กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

แผนภูมิเดนโดแกรม

ชื่อเดนโดแกรมมาจากคำภาษากรีกโบราณ สองคำคือ δένδρον ( déndron ) ซึ่งหมายถึง "ต้นไม้" และγράμμα ( grámma ) ซึ่งหมายถึง "ภาพวาด, รูปทรงทางคณิตศาสตร์"

แผนภูมิเดนโดแกรม

เดนโดแกรมของการจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น (UPGMA) พร้อมความสูงของโหนด (ดัดแปลงจากข้อมูลลำดับ 5S rRNA ของแบคทีเรีย[ 1 ] )
ผลลัพธ์เดนโดแกรมสำหรับการจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นของจังหวัดทางทะเลโดยใช้การมีอยู่/ไม่มีอยู่ของชนิดฟองน้ำ[ 2 ]
แผนภูมิเดนโดแกรมของต้นไม้แห่งชีวิตต้นไม้วิวัฒนาการนี้ดัดแปลงมาจากการวิเคราะห์ rRNA ของ Woese et al. [ 3 ]เส้นแนวตั้งด้านล่างแสดงถึงบรรพบุรุษร่วมสากลสุดท้าย (LUCA)
แผนภูมิแสดง ความสัมพันธ์เชิงปริมาณ (Heatmap) ของ ข้อมูล RNA-Seqโดยมีแผนภูมิเดนโดแกรมสองแผนภูมิอยู่ที่ขอบด้านซ้ายและด้านบน

เดนโดแกรมคือแผนภาพที่แสดงโครงสร้างต้นไม้แผนภาพนี้มักใช้ในบริบทต่างๆ ดังนี้:

ชื่อเดนโดแกรมมาจากคำภาษากรีกโบราณ สองคำคือ δένδρον ( déndron ) ซึ่งหมายถึง "ต้นไม้" และγράμμα ( grámma ) ซึ่งหมายถึง "ภาพวาด, รูปทรงทางคณิตศาสตร์" [ 7 ] [ 8 ]

ตัวอย่างการจัดกลุ่ม

สำหรับตัวอย่างการจัดกลุ่ม สมมติว่ามีกลุ่มสิ่งมีชีวิต 5 กลุ่ม ( ถึง) ที่ถูกจัดกลุ่มโดยUPGMAโดยอิงจากเมทริกซ์ระยะทางทางพันธุกรรม แผนภาพ เดน โดแกรมของ การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นจะแสดงคอลัมน์ของโหนด 5 โหนดที่แสดงถึงข้อมูลเริ่มต้น (ในที่นี้คือสิ่งมีชีวิตแต่ละชนิด) และโหนดที่เหลือแสดงถึงกลุ่มที่ข้อมูลนั้นสังกัดอยู่ โดยลูกศรแสดงถึงระยะทาง (ความแตกต่าง) ระยะทางระหว่างกลุ่มที่รวมกันจะเป็นแบบโมโนโทน เพิ่มขึ้นตามระดับของการรวมกัน: ความสูงของแต่ละโหนดในแผนภาพจะเป็นสัดส่วนกับค่าความแตกต่างระหว่างกลุ่มย่อยทั้งสองกลุ่ม (โหนดทางด้านขวาที่แสดงถึงข้อมูลแต่ละรายการจะถูกพล็อตที่ความสูงศูนย์)

ดูเพิ่มเติม

  • เดนโดแกรมของไอริส - ตัวอย่างการใช้เดนโดแกรมเพื่อแสดงภาพคลัสเตอร์ 3 กลุ่มจากการจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นโดยใช้วิธี "สมบูรณ์" เทียบกับหมวดหมู่สายพันธุ์จริง (โดยใช้R )
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Dendrogram&oldid=1340555276 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ แผนภูมิเดนโดแกรม

ชื่อเดนโดแกรมมาจากคำภาษากรีกโบราณ สองคำคือ δένδρον ( déndron ) ซึ่งหมายถึง "ต้นไม้" และγράμμα ( grámma ) ซึ่งหมายถึง "ภาพวาด, รูปทรงทางคณิตศาสตร์"

ตัวอย่างการจัดกลุ่ม

สำหรับตัวอย่างการจัดกลุ่ม สมมติว่ามีกลุ่มสิ่งมีชีวิต 5 กลุ่ม ( ถึง) ที่ถูกจัดกลุ่มโดย UPGMA โดยอิงจากเมทริกซ์ ระยะทางทางพันธุกรรม แผนภาพ เดน โดแกรมของ การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น จะแสดงคอลัมน์ของโหนด 5 โหนดที่แสดงถึงข้อมูลเริ่มต้น...

ดูเพิ่มเติม

แผนภูมิวิวัฒนาการ เมทริกซ์ระยะทางในวิวัฒนาการชาติพันธุ์ การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น MEGA โปรแกรม ฟรี สำหรับวาดแผนภาพต้นไม้ (dendrogram) yEd เป็นซอฟต์แวร์ฟรีสำหรับวาดและจัดเรียงเดนโดแกรมโดยอัตโนมัติ อนุกรมวิธาน

ลิงก์ภายนอก

เดนโดแกรมของไอริส - ตัวอย่างการใช้เดนโดแกรมเพื่อแสดงภาพคลัสเตอร์ 3 กลุ่มจาก การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น โดยใช้วิธี "สมบูรณ์" เทียบกับหมวดหมู่สายพันธุ์จริง (โดยใช้ R ) ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Dendrogram&oldid=1340555276 "