ปืนใหญ่ประจำดาดฟ้าเรือถูกนำมาใช้ในกองเรือดำน้ำทุกกองก่อนสงครามโลกครั้งที่ 1อย่างไรก็ตาม ปืนใหญ่ชนิดนี้กลับมีบทบาทสำคัญในกองทัพเรือเยอรมัน และพิสูจน์คุณค่าของมันเมื่อเรือดำน้ำ U-boatจำเป็นต้องประหยัดตอร์ปิโดหรือโจมตีเรือข้าศึกที่แล่นตามหลังขบวนเรือกัปตันเรือดำน้ำมักพิจารณาปืนใหญ่ประจำดาดฟ้าเป็นอาวุธหลัก โดยใช้ตอร์ปิโดซึ่งมีราคาแพงกว่าแต่ไม่แม่นยำเสมอไปเฉพาะเมื่อจำเป็นหรือเหมาะสมเท่านั้น (เนื่องจากปืนใหญ่ประจำดาดฟ้าจะเปิดเผยตำแหน่งของเรือดำน้ำ ในขณะที่ตอร์ปิโดสามารถใช้ได้ทั้งใต้น้ำหรืออย่างมีประสิทธิภาพในเวลากลางคืน) นอกจากนี้ เรือดำน้ำยังบรรทุกกระสุนปืนมากกว่าตอร์ปิโดมาก โดยบรรทุกเพียงสิบลูกหรือน้อยกว่านั้นในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 1 ยิงเป็นชุดๆ ละหลายหัวรบเพื่อเพิ่มโอกาสในการโจมตีเป้าหมายได้สำเร็จ

ตัวอย่างหนึ่งของแนวทางนี้คือโลธาร์ ฟอน อาร์โนลด์ เดอ ลา เปริแยร์ซึ่งใช้ปืนใหญ่บนดาดฟ้าเรือหรือทีมวางระเบิดไดนาไมต์ในการจมเรือ 171 ลำจากทั้งหมด 194 ลำ

ในสงครามโลกครั้งที่ 1 กองทัพเรืออังกฤษได้ทดลองใช้วิธีการที่แปลกใหม่กับเรือดำน้ำชั้น M จำนวน 3 ลำ ซึ่งติดตั้งปืนใหญ่เรือขนาด 12 นิ้ว (305 มม.)/40 คาลิเบอร์ เพียงกระบอกเดียว โดยมีจุดประสงค์เพื่อยิงขณะที่เรือดำน้ำอยู่ที่ระดับความลึกที่สามารถมองเห็นกล้องส่องทางไกลได้ โดยให้ปากกระบอกปืนอยู่เหนือน้ำเป็นหลัก ใน บทบาท การระดมยิงชายฝั่งแต่การออกแบบนี้พบว่าใช้การไม่ได้ในระหว่างการทดลอง เนื่องจากเรือดำน้ำจำเป็นต้องขึ้นสู่ผิวน้ำเพื่อบรรจุกระสุนใหม่ และเกิดปัญหาขึ้นเมื่อปริมาณน้ำที่เข้าไปในลำกล้องปืนก่อนการยิงมีปริมาณแตกต่างกัน

เรือดำน้ำSurcouf ของฝรั่งเศส ถูกปล่อยลงน้ำในปี พ.ศ. 2462 โดยติด ตั้งปืน ขนาด 203  มม./50 Modèle 1924จำนวน 2 กระบอก ในป้อมปืนด้านหน้าหอควบคุม^{[ 1 ]}ปืนเหล่านี้เป็นปืนขนาดใหญ่เป็นอันดับสองที่ติดตั้งบนเรือดำน้ำ รองจากเรือHMS M1  ของอังกฤษ ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง^{[ 2 ]}สนธิสัญญาทางทะเลลอนดอน ปี พ.ศ. 2473 จำกัดขนาดปืนของเรือดำน้ำไว้ที่สูงสุด 155  มม. (6.1 นิ้ว)

