กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 6 นาที

การแตกตัวจากการถ่ายโอนอิเล็กตรอน

การแตกตัวด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอน ( ETD ) เป็นวิธีการแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ที่มีประจุหลายตัวในเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีระหว่างขั้นตอนของแมสสเปกโทรเมตรีแบบคู่ (MS/MS)...

การแตกตัวจากการถ่ายโอนอิเล็กตรอน

เครื่องสเปกโทรเมตรมวลแบบดักจับไอออนที่มีความสามารถในการแยกส่วนด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอน
สัญกรณ์การแตกตัวของเปปไทด์

การแตกตัวด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอน ( ETD ) เป็นวิธีการแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ที่มีประจุหลายตัวในเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีระหว่างขั้นตอนของแมสสเปกโทรเมตรีแบบคู่ (MS/MS) [ 1 ]คล้ายกับการแตกตัวด้วยการจับอิเล็กตรอน ETD กระตุ้นการแตกตัวของ แคตไอออนขนาดใหญ่ที่มีประจุหลายตัวโดยการถ่ายโอนอิเล็กตรอนไปยังแคตไอออนเหล่านั้น[ 2 ] ETD ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางกับพอลิเมอร์และโมเลกุลทางชีวภาพ เช่นโปรตีนและเปปไทด์สำหรับ การ วิเคราะห์ลำดับ[ 3 ]การถ่ายโอนอิเล็กตรอนทำให้โครงสร้างหลักของเปปไทด์แตกออกเป็นไอออน c และ zในขณะที่การดัดแปลงหลังการแปล (PTM) ที่ไม่เสถียร ยังคงอยู่ [ 4 ]เทคนิคนี้ใช้ได้ผลดีเฉพาะกับไอออนเปปไทด์หรือพอลิเมอร์ที่มีสถานะประจุสูง (z>2) ​​[ 2 ]อย่างไรก็ตาม เมื่อเทียบกับการแตกตัวที่เกิดจากการชน (CID) ETD มีข้อได้เปรียบในการแตกตัวของเปปไทด์ที่ยาวกว่าหรือแม้แต่โปรตีนทั้งหมด[ 5 ]วิธีนี้ทำให้เทคนิคนี้มีความสำคัญสำหรับโปรตีโอมิกส์แบบท็อปดาวน์วิธีนี้ได้รับการพัฒนาโดยฮันท์และเพื่อนร่วมงานที่มหาวิทยาลัยเวอร์จิเนีย[ 6 ]

ประวัติศาสตร์

การแตกตัวด้วยการจับอิเล็กตรอน (ECD) ได้รับการพัฒนาขึ้นในปี 1998 เพื่อแยกโปรตีนขนาดใหญ่สำหรับการวิเคราะห์ด้วยสเปกโทรเมตรีมวล[ 7 ]เนื่องจาก ECD ต้องการอิเล็กตรอนใกล้ความร้อนจำนวนมาก (<0.2 eV) เดิมทีจึงใช้เฉพาะกับสเปกโทรเมตรีมวลแบบ Fourier transform ion cyclotron resonance (FTICR) ซึ่งเป็นเครื่องมือ MS ที่มีราคาแพงที่สุด[ 8 ]ตัวเลือกที่ราคาถูกกว่า เช่น เครื่องมือ quadrupole time-of-flight (Q-TOF), quadrupole ion trap (QIT) และlinear quadrupole ion trap (QLT) ใช้การแตกตัวที่เกิดจากการชน (CID) ซึ่งใช้พลังงานมากกว่า ส่งผลให้เกิดการแตกตัวแบบสุ่มของเปปไทด์และโปรตีน[ 9 ]ในปี 2004 Syka และคณะได้ประกาศการสร้าง ETD ซึ่งเป็นวิธีการแตกตัวที่คล้ายกับ ECD แต่ใช้สเปกโทรเมตรีเชิงพาณิชย์ราคาถูกและหาได้ง่าย การทดลอง ETD ครั้งแรกดำเนินการบนเครื่องสเปกโตรมิเตอร์มวล QLT ที่มี แหล่งกำเนิด ไอออนไนเซชันแบบอิเล็กโทรสเปรย์ (ESI) [ 10 ]

