อ่าน 2 นาที
แผนภูมิเดนโดแกรม
ชื่อเดนโดแกรมมาจากคำภาษากรีกโบราณ สองคำคือ δένδρον ( déndron ) ซึ่งหมายถึง "ต้นไม้" และγράμμα ( grámma ) ซึ่งหมายถึง "ภาพวาด, รูปทรงทางคณิตศาสตร์"
แผนภูมิเดนโดแกรม




เดนโดแกรมคือแผนภาพที่แสดงโครงสร้างต้นไม้แผนภาพนี้มักใช้ในบริบทต่างๆ ดังนี้:
- ในการจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นจะแสดงการจัดเรียงของกลุ่มที่สร้างขึ้นจากการวิเคราะห์ที่เกี่ยวข้อง[ 4 ]
- ในชีววิทยาเชิงคำนวณจะแสดงการจัดกลุ่มของยีนหรือตัวอย่าง บางครั้งในขอบของฮีทแมป[ 5 ]
- ในทางพันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการจะแสดง ความสัมพันธ์ เชิงวิวัฒนาการระหว่างกลุ่มสิ่ง มีชีวิตต่างๆ ในกรณีนี้ เดนโดแกรมยังเรียกว่าต้นไม้ทางพันธุศาสตร์อีก ด้วย [ 6 ]
ชื่อเดนโดแกรมมาจากคำภาษากรีกโบราณ สองคำคือ δένδρον ( déndron ) ซึ่งหมายถึง "ต้นไม้" และγράμμα ( grámma ) ซึ่งหมายถึง "ภาพวาด, รูปทรงทางคณิตศาสตร์" [ 7 ] [ 8 ]
ตัวอย่างการจัดกลุ่ม
สำหรับตัวอย่างการจัดกลุ่ม สมมติว่ามีกลุ่มสิ่งมีชีวิต 5 กลุ่ม ( ถึง) ที่ถูกจัดกลุ่มโดยUPGMAโดยอิงจากเมทริกซ์ระยะทางทางพันธุกรรม แผนภาพ เดน โดแกรมของ การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นจะแสดงคอลัมน์ของโหนด 5 โหนดที่แสดงถึงข้อมูลเริ่มต้น (ในที่นี้คือสิ่งมีชีวิตแต่ละชนิด) และโหนดที่เหลือแสดงถึงกลุ่มที่ข้อมูลนั้นสังกัดอยู่ โดยลูกศรแสดงถึงระยะทาง (ความแตกต่าง) ระยะทางระหว่างกลุ่มที่รวมกันจะเป็นแบบโมโนโทน เพิ่มขึ้นตามระดับของการรวมกัน: ความสูงของแต่ละโหนดในแผนภาพจะเป็นสัดส่วนกับค่าความแตกต่างระหว่างกลุ่มย่อยทั้งสองกลุ่ม (โหนดทางด้านขวาที่แสดงถึงข้อมูลแต่ละรายการจะถูกพล็อตที่ความสูงศูนย์)
ดูเพิ่มเติม
- แผนภูมิวิวัฒนาการ
- เมทริกซ์ระยะทางในวิวัฒนาการชาติพันธุ์
- การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น
- MEGAโปรแกรมฟรีสำหรับวาดแผนภาพต้นไม้ (dendrogram)
- yEdเป็นซอฟต์แวร์ฟรีสำหรับวาดและจัดเรียงเดนโดแกรมโดยอัตโนมัติ
- อนุกรมวิธาน
ลิงก์ภายนอก
- เดนโดแกรมของไอริส - ตัวอย่างการใช้เดนโดแกรมเพื่อแสดงภาพคลัสเตอร์ 3 กลุ่มจากการจัดกลุ่มแบบลำดับชั้นโดยใช้วิธี "สมบูรณ์" เทียบกับหมวดหมู่สายพันธุ์จริง (โดยใช้R )
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ แผนภูมิเดนโดแกรม
ชื่อเดนโดแกรมมาจากคำภาษากรีกโบราณ สองคำคือ δένδρον ( déndron ) ซึ่งหมายถึง "ต้นไม้" และγράμμα ( grámma ) ซึ่งหมายถึง "ภาพวาด, รูปทรงทางคณิตศาสตร์"
ตัวอย่างการจัดกลุ่ม
สำหรับตัวอย่างการจัดกลุ่ม สมมติว่ามีกลุ่มสิ่งมีชีวิต 5 กลุ่ม ( ถึง) ที่ถูกจัดกลุ่มโดย UPGMA โดยอิงจากเมทริกซ์ ระยะทางทางพันธุกรรม แผนภาพ เดน โดแกรมของ การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น จะแสดงคอลัมน์ของโหนด 5 โหนดที่แสดงถึงข้อมูลเริ่มต้น...
ดูเพิ่มเติม
แผนภูมิวิวัฒนาการ เมทริกซ์ระยะทางในวิวัฒนาการชาติพันธุ์ การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น MEGA โปรแกรม ฟรี สำหรับวาดแผนภาพต้นไม้ (dendrogram) yEd เป็นซอฟต์แวร์ฟรีสำหรับวาดและจัดเรียงเดนโดแกรมโดยอัตโนมัติ อนุกรมวิธาน
ลิงก์ภายนอก
เดนโดแกรมของไอริส - ตัวอย่างการใช้เดนโดแกรมเพื่อแสดงภาพคลัสเตอร์ 3 กลุ่มจาก การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น โดยใช้วิธี "สมบูรณ์" เทียบกับหมวดหมู่สายพันธุ์จริง (โดยใช้ R ) ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Dendrogram&oldid=1340555276 "