อ่าน 6 นาที
เอชเอ็นอาร์เอ็นพีอาร์
ไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส R เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน HNRNPR [ 5 ] [ 6 ]
เอชเอ็นอาร์เอ็นพีอาร์
| เอชเอ็นอาร์เอ็นพีอาร์ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | HNRNPR , HNRPR, hnRNP-R, ไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 607201 ; เอ็มจีไอ : 1891692 ; โฮโมโลยีน : 4251 ; GeneCards : HNRNPR ; OMA : HNRNPR - orthologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส Rเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนHNRNPR [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
ยีนนี้อยู่ในกลุ่มย่อยของโปรตีนไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส (hnRNPs) ที่แสดงออกอย่างแพร่หลาย hnRNPs เป็นโปรตีนที่จับกับ RNAและสร้างคอมเพล็กซ์กับ RNA นิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส (hnRNA) โปรตีนเหล่านี้เกี่ยวข้องกับ pre- mRNAในนิวเคลียสและดูเหมือนจะมีอิทธิพลต่อกระบวนการ pre-mRNA และแง่มุมอื่นๆ ของการเผาผลาญและการขนส่ง mRNA แม้ว่า hnRNPs ทั้งหมดจะอยู่ในนิวเคลียส แต่บางส่วนดูเหมือนจะเคลื่อนย้ายไปมาระหว่างนิวเคลียสและไซโตพลาสซึม โปรตีน hnRNP มีคุณสมบัติการจับกับกรดนิวคลีอิกที่แตกต่างกัน โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้มี โดเมน RRM ซ้ำกัน 3 ครั้ง ที่จับกับ RNA และยังมีโมทีฟการกำหนดตำแหน่งในนิวเคลียสด้วย[ 6 ]
HNRNPR ร่วมกับ7SKซึ่งเป็นคู่หูหลักของ RNA ที่มีปฏิสัมพันธ์กันนั้น มีความสำคัญต่อ การเจริญเติบโต ของแอกซอนในมอเตอร์นิวรอน[ 7 ]การลดปริมาณ HNRNPR ในมอเตอร์นิวรอนปฐมภูมิจะยับยั้งการพัฒนาของแอกซอน แต่จะไม่นำไปสู่การสูญเสียมอเตอร์นิวรอนที่เพิ่มมากขึ้น[ 7 ]นอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญใน การเคลื่อนย้าย mRNA ของ β-actin ในแอกซอน โดยจับกับ3'-UTRของ mRNA ของ β-actin โดยตรง [ 8 ]
HNRNPR ช่วยเพิ่มการถอดรหัสc-fosในหลอดทดลองโดยการสร้างคอมเพล็กซ์กับโคแฟคเตอร์PC4และMediator [ 9 ]
ปฏิสัมพันธ์
HNRNPRได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับ SMN1 [ 10 ] [ 11 ] PRMT1 [ 12 ] [ 13 ] TDP -43 [ 14 ]และFUS/ TLS [ 14 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Mourelatos Z, Abel L, Yong J, Kataoka N, Dreyfuss G (ตุลาคม 2544). "SMN มีปฏิสัมพันธ์กับตระกูลใหม่ของ hnRNP และโปรตีนสไปโซโซม"วารสารEMBO 20 ( 19): 5443– 52. doi : 10.1093/emboj/20.19.5443 . PMC 125643 . PMID 11574476 .
- Rossoll W, Kröning AK, Ohndorf UM, Steegborn C, Jablonka S, Sendtner M (มกราคม 2545). "ปฏิสัมพันธ์จำเพาะของ Smn ซึ่งเป็นผลิตภัณฑ์ยีนที่กำหนดโรคกล้ามเนื้อฝ่อไขสันหลัง กับ hnRNP-R และ gry-rbp/hnRNP-Q: บทบาทของ Smn ในการประมวลผล RNA ในแอกซอนของเซลล์ประสาทสั่งการหรือไม่?" Human Molecular Genetics . 11 (1): 93– 105. doi : 10.1093/hmg/11.1.93 . PMID 11773003 .
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (เมษายน 2545). "การทำให้บริสุทธิ์และลักษณะเฉพาะของสไปโซโซมดั้งเดิมที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์โครงสร้างสามมิติ" . RNA . 8 (4): 426– 39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
- Wada K, Inoue K, Hagiwara M (สิงหาคม 2545). "การระบุโปรตีนที่มีการเติมหมู่เมทิลโดยใช้โปรตีนอาร์จินีน N-เมทิลทรานสเฟอเรส 1, PRMT1 ด้วยกลยุทธ์การโคลนนิ่งการแสดงออกแบบใหม่" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1591 ( 1– 3): 1– 10. doi : 10.1016/S0167-4889(02)00202-1 . PMID 12183049 .
