ก่อนเริ่มดำเนินการ มีการตรวจสอบเส้นทาง 10 เส้นทางที่รถไฟสามารถแข่งขันกับการเดินทางโดยเครื่องบินได้ เส้นทางโคโลญจน์–ฮัมบูร์ก ได้รับค่าสูงสุดในการตรวจสอบ โดยเส้นทางแฟรงก์เฟิร์ต–มิวนิก อยู่ในอันดับที่สอง^{[ 4 ]} เดิมทีมีกำหนดการเปิดให้บริการ รถไฟใต้ดินในวันที่ 13 มิถุนายน 1999 แต่เนื่องจากความล่าช้าในการส่งมอบรถไฟและการฝึกอบรมพนักงาน บริการจึงไม่ได้เริ่มจนกระทั่งวันที่ 1 สิงหาคม เริ่มตั้งแต่วันที่ 1 กรกฎาคม 1999 มีการทดสอบการวิ่งโดยใช้รถไฟชุดแรกจากสองชุดเพื่อรวบรวมประสบการณ์การใช้งาน ระหว่างวันที่ 1 สิงหาคม 1999 และสิ้นสุดการให้บริการในวันที่ 11 ธันวาคม 2004 รถไฟรถไฟ ใต้ดินวิ่งระหว่างสถานีรถไฟโคโลญจน์ (Köln Hauptbahnhof)และ สถานีรถไฟ ฮัมบูร์ก (Hamburg Hauptbahnhof)โดยมีจุดจอดที่สถานีรถไฟดุส เซลดอร์ฟ (Düsseldorf Hauptbahnhof)และ สถานีรถไฟ เอสเซน (Essen Hauptbahnhof ) ^{[ 5 ]}อย่างไรก็ตาม ในช่วงปลายปี 1999 รถไฟมีผู้โดยสารเพียง 20 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งต่ำกว่าจุดคุ้มทุนที่ 53 เปอร์เซ็นต์ มีสองทางเลือกที่พิจารณา: การขยายเส้นทางฮัมบูร์ก-เบอร์ลิน และการยกเลิกข้อกำหนดในการจองที่นั่งล่วงหน้า แต่ทั้งสองทางเลือกก็ไม่ได้รับการอนุมัติ^{[ 6 ]}

ตลอดระยะเวลาห้าปีของ การให้บริการ รถไฟใต้ดินอัตราการใช้งานต่ำกว่าความจุของรถไฟและบริการทางไกลมาตรฐานมาก ประมาณสองเดือนหลังจากเริ่มดำเนินการ รถไฟมีอัตราการใช้งาน 50 ถึง 60 เปอร์เซ็นต์ในเช้าวันจันทร์และเย็นวันศุกร์ แต่โดยเฉลี่ยแล้วมีผู้โดยสารเพียง 30 เปอร์เซ็นต์ของความจุเท่านั้น^{[ 7 ]}ในสองปีแรก อัตราการใช้งานเฉลี่ยเพิ่มขึ้นเป็น 35 ถึง 40 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งยังคงต่ำกว่าจุดคุ้มทุนอัตราการใช้งานถึงระดับที่น่าพอใจเฉพาะในช่วงวันจัดงานแสดงสินค้า เท่านั้น ^{[ 8 ]}จำนวนผู้โดยสารลดลงในไตรมาสแรกของปี 2546 เมื่อ บริการรถไฟ ใต้ดินสูญเสียผู้โดยสารไปหนึ่งในสี่ ตามข้อมูลของ Deutsche Bahn ซึ่งกล่าวโทษว่าเป็นผลมาจากการเพิ่มขึ้นของ สายการ บินต้นทุนต่ำ^{[ 9 ]}

ในการแถลงข่าวทางการเงินเมื่อวันที่ 16 สิงหาคม พ.ศ. 2547 ดอยช์บาห์นได้ยืนยันรายงานว่า บริการ รถไฟใต้ดินจะถูกยกเลิก แต่ไม่ได้ระบุวันที่ยกเลิก^{[ 10 ]}บริการดังกล่าวถูกยกเลิกเนื่องจากการใช้งานต่ำและขาดผลกำไร^{[ 1 ]}ตามรายงานของสื่อ MET GmbH ขาดทุน 3.8 ล้านยูโรในปี พ.ศ. 2546 โดยมีรายได้ 21.3 ล้านยูโร อัตราการใช้บริการเฉลี่ยของรถไฟอยู่ที่เพียง 35 เปอร์เซ็นต์ แทนที่จะเป็น 50 เปอร์เซ็นต์ตามที่วางแผนไว้^{[ 10 ]} รถไฟรถไฟ ใต้ดินยังคงวิ่งต่อไปจนถึงการเปลี่ยนแปลงตารางเวลาปกติครั้งถัดไปในวันที่ 11 ธันวาคม พ.ศ. 2547 บริการถูกแทนที่ด้วย รถไฟ ICE Sprinter ^{[ 10 ]}

