ต่างจากความอดทนอดกลั้นที่มีอยู่ในบางพื้นที่ของชนชั้นสูง ส่วนใหญ่ของประเทศแสดงออกถึงการปฏิเสธการรักร่วมเพศอย่างรุนแรง แม้ว่าการร่วมเพศทางทวารหนักจะถูกกำหนดให้เป็นอาชญากรรมในประมวลกฎหมายอาญาอยู่แล้ว แต่การขึ้นครองอำนาจของคาร์ลอส อิบันเญซ เดล กัมโปในปี 1927 ก็ยิ่งทำให้มาตรการปราบปรามผู้รักร่วมเพศรุนแรงขึ้น

การปกครองแบบเผด็จการของอิบันเญซ (1927-1931) มีลักษณะเด่นคือการปราบปรามฝ่ายตรงข้ามอย่างรุนแรง ซึ่งหลายคนถูกสังหารโดยกลุ่มติดอาวุธ นักโทษทางการเมืองถูกข่มขู่ด้วย "ฟอนเดอามิเอนโต" ซึ่งประกอบด้วยการโยนนักโทษลงจากเรือกลางทะเลโดยมีน้ำหนักผูกติดกับขา แม้ว่าจะไม่มีหลักฐานที่แน่ชัดว่าการกระทำดังกล่าวเกิดขึ้นจริงก็ตาม^{[ 3 ]}ตามตำนานที่เป็นที่นิยม อิบันเญซ เดล กัมโป เกลียดชังคนรักร่วมเพศอย่างมากเพราะลูกชายของเขา คาร์ลอส เป็นเกย์ ดังนั้นเขาจึงดำเนินการบุกค้นและจับกุมคนรักร่วมเพศหลายครั้ง^{[ 3 ]}เรื่องราวที่เป็นที่นิยมกล่าวอ้างว่า "ฟอนเดอามิเอนโต" ถูกกระทำกับคนรักร่วมเพศที่ถูกจับได้ ซึ่งถูกนำตัวขึ้นเรือที่วัลปาราอิโซและไม่เคยมีใครเห็นอีกเลย^{[ 3 ]}อย่างไรก็ตาม ไม่มีหลักฐานเอกสารทางประวัติศาสตร์ใด ๆ ที่สนับสนุนตำนานที่เป็นที่นิยมนี้^{[ 3 ]}

ตามที่นักประวัติศาสตร์ Leonardo Fernández กล่าว เรื่องราวเหล่านี้มีต้นกำเนิดมาจากเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นหลังจากสิ้นสุดการปกครองของ Ibáñez ^{[ 3 ]}ในปี พ.ศ. 2484 ในสมัยรัฐบาลของPedro Aguirre Cerdaนักโทษที่ถูกตัดสินว่ามีความผิดฐานรักร่วมเพศ หรือถูกระบุว่าเป็นเกย์โดยเจ้าหน้าที่ทางการแพทย์หรือการยอมรับของพวกเขาเอง ถูกส่งตัวจาก Valparaíso ไปยังเรือนจำในPisaguaทางตอนเหนือ^{[ 3 ]}โดยมีเจตนาที่จะแยกนักโทษรักร่วมเพศและป้องกันไม่ให้พวกเขานำพฤติกรรมรักร่วมเพศไปเผยแพร่ให้กับนักโทษคนอื่นๆ ใน Pisagua และสถานที่อื่นๆ ทางตอนเหนือ ประวัติศาสตร์ปากเปล่ายังคงบันทึกความทรงจำเกี่ยวกับอาณานิคมเรือนจำที่เต็มไปด้วยนักโทษรักร่วมเพศ^{[ 3 ]}

