ตามบันทึกLiber pontificalisสมเด็จพระสันตะปาปามาร์คทรงสร้างมหาวิหารในสถานที่ชื่อad Pallacinasในปี 336 ^{[ 1 ]}โบสถ์แห่งแรกนี้สร้างขึ้นบนโครงสร้างเดิมก่อนสมัยคอนสแตนตินซึ่งไม่ทราบอายุหรือหน้าที่ แต่การขุดค้นในช่วงกลางศตวรรษที่ 20 เผยให้เห็นโมเสกโรมัน โบราณที่ยังคงหลงเหลืออยู่ พร้อม ลวดลายเถาวัลย์ อะแคนทัสใต้ทางเดินด้านขวาของมหาวิหารในปัจจุบัน^{[ 2 ]}โบสถ์แห่งแรกของสมเด็จพระสันตะปาปามาร์คได้รวมเอาผนังจากโครงสร้างก่อนหน้านี้ และมีเสาใหม่ พื้นปูแบบ opus sectileและ ผนัง ที่ตกแต่งด้วยภาพเฟรสโกซึ่งมีชิ้นส่วนเล็กๆ ที่แสดงภาพม้าหลายตัวยังคงหลงเหลืออยู่ใต้มหาวิหารในปัจจุบัน^{[ 2 ]}การประชุมสังคายนาของสมเด็จพระสันตะปาปาซิมมาคัสในปี 499 บันทึกโบสถ์นี้ว่าTitulus Marci ^{[ 3 ]}เป็นไปได้ว่าโครงสร้างโรมันโบราณก่อนหน้านี้เดิมทีเป็นที่อยู่อาศัยของสมเด็จพระสันตะปาปามาร์ค ซึ่งต่อมาได้มอบทรัพย์สินนี้ให้กับกลุ่มคริสเตียนภายในไม่กี่เดือนแรกของการดำรงตำแหน่งพระสันตะปาปาของพระองค์^{[ 2 ]}การขุดค้นทางโบราณคดียังเผยให้เห็นหินอ่อนที่ถูกเผาและเถ้าถ่านบนพื้นทางเดิน ซึ่งเป็นหลักฐานที่บ่งชี้ว่าโบสถ์แห่งแรกน่าจะถูกทำลายด้วยไฟไหม้^{[ 2 ]}

โบสถ์หลังที่สองอาจสร้างขึ้นในช่วงครึ่งหลังของศตวรรษที่ 6 แต่เนื่องจากขาดหลักฐานทางโบราณคดีและบันทึกเป็นลายลักษณ์อักษร จึงยากที่จะระบุอายุได้อย่างแม่นยำ พื้นของโบสถ์หลังที่สองสูงกว่าพื้นของโบสถ์หลังแรกหนึ่งเมตร อาจเพื่อป้องกันโครงสร้างจากน้ำท่วม ซึ่งเป็นเรื่องปกติในกรุงโรมยุคกลาง โบสถ์หลังที่สองนี้มีผังพื้นเหมือนกับโบสถ์หลังแรก เพียงแต่เพิ่มส่วนล้อม รอบบริเวณแท่น บูชาที่แบ่งทางเดินกลางโบสถ์และจัดพื้นที่สำหรับSchola Cantorum [ ^{2 ]} Liber pontificalisระบุว่าสมเด็จพระสันตะปาปาเอเดรียนที่ 1 ทรงซ่อมแซมหลังคาและทางเดินของโบสถ์หลังที่สอง และทรงมอบผ้าปูแท่นบูชา ม่าน และถ้วยทองคำ เจ็ดใบให้ ^{กับ มหาวิหาร [ 4 ]}

ตามLiber pontificalis สมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4ทรงเห็นสภาพทรุดโทรมของโบสถ์หลังที่สองและทรงตัดสินใจรื้อถอนในปี ค.ศ. 833 เพื่อสร้างมหาวิหารขึ้นใหม่ดังที่เห็นในปัจจุบัน^{[ 5 ]}ผังพื้นของโบสถ์ใหม่ก็สอดคล้องกับโบสถ์หลังก่อนๆ โดยมีทางเดินสองข้างขนาบข้างทางเดินกลางซึ่งสิ้นสุดที่มุขโค้ง พื้นประกอบด้วยบล็อกหินทูฟาขนาดใหญ่ซึ่งน่าจะเป็นส่วนหนึ่งของกำแพงเซอร์เวียน สิ่งที่เกรกอรีที่ 4 ทรงมีส่วนร่วมอย่างโดดเด่นในการสร้างใหม่ครั้งนี้คือภาพโมเสกมุขโค้ง ขนาดใหญ่ ห้องใต้ดิน รูป วงแหวน และช่องแสงด้านบน^{[ 6 ]}

