi : 10.1016/S0300-9084(97)86732-6 . PMID 9150887 .
- Szentirmay MN, Sawadogo M (พฤษภาคม 2000). "การจัดระเบียบเชิงพื้นที่ของการถอดรหัส RNA polymerase II ในนิวเคลียส" . Nucleic Acids Research . 28 (10): 2019– 2025. doi : 10.1093/nar/28.10.2019 . PMC 105382 . PMID 10773068 .
- Anderson JL, Hope TJ (เมษายน 2547). "โปรตีนเสริมของ HIV และการอยู่รอดในเซลล์โฮสต์" รายงานHIV/AIDS ปัจจุบัน1 (1): 47– 53. doi : 10.1007/s11904-004-0007-x . PMID 16091223 . S2CID 34731265 .
- Pederson T, Aebi U (พ.ย. 2548). "แอคตินในนิวเคลียสขยายตัวโดยไม่มีการหดตัวให้เห็น" . Molecular Biology of the Cell . 16 (11): 5055– 5060. doi : 10.1091/mbc.E05-07-0656 . PMC 1266405 . PMID 16148048 .
- Perrin BJ, Ervasti JM (ต.ค. 2010). "ตระกูลยีนแอคติน: หน้าที่ตามไอโซฟอร์ม" . โครงสร้างเซลล์ . 67 (10). โฮโบเคน, นิวเจอร์ซีย์: 630– 634. doi : 10.1002/cm.20475 . PMC 2949686 . PMID 20737541 .
ดูเพิ่มเติม
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เบต้า-แอคติน
เบต้า-แอคติน หรือ แอคตินเบต้า (ตัวย่อของคณะกรรมการตั้งชื่อยีน HUGO คือ ACTB / ACTB ) เป็นหนึ่งในหก ไอโซฟอร์ม ของแอคติน ที่แตกต่างกัน ซึ่งได้รับการระบุในมนุษย์...
ปฏิสัมพันธ์
แอคตินเบตาได้รับการแสดงให้เห็นว่า มีปฏิสัมพันธ์ กับ SPTBN2 [ 8 ] [ 9 ] นอกจากนี้ ยังพบว่า โปรตีนที่จับกับ RNA ชื่อ Sam68 มีปฏิสัมพันธ์กับ mRNA ที่เข้ารหัสแอคตินเบตา ซึ่งควบคุมการสร้างไซแนปส์ของเดนไดรต์สไปน์ด้วยส่วนประกอบของไซโตสเกเลตัน
ความสำคัญทางคลินิก
การกลายพันธุ์ซ้ำในยีนนี้มีความเกี่ยวข้องกับกรณีของ มะเร็งต่อมน้ำ เหลือง ชนิด บีเซลล์ขนาดใหญ่แบบกระจาย [ 11 ] การกลายพันธุ์ แบบเพิ่มฟังก์ชันใหม่ที่เกิด ขึ้นเอง ในยีนนี้มีความเกี่ยวข้องกับ กลุ่มอาการ Baraitser-Winter [ 12 ]
แอปพลิเคชัน
แอคตินเบตา มักใช้ใน เวสเทิร์นบลอตติ้ง เป็น ตัวควบคุมการโหลด เพื่อปรับปริมาณโปรตีนทั้งหมดให้เป็นมาตรฐาน และตรวจสอบการเสื่อมสภาพของโปรตีนในตัวอย่าง [ 13 ] นอกจากนี้ ทรานสคริปต์ของมันยังถูกใช้เป็นมาตรฐานยีนควบคุมใน qPCR ทั่วไป อีกด้วย [ 14 ]...