แฮร์ริสันได้นำทนายความจากกระทรวงกลาโหมผู้มีประสบการณ์สองคนซึ่งจบการศึกษาจากคณะนิติศาสตร์ มหาวิทยาลัยฮาร์ วาร์ด ได้แก่ พลตรีเคนเนธ รอยัลและวิลเลียม แอล. มาร์เบอรี จูเนียร์มารับหน้าที่ร่างกฎหมาย กฎหมายดังกล่าวมีพื้นฐานมาจากข้อเสนอของบุชและคอนันต์ และองค์กรที่เสนอมานั้นมีพื้นฐานมาจากโครงสร้างที่มีอยู่ของโครงการแมนฮัตตัน ร่างกฎหมายของพวกเขาจะจัดตั้งคณะกรรมการเก้าคนซึ่งประกอบด้วยพลเรือนห้าคนและทหารสี่คน โดยให้อำนาจคณะกรรมการอย่างกว้างขวางในการจัดหาทรัพย์สินดำเนินการสิ่งอำนวยความสะดวก ดำเนินการวิจัย ควบคุมพลังงานนิวเคลียร์ทุกรูปแบบ และบริหารจัดการระบบรักษาความปลอดภัย การบริหาร และการตรวจสอบของตนเอง^{[ 5 ] [ 6 ]}

รอยัลและมาร์เบอรีมองว่าพลังงานนิวเคลียร์ควรอยู่ภายใต้การควบคุมของผู้เชี่ยวชาญ โดยมีการแทรกแซงทางการเมืองให้น้อยที่สุด คณะกรรมการจะได้รับการแต่งตั้งโดยไม่มีกำหนดวาระ และอำนาจของประธานาธิบดีในการถอดถอนจะมีจำกัด พวกเขาจะได้รับการสนับสนุนจากคณะกรรมการที่ปรึกษา 4 คณะ สำหรับการใช้งานทางทหาร การใช้งานทางอุตสาหกรรม การวิจัย และการแพทย์ ซึ่งสมาชิกจะจำกัดเฉพาะผู้ที่มีคุณสมบัติทางเทคนิค การดำเนินงานประจำวันขององค์กรจะอยู่ในมือของผู้บริหารและรองผู้บริหาร ร่างกฎหมายรอยัล-มาร์เบอรีได้รับการตรวจสอบโดยคณะกรรมการชั่วคราวในการประชุมเมื่อวันที่ 19 กรกฎาคม และได้รับการแก้ไขตามข้อเสนอแนะของพวกเขา หลังจากเหตุการณ์ ทิ้ง ระเบิดปรมาณูที่ฮิโรชิมาและนางาซากิได้เปิดเผยความลับที่ปกคลุมโครงการแมนฮัตตัน รอยัลและมาร์เบอรีจึงสามารถปรึกษาหารือกับอัยการสูงสุดผู้พิพากษาทหารและสำนักงานวิจัยและพัฒนาวิทยาศาสตร์ได้^{[ 5 ] [ 7 ]}ร่างกฎหมายถูกส่งไปยังประธานาธิบดีในเดือนสิงหาคมเพื่อเผยแพร่และขอความคิดเห็นจากหน่วยงานรัฐบาลที่ได้รับผลกระทบ มี เพียงกระทรวงการต่างประเทศ เท่านั้น ที่คัดค้าน โดยอ้างว่ายังคงมีส่วนร่วมในการพยายามเจรจาข้อตกลงระหว่างประเทศเกี่ยวกับพลังงานนิวเคลียร์^{[ 8 ]}

