ในยูคาริโอต ไกลแคน แบบN -linked ได้มาจากหน่วย น้ำตาลหลัก 14 โมเลกุลที่ประกอบขึ้นในไซโตพลาสม์และเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม ขั้นแรก โมเลกุล N -acetylglucosamineสองโมเลกุลจะถูกเชื่อมต่อกับโดลิโคลโมโนฟอสเฟตซึ่งเป็นลิปิด ที่ด้านนอกของเยื่อหุ้มเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม จากนั้นจะมีการเพิ่มโมเลกุลแมนโนสห้าโมเลกุลเข้าไปในโครงสร้างนี้ ในขั้นตอนนี้ ไกลแคนหลักที่ประกอบเสร็จบางส่วนจะถูกพลิกข้ามเยื่อหุ้มเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม เพื่อให้เข้าไปอยู่ในช่อง ว่างภายใน เรติคูลัม การประกอบจะดำเนินต่อไปภายในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม โดยมีการเพิ่มโมเลกุลแมนโนสอีกสี่โมเลกุล สุดท้าย จะมีการเพิ่มโมเลกุลกลูโคสสามโมเลกุลเข้าไปในโครงสร้างนี้ หลังจากประกอบเสร็จสมบูรณ์ ไกลแคนจะถูกถ่ายโอนทั้งก้อนโดยเอนไซม์glycosyltransferase oligosaccharyltransferaseไปยังสายเปปไทด์ที่กำลังสร้างขึ้นภายในช่องว่างภายในเรติคูลัม โครงสร้างหลักของไกลแคนแบบ N -linked นี้จึงประกอบด้วยหน่วยย่อย 14 หน่วย (กลูโคส 3 หน่วย, แมนโนส 9 หน่วย และ N-อะเซทิลกลูโคซามี น 2 หน่วย ) ^{[ 2 ]}

เมื่อถูกถ่ายโอนไปยังสายเปปไทด์ที่กำลังสร้างขึ้น ไกลแคนแบบ N -linked โดยทั่วไปจะผ่านปฏิกิริยาการประมวลผลอย่างกว้างขวาง ซึ่งจะมีการกำจัดกลูโคสสามโมเลกุลออกไป รวมถึงโมเลกุลแมนโนสอีกหลายโมเลกุล ขึ้นอยู่กับ ชนิดของไกลแคนแบบ N -linked นั้นๆ การกำจัดกลูโคสโมเลกุลนั้นขึ้นอยู่กับการพับตัวของโปรตีนที่ถูกต้อง ปฏิกิริยาการประมวลผลเหล่านี้เกิดขึ้นในเครื่องมือของกอลจิปฏิกิริยาการดัดแปลงอาจเกี่ยวข้องกับการเพิ่มหมู่ฟอสเฟตหรือหมู่แอซิทิลลงบนน้ำตาล หรือการเพิ่มน้ำตาลใหม่ เช่นกรดนิวรามินิกการประมวลผลและการดัดแปลง ไกลแคน แบบ N -linked ภายในกอลจิไม่ได้เป็นไปตามเส้นทางเชิงเส้นตรง ดังนั้นจึง สามารถเกิดโครงสร้างไกลแคนแบบ N -linked ที่แตกต่างกันได้หลายแบบ ขึ้นอยู่กับกิจกรรมของเอนไซม์ในกอลจิ

ไกลแคนชนิด N -linked มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการพับตัวของโปรตีนอย่างถูกต้องในเซลล์ยูคาริโอติก โปรตีนช่วยพับ (Chaperone proteins) ในเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม เช่นแคลเน็กซินและแคลเรติคูลินจะจับกับหมู่กลูโคส 3 หมู่ที่อยู่บนแกนกลางของ ไกลแคนชนิด N -linked จากนั้นโปรตีนช่วยพับเหล่านี้จะช่วยในการพับตัวของโปรตีนที่ไกลแคนนั้นจับอยู่ หลังจากพับตัวอย่างถูกต้องแล้ว หมู่กลูโคส 3 หมู่จะถูกกำจัดออกไป และไกลแคนจะเข้าสู่กระบวนการต่อไป หากโปรตีนพับตัวไม่ถูกต้อง หมู่กลูโคส 3 หมู่จะถูกจับกลับเข้าไปใหม่ ทำให้โปรตีนสามารถกลับมารวมตัวกับโปรตีนช่วยพับอีกครั้ง วงจรนี้อาจเกิดขึ้นซ้ำหลายครั้งจนกว่าโปรตีนจะถึงโครงสร้างที่ถูกต้อง หากโปรตีนพับตัวไม่ถูกต้องซ้ำๆ มันจะถูกขับออกจากเอนโดพลาสมิกเรติคูลัมและถูกย่อยสลายโดยเอนไซม์โปรตีเอสในไซโตพลาสซึม

ไกลแคนชนิด N -linked ยังมีส่วนช่วยในการพับตัวของโปรตีนด้วยผลกระทบเชิงพื้นที่ ตัวอย่างเช่น หมู่ ซิสเทอีนในเปปไทด์อาจถูกปิดกั้นชั่วคราวไม่ให้สร้างพันธะไดซัลไฟด์กับหมู่ซิสเทอีนอื่น ๆ เนื่องจากขนาดของไกลแคนที่อยู่ใกล้เคียง ดังนั้น การมีอยู่ของ ไกลแคนชนิด N -linked ช่วยให้เซลล์สามารถควบคุมได้ว่าหมู่ซิสเทอีนใดจะสร้างพันธะไดซัลไฟด์