ในปี 1952 เมื่ออิบันเญซ เดล กัมโป กลับมามีอำนาจอีกครั้ง คราวนี้มาจากการเลือกตั้งตามระบอบประชาธิปไตยอย่างเปิดเผย ในฐานะประธานาธิบดี เขาได้ดำเนินนโยบายปราบปรามต่อไป ในระหว่างการปกครองของเขา เขาได้ประกาศใช้กฎหมายฉบับที่ 11625 ว่าด้วยรัฐที่ต่อต้านสังคมและมาตรการรักษาความปลอดภัย (ค.ศ. 1954) ( Ley 11625 sobre Estados Antisociales y Medidas de Seguridad ) ซึ่งเสนอครั้งแรกในสมัยรัฐบาลของกอนซาเลซ วิดิลา ผู้ดำรงตำแหน่งก่อนหน้า กฎหมายฉบับนี้กำหนดมาตรการรักษาความปลอดภัยต่างๆ (เช่น การกักกันรักษาการปรับ และการจำคุก) ต่อกลุ่ม "อันตรายทางสังคม" รวมถึงคนเร่ร่อน ผู้ติดยาเสพติด และกลุ่มรักร่วมเพศ เป็นต้นกฎหมายฉบับนี้กำหนดให้มีการออกระเบียบเพื่ออำนวยความสะดวกในการบังคับใช้ แต่ระเบียบดังกล่าวไม่เคยมีการออก ทำให้ไม่สามารถนำมาใช้ได้จนกระทั่งถูกยกเลิกในที่สุดในปี 1994 อย่างไรก็ตาม กฎหมายฉบับนี้ก็ดูเหมือนจะ...

มีการใช้งานเพียงเล็กน้อย โดยมีบันทึกเพียงเล็กน้อยเกี่ยวกับกลุ่มคนรักร่วมเพศที่ย้ายไปอยู่สถานที่ต่างๆ เช่น ชานโก และปาร์รัล

เสรีภาพในอดีตซึ่งเคยมีอยู่ในแวดวงศิลปะและชนชั้นสูงจนถึงทศวรรษ 1950 แทบจะหายไปหมดสิ้นเนื่องจากการกดขี่ข่มเหงของรัฐบาลอิบันเญซตัวอย่างหนึ่งคือ นักแสดงแดเนียล เอมิลฟอร์กที่ไปตั้งรกรากในฝรั่งเศส หลายคนเลือกที่จะอพยพไปยังยุโรปและสหรัฐอเมริกาเพื่อแสวงหาเสรีภาพที่มากกว่า

ในรัฐบาลต่อมา แม้ว่าการปราบปรามโดยรัฐจะลดลงอย่างมาก แต่ก็ไม่ได้ลดลงในสังคม ตัวอย่างหนึ่งคือการปฏิบัติต่อผู้รักร่วมเพศโดยสื่อ หรือการใช้เรื่องรักร่วมเพศเป็นวิธีการใส่ร้ายป้ายสี กรณีที่ชัดเจนที่สุดคือกรณีของประธานาธิบดีของชิลีระหว่างปี 1958 ถึง 1964 ฮอร์เก อเลสซานดรี อเลสซานดรีเป็นประธานาธิบดีโสดคนแรกในประวัติศาสตร์ของประเทศ ทำให้เกิดข่าวลือมากมายเกี่ยวกับเรื่องเพศของเขาในประเทศอนุรักษ์นิยมอย่างชิลี ตำนานเรื่องรักร่วมเพศของเขาถูกนำไปใช้โดยนิตยสารเสียดสีTopazeและหนังสือพิมพ์Clarínซึ่งเรียกฮอร์เก อเลสซานดรี ฝ่ายขวาว่า "สุภาพสตรี" ( La Señora ) ^{[ 4 ]}

ในพื้นที่อื่นๆ ของประเทศ การละเมิดและการดูหมิ่นเหยียดหยามคนรักร่วมเพศโดยตำรวจยังคงดำเนินต่อไป กรณีที่รู้จักกันดีที่สุดเกิดขึ้นที่เมืองอันโตฟาแกสตาเมื่อวันที่ 15 มิถุนายน พ.ศ. 2512 กับเหตุการณ์ที่เรียกว่า " คดีอื้อฉาวบนถนนฮวนชาคา " ซึ่งมีคนรักร่วมเพศหลายคนถูกควบคุมตัวจนถึงวันที่ 2 กรกฎาคม เนื่องจากเข้าร่วมงานปาร์ตี้โดยแต่งกายเป็นผู้หญิง และต่อมาก็ถูกละเมิดและถูกปฏิบัติอย่างไม่เหมาะสมต่างๆ ระหว่างที่ถูกคุมขัง^{[ 5 ]}