ภาพโมเสกในส่วนโค้งด้านหลังของโบสถ์เป็นส่วนประกอบที่หลงเหลืออยู่ดีที่สุดจากการบูรณะของสมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4 ในปี 833 ภาพโมเสกแสดงพระเยซูอยู่ตรงกลาง โดยมีพระสันตะปาปามาร์ค นักบุญ อากาเพตัสและนักบุญแอกเนสอยู่ทางซ้าย และ นักบุญ เฟลิซิสซิมัส สมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4 และนักบุญมาร์คผู้ประกาศข่าวประเสริฐอยู่ทางขวา บุคคลทั้งเจ็ดนี้ยืนอยู่บนพื้นหลังสีทองทึบ โดยยืนอยู่บนแท่นที่มีจารึกระบุชื่อบุคคล ด้านล่างของบุคคลเหล่านั้น มีลูกแกะสิบสองตัวซึ่งเป็นตัวแทนของเผ่าอิสราเอลทั้งสิบสองเผ่าเดินออกมาจากเบธเลเฮมและเยรูซาเล็มและล้อมรอบพระเมษโปดกของพระเจ้าบนส่วนโค้งของส่วนโค้งด้านหลังโบสถ์นักบุญเปโตรและนักบุญเปาโลยืนอยู่ใต้ภาพวงกลมของพระคริสต์และผู้ประกาศข่าวประเสริฐทั้งสี่

จารึกภาษาละตินที่อุทิศแด่สถานที่แห่งนี้ ซึ่งทอดยาวไปตามด้านล่างของภาพโมเสกในบริเวณมุขโค้ง มีใจความว่า:

VASTA THOLI FIRMO SISTVNT FVNDAMINE FVLCHRA / QVAE SALOMONIACO FVLGENT SVB SIDERE RITV / HAEC TIBI PROQVE TVO PERFECIT PRAESVL HONORE / GREGORIS MARCE EXIMIO CVI NOMINE QUARTVS / TV QVOQVE POSCE DEVM VIVENDI TEMPORA LONGA DONET / ET AD CAELI โพสต์ FVNVS SIDERA DVCAT

คำแปล ภาษาอังกฤษ :

เสาขนาดใหญ่ของส่วนโค้งด้านหลังซึ่งส่องประกายเหมือนวิหารของโซโลมอนใต้ดวงดาว ตั้งอยู่บนฐานที่มั่นคง สิ่งเหล่านี้ โอ มาร์ค พระสันตะปาปาผู้มีพระนามอันโดดเด่นว่าเกรกอรีที่ 4 ได้สร้างขึ้นเพื่อท่านและเพื่อเป็นเกียรติแก่ท่าน และท่านขอภาวนาให้พระเจ้าประทานชีวิตอันยาวนานแก่เขาบนโลกนี้ และหลังจากความตาย ขอทรงนำเขาไปสู่ดวงดาวแห่งสวรรค์^{[ 7 ]}

การเลือกวางนักบุญมาร์คผู้ประกาศข่าวประเสริฐไว้ในองค์ประกอบภาพในตำแหน่งที่โดยปกติแล้วสงวนไว้สำหรับนักบุญปีเตอร์ ดูเหมือนจะเป็นการจงใจเปลี่ยนแปลงธรรมเนียมเดิมของภาพโมเสกในส่วนโค้งของโบสถ์ที่มักแสดงภาพกลุ่มนักบุญกับพระสันตะปาปาผู้บริจาค นักประวัติศาสตร์ศิลปะ คลอเดีย โบลเกีย เสนอว่า การย้ายพระธาตุของนักบุญมาร์คจากอเล็ก ซานเดรีย ไปยังมหาวิหารนักบุญมาร์คในเวนิสในปี 830–31 มีอิทธิพลต่อการตัดสินใจของสมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4 ในการแสดงภาพพระองค์เองในความสัมพันธ์กับนักบุญมาร์คผู้ประกาศข่าวประเสริฐองค์นี้ ยิ่งไปกว่านั้น การรวมนักบุญอากาเพตัสและนักบุญเฟลิซิสซิมัสอาจหมายถึงการที่สมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4 เพิ่งส่งพระธาตุของทั้งสองไปยังอารามใน บาวา เรียดังนั้น ภาพโมเสกในส่วนโค้งของโบสถ์จึงสื่อถึงการปรากฏตัวทางจิตวิญญาณของนักบุญเหล่านี้ แม้ว่าพระธาตุของพวกท่านจะตั้งอยู่นอกกรุงโรม และอยู่นอกเขตอำนาจศาลโดยตรงของสันตะสำนักก็ตาม^{[ 7 ]}แม้ว่าการแสดงภาพตนเองของพระสันตะปาปาในโมเสกบริเวณมุขโค้งจะค่อนข้างพบเห็นได้ทั่วไปในศตวรรษที่ 9 (เช่นพระสันตะปาปาปัสคาที่ 1ในซานตาปราสเซเดและซานตาเซซิเลียในทราสเตเวเร ) แต่การรวมพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4 ไว้ในซานมาร์โกแสดงให้เห็นถึงความปรารถนาของพระองค์ที่จะสถาปนาอำนาจของพระสันตะปาปาในเมือง^{[ 8 ]}