ไกลแคนชนิด N -linked ยังมีบทบาทสำคัญในการโต้ตอบระหว่างเซลล์ ตัวอย่างเช่น เซลล์มะเร็งสร้าง ไกลแคนชนิด N -linked ที่ผิดปกติ ซึ่ง ตัวรับ CD337บนเซลล์นักฆ่าธรรมชาติ จะจดจำไกลแคนเหล่านี้ ได้ว่าเป็นสัญญาณบ่งชี้ว่าเซลล์นั้นเป็นเซลล์มะเร็ง

ภายในระบบภูมิคุ้มกัน ไกลแคนแบบN -linked บนพื้นผิวของเซลล์ภูมิคุ้มกันจะช่วยกำหนดรูปแบบการเคลื่อนย้ายของเซลล์ เช่น เซลล์ภูมิคุ้มกันที่เคลื่อนย้ายไปยังผิวหนังจะมีไกลโคซิเลชันเฉพาะที่เอื้อต่อการไปยังบริเวณนั้น^{[ 3 ]}รูปแบบไกลโคซิเลชันบนอิมมูโนโกลบูลินต่างๆ รวมถึง IgE, IgM, IgD, IgE, IgA และ IgG ทำให้พวกมันมีหน้าที่การทำงานเฉพาะตัวโดยการเปลี่ยนแปลงความสัมพันธ์กับFcและตัวรับภูมิคุ้มกันอื่นๆ^{[ 3 ]} ไกลแคนอาจเกี่ยวข้องกับการแยกแยะ "ตนเอง" และ "ไม่ใช่ตนเอง" ซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับพยาธิสรีรวิทยาของโรคภูมิต้านตนเอง ต่างๆ [ ^{3 ]}รวมถึงโรคข้ออักเสบรูมาตอยด์^{[ 4 ]}และโรคเบาหวานชนิดที่^{1 [ 5 ]}

การกำหนดเป้าหมายของ เอนไซม์ ไลโซโซม ที่ทำหน้าที่ย่อยสลาย นั้นยังเกิดขึ้นได้ด้วยไกลแคนแบบN- linked การดัดแปลงไกลแคนแบบ N- linked ด้วย หมู่ แมนโนส-6-ฟอสเฟตทำหน้าที่เป็นสัญญาณว่าโปรตีนที่ไกลแคนนี้ติดอยู่ควรถูกเคลื่อนย้ายไปยังไลโซโซม การจดจำและการเคลื่อนย้ายเอนไซม์ไลโซโซมโดยการมีอยู่ของแมนโนส-6-ฟอสเฟตนั้นเกิดขึ้นได้ด้วยโปรตีนสองชนิด ได้แก่ CI-MPR ( ตัวรับแมนโนส-6-ฟอสเฟต ที่ไม่ขึ้นกับไอออนบวก ) และ CD-MPR (ตัวรับแมนโนส-6-ฟอสเฟตที่ขึ้นกับไอออนบวก)

ไซอะลิล ลูอิส เอ็กซ์มีความสำคัญในการกำหนดแอนติเจนหมู่เลือดABO

SLex ยังมีความสำคัญต่อการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันที่เหมาะสม การปลดปล่อย P- selectinจากWeibel-Palade bodiesบนเซลล์เยื่อบุผนังหลอดเลือด สามารถถูกกระตุ้นได้ด้วยปัจจัยหลายประการ หนึ่งในปัจจัยเหล่านั้นคือการตอบสนองของเซลล์เยื่อบุผนังหลอดเลือดต่อโมเลกุลของแบคทีเรียบางชนิด เช่นpeptidoglycan P-selectin จะจับกับโครงสร้าง SLex ที่มีอยู่บน นิ วโทรฟิลในกระแสเลือดและช่วยในการเคลื่อนย้ายของเซลล์เหล่านี้ออกไปยังเนื้อเยื่อรอบข้างระหว่างการติดเชื้อ

ไกลแคนชนิด O -linked โดยเฉพาะมิวซินพบว่ามีความสำคัญต่อการพัฒนาจุลินทรีย์ในลำไส้ให้เป็นปกติ แบคทีเรียในลำไส้บางสายพันธุ์จะจับกับมิวซินโดยเฉพาะ ทำให้พวกมันสามารถเข้ามาอาศัยอยู่ในลำไส้ได้

ตัวอย่างของไกลโคโปรตีนที่เชื่อมต่อด้วยOได้แก่:

• ไกลโคฟอรินโปรตีนในเยื่อหุ้มเซลล์เม็ดเลือดแดง
• มิวซิน คือโปรตีนในน้ำลายที่เกี่ยวข้องกับการก่อตัวของคราบจุลินทรีย์ในฟัน
• น็อตช์ (Notch ) เป็นตัวรับแบบทรานส์เมมเบรนที่มีบทบาทในการพัฒนาและการตัดสินใจเกี่ยวกับชะตากรรมของเซลล์
• ธรอมโบสปอนดิน
• แฟกเตอร์ VII
• แฟคเตอร์ IX
• ตัวกระตุ้นพลาสมีโนเจนชนิดปัสสาวะ