โปรตีนชาเปอโรน

ในชีววิทยาระดับโมเลกุลโปรตีนชาเปอโรนระดับโมเลกุลคือโปรตีนที่ช่วยในการพับหรือคลายตัวของโปรตีนหรือสารประกอบโปรตีน ขนาดใหญ่ มีชาเปอโรนระดับโมเลกุลหลายประเภท ซึ่งทั้งหมดทำหน้าที่ช่วยให้โปรตีนขนาดใหญ่พับ ตัวได้อย่างถูกต้อง ในระหว่างหรือหลังการสังเคราะห์ และหลังจากที่โปรตีนเสียสภาพบางส่วน นอกจากนี้ ชาเปอโรนยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับการเคลื่อนย้ายโปรตีนเพื่อการย่อยสลายด้วยเอนไซม์ โปรตีเอ ส
โมเลกุลชาเปอโรนกลุ่มแรกที่ถูกค้นพบคือชาเปอโรนประเภทประกอบ ซึ่งช่วยในการประกอบนิวคลีโอโซมจากฮิสโตนและดีเอ็นเอ ที่พับแล้ว [ 1 ] [ 2 ] หน้าที่หลักอย่างหนึ่งของโมเลกุลชาเปอโร นคือการป้องกันการรวมตัวของโปรตีนที่พับผิดรูป ดังนั้นโปรตีนชาเปอโรนจำนวนมากจึงถูกจัดประเภทเป็นโปรตีนช็อกความร้อนเนื่องจากแนวโน้มการรวมตัวของโปรตีนจะเพิ่มขึ้นเมื่อได้รับความเครียดจากความร้อน
โมเลกุลชาเปอโรนส่วนใหญ่ไม่ได้ถ่ายทอด ข้อมูล เชิงพื้นที่ ใดๆ สำหรับการพับโปรตีน แต่จะช่วยในการพับโปรตีนโดยการจับกับและทำให้ตัวกลางการพับมีเสถียรภาพจนกว่าสายโพลีเปปไทด์จะถูกแปล อย่างสมบูรณ์ รูปแบบการทำงานเฉพาะของชาเปอโรนจะแตกต่างกันไปตามโปรตีนเป้าหมายและตำแหน่ง มีการใช้แนวทางต่างๆ เพื่อศึกษาโครงสร้างพลวัตและการทำงานของชาเปอโรน การวัดทางชีวเคมีจำนวนมากได้ให้ข้อมูลเกี่ยวกับประสิทธิภาพการพับโปรตีนและการป้องกันการรวมกลุ่มเมื่อมีชาเปอโรนอยู่ระหว่างการพับโปรตีน ความก้าวหน้าล่าสุดในการวิเคราะห์โมเลกุลเดี่ยว[ 3 ]ได้นำมาซึ่งข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับความไม่สม่ำเสมอทางโครงสร้างของชาเปอโรน ตัวกลางการพับ และความสัมพันธ์ของชาเปอโรนกับสายโปรตีนที่ไม่มีโครงสร้างและมีโครงสร้าง
หน้าที่ของโมเลกุลชาเปอโรน
แชเปอโรนจำนวนมากเป็นโปรตีนช็อกความร้อนซึ่งก็คือโปรตีนที่แสดงออกเพื่อตอบสนองต่ออุณหภูมิที่สูงขึ้นหรือความเครียดของเซลล์อื่นๆ[ 4 ]แชเปอโรนโปรตีนช็อกความร้อนถูกจัดประเภทตามน้ำหนักโมเลกุลที่สังเกตได้เป็น Hsp60, Hsp70 , Hsp90, Hsp104 และ Hsp ขนาดเล็ก[ 5 ]แชเปอโรนโปรตีนในตระกูล Hsp60 เรียกว่าแชเปอโรนินและมีลักษณะเฉพาะคือโครงสร้างวงแหวนคู่ซ้อนกัน และพบได้ในโปรคาริโอต ในไซโตซอลของยูคาริโอต และในไมโทคอนเดรีย