หลักการทำงาน

กระบวนการแยกตัวด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอนนั้นเกี่ยวข้องกับหลายขั้นตอน โดยปกติแล้วจะทำการแยกส่วนผสมของโปรตีนก่อนโดยใช้โครมาโทกราฟีของเหลวประสิทธิภาพสูง (HPLC) จากนั้นจะสร้าง โมเลกุลตั้งต้นที่มีโปรตอนหลายตัวโดยการแตกตัวเป็นไอออนด้วยไฟฟ้าสเปรย์และฉีดเข้าไปในเครื่องแมสสเปกโทรเมตรี (เฉพาะโมเลกุลที่มีประจุ 2+ หรือมากกว่าเท่านั้นที่สามารถใช้ใน ETD ได้) เพื่อให้อิเล็กตรอนถูกถ่ายโอนไปยังโมเลกุลตั้งต้นที่มีประจุบวก จะมีการสร้างอนุมูลแอนไอออนและนำไปใส่ในกับดักไอออน ในระหว่างปฏิกิริยาไอออน/ไอออน อิเล็กตรอนจะถูกถ่ายโอนไปยังโปรตีนหรือเปปไทด์ที่มีประจุบวก ทำให้เกิดการแตกตัวตามโครงสร้างหลักของเปปไทด์ สุดท้ายแล้ว ชิ้นส่วนที่ได้จะถูกวิเคราะห์มวล[ 11 ]

การเตรียมอนุมูลแอนไอออน

ในการทดลอง ETD ดั้งเดิมแอนทราซีน (C H ) ถูกใช้เพื่อสร้างอนุมูลแอนไอออนที่มีปฏิกิริยาผ่านการแตกตัวเป็นไอออนทางเคมี เชิง ลบ[ 10 ] โมเลกุล ไฮโดรคาร์บอนอะโรมาติกหลายวงถูกนำมาใช้ในการทดลองต่อมา โดยปัจจุบัน ฟลูออแรนทีน เป็น รีเอเจนต์ที่นิยมใช้[ 12 ]อย่างไรก็ตาม ฟลูออแรนทีนมีประสิทธิภาพในการถ่ายโอนอิเล็กตรอนเพียงประมาณ 40% ดังนั้นจึงมีการค้นหาโมเลกุลอื่นที่มีความสัมพันธ์กับอิเล็กตรอนต่ำ[ 11 ]

การฉีดและการแตกตัว

ไอออนตั้งต้นที่มีประจุหลายตัวทำปฏิกิริยากับแอนไอออนอนุมูลอิสระ

เมื่อแคตไอออนตั้งต้น (โปรตีนหรือเปปไทด์) และแอนไอออนอนุมูลอิสระรวมกันในกับดักไอออน อิเล็กตรอนจะถูกถ่ายโอนไปยังแคตไอออนที่มีประจุหลายตัว ทำให้เกิดแคตไอออนอนุมูลอิสระบวกที่ไม่เสถียรซึ่งมีประจุบวกน้อยลงหนึ่งตัวและมีอิเล็กตรอนคี่หนึ่งตัว[ 13 ]การแตกตัวเกิดขึ้นตามโครงสร้างหลักของเปปไทด์ที่พันธะ N−Cα ส่งผลให้เกิดไอออนชิ้นส่วนชนิด c และ z [ 14 ]