ในช่วงต้นสงครามโลกครั้งที่สองผู้บัญชาการเรือดำน้ำเยอรมันนิยมใช้ปืนใหญ่บนดาดฟ้าด้วยเหตุผลที่คล้ายคลึงกับผู้บัญชาการในสงครามโลกครั้งที่หนึ่ง คือ จำนวนตอร์ปิโดที่บรรทุกได้มีจำกัด ความไม่น่าเชื่อถือของตอร์ปิโด และเนื่องจากเรือดำน้ำสามารถเดินทางใต้น้ำด้วยความเร็วต่ำในระยะทางสั้นๆ เท่านั้น^{[ 3 ]}ปืนใหญ่บนดาดฟ้ามีประสิทธิภาพลดลงเมื่อขบวนเรือมีขนาดใหญ่ขึ้นและมีอุปกรณ์ที่ดีขึ้น และเรือสินค้าก็ติดอาวุธ การโผล่ขึ้นสู่ผิวน้ำก็กลายเป็นอันตรายในบริเวณใกล้เคียงกับขบวนเรือเนื่องจากการพัฒนาของเรดาร์และการหาทิศทาง (ดูเรือสินค้าที่ติดตั้งอุปกรณ์ป้องกัน (DEMS) และกองรักษาการณ์ติดอาวุธของกองทัพเรือสหรัฐฯ ) ในที่สุดปืนใหญ่บนดาดฟ้าของเรือดำน้ำเยอรมันก็ถูกถอดออกตามคำสั่งของผู้บัญชาการสูงสุดของกองเรือดำน้ำ ( BdU ) ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง และปืนใหญ่บนดาดฟ้าที่เหลืออยู่ก็ไม่มีคนประจำการอีกต่อไป ในช่วงเวลาไม่กี่เดือนในปี 1943 เรือดำน้ำ U-boat บางลำที่ปฏิบัติการในอ่าวบิสเคย์ได้รับการติดตั้งปืนต่อต้านอากาศยานที่ได้รับการปรับปรุง (โดยแลกกับการลดจำนวนตอร์ปิโด) และถูกเรียกว่าเรือ "U-Flak" ซึ่งทำหน้าที่เป็นเรือคุ้มกันให้กับเรือดำน้ำ U-boat ปกติ หลังจากที่กองทัพอากาศอังกฤษปรับเปลี่ยนยุทธวิธีต่อต้านเรือดำน้ำ ซึ่งทำให้การที่เรือดำน้ำอยู่บนผิวน้ำเพื่อต่อสู้เป็นอันตรายเกินไป เรือ U-Flak จึงถูกดัดแปลงกลับไปใช้การติดตั้งอาวุธแบบมาตรฐานของเรือดำน้ำ U-boat ทั่วไป

เรือดำน้ำของญี่ปุ่นใช้ปืนใหญ่เรือประเภท 14 ซม./40 ปีที่ 11ยิงถล่มแคลิฟอร์เนียบริติชโคลัมเบียและโอเรกอนในช่วงสงครามโลกครั้งที่² [ ^{4 ]}

ปืนใหญ่บนดาดฟ้าเรือดำน้ำเยอรมันสองกระบอกที่โดดเด่นในสงครามโลกครั้งที่สองได้แก่ ปืน8.8 ซม. (3.5 นิ้ว) SK C/35   (ไม่ควรสับสนกับปืน 8.8 ซม. Flak ^{[ 5 ]} ) และปืน10.5 ซม. (4.1 นิ้ว) SK C/32  ปืน 88  มม. มีกระสุนหนักประมาณ30 ปอนด์ (14 กก.)และเป็นแบบกระสุนและปลอกกระสุน มีระบบควบคุมเดียวกันทั้งสองด้านของปืน ทำให้ลูกเรือสองคนที่รับผิดชอบการยิงสามารถควบคุมปืนได้จากทั้งสองด้าน ปืน 105 มม. พัฒนามาจากปืน 88 มม. ในแง่ที่ว่ามีความแม่นยำและมีอำนาจการยิงมากกว่า เนื่องจากใช้กระสุนหนัก51 ปอนด์ (23 กก.)      

