ตารางรหัสพันธุกรรม RNA มาตรฐานที่จัดเรียงในรูปแบบวงล้อ

ตารางโคดอนสามารถใช้ในการแปลรหัสพันธุกรรมเป็นลำดับของกรดอะมิโนได้^{[ 1 ] [ 2 ]}โดยทั่วไปแล้ว รหัสพันธุกรรมมาตรฐานจะแสดงเป็น ตาราง โคดอนRNA เนื่องจากเมื่อโปรตีนถูกสร้างขึ้นในเซลล์โดยไรโบโซมRNA ผู้ส่งสาร (mRNA) จะเป็น ตัว กำหนดทิศทางการสังเคราะห์โปรตีน^{[ 2 ] [ 3 ]}ลำดับของ mRNA ถูกกำหนดโดยลำดับของDNA จีโน ม^{[ 4 ]}ในบริบทนี้ รหัสพันธุกรรมมาตรฐานจะถูกเรียกว่า 'ตารางการแปล 1' ในบรรดาตารางอื่นๆ [ ^{3 ] นอกจาก}นี้ยังสามารถแสดงในตารางโคดอน DNA ได้อีกด้วย โคดอน DNA ในตารางดังกล่าวเกิดขึ้นบน สาย DNA ที่มีทิศทางและเรียงตัวในทิศทาง5 ′ถึง 3 ′มีการใช้ตารางที่แตกต่างกันโดยมีโคดอนทางเลือกขึ้นอยู่กับแหล่งที่มาของรหัสพันธุกรรม เช่น จากนิวเคลียสของเซลล์ ไมโตคอนเดรี ยพลาสติดหรือไฮโดรจีโนโซม^{[ 5 ]}

ในรหัสพันธุกรรมมีโคดอนที่แตกต่างกัน 64 แบบดังแสดงในตารางด้านล่าง ส่วนใหญ่ระบุถึงกรดอะมิโน^{[ 6 ]}ลำดับสามลำดับ ได้แก่ UAG, UGA และ UAA ซึ่งเรียกว่าโคดอนหยุด^{[หมายเหตุ 1 ]}ไม่ได้เข้ารหัสกรดอะมิโน แต่ส่งสัญญาณให้ปล่อยพอลิเปปไทด์ ที่เกิดขึ้นใหม่ จากไรโบโซม^{[ 7 ]}ในรหัสมาตรฐาน ลำดับ AUG ซึ่งอ่านว่าเมไทโอนีนสามารถทำหน้าที่เป็นโคดอนเริ่มต้นและร่วมกับลำดับต่างๆ เช่นปัจจัยเริ่มต้นจะเริ่มต้นการแปล^{[ 3 ] [ 9 ] [ 10 ]}ในบางกรณี โคดอนเริ่มต้นในรหัสมาตรฐานอาจรวมถึง GUG หรือ UUG ด้วย โคดอนเหล่านี้โดยปกติจะแทนวาลีนและลิวซีนตามลำดับ แต่เมื่อเป็นโคดอนเริ่มต้น จะถูกแปลเป็นเมไทโอนีนหรือฟอร์มิลเมไทโอ นี น^{[ 3 ] [ 10 ]}

ตาราง/วงล้อแบบคลาสสิกของรหัสพันธุกรรมมาตรฐานถูกจัดเรียงตามตำแหน่งโคดอนที่ 1 โดยพลการ Saier ^{[ 12 ]}ตามการสังเกตจาก Muto ^{[ 13 ]}แสดงให้เห็นว่าการจัดเรียงวงล้อใหม่โดยอิงจากตำแหน่งโคดอนที่ 2 แทน (และเรียงลำดับใหม่จาก UCAG เป็น UCGA) จะจัดเรียงโคดอนได้ดีขึ้นตามความชอบน้ำของกรดอะมิโนที่เข้ารหัส สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าไรโบโซมในยุคแรกอ่านตำแหน่งโคดอนที่สองอย่างระมัดระวังที่สุด เพื่อควบคุมรูปแบบความชอบน้ำในลำดับโปรตีน

ตารางแรก—ตารางมาตรฐาน—สามารถใช้ในการแปลงรหัสสามนิวคลีโอไทด์เป็นกรดอะมิโนที่สอดคล้องกัน หรือสัญญาณที่เหมาะสมหากเป็นรหัสเริ่มต้นหรือรหัสหยุด ตารางที่สอง ซึ่งเรียกว่าตารางผกผัน ทำหน้าที่ตรงกันข้าม: สามารถใช้เพื่ออนุมานรหัสสามนิวคลีโอไทด์ที่เป็นไปได้หากทราบกรดอะมิโน เนื่องจากรหัสหลายรหัสสามารถเข้ารหัสกรดอะมิโนเดียวกันได้ในบางกรณีจึงมีการใช้สัญลักษณ์กรดนิวคลีอิก ของ สหภาพเคมีบริสุทธิ์และประยุกต์ระหว่างประเทศ (IUPAC)