ระบบชาเปอโรนบางระบบทำงานเป็นโฟลเดส : พวกมันสนับสนุนการพับของโปรตีนในลักษณะที่ขึ้นอยู่กับ ATP (ตัวอย่างเช่น ระบบ GroEL / GroESหรือ ระบบ DnaK / DnaJ / GrpE ) แม้ว่าโปรตีนที่สังเคราะห์ขึ้นใหม่ส่วนใหญ่จะสามารถพับได้โดยไม่ต้องอาศัยชาเปอโรน แต่โปรตีนส่วนน้อยจำเป็นต้องใช้ชาเปอโรนอย่างเคร่งครัด ชาเปอโรนอื่นๆ ทำงานเป็นโฮลเดส : พวกมันจับกับตัวกลางการพับเพื่อป้องกันการรวมตัวกัน ตัวอย่างเช่นDnaJหรือHsp33 [ 6 ] ชาเป อ โรนยังสามารถทำงานเป็นดิสแอ็กเกรเกส ซึ่งโต้ตอบกับกลุ่มโปรตีนที่ผิดปกติและเปลี่ยนกลับเป็นโมโนเมอร์[ 7 ] ชาเปอโรน บางชนิดสามารถช่วยในการย่อยสลายโปรตีนนำโปรตีนไปยัง ระบบ โปรตีเอสเช่นระบบยูบิควิติน-โปรตีเอโซมในยูคาริโอต [ 8 ] โปรตีนชาเปอโรนมีส่วนร่วมในการพับของโปรตีนในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมมากกว่าครึ่งหนึ่ง
ความแออัดของโมเลกุลขนาดใหญ่อาจมีความสำคัญต่อการทำงานของชาเปอโรน สภาพแวดล้อมที่แออัดของไซโตซอลสามารถเร่งกระบวนการพับตัวได้ เนื่องจากโปรตีนที่พับตัวอย่างกะทัดรัดจะใช้ปริมาตรน้อยกว่าสายโซ่โปรตีนที่ยังไม่พับตัว[ 9 ]อย่างไรก็ตาม ความแออัดสามารถลดผลผลิตของโปรตีนที่พับตัวอย่างถูกต้องได้โดยการเพิ่ม การรวมตัว ของโปรตีน[ 10 ] [ 11 ]ความแออัดอาจเพิ่มประสิทธิภาพของโปรตีนชาเปอโรน เช่นGroEL [ 12 ]ซึ่งสามารถต่อต้านการลดลงของประสิทธิภาพการพับตัวนี้ได้[ 13 ] 'ชาเปอโรนเชิงโครงสร้าง' ที่มีความเฉพาะเจาะจงสูงบางชนิดจะถ่ายทอดข้อมูลโครงสร้างเฉพาะไปยังโปรตีน ซึ่งไม่สามารถพับตัวได้เอง โปรตีนดังกล่าวละเมิดหลักการของ Anfinsen [ 14 ] ซึ่งกำหนดให้โปรตีนต้องอาศัยพลวัตในการพับตัวอย่างถูกต้อง
ชาเปอโรนประเภทอื่น ๆ มีส่วนเกี่ยวข้องกับการขนส่งผ่านเยื่อหุ้มเซลล์เช่น เยื่อหุ้มไมโตคอนเดรียและเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER) ในยูคาริโอต ชา เปอโรนเฉพาะการเคลื่อนย้ายของแบคทีเรียSecBจะรักษาสายโซ่โพลีเปปไทด์ต้นแบบ ที่สังเคราะห์ขึ้นใหม่ให้อยู่ ใน สถานะที่พร้อม สำหรับการเคลื่อนย้าย ( โดยทั่วไปคือคลายตัว ) และนำทางไปยัง ทราน สโลคอน[ 15 ]
หน้าที่ใหม่ๆ ของชาเปอโรนยังคงถูกค้นพบอย่างต่อเนื่อง เช่นกิจกรรมยึดเกาะของแบคทีเรีย การเหนี่ยวนำให้เกิดการรวมกลุ่มไปสู่กลุ่มที่ไม่ใช่อะไมลอยด์ [ 16 ]การยับยั้งโอลิโกเมอร์โปรตีนที่เป็นพิษผ่านการรวมกลุ่ม[ 17 ] [ 18 ]และการตอบสนองต่อโรคที่เกี่ยวข้องกับการรวมกลุ่มของโปรตีน[ 19 ]และการบำรุงรักษามะเร็ง[ 20 ]