เดิมทีขบวนรถไฟทั้งสองขบวนนี้ตั้งใจจะจอดไว้ แต่ DB Fernverkehr ตัดสินใจนำรถไฟเหล่านี้กลับมาใช้ในการขนส่งทางไกล จึงได้ทำการดัดแปลงภายนอกเพื่อเตรียมพร้อมใช้งาน โดยทาสีใหม่เป็นสีมาตรฐานของ DB และติดตั้งอุปกรณ์ต่างๆ เช่น ที่วางป้ายบอกเส้นทาง อย่างไรก็ตาม ภายในยังคงเหมือนเดิม ตู้โดยสารTraveller สอง ตู้และตู้โดยสารอื่นๆ อีกสามตู้ถูกจัดสรรใหม่เป็นชั้นสอง ขณะที่อีกสองตู้ถูกจัดสรรเป็นชั้นหนึ่ง หลังจากมีการเปลี่ยนแปลงตารางเวลาในวันที่ 13 ธันวาคม 2552 ขบวนรถไฟเจ็ดตู้สองขบวนถูกแปลงเป็นขบวนรถไฟสิบเอ็ดตู้หนึ่งขบวนและขบวนรถไฟสามตู้หนึ่งขบวน แต่ก็กลับมาเป็นแบบเดิมในเดือนมีนาคม 2554 รถไฟ Metropolitan ขบวนสุดท้าย วิ่งในวันที่ 10 ธันวาคม 2564 และตู้ควบคุมของรถไฟได้รับการตกแต่งด้วยโลโก้Metropolitan ^{[ 11 ]}การใช้งานรถไฟทั้งสองขบวนสิ้นสุดลงหลังจากมีการเปลี่ยนแปลงตารางเวลาในเดือนธันวาคม 2564 และรถไฟเหล่านี้ถูกประกาศขาย ภาพถ่ายในปี 2567 แสดงให้เห็นว่ารถไฟถูกตัดแยกและนำไปทำลาย^{[ 2 ]}

บริษัทผู้ดำเนินการ Metropolitan Express Train GmbH ก่อตั้งขึ้นในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2539 ในฐานะบริษัทลูกของDB Fernverkehr (ซึ่งในขณะนั้นมีชื่อว่า DB Reise&Touristik) ซึ่งเป็นบริษัทลูกของDeutsche Bahn AG [ ^{4 ] [ 12 ] MET} GmbH เป็นบริษัทที่สี่ นอกเหนือจาก DB Reise&Touristik (สามบริษัทแรกคือCityNightLine , ThalysและCisalpino ) ที่ให้บริการรถไฟทางไกลในเยอรมนีหลังจากการปฏิรูปทางรถไฟในปี พ.ศ. 2537หลังจากที่การให้บริการถูกยกเลิกในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2547 MET GmbH ก็ถูกยุบและถูกซื้อคืนโดย DB Fernverkehr ^{[ 1 ]}

รถไฟเมโทรโพลิทันเป็นบริการเดียวของดอยช์บาห์นที่ไม่ได้แบ่งออกเป็นชั้นโดยสาร แยกต่างหาก แต่มีบริการชั้นหนึ่งสามประเภทแทน: ^{[ 22 ]}

• รถ Silenceสองคันมีไว้สำหรับให้ผู้โดยสารพักผ่อน มีหมอนและผ้าห่มให้ฟรี รวมถึงที่อุดหูและหูฟัง ไม่แนะนำให้ใช้โทรศัพท์และแล็ปท็อป รถทั้งสองคันนี้ตั้งอยู่ท้ายขบวนรถไฟ^{[ 12 ]}
• รถ สำนักงานสามคันที่ออกแบบมาสำหรับนักเดินทางเพื่อการทำงาน ที่นั่งมีปลั๊กไฟและตัวขยายสัญญาณโทรศัพท์ มือถือ ^{[ 18 ]}หมวดหมู่นี้ประกอบด้วยบาร์เครื่องดื่มค็อกเทลและเอสเปรสโซ รวมถึงโต๊ะสี่ที่นั่งสำหรับการสัมภาษณ์งาน^{[ 12 ]}
• มีตู้ โดยสารคลับ 2 ตู้สำหรับผู้โดยสารที่ไม่ต้องการทำงานหรือนอนหลับ สามารถยืม เครื่องเล่นดีวีดี แบบพกพา และภาพยนตร์ได้ฟรี ส่วนนี้ยังมีบาร์เครื่องดื่มค็อกเทลและเอสเปรสโซ และเครื่องทวนสัญญาณไร้สาย คล้ายกับส่วนสำนักงาน^{[ 18 ]}ตู้โดยสารหมายเลข 7 ออกแบบมาให้สามารถเข้าถึงได้^{[ 12 ]}

ตั้งแต่วันที่ 1 กันยายน 2544 บริษัท MET GmbH ได้เปิดตัวชั้นโดยสารที่สี่ชื่อ"Traveller"เพื่อพยายามเพิ่มการใช้บริการรถไฟ พร้อมทั้งเสนอราคาตั๋วไป-กลับที่ลดลง ชั้นโดยสารใหม่นี้มีความสะดวกสบายน้อยกว่าสามชั้นโดยสารที่มีอยู่เดิม และทำหน้าที่เป็นชั้นสองสำหรับรถไฟเมโทรโพลิแทน

รถไฟขบวนที่ 1 และ 5 (เปลี่ยนหมายเลขเป็นขบวนที่ 1 และ 2) ได้รับการติดตั้งที่นั่งแบบสี่แถวเรียงกันใหม่ แทนที่ที่นั่งแบบสามแถวเรียงกันเดิม รถไฟแต่ละขบวนได้รับที่นั่งใหม่ 145 ที่นั่งเพื่อแทนที่ที่นั่งเดิม 114 ที่นั่ง ^{[ 23 ]}ที่นั่งเดิมถูกถอดออกและขายบนeBayโดย Deutsche Bahn AG ความจุรวมของรถไฟแต่ละขบวนเพิ่มขึ้น 8.8 เปอร์เซ็นต์ จาก 351 เป็น 382 ที่นั่ง อย่างไรก็ตาม เนื่องจาก รถไฟ Travellerถูกนำมาจาก หมวด OfficeและSilenceความจุของหมวดเหล่านั้นจึงลดลง