โปรตีนหรือเปปไทด์ที่เป็นอนุมูลอิสระจะแตกตัวเป็นไอออน c และไอออน z

การวิเคราะห์มวล

การแตกตัวที่เกิดจาก ETD ช่วยให้ได้ข้อมูลลำดับโปรตีนที่สมบูรณ์มากขึ้นจากสเปกตรัม ETD มากกว่าจากการวิเคราะห์มวลสารแบบคู่ CID เนื่องจากมีการตรวจพบไอออนชนิด c และ z ของโครงสร้างหลักของเปปไทด์จำนวนมาก จึงสามารถแยกแยะความครอบคลุมลำดับของเปปไทด์จำนวนมากได้เกือบสมบูรณ์จากสเปกตรัมการแตกตัวของ ETD [ 15 ] สามารถอ่านลำดับกรดอะมิโน 15-40 ตัวที่ปลาย N และปลาย C ของโปรตีนได้โดยใช้ ค่า มวลต่อประจุสำหรับไอออนที่มีประจุเดี่ยวและประจุคู่ ลำดับเหล่านี้พร้อมกับมวลที่วัดได้ของโปรตีนที่สมบูรณ์ สามารถนำไปเปรียบเทียบกับรายการในฐานข้อมูลสำหรับโปรตีนที่รู้จักและเพื่อเปิดเผยการดัดแปลงหลังการแปล[ 16 ]

เครื่องมือวัด

แผนภาพแสดงโครงสร้างของ LTQ ร่วมกับ ETD
เครื่องดักจับไอออนความจุสูงของ Bruker พร้อม ETD (แผนภาพแสดงโครงสร้าง) 

การแตกตัวด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอนเกิดขึ้นใน เครื่องสเปกโตรมิเตอร์มวลแบบ ดักจับไอออนที่มีแหล่งกำเนิดไอออนแบบอิเล็กโทรสเปรย์ การทดลอง ETD ครั้งแรกที่มหาวิทยาลัยเวอร์จิเนียใช้เครื่องดักจับไอออนเชิงเส้นควอดรูโพลความถี่วิทยุ (LQT) ที่ดัดแปลงด้วยแหล่งกำเนิดไอออนทางเคมี (CI) ที่ด้านหลังของเครื่องมือ (ดูแผนภาพด้านขวา) [ 10 ]เนื่องจากสามารถได้สเปกตรัมในเวลาประมาณ 300 มิลลิวินาที จึงมักมีการโครมาโทกราฟีของเหลวร่วมกับ ETD MS/MS [ 11 ]ข้อเสียของการใช้ LQT คือกำลังการแยกมวลน้อยกว่าเครื่องสเปกโตรมิเตอร์มวลอื่นๆ[ 14 ]

การศึกษาครั้งต่อมาได้ลองใช้เครื่องมืออื่นๆ เพื่อปรับปรุงความละเอียดของมวล การมีแหล่งกำเนิด CI เชิงลบที่ด้านหลังของเครื่องมือรบกวนตัววิเคราะห์ความละเอียดสูงใน LQT-Orbitrap และ quadrupole time-of-flight (QTOF) ดังนั้นจึงมีการนำวิธีการไอออนไนซ์แบบอื่นสำหรับแอนไอออนเรดิคัลมาใช้[ 11 ]

ในปี 2549 กลุ่มวิจัยที่มหาวิทยาลัย Purdue นำโดยScott McLuckeyได้ใช้เครื่องสเปกโทรเมตรมวลแบบควอดรูโพล/ไทม์ออฟไฟลต์ (QqTOF) ร่วมกับแหล่งกำเนิดไอออนคู่แบบพัลส์นาโน-ESI/การแตกตัวเป็นไอออนทางเคมีด้วยความดันบรรยากาศ (APCI) โดยใช้แอนไอออนอนุมูลอิสระของ 1,3-ไดไนโตรเบนซีนเป็นตัวให้อิเล็กตรอน[ 17 ]ต่อมาห้องปฏิบัติการที่มหาวิทยาลัยวิสคอนซินได้ดัดแปลงเครื่องสเปกโทรเมตรมวลแบบไฮบริดควอดรูโพลลิเนียร์ไอออนแทรป-ออร์บิทแทรปเพื่อใช้ ETD วิธีนี้ยังใช้วิธีการแตกตัวเป็นไอออนด้านหน้าสำหรับแอนไอออนอนุมูลอิสระของกรด 9-แอนทราซีนคาร์บอกซิลิกผ่านแหล่งกำเนิด ESI คู่แบบพัลส์[ 18 ]