โปรตีนชาเปอโรนของมนุษย์
ในสายเซลล์ของมนุษย์ พบว่าโปรตีนชาเปอโรนประกอบขึ้นเป็นมวลโปรตีโอมรวมประมาณ 10% [ 21 ]และมีการแสดงออกอย่างแพร่หลายและสูงในเนื้อเยื่อของมนุษย์
โปรตีนชาเปอโรนพบได้ทั่วไปในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER) เนื่องจากกระบวนการสังเคราะห์โปรตีนมักเกิดขึ้นในบริเวณนี้
เอนโดพลาสมิกเรติคูลัม
ในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER) มีโมเลกุลชาเปอโรนทั่วไป โมเลกุลชาเปอโรนแบบเลคติน และโมเลกุลชาเปอโรนที่ไม่ใช่แบบคลาสสิก ซึ่งทำหน้าที่ควบคุมการพับตัวของโปรตีน
- ผู้ดูแล ทั่วไป: GRP78/BiP , GRP94 , GRP170
- เลคตินชาเปอโรน: แคลเน็กซินและแคลเรติคูลิน
- โมเลกุลชาเปอโรนที่ไม่ใช่แบบคลาสสิก: HSP47และERp29
- ผู้ดูแลพับได้:
- โปรตีนไดซัลไฟด์ไอโซเมอเรส (PDI), [ 22 ]
- เปปทิดิลโพรลิลซิส-ทรานส์ไอโซเมอเรส (PPI), โพรลิลไอโซเมอเรส[ 23 ]
- ERp57 [ 24 ]
การตั้งชื่อและตัวอย่างของตระกูลชาเปอโรน
มีโปรตีนช่วยพับตัว (chaperone) หลายประเภท แต่ละประเภททำหน้าที่ช่วยในการพับตัวของโปรตีนในรูปแบบที่แตกต่างกัน ในแบคทีเรีย เช่นอี. โคไลโปรตีนเหล่านี้จำนวนมากถูกสร้างขึ้นในปริมาณสูงภายใต้สภาวะที่มีความเครียดสูง เช่น เมื่อแบคทีเรียอยู่ในอุณหภูมิสูง ดังนั้นโปรตีนช่วยพับตัวที่ตอบสนองต่อความร้อน (heat shock protein chaperone) จึงมีจำนวนมากที่สุด
มีการใช้ระบบการตั้งชื่อที่หลากหลายสำหรับชาเปอโรน สำหรับโปรตีนช็อกความร้อน ชื่อที่ใช้กันทั่วไปคือ "Hsp" ตามด้วยมวลโมเลกุลโดยประมาณในหน่วยกิโลดาลตันชื่อดังกล่าวมักใช้กับยูคาริโอต เช่น ยีสต์ ชื่อของแบคทีเรียมีรูปแบบที่หลากหลายกว่า และอ้างอิงโดยตรงถึงหน้าที่ที่ปรากฏเมื่อค้นพบ ตัวอย่างเช่น "GroEL" เดิมหมายถึง "ข้อบกพร่องในการเจริญเติบโตของฟาจ ซึ่งเอาชนะได้ด้วยการกลายพันธุ์ในยีนฟาจ E หน่วยย่อยขนาดใหญ่" [ 25 ]
Hsp10 และ Hsp60
Hsp10/60 (คอมเพล็กซ์ GroEL/GroES ในE. coli ) เป็นคอมเพล็กซ์ชาเปอโรนขนาดใหญ่ (~ 1 MDa) ที่ได้รับการศึกษาอย่างดีที่สุดGroEL (Hsp60) เป็นวงแหวนคู่ 14mer ที่มี แผ่น ไฮโดรโฟบิก ที่ช่องเปิด มีขนาดใหญ่มากจนสามารถรองรับการพับตัวตามธรรมชาติของ GFPขนาด 54 kDa ในช่องว่างภายในได้GroES (Hsp10) เป็นวงแหวนเดี่ยวเจ็ดตัวที่จับกับ GroEL ในที่ที่มี ATP หรือ ADP GroEL/GroES อาจไม่สามารถแก้ไขการรวมตัวกันก่อนหน้านี้ได้ แต่จะแข่งขันในเส้นทางของการพับตัวผิดปกติและการรวมตัวกัน[ 26 ]นอกจากนี้ยังทำหน้าที่ในเมทริกซ์ของไม โทคอนเดรีย ในฐานะชาเปอโรนโมเลกุล