เมื่อวันที่ 3 ตุลาคม พ.ศ. 2488 ร่างกฎหมายนี้ถูกนำเสนอในสภาผู้แทนราษฎรโดยนายแอนดรูว์ เจ. เมย์ สมาชิกสภาผู้แทนราษฎร จากรัฐเคนตัก กี้ ประธานคณะกรรมการกิจการทหารของสภา ผู้แทนราษฎร และในวุฒิสภาโดยวุฒิสมาชิกเอ็ดวิน ซี. จอห์นสันจากรัฐโคโลราโดสมาชิกอาวุโสของคณะกรรมการกิจการทหารของวุฒิสภาร่างกฎหมายนี้เป็นที่รู้จักในชื่อร่างกฎหมายเมย์-จอห์นสัน ตามชื่อผู้เสนอ เมย์ได้ส่งร่างกฎหมายนี้ไปยังคณะกรรมการกิจการทหารทันที ซึ่งได้จัดให้มีการไต่สวนในวันที่ 9 ตุลาคม บุช คอนันต์ และโกรฟส์ ต่างให้การเป็นพยานต่อหน้าคณะกรรมการ แต่ในคณะกรรมการกิจการทหารของวุฒิสภา ร่างกฎหมายนี้ถูกระงับโดยวุฒิสมาชิกอาเธอร์ เอช. แวนเดนเบิร์ก^{[ 9 ] [ 10 ]}

นักวิทยาศาสตร์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ห้องปฏิบัติการโลหะวิทยาในชิคาโก ต่างพากันวิพากษ์วิจารณ์อย่างหนักเลโอ ซิลาร์ดและแฮโรลด์ ยูเรย์เป็นนักวิจารณ์ที่โดดเด่นเป็นพิเศษ ร่างกฎหมายนี้สร้างผู้บริหารและรองผู้บริหารที่มีอำนาจ และระบุอย่างชัดเจนว่าพวกเขาอาจเป็นสมาชิกของกองทัพ มีความเกรงว่าพวกเขาจะครอบงำคณะกรรมการนอกเวลา ข้อเท็จจริงที่ว่าร่างกฎหมายเน้นย้ำว่าผู้บริหารต้องแจ้งให้รองผู้บริหารทราบอย่างครบถ้วนยิ่งทำให้เกิดความสงสัยว่าผู้บริหารจะเป็นนายทหารบกและรองผู้บริหารจะเป็นนายทหารเรือ^{[ 11 ]}บทบัญญัติเกี่ยวกับการรักษาความลับยังทำให้เหล่านักวิทยาศาสตร์หวาดกลัว เพราะมีบทลงโทษที่รุนแรงถึงจำคุกสูงสุด 10 ปีและปรับ 10,000 ดอลลาร์สำหรับการละเมิดความปลอดภัย^{[ 9 ]} พาดหัวข่าว ของChicago Sunกล่าวหากระทรวงสงครามว่าพยายามเร่งรัดกฎหมายผ่านรัฐสภา^{[ 12 ]}

สมาชิกสภานิติบัญญัติพบว่าตนเองอยู่ในสถานการณ์ที่แปลกประหลาดและไม่สบายใจ อาวุธนิวเคลียร์เป็นสิ่งที่น่าหวาดกลัว และธรรมชาติของพลังงานนิวเคลียร์ยังไม่เป็นที่เข้าใจกันอย่างกว้างขวาง เนื่องจากเป็นเรื่องใหม่มาก จึงไม่มีนโยบายหรือแบบอย่างใดที่จะชี้นำสมาชิกสภานิติบัญญัติ และไม่มีการแบ่งพรรคพวกตามแบบแผนดั้งเดิม นักวิทยาศาสตร์ที่พัฒนาเทคโนโลยีใหม่นี้ไม่เคยแสดงความคิดเห็นมาก่อน แต่จู่ๆ ก็เริ่มแสดงความคิดเห็น การสิ้นสุดของสงครามโลกครั้งที่สอง อย่างมีชัยชนะทำให้กองทัพได้รับเกียรติอย่างมหาศาล แต่ความไม่ไว้วางใจของชาวอเมริกัน ที่มีต่อกองทัพประจำการยังคงมีอยู่มายาวนานและประเพณี การควบคุมกองทัพ โดยพลเรือนก็ ยังคงมีอยู่ ^{[ 13 ]}