มีการเปลี่ยนแปลงเพิ่มเติมเกิดขึ้นกับโบสถ์ตลอดศตวรรษที่ 12 โดยมีการเพิ่มหอระฆังแบบโรมาเนสก์ เหนือปลายด้านใต้ของทางเดินกลางโบสถ์ งานประติมากรรมรอบประตูทางเข้าหลักด้านใต้ และอ่างเก็บศีลมหาสนิท ใหม่ เหนือแท่นบูชา หลัก ระหว่างปี 1465–1470 สมเด็จพระสันตะปาปาปอลที่ 2ได้บูรณะด้านหน้าโบสถ์ตาม แบบ เรเนสซอง ส์ โดยมี ระเบียงสองชั้นและชานพักโดยใช้หินอ่อนที่นำมาจากโคลอสเซียมและโรงละครมาร์เซลลัสในช่วงเวลานี้เองที่โบสถ์ได้ถูกรวมเข้ากับ อาคาร Palazzo Veneziaและหน้าต่างช่องแสงด้านบนถูกขยายและประดับด้วยลวดลายโกธิกซึ่งเป็นลักษณะทั่วไปของสถาปัตยกรรมโรมันในยุคควอตโตร เชนโต ^{[ 2 ]}ภายใน เพดานไม้ที่มีตราสัญลักษณ์ของสมเด็จพระสันตะปาปาปอลที่ 2 เป็นหนึ่งในเพดานไม้ดั้งเดิมจากศตวรรษที่ 15 เพียงสองแห่งที่ยังคงหลงเหลืออยู่ในกรุงโรมในปัจจุบัน (อีกแห่งหนึ่งคือเพดานที่โบสถ์ซานตามาเรียมาจโจเร ) ในปี ค.ศ. 1564 สมเด็จพระสันตะปาปาปิอุสที่ 4ทรงมอบอำนาจ การควบคุมส่วนใหญ่ของ Palazzo Venezia ให้แก่ สาธารณรัฐเวนิสเพื่อใช้เป็นสถานทูต ทำให้มหาวิหารแห่งนี้กลายเป็นโบสถ์ประจำชาติเวนิสในกรุงโรม^{[ 9 ]} ในช่วงต้นยุคสมัยใหม่ ภายในโบสถ์ได้รับการตกแต่งใหม่ครั้งใหญ่สองครั้งใน สไตล์ บาโรกตั้งแต่ปี ค.ศ. 1654–57 นิคโคโล ซาเกรโดได้ว่าจ้างโอราซิโอ ตอร์ริอานีให้ตกแต่งเสาใหม่ด้วย หัวเสาแบบ ไอโอนิ กที่เป็นระเบียบ และเสาที่ทาสีขาว จากนั้น ตั้งแต่ปี ค.ศ. 1732–54 พระคาร์ดินัลแองเจโล มาเรีย ควิริ นี ได้ว่าจ้างฟิลิปโป บาริจิโอนีให้ออกแบบแท่นบูชาหลักและที่นั่งของคณะนักร้องประสานเสียงใหม่^{[ 2 ]}ภาพวาดและประติมากรรมของศิลปินยุคบาโรกและนีโอคลาสสิกเช่นPier Francesco Mola , Guillame Courtois , Palma il Giovane , Luigi Primo , Carlo Maratta , Cosimo FancelliและAntonio Canovaสามารถพบได้ทั่วทั้งบริเวณทางเดินกลางของโบสถ์ในปัจจุบัน^{[ 10 ]}

ในปี ค.ศ. 1843 ห้องใต้ดินรูปวงแหวนของสมเด็จพระสันตะปาปาเกรกอรีที่ 4 ซึ่งถูกปิดไปในปี ค.ศ. 1474 ในสมัยพระคาร์ดินัลมาร์โก บาร์โบได้ถูกค้นพบอีกครั้ง การขุดค้นในช่วงปี ค.ศ. 1947-1950 เผยให้เห็นฐานรากและซากของโบสถ์ในยุคก่อนหน้า รวมถึงหีบไม้ไซเปรสขนาดใหญ่ในห้องใต้ดินซึ่งบรรจุพระธาตุของสมเด็จพระสันตะปาปามาร์ค นักบุญอับดอน และนักบุญเซนเนน