- Angenstein F, Evans AM, Settlage RE, Moran ST, Ling SC, Klintsova AY, Shabanowitz J, Hunt DF, Greenough WT (ตุลาคม 2545). "ตัวรับสำหรับ C kinase ที่ถูกกระตุ้นเป็นส่วนหนึ่งของสารเชิงซ้อนไรโบนิวคลีโอโปรตีนของสารส่งสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับ polyA-mRNA ในเซลล์ประสาท"วารสารประสาทวิทยา 22 ( 20): 8827– 37. doi : 10.1523/jneurosci.22-20-08827.2002 . PMC 6757688 . PMID 12388589 .
- Hassel S, Eichner A, Yakymovych M, Hellman U, Knaus P, Souchelnytskyi S (พฤษภาคม 2547). "โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับโปรตีนสร้างกระดูกชนิดที่ 2 (BMPR-II) และระบุโดยการแยกด้วยเจลอิเล็กโทรโฟเรซิสแบบสองมิติและการวิเคราะห์มวลสาร" Proteomics . 4 (5): 1346– 58. doi : 10.1002/pmic.200300770 . PMID 15188402 . S2CID 6773754 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (มกราคม 2548). "พลวัตของโปรตีนในนิวเคลียส" Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
- Huang J, Chen XH, Wu K, Xu P (พฤษภาคม 2548). "การโคลนและการแสดงออกของไอโซฟอร์มใหม่ของเฮเทอโรจีนัส นิวเคลียร์ ไรโบนิวคลีโอโปรตีน-R" NeuroReport . 16 (7): 727– 30. doi : 10.1097/00001756-200505120-00014 . PMID 15858414 . S2CID 42006801 .
- คิมูระ เค, วากามัตสึ เอ, ซูซูกิ วาย, โอตะ ที, นิชิคาวะ ที, ยามาชิตะ อาร์, ยามาโมโตะ เจ, เซกิเนะ เอ็ม, สึริทานิ เค, วาคางุริ เอช, อิชิอิ เอส, ซูกิยามะ ที, ไซโตะ เค, อิโซโนะ วาย, ไอริเอะ อาร์, คุชิดะ เอ็น, โยเนยามะ ที, โอสึกะ อาร์, คันดะ เค, โยโคอิ ที, คอนโด เอช, วากัทสึมะ เอ็ม, มุราคาวะ เค, อิชิดะ เอส, อิชิบาชิ T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (มกราคม 2549) "ความหลากหลายของการปรับการถอดเสียง: การระบุขนาดใหญ่และลักษณะของผู้สนับสนุนทางเลือกสมมุติของยีนมนุษย์ " การวิจัยจีโนม . 16 (1): 55– 65. ดอย : 10.1101 / gr.4039406 PMC 1356129 . PMID 16344560
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "การทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์ในระดับใหญ่ด้วยแมสสเปกโทรเมตรี" . Molecular Systems Biology . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
- Szafranski K, Schindler S, Taudien S, Hiller M, Huse K, Jahn N, Schreiber S, Backofen R, Platzer M (2007). "การละเมิดกฎการต่อเชื่อม: ไดนิวคลีโอไทด์ TG ทำหน้าที่เป็นไซต์ต่อเชื่อม 3' ทางเลือกในอินทรอนที่ขึ้นอยู่กับ U2" . Genome Biology . 8 (8): R154. doi : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . PMC 2374985 . PMID 17672918 .
ลิงก์ภายนอก
- ตำแหน่งของยีน HNRNPR ในมนุษย์บน UCSC Genome Browser
- รายละเอียดเกี่ยวกับยีน HNRNPRในมนุษย์ สามารถดูได้ที่ UCSC Genome Browser
- ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : O43390 (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R) ที่PDBe- KB
 | บทความเกี่ยวกับยีนบนโครโมโซมคู่ที่ 1 ของมนุษย์นี้ ยังไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป |
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอชเอ็นอาร์เอ็นพีอาร์
ไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส R เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน HNRNPR [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
ยีนนี้อยู่ในกลุ่มย่อยของโปรตีน ไรโบนิวคลีโอโปรตีนนิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส (hnRNPs) ที่แสดงออกอย่างแพร่หลาย hnRNPs เป็น โปรตีนที่จับกับ RNA และสร้างคอมเพล็กซ์กับ RNA นิวเคลียร์เฮเทอโรจีนัส (hnRNA) โปรตีนเหล่านี้เกี่ยวข้องกับ pre- mRNA...
ปฏิสัมพันธ์
HNRNPR ได้รับการแสดงให้เห็นว่า มี ปฏิสัมพันธ์ กับ SMN1 [ 10 ] [ 11 ] PRMT1 [ 12 ] [ 13 ] TDP -43 [ 14 ] และ FUS/ TLS [ 14 ]
อ่านเพิ่มเติม
Mourelatos Z, Abel L, Yong J, Kataoka N, Dreyfuss G (ตุลาคม 2544). "SMN มีปฏิสัมพันธ์กับตระกูลใหม่ของ hnRNP และโปรตีนสไปโซโซม"วารสาร EMBO 20 ( 19): 5443– 52. doi : 10.1093/emboj/20.19.5443 . PMC 125643 . PMID 11574476 .