เมื่อวันที่ 20 ธันวาคม พ.ศ. 2488 วุฒิสมาชิกไบรอัน แม็กมาฮอนได้เสนอร่างกฎหมายทางเลือกเกี่ยวกับพลังงานปรมาณู ซึ่งร่างโดยคณะกรรมการกิจการทหารของวุฒิสภา และกลายเป็นที่รู้จักอย่างรวดเร็วในชื่อร่างกฎหมายแม็กมาฮอน^{[ 14 ]}ในตอนแรก ร่างกฎหมายนี้เป็นร่างกฎหมายที่ค่อนข้างเสรีเกี่ยวกับการควบคุมการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ และได้รับการสนับสนุนอย่างกว้างขวางจากนักวิทยาศาสตร์ แม็กมาฮอนได้กำหนดประเด็นความขัดแย้งว่าเป็นคำถามเกี่ยวกับการควบคุมพลังงานปรมาณูระหว่างฝ่ายทหารกับฝ่ายพลเรือน แม้ว่าร่างกฎหมายเมย์-จอห์นสันจะกำหนดให้มีการควบคุมโดยพลเรือนเช่นกัน^{[ 15 ]}ร่างกฎหมายแม็กมาฮอนพยายามแก้ไขประเด็นที่เป็นข้อถกเถียงของร่างกฎหมายเมย์-จอห์นสัน จำนวนคณะกรรมการลดลงเหลือห้าคน และพวกเขาจะปฏิบัติหน้าที่เต็มเวลา ไม่มีการยกเว้นสำหรับเจ้าหน้าที่ทหารที่กำลังปฏิบัติหน้าที่^{[ 16 ]}การแก้ไขเพิ่มเติมระบุว่าพวกเขามีวาระการดำรงตำแหน่งแบบเหลื่อมกันเป็นเวลาห้าปี^{[ 17 ]}

ขณะที่ร่างกฎหมายกำลังถูกอภิปราย ข่าวการแปรพักตร์ของIgor Gouzenkoในแคนาดาและการจับกุมผู้คน 22 คนในเวลาต่อมาก็แพร่กระจายเมื่อวันที่ 16 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2489 สมาชิกสภาคองเกรสที่กำลังอภิปรายร่างกฎหมายเกรงว่า "ความลับเกี่ยวกับอะตอม" จะถูกสายลับอะตอม ของโซเวียตขโมยไปอย่างเป็นระบบ McMahon จึงเรียกประชุมลับโดย เรียก J. Edgar Hooverผู้อำนวยการสำนักงานสอบสวนกลาง รัฐมนตรีต่างประเทศ James F. Byrnesและ Groves มาให้การ Groves เปิดเผยว่าAlan Nunn May นักฟิสิกส์ชาวอังกฤษ ได้ส่งข้อมูลเกี่ยวกับโครงการแมนฮัตตันให้กับสายลับโซเวียต^{[ 18 ]}

กลุ่มอนุรักษ์นิยมในรัฐสภาได้ดำเนินการเพื่อทำให้กฎหมายนี้เข้มงวดขึ้น มาตรา 10 ซึ่งเดิมมีชื่อว่า "การเผยแพร่ข้อมูล" ได้เปลี่ยนเป็น "การควบคุมข้อมูล" ^{[ 19 ]}มาตราใหม่นี้มีหลักการใหม่ที่ต่อมาถูกอธิบายว่า " ความลับที่เกิดมา " หรือ "ถูกจัดประเภทตั้งแต่แรกเกิด" ข้อมูลทั้งหมดเกี่ยวกับการออกแบบ การพัฒนา และการผลิตอาวุธนิวเคลียร์ถือเป็น " ข้อมูลที่ถูกจำกัด " และไม่ว่าจะได้มาอย่างไรก็ถือว่าเป็นข้อมูลลับ เว้นแต่จะมีการเปิดเผยข้อมูลลับอย่างชัดเจน ข้อจำกัดเกี่ยวกับเสรีภาพในการพูดนี้ ซึ่งครอบคลุมหัวข้อทั้งหมด ยังคงถูกบังคับใช้ "กำแพงแห่งความลับ" ที่กำหนดโดยกฎหมายนี้หมายความว่าการวิจัยและพัฒนาพลังงานปรมาณูจะต้องดำเนินการภายใต้การกำกับดูแลของคณะกรรมการพลังงานปรมาณู^{[ 20 ]}