Hsp70 และ Hsp40

Hsp70 (DnaK ในE. coli ) อาจเป็นชาเปอโรนขนาดเล็ก (~ 70 kDa) ที่ได้รับการศึกษามากที่สุด โปรตีน Hsp70ได้รับความช่วยเหลือจากโปรตีน Hsp40 (DnaJ ในE. coli ) ซึ่งเพิ่มอัตราการใช้ ATP และกิจกรรมของ Hsp70 โปรตีนทั้งสองชนิดนี้มีชื่อว่า "Dna" ในแบคทีเรีย เนื่องจากในตอนแรกพบว่าจำเป็นสำหรับการจำลองแบบ DNA ของ E. coli [ 27 ]
มีการสังเกตว่าการแสดงออกของโปรตีน Hsp70 ที่เพิ่มขึ้นในเซลล์ส่งผลให้แนวโน้มการเกิดอะพอพโทซิส ลดลง แม้ว่ากลไกที่แน่ชัดยังไม่ได้รับการระบุ แต่เป็นที่ทราบกันว่า Hsp70 มีสถานะการจับกับโปรตีนที่คลายตัวที่มีความสัมพันธ์สูงเมื่อจับกับADPและมีสถานะความสัมพันธ์ต่ำเมื่อจับกับATP
เชื่อกันว่า Hsp70 จำนวนมากจะรวมตัวกันรอบสารตั้งต้นที่คลี่ออก ทำให้มีเสถียรภาพและป้องกันการรวมตัวกันจนกว่าโมเลกุลที่คลี่ออกจะพับตัวอย่างถูกต้อง ซึ่งในเวลานั้น Hsp70 จะสูญเสียความสัมพันธ์กับโมเลกุลและแยกตัวออกไป[ 28 ] Hsp70 ยังทำหน้าที่เป็นโมเลกุลชาเปอโรนในไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์ในยูคาริโอตอีกด้วย
เอชเอสพี90
Hsp90 (HtpG ในE. coli [ a ] ) อาจเป็นชาเปอโรนที่เข้าใจน้อยที่สุด มีน้ำหนักโมเลกุลประมาณ 90 kDa และจำเป็นต่อการดำรงชีวิตในยูคาริโอต (อาจรวมถึงโปรคาริโอตด้วย) โปรตีนช็อกความร้อน 90 (Hsp90) เป็นชาเปอโรนระดับโมเลกุลที่จำเป็นสำหรับการกระตุ้นโปรตีนส่งสัญญาณหลายชนิดในเซลล์ยูคาริโอต
Hsp90 แต่ละตัวมีโดเมนจับ ATP โดเมน กลาง และ โดเมน ไดเมอไรเซชันเดิมทีคิดว่าจะยึดเกาะกับโปรตีนที่เป็นสารตั้งต้น (หรือที่เรียกว่าโปรตีนลูกค้า) เมื่อจับกับ ATP แต่โครงสร้างที่ตีพิมพ์ล่าสุดโดย Vaughan et al.และ Ali et al.แสดงให้เห็นว่าโปรตีนลูกค้าอาจจับกับทั้งโดเมน N-terminal และโดเมนกลางของ Hsp90 จากภายนอกได้[ 29 ] [ 30 ]
Hsp90 อาจต้องการโคแชเปอโร น เช่นอิมมูโนฟิลิน Sti1 p50 ( Cdc37 ) และAha1และยังทำงานร่วมกับระบบแชเปอโรน Hsp70 อีก ด้วย [ 31 ] [ 32 ]
เอชเอสพี100