เนื่องจาก ETD ได้รับความนิยมมากขึ้นเรื่อยๆ สำหรับการวิเคราะห์โครงสร้างโปรตีนและเปปไทด์ การนำไปใช้บนเครื่องสเปกโตรมิเตอร์มวลไอออนแทรปที่หาได้ง่ายซึ่งเชื่อมต่อกับเครื่องวิเคราะห์มวลความละเอียดสูงจึงยังคงพัฒนาต่อไป[ 19 ]

แอปพลิเคชัน

โปรตีโอมิกส์

ETD ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์โปรตีนและเปปไทด์ขนาดใหญ่ การดัดแปลงหลังการแปลที่สำคัญ รวมถึงการฟอสโฟรีเลชันการไกลโคซิเลชัน และพันธะไดซัลไฟด์ ล้วนได้รับการวิเคราะห์โดยใช้ ETD [ 20 ]

เคมีพอลิเมอร์

แม้ว่าการวิเคราะห์โพลีเมอร์โดยใช้ MS ส่วนใหญ่จะดำเนินการโดยใช้ MS แบบขั้นตอนเดียว แต่ MS แบบต่อเนื่องก็ถูกนำมาใช้เพื่อระบุลักษณะของส่วนประกอบโพลีเมอร์เช่นกัน CID เป็นวิธีการแยกส่วนที่ใช้กันมากที่สุด แต่ ETD ก็ถูกใช้เป็นวิธีการเสริม การแตกพันธะที่ไม่ซ้ำกันซึ่งเกิดจาก ETD ให้ข้อมูลการวินิจฉัยที่มีค่า[ 2 ]

ดูเพิ่มเติม

ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Electron-transfer_dissociation&oldid=1251600009 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ การแตกตัวจากการถ่ายโอนอิเล็กตรอน

การแตกตัวด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอน ( ETD ) เป็นวิธีการแยกโมเลกุลขนาดใหญ่ที่มีประจุหลายตัวในเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีระหว่างขั้นตอนของแมสสเปกโทรเมตรีแบบคู่ (MS/MS)...

ประวัติศาสตร์

การแตกตัวด้วยการจับอิเล็กตรอน (ECD) ได้รับการพัฒนาขึ้นในปี 1998 เพื่อแยกโปรตีนขนาดใหญ่สำหรับการวิเคราะห์ด้วยสเปกโทรเมตรีมวล [ 7 ] เนื่องจาก ECD ต้องการอิเล็กตรอนใกล้ความร้อนจำนวนมาก (<0.

หลักการทำงาน

กระบวนการแยกตัวด้วยการถ่ายโอนอิเล็กตรอนนั้นเกี่ยวข้องกับหลายขั้นตอน โดยปกติแล้วจะทำการแยกส่วนผสมของโปรตีนก่อนโดยใช้ โครมาโทกราฟีของเหลวประสิทธิภาพสูง (HPLC) จากนั้นจะสร้าง โมเลกุลตั้งต้นที่...

การเตรียมอนุมูลแอนไอออน

ในการทดลอง ETD ดั้งเดิม แอนทราซีน (C H ) ถูกใช้เพื่อสร้างอนุมูลแอนไอออนที่มีปฏิกิริยาผ่าน การแตกตัวเป็นไอออนทางเคมี เชิง ลบ [ 10 ] โมเลกุล ไฮโดรคาร์บอนอะโรมาติก หลายวงถูกนำมาใช้ในการทดลองต่อมา โดยปัจจุบัน ฟลูออแรนทีน เป็น รีเอเจนต์ที่นิยมใช้ [ 12 ]...