ตัวแทนHelen Gahagan Douglasซึ่งเป็นผู้สนับสนุนร่างกฎหมาย McMahon ในสภา^{[ 21 ]}ได้ปกป้องบทบัญญัติการเผยแพร่ของมาตรา 10 อย่างแข็งขันต่อข้อโต้แย้ง เธอปฏิเสธข้อคัดค้านที่ว่ามันจะ "เปิดเผยความลับของระเบิด" ^{[ 22 ]}โดยยืนยันว่าความได้เปรียบของอเมริกาในด้านอาวุธนิวเคลียร์จะเป็นเพียงชั่วคราว ในขณะที่ร่างกฎหมายนี้สามารถรักษาความเป็นผู้นำในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ได้^{[ 22 ]}ส่วนเพิ่มเติมที่สำคัญ ซึ่งรู้จักกันในชื่อการแก้ไขเพิ่มเติมของ Vandenberg ได้จัดตั้งคณะกรรมการประสานงานทางทหารเพื่อให้คำแนะนำแก่คณะกรรมาธิการเกี่ยวกับเรื่องการป้องกัน ประเทศ ^{[ 23 ]}มาตรา 2 ของพระราชบัญญัติยังได้จัดตั้งคณะกรรมการที่ปรึกษาทั่วไป และคณะกรรมการร่วมด้านพลังงานปรมาณูชุด ใหม่ เพื่อกำกับดูแลองค์กรใหม่^{[ 17 ]}

วุฒิสภาผ่านร่างกฎหมายนี้โดยเอกฉันท์ด้วยการลงคะแนนเสียงในวันที่ 1 มิถุนายน พ.ศ. 2489 ^{[ 24 ]}ต้องมีการเจรจาทางการเมืองอย่างมากก่อนที่สภาผู้แทนราษฎรจะผ่านร่างกฎหมายนี้ด้วยคะแนนเสียง 265–79 ในวันที่ 20 กรกฎาคม จากนั้นทั้งสองสภาก็ได้ตกลงร่างกฎหมายประนีประนอมกันในวันที่ 26 กรกฎาคม^{[ 25 ]}ทรูแมนลงนามในร่างกฎหมายประนีประนอมนี้ให้เป็นกฎหมายว่าด้วยพลังงานปรมาณู พ.ศ. 2489 ในวันที่ 1 สิงหาคม พ.ศ. 2489 เมื่อกฎหมายนี้มีผลบังคับใช้ในเวลาเที่ยงคืนของวันที่ 1 มกราคม พ.ศ. 2490 คณะกรรมการพลังงานปรมาณู ที่จัดตั้งขึ้นใหม่ ได้เข้ามารับผิดชอบด้านพลังงานนิวเคลียร์จากโครงการแมนฮัตตันในช่วงสงคราม^{[ 15 ]}

สิ่งสำคัญที่ถูกละเว้นจากพระราชบัญญัติพลังงานปรมาณู พ.ศ. 2489 คือการไม่ได้กล่าวถึงการใช้พลังงานนิวเคลียร์โดยหน่วยงานที่ไม่ใช่ภาครัฐ เนื่องจากการใช้งานทางทหารมีความสำคัญเหนือกว่าการใช้งานอื่นๆ ในขณะนั้น^{[ 26 ]}ข้อจำกัดของพระราชบัญญัติที่เกี่ยวข้องกับการรักษาความลับ การควบคุม วัสดุ ฟิสไซล์การเป็นเจ้าของสิทธิบัตร และการดำเนินงานของโรงงานผลิต ได้สร้างอุปสรรคทางกฎหมายหลายประการต่อโรงไฟฟ้านิวเคลียร์เอกชน^{[ 27 ]}

