หลังสงคราม ความรับผิดชอบด้านการป้องกันพลเรือนตกอยู่ภายใต้กระทรวงมหาดไทย เอกสารนโยบาย การทบทวนด้านกลาโหมที่ออกโดยรัฐบาลแรงงานชุดที่สองท่ามกลางความหวาดกลัวสงครามนิวเคลียร์ ได้เสนอให้จัดตั้งกระทรวงป้องกันพลเรือนขึ้นแยกต่างหาก ผู้อำนวยการป้องกันพลเรือนคนแรกคือ เจ.วี. มีช (ซึ่งดำรงตำแหน่งเลขาธิการกระทรวงมหาดไทยด้วย) แม้ว่าในทางปฏิบัติงานส่วนใหญ่จะถูกมอบหมายให้แอนดรูว์ ชาร์ป รัฐมนตรีว่าการกระทรวงป้องกันพลเรือนคนแรกในยุคหลังสงครามคือบิล แอนเดอร์ตัน (ซึ่งดำรงตำแหน่งรัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทยด้วย) พระราชบัญญัติป้องกันพลเรือน ค.ศ. 1962 ได้กำหนดความรับผิดชอบและหน้าที่ของกระทรวงไว้ในกฎหมาย ในปี ค.ศ. 1964 ได้มีการแต่งตั้งผู้อำนวยการป้องกันพลเรือนแบบเต็มเวลาคนแรก คือพลตรี อาร์.ซี. เคอรี

กระทรวงการจัดการเหตุฉุกเฉินแห่งใหม่ได้รับการจัดตั้งขึ้นภายใต้รัฐบาลผสมพรรคเนชั่นแนล/นิวซีแลนด์เฟิร์สต์โดยรัฐมนตรีว่าการกระทรวงป้องกันภัยพลเรือนแจ็ค เอลเดอร์เมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม พ.ศ. 2542 หลังจากการทบทวนบริการฉุกเฉิน^{[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]}ซึ่งเข้ามาแทนที่กระทรวงป้องกันภัยพลเรือนที่มีอยู่เดิม^{[ 6 ]}ต่อมา ชื่อของกระทรวงได้เปลี่ยนอีกครั้งเป็นกระทรวงป้องกันภัยพลเรือนและการจัดการเหตุฉุกเฉิน

กระทรวงป้องกันภัยพลเรือนและการจัดการเหตุฉุกเฉินยังคงเป็นหน่วยงานธุรกิจของกระทรวงกิจการภายในจนถึงวันที่ 1 เมษายน 2557 เมื่อถูกโอนไปยังสำนักนายกรัฐมนตรีและคณะรัฐมนตรี (DPMC) ^{[ 7 ]}ซึ่งมีจุดประสงค์เพื่อสะท้อนบทบาทของ DPMC ในฐานะหน่วยงานหลักของรัฐบาลในการวางแผนความมั่นคงแห่งชาติ^{[ 8 ]}

ตั้งแต่วันที่ 1 ธันวาคม 2019 กระทรวงได้เปลี่ยนชื่อเป็นสำนักงานจัดการเหตุฉุกเฉินแห่งชาติ (NEMA) โครงสร้างของกระทรวงก็เปลี่ยนแปลงเช่นกัน โดยกลายเป็นหน่วยงานในสังกัดกระทรวง และมีการแต่งตั้งประธานเจ้าหน้าที่บริหารชั่วคราวคนแรกของ NEMA (แทนที่จะขึ้นตรงกับประธานเจ้าหน้าที่บริหารของ DPMC) หน่วยงานในสังกัดกระทรวงคือหน่วยงานที่มีความเป็นอิสระในการดำเนินงาน มีประธานเจ้าหน้าที่บริหารของตนเอง และอยู่ภายใต้กระทรวงของราชการนิวซีแลนด์

เมื่อวันที่ 25 กันยายน พ.ศ. 2568 NEMA ถูกโอนกลับไปยังกระทรวงกิจการภายใน^{[ 9 ]}

ในปี 2024 รัฐบาลได้เผยแพร่ผลการสอบสวนเกี่ยวกับประสิทธิภาพของระบบการจัดการเหตุฉุกเฉินของนิวซีแลนด์ การสอบสวนมุ่งเน้นไปที่การตอบสนองต่อเหตุการณ์สภาพอากาศรุนแรง 3 ครั้งในเกาะเหนือในช่วงต้นปี 2023 ได้แก่พายุไซโคลนเฮล (8 ถึง 12 มกราคม) น้ำท่วมโอ๊คแลนด์แอนดรูว์ (26 มกราคมถึง 3 กุมภาพันธ์) และพายุไซโคลนกาเบรียล (12 ถึง 16 กุมภาพันธ์) เหตุการณ์สภาพอากาศรุนแรงทั้ง 3 ครั้งนี้ทำให้มีผู้เสียชีวิต 15 ราย และค่าเสียหายโดยประมาณอยู่ในช่วง 9–14.5 พันล้านดอลลาร์ รายงานการสอบสวนสรุปว่า: ^{[ 10 ]}

ชุมชนและหน่วยงาน CDEM (การจัดการเหตุฉุกเฉินด้านการป้องกันพลเรือน) จำนวนมากไม่ได้เตรียมพร้อมอย่างเพียงพอ การสื่อสารและการแจ้งเตือนไม่มีอยู่จริงหรือมีไม่เพียงพอ และความสามารถและศักยภาพของบุคลากรและโครงสร้างพื้นฐานถูกประเมินสูงเกินไปหรือขาดไป

สำนักงานจัดการเหตุฉุกเฉินแห่งชาติได้ทำการตรวจสอบภายในของตนเองและสรุปว่าขาดบุคลากรและผู้นำที่ได้รับการฝึกฝนมาอย่างดีเพียงพอที่จะรับมือกับเหตุการณ์สภาพอากาศรุนแรง นอกจากนี้ยังพบว่าสิ่งอำนวยความสะดวกที่ใช้โดยศูนย์จัดการวิกฤตแห่งชาติและศูนย์ประสานงานแห่งชาติไม่เหมาะสมกับวัตถุประสงค์ และเทคโนโลยีที่ใช้โดยศูนย์เหล่านี้ไม่น่าเชื่อถือ^{[ 11 ]}