โปรตีน Hsp100 (ตระกูล Clp ในE. coli ) ได้รับการศึกษาทั้งในร่างกายและในหลอดทดลองถึงความสามารถในการกำหนดเป้าหมายและคลายโครงสร้างโปรตีนที่ติดแท็กและพับตัวผิดรูป
โปรตีนในกลุ่ม Hsp100/Clp จะสร้าง โครงสร้าง หกเหลี่ยม ขนาดใหญ่ ที่มีฤทธิ์คลายโครงสร้างเมื่อมี ATP อยู่ โปรตีนเหล่านี้เชื่อกันว่าทำหน้าที่เป็นชาเปอโรน โดยค่อยๆ สอดโปรตีนเป้าหมายผ่านรูเล็กๆ ขนาด 20 อังสตรอม (2 นาโนเมตร ) ทำให้โปรตีนเป้าหมายแต่ละตัวมีโอกาสพับตัวอีกครั้ง
โปรตีนช่วยพับ Hsp100 บางชนิด เช่น ClpA และ ClpX จะจับคู่กับ โปรตีเอ สเซริน แบบเทตราเดคา เมอร์ สองวงที่ชื่อClpP โดยแทนที่จะเร่งปฏิกิริยาการพับตัวใหม่ของโปรตีนเป้าหมาย คอมเพล็กซ์เหล่านี้มีหน้าที่ทำลายโปรตีนที่ติดแท็กและพับตัวผิดรูปอย่างจำเพาะเจาะจง
Hsp104ซึ่งเป็น Hsp100 ของSaccharomyces cerevisiaeมีความสำคัญต่อการแพร่กระจายของพรีออนในยีสต์ หลายชนิด การลบยีน HSP104 ส่งผลให้เซลล์ไม่สามารถแพร่กระจายพรีออน บางชนิด ได้
แบคทีริโอเฟจ
ยีนของแบคทีริโอเฟจ (ฟาจ) T4ที่เข้ารหัสโปรตีนที่มีบทบาทในการกำหนดโครงสร้างของฟาจ T4 ได้รับการระบุโดยใช้มิวแทนต์ ที่ทำให้เกิดการตาย แบบ มีเงื่อนไข [ 33 ]โปรตีนส่วนใหญ่เหล่านี้พิสูจน์แล้วว่าเป็นส่วนประกอบโครงสร้างหลักหรือรองของอนุภาคฟาจที่สมบูรณ์ อย่างไรก็ตาม ในบรรดาผลิตภัณฑ์ยีน (gps) ที่จำเป็นสำหรับการประกอบฟาจ Snustad [ 34 ]ได้ระบุกลุ่มของ gps ที่ทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาแทนที่จะถูกรวมเข้ากับโครงสร้างของฟาจเอง gps เหล่านี้คือ gp26, gp31, gp38, gp51, gp28 และ gp4 [ยีน 4 มีความหมายเหมือนกับยีน 50 และ 65 ดังนั้น gp จึงสามารถกำหนดเป็น gp4(50)(65)] ผลิตภัณฑ์ยีนสี่ตัวแรกจากหกตัวนี้ได้รับการยอมรับว่าเป็นโปรตีนชาเปอโรน นอกจากนี้ gp40, gp57A, gp63 และ gpwac ยังได้รับการระบุว่าเป็นชาเปอโรนอีกด้วย
การสร้างรูปร่างของฟาจ T4 แบ่งออกเป็นสามเส้นทางอิสระ ได้แก่ เส้นทางหัว เส้นทางหาง และเส้นทางเส้นใยหางยาว ดังที่ Yap และ Rossman ได้อธิบายไว้โดยละเอียด[ 35 ]ในส่วนของการสร้างรูปร่างหัว โปรตีนชาเปอโรน gp31 จะมีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนชาเปอโรนGroEL ของโฮสต์แบคทีเรีย เพื่อส่งเสริมการพับตัวที่เหมาะสมของโปรตีน แคปซิดหัวหลักgp23 [ 36 ] [ 35 ]โปรตีนชาเปอโรน gp40 มีส่วนร่วมในการประกอบ gp20 