บางทีสัญลักษณ์ที่สำคัญที่สุดของการต่อต้านคนรักเพศเดียวกันในสื่อก็คือClarínซึ่งเป็นหนังสือพิมพ์ยอดนิยม เน้นความตื่นเต้น และมีแนวคิดทางการเมืองแบบซ้ายจัด ซึ่งตีพิมพ์บทความเกี่ยวกับคนรักเพศเดียวกันอย่างต่อเนื่องในลักษณะที่ดูหมิ่นเหยียดหยาม โดยมักจะนำเสนอข่าวอาชญากรรมที่กระทำโดย "colipatos", "locas" หรือ "yeguas" ซึ่งเป็นคำที่พวกเขาใช้เรียกคนรักเพศเดียวกัน^{[ 6 ]}การต่อต้านคนรักเพศเดียวกันที่กระทำโดยสื่อฝ่ายซ้ายนี้อาจถือได้ว่าเป็นผลมาจากการยกย่องต้นแบบของความเป็นชายในช่วงปีแห่งความสามัคคีของประชาชนซึ่งสอดคล้องกับคนทำงานหนัก ดังนั้น ฝ่ายซ้ายจึงมองเห็นความเป็นชายเป็นอุดมคติของการปฏิวัติที่นำโดยซัลวาดอร์ อัลเลนเดในขณะที่ฝ่ายขวาใช้ประโยชน์จากภาพลักษณ์ของความเป็นหญิงที่เห็นได้จากการประท้วงด้วยการเคาะหม้อที่เรียกว่าcacerolazosดังนั้น การรักเพศเดียวกันจึงขัดแย้งกับแนวคิดทั้งสอง โดยเฉพาะอย่างยิ่งจากฝ่ายซ้ายทางการเมือง

ในช่วงปลายทศวรรษ 1960 แพทย์ระบบทางเดินปัสสาวะ Antonio Salas Vieyra และ Osvaldo Quijada ได้ก่อตั้งสมาคมเพศวิทยาเชิงมานุษยวิทยาแห่งชิลีขึ้นเพื่อพัฒนาการศึกษาและสำรวจสาขาเพศสภาพที่กำลังเกิดขึ้นใหม่ ภายในปี 1970 พวกเขาได้เริ่มศึกษาความเป็นไปได้ในการผ่าตัดแก้ไขเพศสภาพเพื่อช่วยเหลือผู้ที่ประสบปัญหาความผิดปกติทางอัตลักษณ์^{[ 7 ] [ 8 ]}ในปีเดียวกันนั้นเอง ได้มีการออกกฎหมายฉบับที่ 17,344 ซึ่งอนุญาตให้เปลี่ยนชื่อได้หากชื่อปัจจุบันก่อให้เกิดความเสียหายทางวัตถุหรือทางศีลธรรม เพื่อแก้ไขความเกี่ยวข้องที่ไม่เคยทราบมาก่อน หรือในกรณีที่บุคคลนั้นเป็นที่รู้จักด้วยชื่ออื่นนอกเหนือจากชื่อในเอกสารราชการเป็นเวลานานกว่าห้าปี หากศาลอนุมัติการเปลี่ยนแปลง กฎหมายกำหนดให้มีการประกาศในราชกิจจานุเบกษาเกี่ยวกับการแจ้งชื่อปัจจุบันและชื่อใหม่ที่บุคคลนั้นตั้งใจจะเริ่มใช้ หลังจากประกาศแล้ว บุคคลที่สามสามารถคัดค้านการเปลี่ยนแปลงได้ภายในระยะเวลารอคอยสามสิบวัน ก่อนที่ศาลจะมีอำนาจในการทำให้การเปลี่ยนชื่อเป็นทางการ^{[ 9 ] [ 10 ]} ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2516 มาร์เซีย ตอร์เรสกลายเป็นบุคคลแรกที่ได้รับการแก้ไขเพศในชิลี และในเดือนพฤษภาคมได้ยื่นขอเปลี่ยนชื่อ ในช่วงเดือนแรก ๆ ของการปกครองแบบเผด็จการของปิโนเชต์ ตอร์เรสได้รับคำสั่งศาลให้เปลี่ยนชื่อและเครื่องหมายเพศในทะเบียนเพศและในเอกสารราชการของเธอ^{[ 8 ] [ 11 ]}