สิ่งนี้ขัดแย้งกับ โครงการ อะตอมเพื่อสันติภาพของรัฐบาลไอเซนฮาวร์และส่งผลให้เจ้าหน้าที่รัฐบาลกลางถูกกดดันให้พัฒนาอุตสาหกรรมพลังงานนิวเคลียร์พลเรือนที่สามารถช่วยพิสูจน์การใช้จ่ายจำนวนมากของรัฐบาลในโครงการอาวุธนิวเคลียร์ได้^{[ 28 ]}ในปี พ.ศ. 2496 คณะกรรมการพลังงานปรมาณูได้เสนอร่างแก้ไขเพิ่มเติมชุดหนึ่งต่อคณะกรรมการร่วมด้านพลังงานปรมาณูเพื่อพิจารณา^{[ 29 ]}หลังจากการอภิปรายบางส่วน ส่งผลให้เกิดพระราชบัญญัติพลังงานปรมาณู พ.ศ. 2497 ^{[ 30 ]}

พระราชบัญญัติพลังงานปรมาณู พ.ศ. 2497 พิสูจน์แล้วว่าไม่เพียงพอต่อวัตถุประสงค์ในการส่งเสริมให้เอกชนสร้างและดำเนินการเครื่องปฏิกรณ์นิวเคลียร์ อุบัติเหตุหลายครั้งกับเครื่องปฏิกรณ์วิจัย รวมถึงการหลอมละลายของแกน บางส่วน ทำให้บริษัทเอกชนระมัดระวังและลังเลที่จะเข้ามาเกี่ยวข้องกับพลังงานนิวเคลียร์โดยปราศจากการคุ้มครองจากความรับผิด สิ่งนี้นำไปสู่พระราชบัญญัติการชดเชยอุตสาหกรรมนิวเคลียร์ไพรซ์-แอนเดอร์สันพ.ศ. 2490 ^{[ 31 ] [ 28 ]}ซึ่งจำกัดความรับผิดของเอกชนสำหรับอุบัติเหตุนิวเคลียร์ ในขณะเดียวกันก็จัดให้มีการชดเชยที่เพียงพอสำหรับผู้ประสบอุบัติเหตุ^{[ 32 ]}

การบังคับใช้กฎหมาย McMahon Act ก่อให้เกิดความแตกแยกอย่างมากระหว่างสหรัฐอเมริกาและสหราชอาณาจักร การควบคุม "ข้อมูลที่ถูกจำกัด" แบบใหม่นี้ทำให้พันธมิตรของสหรัฐอเมริกาไม่ได้รับข้อมูลใดๆ แม้ว่ารัฐบาลอังกฤษและแคนาดาจะทำข้อตกลงกับสหรัฐอเมริกาเกี่ยวกับการแบ่งปันเทคโนโลยีนิวเคลียร์หลังสงครามก่อนที่จะบริจาคเทคโนโลยีและกำลังคนให้กับโครงการแมนฮัตตันก็ตาม ข้อตกลงเหล่านั้นได้รับการจัดทำเป็นทางการในข้อตกลงควิเบก ปี 1943 ในกรณีของสหราชอาณาจักร ข้อตกลงเหล่านี้ได้รับการพัฒนาเพิ่มเติมในข้อตกลงไฮด์พาร์คปี 1944 ซึ่งลงนามโดยวินสตัน เชอร์ชิลล์และแฟรงคลิน รูสเวลต์^{[ 33 ]}