ในกองทัพเรือสหรัฐฯปืนใหญ่บนดาดฟ้าเรือถูกใช้งานจนถึงสิ้นสุดสงครามโลกครั้งที่สอง โดยยังมีบางลำที่ยังคงติดตั้งอยู่ในช่วงต้นทศวรรษ 1950 ^{[ 6 ]}เป้าหมายจำนวนมากในสงครามแปซิฟิกคือเรือสำเภาหรือเรือขนาดเล็กอื่นๆ ที่ไม่คุ้มค่ากับการใช้ตอร์ปิโด ความไม่น่าเชื่อถือของตอร์ปิโด Mark 14จนถึงกลางปี ​​1943 ยังส่งเสริมการใช้ปืนใหญ่บนดาดฟ้าเรือ เรือดำน้ำของสหรัฐฯ ส่วนใหญ่เริ่มต้นสงครามด้วย ปืนใหญ่บนดาดฟ้าเรือ ขนาด 3 นิ้ว (76 มม.)/50 คาลิเบอร์ เพียงกระบอกเดียว ซึ่งนำมาใช้ในทศวรรษ 1930 เพื่อไม่ให้ผู้บัญชาการเข้าปะทะกับเรือคุ้มกันติดอาวุธหนัก อย่างไรก็ตามเรือดำน้ำ S-boat ที่เก่าแล้ว ติดตั้ง ปืน ขนาด 4 นิ้ว (102 มม.)/50 คาลิเบอร์ซึ่งมักถูกนำมาใช้เพื่อติดตั้งปืนใหม่ให้กับเรือดำน้ำ S-boat ที่ถูกโอนไปทำหน้าที่ฝึกอบรมตั้งแต่กลางปี ​​1942 ภายในปี พ.ศ. 2487 เรือดำน้ำแนวหน้าส่วนใหญ่ได้รับการปรับปรุงใหม่ด้วย ปืน ขนาด 5 นิ้ว (127 มม.)/25 คาลิเบอร์และบางลำติดตั้งปืนขนาด 5 นิ้วสองกระบอก^{[ 7 ]}เรือดำน้ำลาดตระเวนUSS Argonaut  , NarwhalและNautilusแต่ละลำติดตั้งปืนขนาด 6 นิ้ว/53 คาลิเบอร์ Mark 18 (152  มม.) สองกระบอกตามที่สร้างขึ้นในทศวรรษ พ.ศ. 2463 ซึ่งเป็นปืนบนดาดฟ้าที่ใหญ่ที่สุดที่ติดตั้งบนเรือดำน้ำของสหรัฐอเมริกา^{[ 8 ]}

ในกองทัพเรืออังกฤษเรือดำน้ำชั้นแอมฟิออน HMS Andrew เป็นเรือดำน้ำอังกฤษลำสุดท้ายที่ติดตั้งปืนใหญ่บนดาดฟ้า (ปืนQF ขนาด 4 นิ้ว Mk XXIII ) HMS Andrewถูกปลดประจำการในปี 1974 ^{[ 9 ]}และปืนใหญ่บนดาดฟ้าอยู่ในพิพิธภัณฑ์เรือดำน้ำของกองทัพเรืออังกฤษ ใน ปัจจุบัน

เรือดำน้ำลำสุดท้ายที่ประจำการในกองทัพเรือใดๆ ที่ติดตั้งปืนใหญ่บนดาดฟ้าคือเรือดำน้ำชั้นAbtao สองลำจากทั้งหมดสี่ลำ ของกองทัพเรือเปรูในปี พ.ศ. 2542 ^{[ 10 ]}