เมื่อวันที่ 22 เมษายน พ.ศ. 2516 เกิดการชุมนุม ประท้วงครั้งแรกของกลุ่มคนรักร่วมเพศในชิลีที่จัตุรัสพลาซา เด อาร์มาส ในซานติอาโกบุคคลรักร่วมเพศและคนข้ามเพศเกือบ 25 คน ซึ่งมักเดินในเวลากลางคืน ตาม ถนนฮูเออร์ฟาโนสและอาฮูมาดา ใน ใจกลางเมืองซานติอาโกได้รวมตัวกันเพื่อประท้วงการละเมิดโดยตำรวจ ซึ่งจับกุมพวกเขาอย่างต่อเนื่องในข้อหา "ประพฤติไม่เหมาะสมและไร้มารยาท" ทุบตี และโกนผมของพวกเขา แม้จะมีการปราบปรามเช่นนี้ การชุมนุมก็ดำเนินไปตามปกติ อย่างไรก็ตาม สื่อกลับโจมตีผ่านรายงานข่าว แม้แต่ผู้ว่าการจังหวัดซานติอาโก ฮูลิโอ สตูอาร์โด ก็กล่าวว่าเขาจะใช้ "กองกำลังรักษาความปลอดภัยและทุกวิถีทางที่รัฐธรรมนูญกำหนด" เพื่อป้องกันการชุมนุมครั้งใหม่ที่กำหนดไว้ในครั้งนี้ในย่านที่อยู่อาศัยชั้นสูงของเมืองหลวง^{[ 12 ]}

พบว่ามีบุคคลข้ามเพศอีก 5 คนที่เปลี่ยนชื่อก่อนปี 1977 ตามที่ตีพิมพ์ใน^{ราชกิจจานุเบกษา [} 13 ] ^{แต่ระบอบ}การปกครองของปิโนเชต์กลับเพิ่มการตีตราและการทำให้กิจกรรมของชุมชน LGBT เป็นอาชญากรรมมากขึ้นเรื่อยๆ มาตรา 365 ของประมวลกฎหมายอาญาได้กำหนดบทลงโทษสำหรับความสัมพันธ์ทางเพศระหว่างชายกับชาย และมาตรา 373 มีบทลงโทษสำหรับความไม่เหมาะสมทางศีลธรรม ซึ่งนิยามว่าเป็นพฤติกรรมที่ไม่ยืนยันรูปแบบครอบครัวแบบรักต่างเพศหรือเสริมสร้างค่านิยมคาทอลิก^{[ 14 ]}

ในช่วงการปกครองแบบเผด็จการทหารของชิลีแม้จะมีการปราบปรามอย่างรุนแรง องค์กร LGBT แรกๆ ก็เริ่มปรากฏขึ้น แม้ว่าจะผิดกฎหมายและซ่อนเร้นก็ตาม ในปี 1977 กลุ่มรักร่วมเพศกลุ่มหนึ่งได้ก่อตั้งองค์กรเกย์แห่งแรกในชิลี กลุ่มนี้ชื่อว่าIntegraciónได้จัดการประชุมในบ้านส่วนตัว โดยมีการบรรยายให้ความรู้เกี่ยวกับเรื่องรักร่วมเพศ แม้จะดำเนินการอย่างเงียบๆ แต่กลุ่มนี้ได้จัดงานประชุมรักร่วมเพศครั้งแรกในชิลีที่เมืองซานติอาโกในปี 1982 ณ สถานที่ชื่อEl delfínโดยมีผู้เข้าร่วมประมาณ 100 คน ส่วนAyuquelén ก่อตั้งขึ้นในปี 1983 เป็นองค์กรเลสเบี้ยนแห่งแรกในชิลี และเป็นตัวแทนเสียงของเลสเบี้ยนเพียงหนึ่งเดียวมานานหลายปี โดยเข้าร่วมการประชุมและสัมมนาระดับนานาชาติ กลุ่มนี้เชื่อมโยงกับขบวนการเฟมินิสต์มาตั้งแต่เริ่มต้น ในปี 1992 พวกเขาได้จัดงานประชุมเลสเบี้ยนเฟมินิสต์แห่งชาติครั้งแรก โดยมีผู้หญิงประมาณ 50 คนจากภูมิภาคต่างๆ ของประเทศเข้าร่วม ในช่วงปลายทศวรรษ 1980 ในเมืองคอนเซปซิออนกลุ่มSERและLesbianas en Acción (LEA) ได้ถือกำเนิดขึ้น ซึ่งเป็นองค์กรเกย์และเลสเบี้ยนแห่งแรกในภาคใต้ของชิลี^{[ 15 ]}