จึงช่วยในการสร้างคอมเพล็กซ์ตัวเชื่อมต่อที่เริ่มต้นการประกอบโปรแคปซิดหัว[ 36 ] [ 35 ] Gp4(50)(65) แม้ว่าจะไม่ได้ระบุไว้โดยเฉพาะว่าเป็นชาเปอโรน แต่ก็ทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในฐานะนิวคลีเอส ซึ่งดูเหมือนจะเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการสร้างรูปร่างโดยการตัด DNA ที่บรรจุไว้เพื่อให้สามารถเชื่อมต่อหัวกับหางได้[ 37 ]
ในระหว่างการประกอบหางโดยรวม โปรตีนชาเปอโรน gp26 และ gp51 จำเป็นสำหรับการประกอบฮับฐานเพลท[ 38 ] Gp57A จำเป็นสำหรับการพับที่ถูกต้องของ gp12 ซึ่งเป็นส่วนประกอบโครงสร้างของเส้นใยหางสั้นฐานเพลท[ 38 ]
การสังเคราะห์เส้นใยหางยาวขึ้นอยู่กับโปรตีนชาเปอโรน gp57A ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างไตรเมอร์ของ gp34 และ gp37 ซึ่งเป็นโปรตีนโครงสร้างหลักของเส้นใยหาง[ 36 ] [ 35 ]โปรตีนชาเปอโรน gp38 ก็จำเป็นสำหรับการพับตัวที่เหมาะสมของ gp37 เช่นกัน[ 38 ] [ 39 ]โปรตีนชาเปอโรน gp63 และ gpwac ถูกนำมาใช้ในการยึดเส้นใยหางยาวเข้ากับฐานของหาง[ 38 ]
ประวัติศาสตร์
การศึกษาเกี่ยวกับชาเปอโรนมีประวัติมายาวนาน[ 40 ]คำว่า "ชาเปอโรนระดับโมเลกุล" ปรากฏในวรรณกรรมครั้งแรกในปี 1978 โดยรอน ลาสกีย์ เป็นผู้คิดค้นขึ้น เพื่ออธิบายความสามารถของโปรตีนนิวเคลียร์ที่เรียกว่านิวคลีโอพลาสมินในการป้องกันการรวมตัวของโปรตีนฮิสโตนที่พับแล้วกับดีเอ็นเอระหว่างการประกอบนิวคลีโอโซม[ 41 ]ต่อมาคำนี้ได้รับการขยายความโดยอาร์. จอห์น เอลลิสในปี 1987 เพื่ออธิบายโปรตีนที่ทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการประกอบโปรตีนเชิงซ้อนหลังการแปล[ 42 ]ในปี 1988 พบว่าโปรตีนที่คล้ายกันทำหน้าที่เป็นตัวกลางในกระบวนการนี้ทั้งในโปรคาริโอตและยูคาริโอต[ 43 ]รายละเอียดของกระบวนการนี้ได้รับการกำหนดในปี 1989 เมื่อมีการสาธิตการพับโปรตีนที่ขึ้นอยู่กับ ATP ในหลอดทดลอง[ 44 ]
ความสำคัญทางคลินิก
มีโรคหลายอย่างที่เกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์ในยีนที่เข้ารหัสชาเปอโรน (เช่นโรคโปรตีนหลายระบบ ) ซึ่งอาจส่งผลต่อกล้ามเนื้อ กระดูก และ/หรือระบบประสาทส่วนกลาง[ 45 ]
ดูเพิ่มเติม
หมายเหตุ
- ↑เดิมทีระบุว่าเป็น โปรตีนที่คล้ายคลึงกับ Hsp83 ในแมลงหวี่ชื่อย่อมาจาก "high temperature protein G" (โปรตีน G ที่ทนต่ออุณหภูมิสูง)