ข้อตกลงไฮด์พาร์คหายไปในเอกสารของรูสเวลต์หลังจากที่เขาเสียชีวิต และจนกระทั่งพบสำเนาเอกสารฉบับอเมริกัน เจ้าหน้าที่อเมริกันก็งุนงงเมื่ออังกฤษกล่าวถึงข้อตกลงนี้^{[ 33 ]}ข้อตกลงควิเบกเป็นข้อตกลงบริหารที่ใช้ได้เฉพาะกับฝ่ายบริหารของรูสเวลต์ เท่านั้น และวุฒิสภาไม่เคยเห็นเอกสารนี้ แม็กมาฮอนบอกกับเชอร์ชิลล์ในปี 1952 ว่า "ถ้าเราได้เห็นข้อตกลงนี้ ก็คงไม่มีกฎหมายแม็กมาฮอน" ^{[ 34 ]}กฎหมายแม็กมาฮอนก่อให้เกิดความไม่พอใจจากนักวิทยาศาสตร์ชาวอังกฤษและเชอร์ชิลล์ และนำไปสู่การที่อังกฤษพัฒนาอาวุธนิวเคลียร์ของตนเอง^{[ 35 ]}

ลูอิส สเตราสส์ประธานคณะกรรมการพลังงานปรมาณู เสนอในเดือนมกราคม พ.ศ. 2491 ว่าประธานาธิบดีควรสามารถแบ่งปันข้อมูลนิวเคลียร์กับพันธมิตรที่ "มีส่วนร่วมอย่างสำคัญและเป็นรูปธรรมในการป้องกันประเทศและความมั่นคง" นอกจากอาวุธนิวเคลียร์ของตนเองแล้ว สหราชอาณาจักรยังเป็นเจ้าภาพ เครื่องบินทิ้งระเบิดนิวเคลียร์ ของกองบัญชาการยุทธศาสตร์ทางอากาศ ของอเมริกา ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2491 รัฐสภาได้แก้ไขพระราชบัญญัติพลังงานปรมาณู พ.ศ. 2497 ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2491 และอเมริกาและสหราชอาณาจักรก็เริ่มแบ่งปันการวิจัยนิวเคลียร์อีกครั้งภายใต้ข้อตกลงป้องกันร่วมกันระหว่างสหรัฐฯ และสหราชอาณาจักร พ.ศ. 2491 ^{[ 36 ] [ 37 ]}

ข้อกำหนดที่อยู่ในพระราชบัญญัติดังกล่าวทำให้เกิดข้อโต้แย้งอย่างมากในระหว่างการอภิปรายเกี่ยวกับโครงสร้างการบังคับบัญชาทางทหารของนาโต ทั้ง กองเรือโจมตีแอตแลนติกและกองเรือที่หกของสหรัฐฯไม่เคยได้รับอนุญาตให้อยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของนายทหารอเมริกันโดยตรง ได้แก่ผู้บัญชาการสูงสุดของฝ่ายสัมพันธมิตรแอตแลนติกและผู้บัญชาการสูงสุดของกองกำลังฝ่ายสัมพันธมิตรยุโรปตอนใต้เนื่องจากการตีความทางกฎหมายที่โดดเด่นของพระราชบัญญัติแม็กมาฮอนคือ กองกำลังโจมตีด้วยอาวุธนิวเคลียร์ไม่สามารถอยู่ภายใต้การควบคุมของผู้บัญชาการที่ไม่ใช่ชาวอเมริกันได้ นี่เป็นเหตุผลสำหรับการก่อตั้งกองเรือโจมตีแอตแลนติกในฐานะหน่วยงานอิสระ แทนที่จะอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของพลเรือเอกแห่งสหราชอาณาจักรที่ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการสูงสุดของแอตแลนติกตะวันออก ในเดือนตุลาคม-พฤศจิกายน พ.ศ. 2495 ^{[ 38 ]}นี่เป็นเหตุผลเช่นกันที่กองเรือที่หก ในรูปแบบของนาโตในฐานะกองกำลังโจมตีและสนับสนุนทางทะเลตอนใต้ ถูกจัดให้อยู่ภายใต้การควบคุมของอเมริกา แทนที่จะเป็นกองกำลังฝ่ายสัมพันธมิตรเมดิเตอร์เรเนียน เมื่อมีการตกลงกันในกองบัญชาการยุโรปในเวลาเดียวกัน^{[ 39 ]}