การกระทำสาธารณะเพียงไม่กี่อย่างของกลุ่มคนรักร่วมเพศเกิดขึ้นผ่านกลุ่มศิลปะหัวรุนแรงLas Yeguas del Apocalipsis (ม้าแห่งวันสิ้นโลก) ซึ่งก่อตั้งขึ้นในปี 1987 โดยศิลปิน Francisco Casas และPedro Lemebelพวกเขามุ่งหวังที่จะตั้งคำถามต่อสถานะที่เป็นอยู่ซึ่งถูกกำหนดโดยระบอบเผด็จการ และเป็นหนึ่งในตัวอย่างแรกๆ ของเสียงทางการเมืองที่เป็นระบบจากชาวชิลีที่เป็นคนรักร่วมเพศ^{[ 16 ]}แม้ว่าที่มาที่แท้จริงของชื่อกลุ่มจะไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด แต่ดูเหมือนว่าจะได้รับแรงบันดาลใจจากการระบาดของโรคเอดส์ ซึ่งเป็นแรงบันดาลใจให้เกิดภาพลักษณ์ของโรคระบาดในพระคัมภีร์^{[ 17 ]}กลุ่มนี้มีลักษณะเด่นคือการกระทำที่ก่อให้เกิดความขัดแย้งในการประท้วงทางการเมือง ในระหว่างการประกาศของPatricio Aylwinในฐานะ ผู้สมัคร ของ Concertaciónสำหรับการเลือกตั้งประธานาธิบดีในปี 1989 Lemebel และ Casas ได้กางป้ายขนาดใหญ่ที่มีข้อความว่า "คนรักร่วมเพศเพื่อการเปลี่ยนแปลง" พิธีดังกล่าวเป็นจุดเริ่มต้นของการรณรงค์หาเสียงของ Aylwin เพื่อเป็นประธานาธิบดีที่มาจากการเลือกตั้งตามระบอบประชาธิปไตยคนแรกของชิลี นับตั้งแต่สมัยของSalvador Allende ^{[ 18 ]} Las Yeguas del Apocalipsisจะเข้าร่วมการประท้วงอื่นๆ ในระหว่างการ "ฟื้นฟู" อาคาร Casa Central ของมหาวิทยาลัยชิลี^{[ 19 ]}ซึ่งเกี่ยวข้องกับการขี่ม้าเปลือยกายเข้าไปในอาคาร โดยจงใจสื่อถึงภาพลักษณ์ของเลดี้โกไดวาและเรื่องรักร่วมเพศ

การกลับคืนสู่ระบอบประชาธิปไตยก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงทางสังคมมากมาย และอำนวยความสะดวกในการก่อตั้งกลุ่มสิทธิ LGBT ต่างๆ ซึ่งทำให้พวกเขามีโอกาสเรียกร้องสิทธิของตน ในช่วงเวลาแห่งการเปลี่ยนแปลงนี้ กลุ่มคนรักร่วมเพศชาวชิลีได้แสดงออกถึงเสียงทางการเมืองที่เป็นระบบและแข็งขันเป็นครั้งแรก ความสำเร็จหลักของพวกเขาในทศวรรษนี้คือการยกเลิกการลงโทษทางอาญาสำหรับการกระทำทางเพศระหว่างเพศเดียวกันในปี 1999 ^{[ 20 ]}