ครั้งหนึ่งเคยเชื่อกันว่ารหัสพันธุกรรมเป็นสากล: ^{[ 21 ]}โคดอนจะเข้ารหัสกรดอะมิโนตัวเดียวกันโดยไม่คำนึงถึงสิ่งมีชีวิตหรือแหล่งที่มา อย่างไรก็ตาม ปัจจุบันเป็นที่ยอมรับกันว่ารหัสพันธุกรรมมีการวิวัฒนาการ^{[ 22 ]}ส่งผลให้เกิดความแตกต่างในการแปลโคดอนขึ้นอยู่กับแหล่งที่มาทางพันธุกรรม^{[ 21 ] [ 22 ]}ตัวอย่างเช่น ในปี 1981 มีการค้นพบว่าการใช้โคดอน AUA, UGA, AGA และ AGG โดยระบบการเข้ารหัสในไมโทคอนเดรียของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมนั้นแตกต่างจากรหัสสากล^{[ 21 ]}โคดอนหยุดก็อาจได้รับผลกระทบเช่นกัน: ในโปรโตซัวที่มีขน โคดอนหยุดสากล UAA และ UAG เข้ารหัสกลูตามีน^{[ 22 ] [หมายเหตุ 4 ]} Shulgina และ Eddy ได้ค้นพบรหัสพันธุกรรมทางเลือกใหม่สี่รหัส (หมายเลข 34–37 ในที่นี้) ในจีโนมของแบคทีเรีย ซึ่งเผยให้เห็นการเปลี่ยนแปลงโคดอนแบบ sense ครั้งแรกในแบคทีเรีย^{[ 23 ]}ตารางต่อไปนี้แสดงโคดอนทางเลือกเหล่านี้

• ชีวสารสนเทศ
• รายชื่อรหัสพันธุกรรม

• Chevance FV, Hughes KT (2 พฤษภาคม 2017). "ข้อโต้แย้งสำหรับรหัสพันธุกรรมในฐานะไตรเพล็ตของไตรเพล็ต" . วารสาร Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 114 (18): 4745– 4750. Bibcode : 2017PNAS..114.4745C . doi : 10.1073/pnas.1614896114 . JSTOR 26481868 . PMC 5422812 . PMID 28416671 .   
• Dever TE (29 มิถุนายน 2012). "จุดเริ่มต้นใหม่ของการสังเคราะห์โปรตีน" . Science . 336 (6089). American Association for the Advancement of Science: 1645– 1646. Bibcode : 2012Sci...336.1645D . doi : 10.1126/science.1224439 . JSTOR 41585146 . PMID 22745408 . S2CID 44326947 . เก็บถาวรจากต้นฉบับเมื่อ 8 มิถุนายน 2022 . สืบค้นเมื่อ17 ตุลาคม 2020 .   
• Gardner RS, Wahba AJ, Basilio C, Miller RS, Lengyel P, Speyer JF (ธันวาคม 1962). "โพลีนิวคลีโอไทด์สังเคราะห์และรหัสกรดอะมิโน VII" . วารสาร Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 48 (12): 2087– 2094. Bibcode : 1962PNAS...48.2087G . doi : 10.1073/pnas.48.12.2087 . PMC 221128 . PMID 13946552 .  
• Nakamoto T (มีนาคม 2552). "วิวัฒนาการและความเป็นสากลของกลไกการเริ่มต้นการสังเคราะห์โปรตีน" Gene . 432 ( 1– 2): 1– 6. doi : 10.1016/j.gene.2008.11.001 . PMID 19056476 . 
• Wahba AJ, Gardner RS, Basilio C, Miller RS, Speyer JF, Lengyel P (มกราคม 1963). "โพลีนิวคลีโอไทด์สังเคราะห์และรหัสกรดอะมิโน VIII" . วารสาร Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 49 (1): 116– 122. Bibcode : 1963PNAS...49..116W . doi : 10.1073/pnas.49.1.116 . PMC 300638 . PMID 13998282 .  
• Yanofsky C (9 มีนาคม 2550). "การสร้างลักษณะสามตัวของรหัสพันธุกรรม" . Cell . 128 (5): 815– 818. doi : 10.1016/j.cell.2007.02.029 . PMID 17350564 . S2CID 14249277 .  
• Zaneveld J, Hamady M, Sueoka N, Knight R (28 กุมภาพันธ์ 2552). "CodonExplorer: ฐานข้อมูลออนไลน์แบบโต้ตอบสำหรับการวิเคราะห์การใช้โคดอนและองค์ประกอบลำดับ" ชีวสารสนเทศสำหรับการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอวิธีการทางชีววิทยาระดับโมเลกุล เล่มที่537หน้า 207–232 doi : 10.1007 /978-1-59745-251-9_10 ISBN  978-1-58829-910-9. PMC 2953947 . PMID 19378146 .  

• แผนภูมิรหัสพันธุกรรม DNA ที่จัดเรียงในรูปแบบวงล้อ