ในปี พ.ศ. 2534 ได้มีการจัดการประชุมกลุ่มรักร่วมเพศอย่างเป็นทางการครั้งแรกของชิลีขึ้นที่เมืองโคโรเนลทางตอนใต้ โดยมีองค์กรต่างๆ ที่ก่อตั้งขึ้นในช่วงยุคเผด็จการเข้าร่วม องค์กรรักร่วมเพศแห่งแรกคือ "ขบวนการเพื่อการปลดปล่อยกลุ่มรักร่วมเพศ" ( MOVILH ) ก่อตั้งขึ้นในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2534 ซึ่งต่อมาได้กลายเป็นหนึ่งในกลุ่มเคลื่อนไหวหลักของกลุ่ม LGBT ในประเทศ^{[ 21 ]}

ในปี 1992 รัฐบาลชิลีตัดสินใจเริ่มดำเนิน การรณรงค์ป้องกัน เอชไอวี/เอดส์ เป็นครั้งแรก แม้จะได้รับการต่อต้านจากคริสตจักรคาทอลิกในชิลี ก็ตาม กลุ่มต่างๆ ใช้โอกาสนี้หยิบยกประเด็นเรื่องรักร่วมเพศขึ้นมาในประเทศ โดยมีการให้สัมภาษณ์ ลงหนังสือพิมพ์ และออกอากาศทางโทรทัศน์เป็นครั้งแรก เมื่อวันที่ 4 มีนาคม 1992 องค์กรสิทธิมนุษยชนเรียกร้องให้มีการเดินขบวนเพื่อรำลึกถึงการตีพิมพ์รายงานเรตติงเกี่ยวกับการละเมิดสิทธิมนุษยชนในช่วงเผด็จการทหารภายใต้การนำของออกุสโต ปิโนเชต์ระหว่างปี 1973 ถึง 1990 กลุ่ม MOVILH ตอบรับคำเรียกร้องและสมาชิกประมาณสิบคนของกลุ่มได้เข้าร่วมการเดินขบวนโดยปิดบังใบหน้าและสวมชุดสีดำ กลุ่มดังกล่าวเดินขบวนพร้อมป้ายที่มีข้อความว่า "เพื่อพี่น้องผู้ล่วงลับของเรา ขบวนการปลดปล่อยผู้รักร่วมเพศ" ปฏิกิริยาตอบรับมีหลากหลาย ทั้งการสนับสนุนและการปฏิเสธ ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2536 ระหว่างการเดินขบวนที่จัดโดยสมาคมญาติของผู้ถูกคุมขังที่หายสาบสูญ กลุ่มคนรักร่วมเพศและคนแปลงเพศมากกว่า 300 คนได้เดินขบวนโดยไม่ปิดบังใบหน้าเป็นครั้งแรกหลังจากการกลับคืนสู่ระบอบประชาธิปไตย ซึ่งได้รับความสนใจจากสื่อเป็นอย่างมาก^{[ 22 ]}

ในช่วงต้นปี 1994 คณะกรรมการป้องกันโรคเอดส์ของ MOVILH ได้ออกจากองค์กรและก่อตั้ง Lambda Center Chile ซึ่งเป็นกลุ่มเกย์คู่ขนานที่มุ่งเน้นการทำงานด้านการป้องกันโรคเอดส์เป็นหลัก ในการเลือกตั้งเทศบาลปี 1996 มีการลงทะเบียนผู้สมัครเกย์คนแรกในเขตเทศบาล Santiago, Concepción และ Antofagasta แต่ไม่ประสบความสำเร็จ ในปี 1997 ขบวนการรวมกลุ่มของชนกลุ่มน้อยทางเพศ (MUMS Chile) ได้ก่อตั้งขึ้นจากการรวมตัวของสมาชิก MOVILH และ Lambda Center Chile ในขณะเดียวกัน กลุ่มสิทธิ LGBT อย่าง MOVILH ได้เปลี่ยนชื่อเป็น "ขบวนการรักร่วมเพศเพื่อการบูรณาการและการปลดปล่อย" ^{[ 23 ]}

ในเดือนมิถุนายน ปี 1999 การเดินขบวนเพื่อความหลากหลายทางเพศ ครั้งแรก จัดขึ้นที่เมืองซานติอาโก เพื่อเรียกร้องสิทธิของกลุ่ม LGBT และต่อสู้กับการเกลียดชังคนรักเพศเดียวกัน

การรักร่วมเพศในชิลีถูกยกเลิกโทษทางอาญาในปี พ.ศ. 2542 ^{[ 24 ]}